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关键词： 糖尿病肾病   糖肾安方   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的 基于网络药理学和分子对接技术探讨糖肾安方治疗糖尿病肾病的物质基础和作用机制。方法 运用TCMSP检索糖肾安方组方药物的活性成分及对应靶点,检索OMIM、GeneCards、TTD、PharmGKB、DisGeNET数据库获得糖尿病肾病相关靶点,运用Cytoscape3.6.1软件构建“糖肾安方-活性成分-潜在靶点”网络。通过STRING数据库及CytoNCA插件构建糖肾安方治疗糖尿病肾病的蛋白质-蛋白质相互作用网络。采用R语言软件ClusterProfiler、Bioconductor等程序包对潜在靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析,并进行分子对接验证。结果 获得糖肾安方治疗糖尿病肾病的核心成分为槲皮素、山柰酚、淫羊藿苷元、豆甾醇,核心作用靶点包括PTGS2、PPARG、JUN、CASP3等。KEGG富集通路包括糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路、血脂和动脉粥样硬化相关通路、流体剪切力及动脉硬化通路、炎症与缺氧多条相关通路。分子对接结果显示,糖肾安方活性成分与核心靶点有较好的结合能力。结论 糖肾安方治疗糖尿病肾病的作用机制可能与调控炎症、改善糖基化终产物、减少脂肪堆积、调节葡萄糖稳态等有关。

关键词： 网络药理学   复方枳实薤白桂枝汤   心胃同治  

摘要： 基于网络药理学方法研究枳实薤白桂枝汤心胃同治的作用机制。方法 利用TCMSP V2.0 的中药材数据库和中药成分数据库,OMIM数据库、SWISS数据库、GENECARDS数据库及STRING11.0 数据库构建可视化的“中药-化学成分-核心靶标-关键通路”的多层次关联整合网络。结果 共收集化学成分224个,经ADME筛选后,成分-靶标共46个。富集心血管疾病相关的靶标的信号通路有:钙离子信号通路、肾素-血管紧张素系统、扩张型心肌病、花生四烯酸代谢通路、炎症通路和心肌收缩等通路。涉及的生物进程有:细胞增殖、程序性细胞坏死、细胞凋亡、整体系统等。结论 枳实薤白桂枝汤主要从炎症进程、心脏收缩、多靶标参与的生物过程方面起到“心胃同治”的作用。

关键词： 栀子   脑缺血再灌注损伤   铁死亡   网络药理学  

摘要： 目的采用网络药理学方法探究栀子调控铁死亡治疗脑缺血再灌注损伤(CIRI)的分子机制。方法采用中药系统药理数据库及分析平台(TCMSP)获取栀子有效活性成分及其预测靶点,利用基因卡(GeneCards)数据库收集获取CIRI的基因靶点,通过韦恩图工具获得栀子有效活性成分和CIRI的交集基因。利用Cytoscape 3.9.1软件构建栀子、活性成分以及预测靶点间的相互关系网络图。应用R语言软件对“栀子-CIRI”交集基因进行基因本体(GO)富集和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析。使用铁死亡FerrDb数据库,收集铁死亡的相关基因,对栀子活性成分、CIRI、铁死亡三者间的公共靶点进行综合分析并预测栀子调控铁死亡干预CIRI的有效成分及靶点。结果从栀子中筛选出有对应基因靶点的65个有效活性成分进行相关预测,得到缺氧诱导因子RE-1亚基α(HIF-1α)、肿瘤蛋白P53(TP53)、丝裂原活化蛋白激酶8(MAPK8)、血红素加氧酶1(HMOX1)、一氧化氮合酶2(NOS2)、核因子κB(NF-κB)亚基-RELA原癌基因(RELA)、白细胞介素-6(IL-6)等24个栀子调控铁死亡干预CIRI的可能作用靶标,介导HIF-1、肿瘤坏死因子(TNF)、MAPK和Toll样受体信号通路等途径调控铁死亡过程,从而对CIRI损伤产生治疗作用。结论栀子可能通过调控铁死亡途径治疗CIRI。

关键词： 表没食子儿茶素没食子酸酯   溃疡性结肠炎   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:预测表没食子儿茶素没食子酸酯(EGCG)缓解溃疡性结肠炎(UC)的可能的作用靶点及机制。方法:利用SwissTargetPrediction数据库和中药系统药理数据分析平台(TCMSP)检索EGCG相关靶基因。从GeneCards、DisGeNET、TTD和PharmGkb数据库中获得UC相关靶基因。将UC和EGCG相互作用的靶点进行差异分析、GO功能注释和KEGG通路富集分析。借助STRING数据库获取交集靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,并通过Cytoscape 3.7.1软件进行可视化及拓扑学分析获得潜在关键靶点。筛选出的关键靶点通过PyMOL、AutoDock Vina等软件进行分子对接验证。结果:筛选出52个EGCG相关UC的靶基因。GO功能注释得到1928个条目,如细胞增殖、氧化应激反应等。KEGG富集分析得到147个条目,如脂质与动脉硬化、PI3K-AKT Signaling Pathway、MAPK Signaling Pathway等通路。通过分子对接验证,发现EGCG与7个关键靶基因MAPK1、FOS、JUN、AKT1、TNF、HIF1A、RELA具有较强的结合能力。结论:EGCG通过调节多靶点、多信号通路作用UC。

关键词： 火炭母   凤尾草   溃疡性结肠炎   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的 探索中药火炭母、凤尾草治疗溃疡性结肠炎(UC)的有效成分及其作用机制。方法 通过检索文献收集火炭母、凤尾草的主要成分,通过TCMSP、SwissADME数据库对成分进行筛选,SwissTargetPrediction数据库获得活性成分的作用靶点;使用Cytoscape3.9.1构建“成分-靶点”网络,筛选核心成分。通过GeneCards、OMIM数据库筛选UC靶点;使用STRING数据库、Cytoscape3.9.1软件构建交集靶点蛋白相互作用网络;应用DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析。通过AutoDock软件对核心成分与核心靶点进行分子对接验证。结果 得到火炭母、凤尾草23个活性成分,其中木犀草素、山柰酚、槲皮素、异鼠李素、芹菜素等为其抗UC核心成分。得到火炭母-凤尾草抗UC潜在靶点146个,核心靶点涉及MAPK3、SRC、MAPK1、AKT1、LCK等。GO功能及KEGG通路富集分析结果显示,火炭母-凤尾草抗UC作用机制主要与癌症通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂、PI3K-Akt通路、HIF-1通路、MAPK通路有关。分子对接显示,火炭母-凤尾草核心成分与核心靶点结合较好。结论 火炭母、凤尾草可通过MAPK3、SRC、MAPK1、AKT1、LCK等靶点作用于EGFR、癌症通路、PI3K-Akt、MAPK信号通路等,发挥抗炎作用。

关键词： 网络药理学   丹七片   急性心肌梗死   作用机制   靶点   通路   富集分析  

摘要： 目的 利用网络药理学方法探讨丹七片治疗急性心肌梗死的物质基础及作用机制。方法 检索TCMSP获得丹七片组方药物的活性成分和作用靶点。通过SwissTargetPrediction数据库检索丹七片药物靶点。利用UniProt数据库对药物靶点进行规范化处理。在DrugBank、DisGeNET数据库筛选急性心肌梗死相关靶点。通过STRING数据库进行靶点蛋白相互作用关系分析,构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。利用DAVID数据库对疾病和药物的交集靶点进行GO功能富集分析,利用KEGG Mapper平台进行KEGG通路富集分析,运用Cytoscape3.8.0进行可视化处理和网络拓扑结构分析。结果 获得丹七片42个活性成分,核心成分包括丹参酮、木犀草素、槲皮素等,获得急性心肌梗死166个靶点,获得丹七片治疗急性心肌梗死的核心靶点23个,包括CES1、MMP9、MMP2、PTGS2等。GO功能富集结果显示,丹七片在生物过程、分子功能、细胞组分等多方面影响急性心肌梗死的发生和发展。KEGG通路富集主要涉及血管直径的调节通路、蜕膜化通路、血管内皮生长因子刺激的细胞反应等通路。结论 丹七片可能通过多成分、多靶点和多通路协同作用,发挥降低心肌内皮细胞炎性反应、减轻缺血再灌注损伤等作用,从而治疗急性心肌梗死。

关键词： 广州中医药大学   中药药理学   中西医并重   中医药发展   西医药   结构生物学   作用靶点   现代科学  

摘要： 我国《“十四五”中医药发展规划》明确提出:坚持中西医并重,传承精华、守正创新,推进中医药和现代科学相结合,推动中医药和西医药相互补充、协调发展。来自广州中医药大学中药学院的研究员王彩艳近年来深耕中药药理学与结构生物学,聚焦中药苯丙素类成分作用靶点的确证及机制解析,走的正是一条守正创新、补充协调之路。她带着结构生物学的学科背景,不断深入中药药理学研究,坚持不懈地引入、运用新技术和新方法,蹚出了一条交叉、创新、融合的关于中药抗炎的结构药理学之路。

关键词： 经络舒宁   2型糖尿病   DPN   网络药理学   潜在靶点  

摘要： 目的:基于网络药理学和动物实验探讨经络舒宁胶囊治疗糖尿病周围神经病变(DPN)的相关分子机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台查找经络舒宁胶囊组方中各药味所含的活性成分及对应靶点基因,通过Gene Card等数据库收集DPN的相关疾病靶点基因,Venny 2.1软件获取成分–疾病靶点交集基因,STRING数据库进行蛋白互作(PPI)分析获得核心靶点,利用Metascape数据库进行GO和KEGG富集分析。以2型糖尿病大鼠模型观察经络舒宁胶囊对DPN的治疗作用。结果:数据库检索并筛选得到经络舒宁有效成分41种、潜在靶点584个,DPN疾病相关靶点1869,成分–疾病交集靶点191个,核心靶点36个。GO富集分析得到激素水平调节、磷酸化正调节等分子功能条目,KEGG富集分析结果显示潜在靶点在AGE-RAGE糖尿病并发症、2型糖尿病等信号通路上富集。动物实验表明,与模型组相比,经络舒宁能降低糖尿病大鼠的压痛阈值和甩尾温度阈值,延缓糖尿病大鼠坐骨神经传导速度的减慢,减轻坐骨神经的病理变化。结论:经络舒宁胶囊具有多种活性成分,通过多靶点和多通路改善周围神经功能,进而发挥治疗DPN的作用,动物实验也验证了经络舒宁胶囊对DPN大鼠具有一定的治疗效果。

关键词： 职业教育   药理学   课程思政  

摘要： 落实立德树人根本任务,应注重价值塑造、知识传授和能力培养的融合。对高职院校药理学课程思政进行研究,提出课程思政元素挖掘、教学设计、教学评价等方面的建议,实践出药理学课程思政教学改革的有效路径。

关键词： 帕金森病   半夏-陈皮-茯苓   网络药理学   作用机制预测  

摘要： 目的:基于网络药理学探究半夏-陈皮-茯苓治疗帕金森病的作用机制。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取药物有效成分并预测靶点。获取2D结构图,并录入Phrammarpper数据库获得成分靶点。使用PharmGKb数据库、GeneCard数据库、DrugBank数据库、Therapeutic Target Database数据库预测疾病靶点。使用Venny 2.1在线制作平台获取药物疾病交集靶点。使用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络。使用R语言和Cytoscape软件中CytoNCA APP获取核心靶点。通过R语言中BiocManager包和OrgDb包等和R Studio软件进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析。使用Cytoscape软件建立“药物-成分-靶点-通路”网络关系图。结果:获得药物核心成分8个,核心靶点11个。GO富集共得到1 959条项目,包括生物进程1 731条、细胞组分80条、分子功能148条。京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集结果主要包括磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase, PI3K)-蛋白激酶B(Akt)、环磷酸腺苷(Cyclic Adenosine Monophosphate,cAMP)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)、白细胞介素(Interleukin,IL)-17、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)等信号通路。结论:半夏-陈皮-茯苓具有多种成分、多个靶点、多条通路治疗帕金森病的特点,为治疗帕金森病提供了基础研究。