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关键词： 数据图表   复制粘贴   化学结构式   图数据   作图软件   典型病变   电泳图   双击  

摘要： 1.论文中的病理照片、电泳图及化学结构式图等要求以“插入”→“图片”方式插入word文档,不要使用复制粘贴。病理照片必须加标尺,并以箭头指示典型病变位置。除照片外,其他图尽量不用彩色。2.统计的数据图表(包括线图和柱图等)一般通过“插入”→“图表”方式插入word文档,双击该图即可直接进入此图的作图软件,看到作图数据。

关键词： 冠状动脉粥样硬化   急性心肌梗死   黄连   川芎   作用机制   网络药理学   活血解毒  

摘要： 目的:基于网络药理学方法与分子对接技术,探究活血解毒中药药对黄连-川芎治疗冠状动脉粥样硬化(CAS)和急性心肌梗死(AMI)作用机制的差异性,为活血解毒中药在冠心病不同阶段的应用提供理论依据。方法:通过基因表达综合数据库(GEO)获得CAS和AMI的差异基因,并进行GEO差异分析。从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)搜集黄连、川芎中主要活性成分和筛选预测靶点。根据药物作用靶点,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图并进行拓扑分析,再利用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。采用Schrodinger软件将中药主要活性成分分别与CAS和AMI的关键蛋白进行分子对接。结果:黄连-川芎治疗CAS和AMI的活性成分基本相同。PPI网络拓扑分析显示,治疗CAS有17种靶蛋白,治疗AMI有37种靶蛋白,两者共有16个相同的靶蛋白,而AMI多出了21个特有靶蛋白等,表明在AMI时,黄连-川芎能在调控CAS相关靶点基础上进一步作用于新的靶点。GO富集分析显示黄连-川芎通过不同的生物过程干预CAS和AMI。KEGG富集分析发现CAS相关通路为22条,而AMI相关通路为90条,两者共有通路17条,但在CAS和AMI中的富集程度存在差异;而AMI特有的通路有73条,主要为肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、核转录因子-κB(NF-κB)信号通路等,涉及多个炎症相关通路;表明中药黄连和川芎能够在调控CAS相关通路的基础上,进一步调控AMI时的特有通路。分子对接结果显示,主要化合物和靶点能很好地结合,支持网络药理学结果。结论:本研究阐释了黄连-川芎基于多化合物、多靶点、多途径治疗CAS和AMI的可能作用机制及两者的差异性,发现黄连-川芎可以在调控CAS和AMI共有靶点和通路的基础上,进一步作用于AMI发生时出现的特有蛋白和通路,揭示了在冠心病不同阶段活血解毒中药黄连-川芎作用的不同机制,从药理学层面完善了冠心病的“瘀毒”理论。

关键词： 甲型流感病毒   天名精   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学方法对天名精(CAL)抗甲型流感病毒(IAV)潜在化学成分、靶点及作用机制进行分析研究,为后续开发CAL提供参考依据。方法:从中国知网(CNKI)等数据库收集自1988年1月1日至2023年2月25日分离鉴定的CAL化学成分,在SwissTargetPrediction平台预测成分靶点。在GeneCards和OMIM平台收集IAV靶点,导入jvenn取交集基因。利用Cytoscape 3.8.2软件构建CAL-活性成分-IAV网络,在STRING平台分析蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)关系。结合运用DAVIED数据库和微生信平台进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用Autodock与Pymol软件将关键药物成分与核心靶点进行分子对接。结果:筛选获得主要潜在活性成分27种,潜在靶点468个,CAL与IAV交集靶点175个。GO功能分析获得97个细胞组分、664个生物过程和150个分子功能;KEGG通路富集分析获得CAL抗IAV信号通路共168条,包括高糖基化终产物-高糖基化终产物受体(AGE-RAGE)、癌症和IAV等通路。分子对接结果显示在前五种核心成分里面,熊果酸与丝裂原活化蛋白激酶(MAPK1)、淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶(LCK)、磷酸肌醇3-激酶调节亚基1(PIK3R1)、磷脂酰肌醇4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(PIK3CA)、非受体型酪氨酸蛋白激酶2(JAK2)、丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)有更高结合亲和力。结论:CAL作用于IAV可能涉及多成分、多靶点、多通路共同参与,通过网络药理学分析为CAL抗IAV进一步研究提供思路和方法,为新型抗甲流药物研发提供依据。

关键词： 扶正感康丸   新型冠状病毒感染   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接探讨扶正感康丸治疗新型冠状病毒感染的作用机制。方法:通过检索TCMSP及HERB数据库获取扶正感康丸6味核心药物的有效成分及作用靶点;分别在Genecards数据库、国家生物技术信息中心数据库(national center for biotechnology information,NCBI)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)数据库检测新型冠状病毒感染相关疾病靶点,并取其与活性成分的交集靶点。采用STRING数据库对交集靶点进行蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析,并采用Cytoscape软件对PPI网络进行分析筛选核心靶点。通过Metascape数据库对交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析和KEGG信号通路富集分析。通过检索BioGPS及Genecards数据库获取关键通路涉及的靶点的组织分布及亚细胞定位数据。采用AutoDock Vina1.1.2对关键有效成分和核心靶点进行分子对接。结果:扶正感康丸6味核心药物共含活性成分85个,相关靶点226个。检索Genecards、NCBI及KEGG数据库获得新型冠状病毒感染疾病靶点3510个,与活性成分相关靶点取交集,得到86个交集靶点。槲皮素、山柰酚、豆甾醇等为核心成分。PPI网络分析得到白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、IL-1β、肿瘤蛋白p53(tumor protein p53,TP53)、JUN、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)、IL-10等为关键靶点。GO富集分析显示,扶正感康丸的6味核心药物主要参与细胞因子反应、细胞分化负调节、炎症反应(inflammatory response)、凋亡信号通路的调控等生物过程,膜筏、膜侧、囊腔等细胞组分及RNA聚合酶II特异性DNA结合转录因子结合、蛋白质同源二聚化活性等分子功能。KEGG共富集得到191条信号通路,其中血脂和动脉粥样硬化、糖尿病并发症的AGE-RAGE信号传导途径、MAPK信号通路、NF-kappa B信号通路等6条通路为关键信号通路。关键通路中的关键基因靶点主要分布在平滑肌、肺等;亚细胞定位分析显示主要分布于细胞核、细胞膜、细胞质、细胞外、细胞骨架、线粒体、内质网等。分子对接显示,扶正感康丸中有效成分与核心靶点之间的结合能力较好。结论:扶正感康丸可能通过核心成分槲皮素、汉黄芩素等作用于IL-6、IL-1β和TNF等核心靶点调节NF-κB、PI3K/AKT等信号通路干预炎症反应、免疫反应、组织重塑、细胞凋亡等生物学进程,从而治疗新型冠状病毒感染。

关键词： 免疫药理学   免疫学   药理学   教学改革   课程建设  

摘要： 免疫药理学涵盖免疫学和药理学,是一门快速发展和逐渐兴起的混合学科。《免疫药理学》课程近年来也逐渐在医学院校推广,旨在培养医学生了解药物与免疫及免疫相关疾病的相互作用规律。然而免疫药理学涉及领域广泛,教材和教学内容无法满足该学科发展的需要,因此本文旨在对本学科的教学改革提供一些探索思路。通过分析本校开设的《免疫药理学》课程及其中的“免疫抑制药物”章节,结合本学科跨领域交叉的特点,初步探索通过更新教学内容、增加科研实验及临床实践课程等教学改革策略,从而培养学生的实践创新能力,以期为高校提高教学质量提供借鉴。

关键词： 灵芝酸   阿尔茨海默病   网络药理学   PI3K   AKT   信号通路  

摘要： 目的 利用网络药理学技术确定灵芝酸治疗阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease, AD)的相关靶点,探讨灵芝酸治疗AD的潜在机制。方法 采用Swiss Target Prediction药物靶点预测平台预测灵芝酸的靶点,并借助Disgenet数据库、Drugbank数据库和Genecards数据库检索AD的相关靶点;将化合物靶点与疾病靶点作交集得到灵芝酸作用于AD的潜在靶点。进一步使用STRING平台构建蛋白质相互作用(protein-protein interactions, PPI)网络,并通过网络拓扑分析筛选核心靶点;Bioconducter生物信息软件包对交集靶点进行GO与KEGG功能富集分析,筛选出灵芝酸与AD关联程度较高的信号通路。最后通过细胞实验,验证其中富集程度最高的靶点,进一步明确灵芝酸作用于AD的核心靶点。结果 从数据库中共获得灵芝酸与AD靶点1 211个,其中共同靶点56个。PPI网络拓扑分析发现,AKT1、ALB、MAPK3、CASP3、TNF等是灵芝酸治疗AD的关键靶点。KEGG通路富集分析结果显示,灵芝酸治疗AD的通路涉及AD、神经变性途径、人巨噬细胞感染途径、卡波西氏肉瘤相关疱疹病毒感染途径等。细胞实验验证发现,灵芝酸A的最佳给药浓度为50μmol/L,可以通过抑制p-PI3K和p-AKT的表达,保护受Aβ25-35毒性损伤的PC12细胞。结论 灵芝酸可能通过关键蛋白和重要通路达到靶向治疗AD的作用。

关键词： 膀胱癌   丹参   FASN   网络药理学  

摘要： 目的应用网络药理学思路与方法研究丹参的有效成分及潜在分子靶点,揭示丹参治疗膀胱癌的分子机制。方法研究时间为2022年1月至2023年6月。基于中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)分析丹参中生物利用度(OB)≥30%,类药性指数(DL)≥0.18的活性成分,进而获得活性成分的下游靶点进行基因本体论(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集分析,并纳入癌症基因图谱(TCGA)数据库中膀胱癌数据集进行风险回归分析,结合风险基因表达水平与生存预后信息筛选丹参在膀胱癌中的潜在治疗靶点,并在膀胱癌细胞系中进行验证与体外治疗实验。结果丹参中65个活性成分可作用于下游270个靶蛋白,其功能富集分析集中在氮代谢、膀胱癌、内分泌抵抗、前列腺癌、神经活性配体-受体相互作用等通路上,提示丹参具备治疗膀胱癌的潜力,膀胱癌患者测序数据显示其中44个基因在膀胱癌中具有预后价值(P<0.05),研究进一步基于其中18个基因成功构建了风险回归模型[曲线下面积(AUC)=0.819],结合基因在癌与癌旁中的表达水平筛选获得MMP9、MAOA、PSMB5、HCAR及脂肪酸合成酶(FASN)作为丹参治疗膀胱癌的分子靶点,其中的FASN风险系数最高(core=0.007412)。细胞实验表明FASN在膀胱癌细胞系J82中表达明显增高,而经过丹参(IC50=10 mg/L)处理后,膀胱癌细胞的增殖、侵袭及迁移能力均明显减弱,且FASN蛋白也表达减少。结论本研究揭示了丹参的有效活性成分及其治疗膀胱癌的分子靶点,为临床应用丹参治疗膀胱癌提供了必要的实验依据与理论基础。

关键词： 桃仁-红花   药对   网络药理学   动脉粥样硬化   分子对接  

摘要： 利用网络药理学方法探讨“桃仁-红花”药对抗动脉粥样硬化的作用机制。方法 在TCMSP、SEA、Genecards数据库中获取“桃仁-红花”药对有效成分、靶点及疾病靶点,Cytoscape绘制药对活性成分-交集靶点的网络图,STRING平台构建交集靶点的蛋白质互作网络,omicsharetools平台对交集靶点进行GO二级注释及KEGG通路富集分析,利用分子对接软件Autodock vina将核心靶点和主要活性成分进行分子对接验证。结果 筛选得到22个“桃仁-红花”药对活性成分,其中与动脉粥样硬化的交集靶点114个。木犀草素、槲皮素、黄芩素、山奈酚等是“桃仁-红花”药对抗动脉粥样硬化主要活性成分,PPI提示蛋白激酶B(AKT)1、血管内皮生长因子(VEGFA)、表皮生长因子受体(EGFR)、基质金属蛋白酶(MMP)9、人雌激素受体(ESR)1等可能是桃仁-红花”药对抗动脉粥样硬化的核心靶点。GO、KEGG富集分析显示:生物过程主要涉及单一生物过程、细胞过程、代谢过程等,信号通路主要涉及Th17细胞分化、流体剪切应激和动脉粥样硬化、MAPK信号通路等。分子对接验证核心靶点和主要成分之间具有优秀的结合活性。结论 桃仁-红花药对以木犀草素、槲皮素、黄芩素、山奈酚等主要活性成分,通过多通路、多靶点、多通路抗动脉粥样硬化。

关键词： 丹栀逍遥方   入血成分   围绝经期抑郁症   UPLC-Q-TOF-MS E   作用机制   网络药理学  

摘要： 该研究采用超高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱法(UPLC-Q-TOF-MS E),对丹栀逍遥方在大鼠灌胃给药后体内血中移行成分进行分析,通过比较复方提取物、给药后含药血清及空白血清成分,从大鼠血清中发现入血成分共49个,其中首次在血清中发现的有6-羟基香豆素、茯苓新酸F、去氧甘草内酯、30-降常春藤皂苷元、kanzonol R、3′,6′-di-O-galloylpaeoniflorin、16α-hydroxytrametenolic acid、16-deoxyporicoic acid B、3-O-acetyl-16α-hydroxytrametenolic acid、16α,25-dihydroxydehydroeburiconic acid。并通过悬尾实验、新物体识别实验、新奇抑制摄食实验进行行为学检测分析,证实该方剂具有治疗围绝经期抑郁症的作用,进一步结合网络药理学方法,筛选出MAPK1、HRAS、AKT1、EGFR、ESR1等53个核心靶点,参与PI3K-AKT、AMPK、VEGFA、MAPK、HIF-1等165条信号通路。综合显示,丹栀逍遥方治疗围绝经期抑郁症的潜在作用与加快炎症修复、改善神经可塑性、影响神经递质、调节雌激素水平、促进新生血管形成等作用机制有关。

关键词： 川楝子   肝毒性   网络药理学   分子对接   PI3K/Akt信号通路  

摘要： 目的通过网络药理学及分子对接技术探究川楝子肝毒性机制。方法通过TCMSP、PubChem、SwissADME数据库及文献检索筛选川楝子的潜在毒性成分,利用SwissTargetPrediction数据库预测潜在毒性成分的作用靶点,再通过GeneCards数据库搜索与肝脏损伤相关的靶点,将毒性成分预测靶点与肝脏损伤靶点取交集靶点,获得毒性成分肝脏潜在作用靶点,再利用软件Cytoscape 3.8.2版进行毒性成分–预测靶点、毒性成分–潜在作用靶点、蛋白相互作用(PPI)网络、毒性成分–潜在作用靶点–核心通路网络的构建,采用AutoDock 1.5.6版进行分子对接,并应用PyMOL软件对对接结果进行可视化示例。结果筛选得到6个川楝子潜在毒性化合物,分别是toosandanin、meliasenin B、trichilinin D、1-O-tigloy-1-O-debenzoylohchinal、butenolide、5-hydxoymethylfurfural,与肝脏损伤共同作用靶点103个。GO和KEGG结果显示,川楝子通过蛋白质磷酸化、凋亡过程的负调控、对异种生物刺激的反应、酶激活的正向调控等过程引起肝脏毒性。分子对接结果显示,川楝子中toosandanin、trichilinin D、1-O-tigloy-1-O-debenzoylohchinal与关键靶点具有较好的结合能力。结论应用网络药理学及分子对接技术对川楝子致肝毒成分、机制、靶点、通路进行了初步探索,为进一步对川楝子的临床应用研究和效应机制提供数据支持。