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关键词： 药理学   混合式教学   学生为中心   一流课程建设  

摘要： 教学团队基于问题导向和以学生为中心的教学理念,全面落实立德树人根本任务,通过构建多维课程目标、整合教学内容、实施混合式教学模式、改进教学方法和手段、丰富教学资源、运用多元化的考评体系,很好地解决了课程教学的痛点问题,增加了课程的趣味性的同时,激发了学生学习的兴趣,提高了学生的学习效果和教师的教学能力。

关键词： 白芷   黄褐斑   网络药理学   分子对接   靶点预测  

摘要： 目的本研究采用网络药理学和分子对接技术探究白芷治疗黄褐斑(chloasma)的潜在疗效机制。方法利用TCMSP数据库搜集白芷的主要活性成分及作用靶点,选定GeneCards数据库筛选黄褐斑有关基因,将选取的交集靶点导入String数据库构建蛋白互作网络,用Cytoscape 3.9.0将结果数据可视化。使用Metascape数据库对交集靶点进行GO分析和KEGG通路富集分析,最后运用分子对接技术进一步验证。结果筛选白芷中β-谷甾醇、豆甾醇、2-亚油酰甘油、油酸乙酯等22个有效成分,预测白芷治疗黄褐斑的相关靶点108个,基因文本(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)通路富集结果显示,白芷治疗黄褐斑的作用机制主要涉及对激素的反应、细胞对脂质的反应、蛋白质磷酸化等生物过程,并通过PI3K-Akt、NF-κB、PPAR等信号通路进行调控。分子对接结果显示,β-谷甾醇、豆甾醇、2-亚油酰甘油、油酸乙酯等潜在活性成分和MAPK3、EGFR、TNF、PTGS、BCL2等关键靶蛋白有较强亲和能力。结论白芷可能通过靶向MAPK3、EGFR、TNF、PTGS、BCL2等靶点,调控PI3K-Akt、NF-κB、PPAR等信号通路,发挥治疗黄褐斑的作用。

关键词： 华蟾酥毒基   胃癌   TCGA数据库   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的 基于网络药理学结合生物信息学、分子对接技术,探究华蟾酥毒基(cinobufagin, CBG)治疗胃癌的作用机制。方法 利用PubChem数据库、TCMSP数据库和SwissTargetPrediction数据库,收集CBG治疗胃癌活性成分的结构及其潜在靶点。从TGGA数据库获取胃癌样本转录组数据,通过差异基因分析获取胃癌相关靶点。取CBG靶点和胃癌疾病靶点的交集,进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析。使用STRING数据库对共同靶点构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape软件筛选核心靶点,SYBYL-X 2.1.1软件将筛选得到的核心靶点和CBG进行分子对接,进一步筛选出得分排名前10的靶点,利用Kaplan-Meier plotter数据库筛选出与胃癌患者生存期密切相关的靶点。结果 CBG治疗胃癌涉及59个靶点,关键核心靶点19个,其中关键靶点极光激酶A (AURKA)、肝细胞生长因子受体细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、增强子同源物2(EZH2)、肝细胞生长因子受体(MET)、基质金属蛋白酶3(MMP-3)、孕酮受体(PGR)、前列腺素内过氧化物合酶1(PTGS1)和胸苷酸合成酶(TYMS)与CBG具有较好的结合活性,且与胃癌预后密切相关。结论 CBG可能通过多靶点、多途径来发挥抗胃癌作用。

关键词： 山豆根   鼻咽癌   网络药理学   分子对接   作用机制   物质基础  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接技术探索山豆根抗鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma, NPC)的作用机制与物质基础。方法:前期研究获取山豆根的活性成分。通过Swiss Target Prediction数据库筛选出山豆根化学成分的潜在作用靶点;GeneCards、OMIM、CTD等数据库检索鼻咽癌的潜在基因靶点;使用Venny 2.0.1平台筛选药物与疾病作用的交集靶点;将药物与疾病的交集靶点导入至String平台构建蛋白互作(PPI)网络,将PPI网络导入Cytoscape软件筛选核心靶点,在Cytoscape软件中制作“中药–活性成分–靶点–疾病”网络图筛选核心活性成分。应用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析,预测涉及的生物过程与代谢通路。使用CB-DOCK2对山豆根抗鼻咽癌的核心活性成分及核心靶点进行分子对接。结果:本研究共筛选山豆根抗鼻咽癌的31个有效活性成分以及51个交集靶点,其中核心活性成分主要包括葛根素、大豆苷、白蜡树素等;核心靶点主要包括MMP9、肿瘤坏死因子(TNF-α)、MMP1、MMP2、IL2等。GO分析主要涉及单碳代谢过程、兴奋性突触后电位、单原子离子跨膜转运等生物过程,KEGG分析主要富集在氮代谢信号通路、炎症性肠病信号通路、膀胱癌信号通路等信号通路。分子对接结果显示核心靶点与对应的活性成分具有良好的结合能力。结论:应用网络药理学和分子对接技术预测山豆根抗鼻咽癌的作用机制以及物质基础,为其进一步研究提供新的思路与线索。Objective: To explore the mechanism of action and material basis of Sophora tonkinensis Gagnep in the treatment of nasopharyngeal carcinoma based on network pharmacology and molecular docking technology. Method: Preliminary research was conducted to identify the active components of Sophora tonkinensis Gagnep. The Swiss Target Prediction database was utilized to screen for potential targets of the chemical constituents of Sophora tonkinensis Gagnep. GeneCards, OMIM, CTD, and other databases were searched to identify potential gene targets for nasopharyngeal carcinoma. The Venny 2.0.1 platform was employed to filter the intersection of drug and disease targets. The intersection targets were imported into the String platform to construct a protein-protein interaction (PPI) network, which was then imported into Cytoscape software to identify core targets and create a “Chinese medicine-active ingredient-targets-disease” network to filter core active ingredients. The DAVID database was applied for GO and KEGG enrichment analysis to predict the biological processes and metabolic pathways involved. CB-DOCK2 was used for molecular docking of the core active ingredients and core targets of Sophora tonkinensis Gagnep against nasopharyngeal carcinoma. Result: This study screened 31 effective active ingredients and 51 intersecting targets of S

关键词： 丹参   特发性耳鸣   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:通过网络药理学及分子对接研究丹参治疗特发性耳鸣的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选丹参的药物成分,使用Swiss Target Prediction预测药物成分的作用靶点;运用人类基因组数据库(GeneCards)及人类孟德尔遗传疾病在线数据库(OMIM)获取特发性耳鸣的疾病靶点,利用venny 2.1获取交集靶点。使用String进行蛋白质互作(PPI)网络分析并使用Cytoscape构建网络图,利用DAVID数据库进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。使用Cytoscape软件构建“成分-靶点-通路”网络图。利用化学数据库(PubChem)、生物大分子结构数据库(PDB)及分子可视化软件(PyMoL)、AutoDockTools1.5.7软件进行分子对接。结果:研究发现丹参中的31个有效成分通过多条通路直接作用于13个疾病靶点以治疗特发性耳鸣,其中黄体素、毛地黄黄酮、诺坦申酮、隐丹参酮等是核心成分,PTPT11、TERT、STAT3、MMP9、AKT1蛋白是至关重要的靶点。基因功能注释分析结果显示,交集基因最可能相关的生物过程主要涉及对紫外线-A的细胞反应、内在凋亡信号通路的负调控、细胞对脂多糖的反应、对凋亡过程的负调控等,细胞组分主要涉及细胞外空间、细胞外泌体、细胞外基质、核质和等离子膜等,分子功能主要涉及丝氨酸型内肽酶活性、肽链内切酶活性、肽酶活性、金属内肽酶活性和ATP结合等。通路富集分析结果提示,丹参主要参与脂质和动脉粥样硬化、松弛素、脂肪细胞因子、催乳素(PRL)、白细胞介素(IL)-17、内分泌抗性、肿瘤坏死因子(TNF)、雌激素等信号通路。分子对接显示黄体素和MMP9、TERT、AKT1靶点具有较好的结合力。结论:丹参主要通过调节脂质和动脉粥样硬化、松弛素、脂肪细胞因子、PRL、IL-17、内分泌抗性、TNF、雌激素等信号通路的PTPT11、TERT、STAT3、MMP9、AKT1等靶点治疗特发性耳鸣。

关键词： 旋覆代赭汤   指纹图谱   化学模式识别   网络药理学   质量标志物  

摘要： 目的通过指纹图谱结合化学模式识别以及网络药理学筛选旋覆代赭汤的质量标志物。方法用不同方法制备15批旋覆代赭汤供试品,建立UPLC指纹图谱并进行共有峰指认和相似度评价。运用聚类分析及正交偏最小二乘判别分析等化学模式识别方法对指纹图谱进行研究,寻找造成差异的标志性成分,再运用网络药理学预测标志性成分的作用靶点和通路,构建“成分-靶点-通路”网络图,并进行细胞实验验证,从而筛选出旋覆代赭汤的质量标志物。结果15批旋覆代赭汤中共有23个共有峰,指认出其中16个成分并对其进行归属,化学模式识别分析寻找出4个差异标志性成分。通过网络药理学筛选出这4个成分的20个关键靶点和20条关键信号通路,通过细胞实验,发现旋覆代赭汤可显著抑制脂多糖诱导的巨噬细胞RAW264.7炎症模型中STAT3和JAK2磷酸化,结果表明绿原酸、1,5-二咖啡酰奎宁酸、1-O-乙酰旋覆花内酯、人参皂苷Rb1这4个成分可作为旋覆代赭汤潜在的质量标志物。结论该方法筛选出4个可作为旋覆代赭汤潜在质量标志物的化学成分,为旋覆代赭汤质量标准的建立提供了基础和借鉴,同时也为旋覆代赭汤相关制剂的开发提供参考。

关键词： 药理学   化学知识   教学改革   学科交叉   教学融合  

摘要： 随着药物研发和临床应用的不断深入,药理学作为一门重要的医学基础课程,其教学内容日益丰富和复杂。由于药物的化学结构决定了其药理学特性,将化学知识融入药理学教学中具有重要的意义。文章首先分析了药理学教学中化学知识的重要性和融合的必要性。其次,探讨了如何将化学知识与药理学知识相结合,通过案例教学和实验教学等方式,加深学生对药物的化学结构和药理学特性的理解。最后,提出了在药理学教学中化学知识融合与创新的几点建议:教师应该加强跨学科的合作,将化学知识和药理学知识有机结合,打破学科之间的壁垒,并采用多样化的教学方法,激发学生的学习兴趣和创新能力。

关键词： 网络药理学   中医药   阿尔茨海默病   可视化分析   研究热点  

摘要： 目的:基于网络药理学(NP)分析中医药治疗阿尔茨海默病(AD)的相关文献,梳理该领域的研究热点和发展方向。方法:检索中国知网(CNKI)、中国学术期刊数据库(万方数据)、中文科技期刊数据库(VIP)、PubMed、Web of Science数据库建库至2023年公开发布的NP在中医药领域治疗AD的相关文献。采用NoteExpress 3.6.0对题录进行去重及人工筛选,采用Origin V 9.1绘制发文趋势图,利用CiteSpace 6.2.R4对纳入文献的作者、国家/地区、关键词进行可视化分析。结果:本研究最终纳入中文文献145篇、英文文献164篇,该领域发文量逐年增加,共涉及17个国家/地区的395位作者,形成以周小青、FANG JIANSONG(方坚松)、张宁、CHEN J(陈健)等为代表的研究团队。中、英文关键词分别形成了7个和8个有效聚类,显示该领域研究热点主要集中于筛选技术、物质基础、靶标/信号通路、临床试验等。共被引结果显示该领域高引用文献多集中于数据库功能及中药复方的机理研究。结论:NP在中医药治疗AD的研究热度逐年攀升,开心散、六味地黄汤、当归芍药散、石菖蒲、熟地黄、人参在PI3K/Akt、NF-κB、TLR4等免疫应答、炎性通路方面的研究为目前的热点。今后中医药治疗AD的机制预测和实验验证为未来研究趋势。

关键词： 白花蛇舌草   分子对接   急性髓系白血病   网络药理学   生存分析  

摘要： 目的通过网络药理学、分子对接技术研究白花蛇舌草医治急性髓系白血病(AML)可能的分子学机制。方法依附TCMSP、PubChem数据库收集白花蛇舌草相关化合物成分、靶点、再使用GeneCards和OMMI数据库选出已被证明有关急性白血病的相关靶点,随后取其交集,筛选共有基因,导入Cytoscape软件构建“药物、成分、疾病、靶标”的关系图,然后将交集靶标输入STRING分析平台绘出PPI图谱;其后用R软件对关键靶标进行GO及KEGG过程分析。利用AutoDock软件包进行分子对接,最后通过GEPIA数据库分析核心基因在AML中的表达与预后。结果白花蛇舌草治疗AML的可能作用靶标位置基因共82个,涉及对异种刺激的反应、调节体液水平、创伤愈合等多个过程,且与化学致癌—受体活化作用、脂质和相关动脉粥样硬化、流体剪切应力和乙型肝炎等生物学过程密切相关。白花蛇舌草可能通过对异种刺激的反应、调节体液水平、创伤愈合等过程涉及DNA结合转录因子激活、RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合等分子功能治疗AML,且与化学物质致癌——相关受体激活以及动脉粥样硬化相关通路息息相关。IL6、HSP90AA1、HIF1A、CASP3、ESR1等5个基因在AML中均表达上调,其中IL6、HIF1A表达具有显著差异性;ESR1基因对患者预后有着深远的影响(P<0.01)。结论研究初步揭示了白花蛇舌草是以多成分、多靶点、多通路的复杂形式发挥治疗AML作用,为白花蛇舌草的临床应用提供了理论依据。

关键词： 硬皮病   雷公藤   雷公藤甲素   网络药理学   分子机制  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接对雷公藤治疗硬皮病(sytemic sclerosis,SSc)单体成分及蛋白靶点进行预测及分析,并通过动物实验探究雷公藤对硬皮病(sytemic sclerosis,SSc)产生治疗效果的主要单体成分及其作用机制。方法依托TCMSP、similarity ensemble approach(SEA)平台查找并筛出雷公藤所包含的化学成分及靶点;在TTD、GeneCards、DisGeNET信息库中搜索SSc相关联的基因靶点;利用Venny平台整合雷公藤治疗SSc的潜在靶点;构建蛋白相互作用(PPI)网络;借助Cytoscape 3.8.0软件筛选出雷公藤治疗SSc的主要单体成分和核心作用靶点;将雷公藤治疗SSc的靶点导入Metascape进行GO功能富集分析和KEGG信号通路富集分析;用AutoDock Vina对雷公藤主要单体成分与核心靶点进行分子对接;HE和Masson染色观察雷公藤主要单体成分对SSc小鼠皮肤和肺组织病理学的影响;酶联免疫吸附法(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)检测小鼠血清白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、γ-干扰素(INF-γ)水平;蛋白免疫印迹法分析(western blot,WB)雷公藤主要单体成分对血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor,VEGFA)、细胞肿瘤抗原P53(P53)、前列腺素G/H合成酶2(prostaglandin G/H sgnthase 2,PTGS2)靶点的调控作用。结果共得到雷公藤51个化学活性成分,SSc相关靶点1627个,药物-疾病交集靶点65个,雷公藤治疗SSc的主要单体成分为雷公藤甲素(triptolide,TPL),关键核心靶点为P53、PTGS2、VEGFA;KEGG通路分析表明雷公藤甲素可能通过调控癌症通路抑制新生血管生成、改善炎症及免疫微环境,达到抗SSc的作用。分子对接验证表明雷公藤甲素与核心靶点P53、PTGS2、VEGFA的对接结合活性较高;动物实验结果显示,与模型组比较,雷公藤甲素可明显改善小鼠炎症和纤维化症状、下调P53、PTGS2、VEGFA的表达水平(P<0.05,P<0.01)。结论雷公藤治疗SSc具有多成分—多靶点—多通路的作用特点,其机制可能与雷公藤甲素影响P53、PTGS2、VEGFA等靶点调控癌症信号通路相关。