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关键词： 川贝母   百部   网络药理学   分子对接   慢性阻塞性肺疾病  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探讨川贝母-百部药对干预慢性阻塞性肺疾病(COPD)药效物质、作用靶点与潜在机制。方法分别从TCMSP、Gene Cards、OMIM和Drug Bank收集川贝母与百部活性成分、COPD相关靶点,取二者交叠基因并采用STRING数据库构建蛋白相互作用网络。通过Metascape数据库进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后,利用SwissDock平台对潜在药效物质和关键靶点进行分子对接。结果共筛选出活性成分36个、关键靶点30个。GO富集到20个生物过程、10个分子功能、5个细胞组分,KEGG通路富集到61条信号通路,涉及细胞凋亡、氧化及炎症反应等通路。分子对接结果显示,潜在药效物质beta-sitosterol、7-methoxy-3-methyl-2,5-dihydroxy-9,10-dihydrophenanthrene、formononetin与关键靶点半胱氨酸蛋白酶(CASP)3、糖皮质激素受体(NR3C1)、前列腺素合成酶(PTGS)2、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)14和c-Jun氨基端激酶(JNK)对接结果能量低于-5 kcal/mol,表明两者结合活性较好。结论揭示了川贝母-百部药对治疗COPD的潜在药效物质和关键靶点,为其后续临床应用和基础研究提供依据。

关键词： 黄芪   抗肝癌机制   PI3K-AKT信号通路   网络药理学   细胞实验   靶点   拓扑分析   分子对接  

摘要： 目的:从细胞实验和网络药理学探讨黄芪对肝癌的作用机制。方法:通过国家知识基础设施数据库(CNKI)、PubMed、中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GeneCards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)检索黄芪和肝癌的相关基因靶点及活性成分。通过STRING数据库和Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)和黄芪-肝癌作用网络。以DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,并以CB-DOCK平台进行分子对接。细胞实验采用MTT法和蛋白质印迹法检测细胞增殖和蛋白表达。结果:筛选出黄芪19个有效成分,250个靶点。GO和KEGG富集分析得549个条目,145条信号通路,主要涉及调节DNA的转录,对细胞增殖和凋亡的调控等。作用通路主要涉及肿瘤相关的通路,如癌症通路、脂质和动脉粥样硬化、卡波西肉瘤、PI3K-AKT信号通路等。分子对接结果显示黄芪抗肝癌核心成分芒柄花黄素,毛蕊异黄酮,黄芪甲苷与PI3K-AKT信号通路蛋白有较好的结合力。网络药理学分析结果基础上,进一步细胞实验证实黄芪水提液能有效抑制HepG2细胞增殖,下调AKT1、PI3K p110,p-AKT1的蛋白表达水平。结论:黄芪能抑制PI3K-AKT信号通路,发挥对肝癌细胞的抑制作用,为其应用于肝癌临床治疗提供理论支持。

关键词： 创新思维   启发式教学   科研前沿   案例教学   课程思政  

摘要： 知识经济的迅猛发展,对学生创新思维及能力的培养都提出了更高要求。在药理学教学中,采取多元化教学方式,通过举例结合视频教学激发学生的求知欲,启发比较式教学调动学生主动思维,科研前沿导入式教学培养学生发散思维,案例讨论式教学培养学生逻辑思维,课程思政自然融入激励学生创新思维。多种教学方式的融合,促进了药学创新人才的培养。

关键词： 肾损伤   当归四逆汤   血瘀证   代谢组学   网络药理学  

摘要： 为了分析当归四逆汤(Danggui Sini Decoction,DSD)改善寒凝血瘀证(blood stasis syndrome,BSS)导致大鼠肾损伤的作用机制。首先,将32只SD雌鼠随机分为4组,正常组和寒凝血瘀组大鼠灌胃等量的蒸馏水,正常+当归四逆汤组以及寒凝血瘀+当归四逆汤组灌胃5.103 g·kg^(-1)当归四逆汤,共计14 d。同时每日给予大鼠冰水浴建立寒凝血瘀模型,并于第14天对寒凝血瘀大鼠皮下注射0.8 mg·kg^(-1)肾上腺素。正常大鼠在37℃下水浴和注射等量的蒸馏水。接着,实验结束后收集大鼠的24 h尿、血清和肾脏,分别进行代谢组学分析、生化指标检测和苏木精-伊红(HE)染色。然后,该研究利用1H-NMR代谢组学技术揭示DSD改善BSS导致大鼠肾损伤调控的代谢网络,结合网络药理学初步阐明DSD起效作用的关键靶点。病理及生化检测结果显示,在DSD干预后肾脏的炎症浸润,血肌酐、血尿素氮和尿蛋白的含量异常得到了显著回调;代谢组学分析发现,DSD降低BSS导致大鼠的肾损伤主要通过回调10个差异代谢物和3条主要代谢通路(牛磺酸与低牛磺酸代谢、柠檬酸循环、乙醛酸和二羧酸代谢)的异常发挥作用;网络药理学分析提示DSD减轻BSS导致大鼠的肾损伤可能与ATP柠檬酸裂解酶(ACLY)和一氧化氮合酶2(NOS2)2个关键基因以及精氨酸生物合成与精氨酸和脯氨酸代谢2条主要代谢通路有关。该研究基于网络调控视角初步揭示了DSD改善BSS导致大鼠肾损伤的作用机制,为进一步深入研究起效过程的分子机制提供了线索和依据。

关键词： 肝癌   网络药理学   黄连-大黄-肉桂复方   凋亡  

摘要： 目的:基于网络药理学和体外实验探索黄连-大黄-肉桂复方(RRC)治疗肝癌的作用机制。方法:通过TCMSP数据库检索RRC的主要活性成分及其对应靶点蛋白,通过Genecards数据库检索肝癌相关基因,采用Venny交集RRC靶点和肝癌相关基因;运用Cytoscape构建复方中药-成分-肝癌靶点网络图;运用DAVID和微生信等在线软件对RRC与肝癌的交集靶点进行GO和KEGG通路富集分析。采用CCK-8法、流式细胞术和RT-qPCR法分析RRC干预后人肝癌细胞增殖、凋亡及相关凋亡基因mRNA表达的变化,验证上述网络药理学分析结果。结果:筛选到RRC活性成分34个,其中25个含作用靶点,其靶点-肝癌交集基因共190个;复方中药-成分-肝癌靶点网络图显示每个成分均对应多个靶点,每个靶点均受多个成分调控;GO和KEGG分析均显示细胞凋亡等通路显著富集。体外实验证实,各浓度梯度RRC均能不同程度地抑制肝癌细胞增殖,且具有一定的量效和时效关系,1.5 mg/ml RRC能显著抑制肝癌细胞凋亡,上调外源性凋亡途径中相关基因的mRNA表达。结论:RRC治疗肝癌具有多靶点和多通路的作用特点,通过激活外源性凋亡途径,诱导肝癌细胞凋亡,可能是其抗肝癌作用的主要作用机制之一。

关键词： 甲状腺癌   益气养阴汤   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:利用网络药理学和分子对接技术探讨益气养阴汤治疗甲状腺癌术后的作用机制。方法:通过本草组鉴(HERB)数据库检索益气养阴汤10味药物化学成分,通过PubChem、SwissADNE筛选药物活性成分,Swiss target prediction预测活性成分作用靶点。在Gene Cards、OMIM、DisGeNET、Drug Bank数据库检索获得甲状腺癌术后的疾病靶点。Venny2.1.0平台获得药物与疾病的交集靶点,使用String数据库构建交集靶点蛋白互作网络,并导入Cytoscape3.9.1筛选得到核心靶点蛋白;借助Cytoscape3.9.1构建药物-活性成分-靶点网络图,并获取关键活性成分;使用Metascape数据库进行GO和KEGG富集分析;对关键靶点和关键成分进行分子对接验证。结果:得到益气养阴汤活性成分157种,预测活性成分作用靶点507个,甲状腺癌术后相关疾病靶点1817个,药物活性成分—疾病交集靶点154个。PPI分析得到SRC、HSP90AA1、PIK3R1、PIK3CA、AKT1为关键靶点基因,槲皮素、山柰酚、木犀草素为关键活性成分,分子对接显示关键靶点和关键活性成分具有良好的亲和力。KEGG富集分析提示癌症通路、PI3K-Akt通路、HIF-1通路等是药物作用的关键通路。结论:益气养阴汤可以多成分、多靶点、多通路参与抗炎、抗肿瘤、改善组织微环境,在甲状腺癌术后发挥治疗作用。

关键词： 刺山柑   巨噬细胞极化   类风湿关节炎   网络药理学  

摘要： 目的:应用网络药理学方法筛选刺山柑治疗类风湿关节炎(rheumatoid arthritis, RA)的靶点,从巨噬细胞极化途径探讨刺山柑防治类风湿关节炎的药理机制。方法:通过查阅相关文献检索刺山柑的主要化学成分;通过Pubchem有机小分子生物活性数据库检索化学成分的SMILES结构式,经Swiss ADME数据库筛选后将符合标准的化学成分上传至Swiss Target Prediction数据库预测药物活性靶点;通过人类基因数据库(Gencards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man, OMIM)数据库获取巨噬细胞极化相关靶点;绘制韦恩图并获取刺山柑活性成分与巨噬细胞极化的共同靶点;基于String平台构建药物疾病共同靶点的蛋白互作网络;基于David平台进行基因本体(gene ontology, GO)生物功能分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)通路富集分析;采用Cytoscape-v3.9.0软件构建“成分–靶点–通路”网络,应用网络分析仪(network analyzer)功能获得各成分、靶点的网络拓扑参数,筛选刺山柑发挥调控巨噬细胞极化的重要活性成分及核心靶点。结果:通过文献检索获得25个刺山柑活性成分及186个相关靶点;通过Gene Cards、OMIM数据库获得4081个巨噬细胞极化潜在靶点;将药物成分作用靶点与巨噬细胞极化相关靶点映射后,得到刺山柑调控巨噬细胞极化治疗RA的靶点165个;GO生物功能富集分析得到681个条目,其中生物过程445条,细胞组分74条,分子功能162条;KEGG通路富集分析获得136个信号通路,主要涉及HIF-1信号通路、氮素代谢通路、ROS通路、PI3K-Akt信号通路等生物学途径;网络拓扑分析得出刺山柑调控巨噬细胞极化的重要活性成分异鼠李素、木犀草素、山柰酚、芹菜素等化合物,重要靶点基因主要有AKT1、TNF、EGFR等。结论:刺山柑可能通过异鼠李素、山奈酚、木犀草素、芹菜素等潜在药效成分调控AKT1、TNF、EGFR等多个靶点基因的表达,通过HIF-1信号通路、氮素代谢通路、ROS通路、PI3K-Akt信号通路等多个信号通路协同作用,发挥调控巨噬细胞极化介导RA治疗的作用。

关键词： 升白方   环磷酰胺   免疫抑制   网络药理学   细胞免疫   体液免疫   作用机制   NF-κB信号   实验验证  

摘要： 目的基于网络药理学探究升白方对环磷酰胺诱导小鼠免疫抑制模型的治疗机制。方法建立环磷酰胺免疫抑制模型,观察升白方对小鼠免疫损伤的影响。采用网络药理学分析建立“疾病-药物-靶点”网络,确定生物学过程和信号通路;采用Western blot方法对代表性通路进行实验验证。结果升白方显著逆转了免疫抑制小鼠体重、胸腺指数、脏器指数、碳粒廓清指数、吞噬指数、足跖增厚、巨噬细胞吞噬功能及自然杀伤细胞杀伤活性的变化。网络药理学预测出升白方含有134个生物活性成分、577个作用靶点、133个与免疫力低下的共同靶点;得到了6个主要活性因子,分别为TP53、AKT1、JUN、MAPK1、MAPK3、RELA。Western blot分析表明:升白方显著促进NF-κB的表达。结论升白方可显著增强免疫抑制小鼠的免疫功能,其可能通过激活NF-κB信号通路发挥增强机体免疫力活性的作用,有望用于化疗后免疫抑制保健产品的开发。

关键词： 济生肾气丸   糖尿病肾病   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:采用网络药理学方法预测济生肾气丸治疗糖尿病肾病(DN)的活性成分和作用机制。方法:利用TCMSP平台获得济生肾气丸药物活性成分及基因靶点,利用GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD和DrugBank等数据库获取DN相关的基因靶点,利用Venny 2.1绘制共同靶点韦恩图;采用Cytoscape 3.9软件构建“药物-成分-靶点”相互作用网络;利用STRING构建PPI网络并进行拓扑分析;通过R/BioConductor对共同靶点进行GO及KEGG富集分析。结果:共获得济生肾气丸生物活性成分72个,筛选到济生肾气丸治疗DN的潜在靶点167个,核心靶点为AKT1、INS、PTGS2、IL6、CASP3等,主要富集在脂质与动脉粥样硬化、AGE-RAGE、流体剪切应力、HIF-1等信号通路。结论:济生肾气丸通过抗氧化应激、抗炎、抗凋亡、抗增殖等作用修复DN受损的肾脏微血管系统,保护肾功能。

关键词： 小陷胸汤   肺源性心脏病   网络药理学  

摘要： 目的:通过网络药理学及分子对接研究小陷胸汤治疗肺源性心脏病的作用机制。方法:借助TCMSP筛选药物成分,运用GeneCards、TTD等数据库筛选活性成分并预测潜在作用靶点,利用Cytoscape软件构建“药物-活性成分-靶点”的调控网络,运用Metascape进行GO和KEGG富集分析,最后利用Auto Dock Vina 1.1.2软件将活性成分和关键靶点作分子对接。结果:共筛选出38个活性成分,潜在治疗靶点179个,得出FOS、TP53、MAPK1、MYC、BCL2、AKT1、RELA、ESR1、JUN、IL1B10个关键靶点;GO功能富集分析涉及分子功能、生物过程和细胞组成,KEGG通路富集主要涉及脂质和动脉粥样硬化通路等信号通路。分子对接结果显示存在良好的结合活性。结论:小陷胸汤通过多成分、多靶点、多通路治疗肺源性心脏病,为中西医结合治疗PHD提供新的思路和方向。