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关键词： 人参   肝损伤   网络药理学   分子对接  

摘要： 运用网络药理学和分子对接技术研究人参治疗肝损伤的作用机制。查阅文献并利用TCMSP、Uniprot和Swiss Target Prediction等数据库得到人参的活性成分及其作用靶点,并结合OMIM、GeneCards、DisGeNET和TTD等数据库获取肝损伤靶点。通过STRING和Cytoscape构建人参治疗肝损伤的成分—靶点网络图和PPI网络图。使用R语言对交集靶点进行GO和KEGG富集分析,并通过Autodock vina进行分子对接验证。结果表明,人参的活性成分25个,潜在作用靶点129个。GO和KEGG分析表明,人参可能通过对脂多糖的反应和激酶活性的正向调节等生物过程起到治疗肝损伤的作用,通过TNF、AGE-RAGE和细胞凋亡等通路起到治疗肝损伤的作用。网络分析与分子对接结果显示,人参治疗肝损伤的核心成分可能是人参皂苷Rk3、人参皂苷Rh1、人参皂苷CK、山柰酚和β-谷甾醇,涉及的核心靶点是AKT1、NFKBIA、CASP3、VEGFA和STAT3,且核心成分与核心靶点间有较强的结合活性。人参可能通过多成分、多靶点和多通路的方式起到治疗肝损伤的作用,为进一步探究人参治疗肝损伤的理论研究提供参考。

关键词： 还少丹   少弱精子症   网络药理学   分子对接   槲皮素   豆甾醇  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接探讨还少丹治疗少弱精子症的潜在作用机制。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药整合药理学研究平台(TCMIP)获取中药有效成分,利用GEO数据库检索疾病相关基因,将中药基因与疾病基因进行交集分析,使用STRING平台进行PPI蛋白互作网络构建,借助Cytoscape软件对共同基因进行分析,采用R软件对交集基因进行GO功能分析及KEGG通路分析;采用AutoDock Tools、QuickVina-W等软件进行分子对接,验证分析结果的准确性。结果:获得中药有效成分195个,作用基因1101个,药物-疾病交集靶点108个,8个核心药效分子为豆甾醇、槲皮素、黄豆黄素、玉兰脂素B、山柰酚、车叶草苷四乙酸脂、苏齐内酯、过氧麦角甾醇,关键靶点为CDC25A、TOP2A、AURKA、CHEK1、PLK1、KIF11、PLK4、TTK。GO功能结果显示还少丹治疗少弱精子症的生物过程主要富集于磷酸化、激酶活性调节、类固醇代谢、脂质代谢、激素代谢调节等。KEGG通路主要富集于钙信号通路、Rap1、Ras、MAPK、PI3K-Akt、AMPK、FoxO信号通路以及细胞周期、胞葬作用等。分子对接显示核心药效成分与预测作用靶点均有良好的对接活性。结论:还少丹治疗少弱精子症的作用机制可能是通过豆甾醇、槲皮素、黄豆黄素等药效分子,经过钙信号通路、Rap1、Ras等信号通路,作用于CDC25A、TOP2A、AURKA等关键靶点,经过磷酸化、激酶活性调节、类固醇代谢等多个生物过程,最终起到治疗少弱精子症的作用。

关键词： 芍药甘草汤   功能性腹痛   网络药理学  

摘要： 目的:利用网络药理学研究芍药甘草汤治疗功能性腹痛的机制。方法:基于网络药理学,通过多种数据库进行药物化学成分的收集以及核心靶点预测;结合相关软件构建PPI网络、GO富集分析和KEGG通路分析,预测芍药甘草汤治疗儿童功能性腹痛的机制。结果:筛选出芍药甘草汤中102个活性成分,包括甘草酚、芍药苷、甘草吡喃香豆素等,治疗疾病的核心靶点蛋白11个,包含HSP90AA1、AKT1、STAT3等。KEGG通路富集分析得到20条潜在信号通路,主要涉及MAPK信号通路、HIF-1信号通路等。结论:芍药甘草汤治疗功能性腹痛具有多通路、多靶点的特性,可能通过影响MAPK信号通路、HIF-1信号通路,进而达到治疗的目的。Objective: To study the mechanism of Shaoyao Gancao decoction in the treatment of functional abdominal pain using network pharmacology. Methods: Based on network pharmacology, a variety of databases were used to collect chemical components and predict core targets. Combined with relevant software, PPI network, GO enrichment analysis and KEGG pathway analysis were constructed to predict the mechanism of Shaoyao Gancao decoction in the treatment of functional abdominal pain in children. Results: A total of 102 active ingredients in Shaoyao Gancao Decoction were screened, including glycyrol, paeoniflorgenone, licopyranocoumarin, etc., and 11 core target proteins were screened, including HSP90AA1, AKT1, STAT3, etc. KEGG pathway enrichment analysis identified 20 potential signaling pathways, mainly involving MAPK signaling pathway and HIF-1 signaling pathway. Conclusion: Shaoyao Gancao Decoction has the characteristics of multi-pathway and multi-target in the treatment of functional abdominal pain, and may affect the MAPK signaling pathway and HIF-1 signaling pathway to achieve the purpose of treatment.

关键词： 高等药理学   科学思维   研究生教育   教学改革  

摘要： 在“高等药理学”研究生课程中,通过探索基于问题的教学模式(PBL)改革方法,从多方面、多角度激发学生的积极性。在药理学知识的延伸学习中,通过老药新用案例、文献分析讨论交流、临床案例讨论以及反转课堂等环节,全面培养学生科学思维的能力,取得了较好的效果。

关键词： 非酒精性脂肪性肝炎   二月兰籽   网络药理学   脂质代谢   胰岛素抵抗  

摘要： 探究二月兰籽水提物(water extract of Orychophragmus violaceus(L.)*** seeds,OVSWE)治疗非酒精性脂肪性肝炎(nonalcoholic steatohepatitis,NASH)治疗作用及作用机制。采用中国知网(China National Knowledge Infrastructure,CNKI)检索并获取OVSWE活性成分,使用疾病数据库以获取NASH的相关基因。提取OVSWE和NASH的交集靶点,进一步对“药物-潜在活性成分-潜在靶点”网络进行可视化展示。将交集靶点导入STRING数据库以构建蛋白-蛋白相互作用网络;然后进行GO功能和KEGG通路富集分析并可视化,再用Autodock软件实现分子对接模型的构建。最后通过动物实验对网络药理学预测的靶点及通路进行实验验证。网络药理学分析显示OVSWE治疗NASH的核心靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt serine/threonine kinase 1,AKT1)及磷酸肌醇3激酶调节亚基1(phosphoinositide-3-kinase regulatory subunit 1,PIK3R1)等,核心成分有诸葛菜碱A、诸葛菜素B及诸葛菜素C;OVSWE治疗NASH与胰岛素抵抗(insulin resistance,IR)、脂质代谢等相关信号通路关系密切。分子对接结果显示OVSWE中的核心成分与核心靶点AKT1对接良好。OVSWE治疗高脂高糖饮食联合CCl 4诱导NASH大鼠动物实验结果中,通过苏木精-伊红染色(hematoxylin-eosin staining,HE)及天狼猩红染色可观察到OVSWE可缓解肝脏脂质堆积和损伤;生化法检测发现,OVSWE可显著降低肝组织甘油三酯(triglycerides,TG)及低密度脂蛋白胆固醇(low-density lipoprotein cholesterol,LDL-C)含量(P<0.05或P<0.01);大鼠血清葡萄糖(glucose,GLU)、游离脂肪酸(free fatty acid,FFA)、空腹胰岛素含量及IR指数亦显著降低(P<0.05或P<0.01)。非靶向脂质组学分析表明经OVSWE干预后,NASH大鼠多种脂质差异物回调,对其通路富集发现脂质代谢紊乱主要表现在鞘脂代谢及甘油磷脂代谢通路。Western blot结果显示,OVSWE可显著增加肝组织胰岛素受体(insulin receptor,InsR)和p-AKT/AKT蛋白表达水平(P<0.05或P<0.01)。以上发现表明,OVSWE对高脂高糖饮食联合CCl 4诱导的NASH大鼠的治疗可能是通过激活InsR/PI3K/AKT信号通路,改善IR,调节脂质代谢来实现。

关键词： 绝经后冠心病   绝经后骨质疏松   二仙汤   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接技术分析二仙汤治疗绝经后冠心病共病骨质疏松的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台获取二仙汤靶蛋白,从GeneCards和OMMI数据库中获得绝经后骨质疏松与绝经后冠心病相关蛋白,将药物与疾病靶点取交集;通过Cytoscape软件、STRING数据库以及DAVID数据库筛选二仙汤治疗绝经后冠心病共病骨质疏松的关键靶蛋白、靶点以及通路。最后,通过分子对接验证关键靶点与靶蛋白之间的紧密联系。结果:网络药理学研究发现二仙汤治疗绝经后冠心病共病骨质疏松的核心成分为槲皮素、山柰酚、淫羊藿苷、木犀草素、β-谷甾醇、豆甾醇,关键靶点为苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-1β(IL1β)、白细胞介素-6(IL6)、前列腺素G/H合酶2(PTGS2)、转录因子(JUN)、基质金属蛋白酶-9(MMP9)、胱天蛋白酶3(CASP3)、促表皮生长因子(EGF)、血管内皮生长因子A(VEGFA)。京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析发现,二仙汤通过磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)通路、TNF信号通路等发挥对绝经后冠心病共病骨质疏松的治疗作用。分子对接结果显示,关键靶点与关键化合物结合比较稳定。结论:网络药理学方法与分子对接结果显示,二仙汤治疗绝经后骨质疏松与冠心病呈现多靶点、多路径协同作用,二仙汤可通过PI3K-AKT通路、MAPK通路、TNF信号通路等多种途径发挥抗绝经后冠心病共病骨质疏松的作用。

关键词： 甲状腺功能亢进症   富碘中药   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:利用UPLC-Q-TOF-MS及网络药理学与分子对接研究四海舒郁丸治疗甲状腺功能亢进症(以下简称甲亢)的物质基础和作用机制。方法:通过UPLC-Q-TOF-MS鉴定四海舒郁丸的活性成分,以口服生物利用度(OB)、类药性(DL)作为参数通过TSMSP数据库进行筛选,利用PubChem数据库下载符合标准的活性成分的sdf文件,通过SwissTargetPrediction数据库预测各活性成分作用靶点。通过OMIM、DisGenet、DrugBank、GeneCards数据库检索甲亢的疾病相关靶点。取药物靶点和疾病靶点的交集作为潜在靶点,并在STRING数据库中获得靶点-蛋白质相互作用网络图,导入Cytoscape软件获得关键靶点和有效成分,并进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,最后利用分子对接进行验证。结果:共得到50种中药活性成分,其与甲亢有162个交集靶点。利用Cytoscape软件插件获得蛋白酪氨酸磷酸酶非受体11型(PTPN11)、胰岛素样生长因子1受体(IGF1R)、磷脂酰肌醇4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(PIK3CA)、表皮生长因子受体(EGFR)、蛋白激酶B1(AKT1)等12个四海舒郁丸中治疗甲亢的核心靶点。富集分析结果表明,四海舒郁丸通过磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B信号通路、缺氧诱导因子1信号通路起到治疗甲亢的作用,而分子对接结果显示去氧地胆草素、黄柏酮、氧化小檗碱等与核心治疗靶点的分子结合力较强,为四海舒郁丸治疗甲亢的重要物质基础。结论:四海舒郁丸治疗甲亢的作用机制可能是其有效成分通过调节多个甲亢相关靶点,进而介导多条信号通路,从而治疗疾病。

关键词： 网络药理学   六味地黄丸   骨髓增生异常综合征   作用机制  

摘要： 本文旨在运用网络药理学方法筛选六味地黄丸治疗骨髓增生异常综合征(MDS)的有效成分,并探讨其潜在作用机制。方法 通过TCMSP检索并整理六味地黄丸的主要活性成分,并通过SwissTargetPredicition、UniProt数据库筛选活性成分相对应的靶点;通过GeneCards和OMIM数据库收集整理MDS相关的疾病靶点;利用STRING平台构建六味地黄丸-MDS交集靶点的蛋白质互作(PPI)网络图,提现交集靶点之间的相互作用关系;利用Cytoscape3.10.3软件构建成分-靶点-通路网络图,通过该网络图筛选出治疗的核心靶点。最后,对六味地黄丸-MDS的交集靶点进行富集分析包括GO功能富集分析和KEGG通路富集分析。结果 通过一系列的筛选和分析,得到六味地黄丸的有效活性成分68个,这些成分对应的药物靶点共有674个,与MDS相关的疾病靶点4859个,并从中筛选出六味地黄丸-MDS交集靶点288个,其中核心靶点57个,主要为AKT1、TNF、EGFR、BCL2、SRC等。KEGG通路富集分析揭示了信号通路主要涉及癌症通路、PI3K-Akt信号通路、癌症中的蛋白聚糖等传导途径。结论 六味地黄丸可能通过多成分、多靶点、多通路的协同作用对MDS产生治疗效果,为后续的临床研究提供了科学依据。

关键词： 芪蛭通窍胶囊   前列通窍胶囊   良性前列腺增生   勃起功能障碍   异病同治   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学、分子对接技术探讨芪蛭通窍胶囊(QTC)“异病同治”良性前列腺增生(BPH)和勃起功能障碍(ED)的作用机制。方法基于TCMSP、BATMAN、PubChem及Swiss Target Prediction数据库搜集、获取QTC的活性成分及相应靶点、GeneCards数据库预测BPH和ED靶点基因,利用Venny 2.1获取交集靶点、Cytoscape 3.10.0构建“药物-成分-靶点-疾病”可视化网络图,基于STRING数据库构建PPI网络后导入Cytoscape 3.10.0输出核心靶点、Metascape数据库进行GO功能及KEGG通路富集分析,最后进行分子对接测试。结果共获得QTC活性成分70个,包括西红花酸、枸杞醇、3,9-二-O-甲基尼索林、槲皮素、山奈酚等;“药物-疾病”交集靶点146个。QTC可能作用于丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、白细胞介素-6(IL6)、雌激素受体(ESR1)通络信号转导和转录激活因子3(STAT3)、肿瘤坏死因子(TNF)、Jun转录因子(JUN)、细胞凋亡调节因子(BCL2)、半胱天冬酶-3(CASP3)等多个靶点,调控NF-κB信号、糖尿病并发症、钙离子等相关多条信号通路。分子对接结果表明槲皮素与核心靶点对接程度较好。结论QTC可能基于AKT1、IL6、ESR1、STAT3、TNF、JUN、BCL2、CASP3等靶点,通过调控NF-κB信号通路、糖尿病并发症相关途径以及钙离子信号通路等相关途径对BPH和ED发挥异病同治作用,但尚需在进一步研究中予以验证。

关键词： 毡毛马兰挥发油   免疫性肝损伤   GC-MS   网络药理学  

摘要： 目的:明确毡毛马兰挥发油的活性成分,并进一步探讨毡毛马兰挥发油对免疫性肝损伤的潜在作用机制。方法:采用水蒸气蒸馏法分别提取毡毛马兰地上部分以及根部挥发油,用Griess试剂法检测抗炎活性;用气相色谱-质谱联用(GC-MS)分析毡毛马兰挥发油的组成成分,再通过网络药理学探究毡毛马兰挥发油对免疫性肝损伤的保护机制。结果:毡毛马兰挥发油在体外实验中显示出了一定的抗炎活性。对毡毛马兰挥发油进行成分分析,发现地上部分挥发油中含90种成分,根部挥发油含有65种成分,其中共有成分23种。将分析出的化学成分进行网络药理学分析,其发挥治疗免疫性肝损伤作用的“成分-靶点-信号通路-疾病”网络包含18个活性成分和265个药物靶点。通路富集分析得到159条信号通路。分子对接结果表明3,7,11-三甲基-1,6,10-十二烷三烯-3-醇乙酸酯、美雄酮、2-甲氧基-4-丙基-苯酚等成分可能与核心靶点AKT1、IL-6、EGFR、SRC、VEGFA等具有较好的结合能力,初步验证了网络药理学预测结果的准确性。结论:毡毛马兰挥发油可能通过多成分、多靶点、多通路协同发挥对免疫性肝损伤的保护作用。