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关键词： 桂枝茯苓丸   异位妊娠   网络药理学   分子对接   作用机制   张仲景  

摘要： 目的:应用网络药理学和分子对接探究桂枝茯苓丸治疗异位妊娠的潜在作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)筛选桂枝茯苓丸组方中药有效成分及相应作用靶点。在DrugBank、PharmGkb、GeneCards、TTD和OMIM五大数据库检索异位妊娠相关靶点,并与药物作用靶点进行映射,取交集得到桂枝茯苓丸治疗异位妊娠的潜在靶点。应用Cytoscape_v3.9.1软件构建“桂枝茯苓丸-异位妊娠”调控网络,并使用CytoNCA插件进行拓扑分析筛选关键化合物。将潜在靶点输入STRING在线平台获得蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)关系,通过Cytoscape_v3.9.1构建PPI网络并进行拓扑分析筛选核心靶点。使用David数据库对潜在靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析。采用AutoDock vina软件对关键化合物与核心靶点进行分子对接。结果:运用TCMSP数据库筛选得到桂枝茯苓丸有效成分85个,相关靶点525个。于DrugBank、PharmGkb、GeneCards、TTD、OMIM五大数据库检索得到异位妊娠靶点3055个。桂枝茯苓丸有效成分作用靶点与异位妊娠总靶点进行映射得到桂枝茯苓丸治疗异位妊娠的潜在靶点145个。“桂枝茯苓丸-异位妊娠”调控网络分析筛选得到槲皮素、山柰酚、黄芩素等6个关键化合物。PPI网络分析得到10个核心靶点。GO富集分析得到生物学过程725种、分子功能154类和78个细胞组分。KEGG信号通路富集分析得到167条富集通路。分子对接结果表明,关键化合物与核心靶点蛋白间存在良好的亲和力。结论:桂枝茯苓丸中的多种有效成分能够作用于多个潜在靶点并通过多条途径发挥治疗异位妊娠的作用。

关键词： 锦灯笼   化学成分   网络药理学   分子对接   HPLC-Q-TOF-MS  

摘要： 为探究锦灯笼配方颗粒抗炎、抗肿瘤有效成分及其作用机制,采用UPLC-Q-TOF-MS技术对锦灯笼配方颗粒进行成分分析;筛选锦灯笼配方颗粒抗炎、抗肿瘤作用对应的靶点,构建核心蛋白互作(PPI)网络和活性成分-靶点网络;对关键靶点进行GO和KEGG通路富集分析,采用AutoDock软件进行分子对接验证。结果表明:共鉴定出有机酸类、黄酮类、香豆素类和甾体类等化合物共36个。PPI分析发现TNF、AKT1、IL1β等为锦灯笼配方颗粒抗炎作用核心靶点,AKT1、EGFR、TNF等为抗肿瘤作用核心靶点,GO富集分析发现锦灯笼配方颗粒抗炎、抗肿瘤作用与急性病毒性心肌炎、癌症等信号通路相关。5个核心成分木犀草素、槲皮素、酸浆苦素G、阿魏酸、秦皮乙素与8个核心靶点具有较低的结合能。综上,基于超高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱技术、网络药理学、分子对接技术初步阐述锦灯笼配方颗粒抗炎、抗肿瘤有效成分及作用机制,为锦灯笼配方颗粒药效物质基础研究奠定了试验基础,为其质量控制与临床应用提供了参考依据。

关键词： 白藜芦醇   脊髓损伤   网络药理学   动物实验  

摘要： 目的:使用网络药理学方法和动物实验探讨白藜芦醇抗脊髓损伤的作用机制。方法:使用TCMSP搜集及Swiss平台预测,获得白藜芦醇作用靶点。使用Gene card、OMIM、TTD、Drug bank数据库搜集脊髓损伤相关靶点。韦恩图对二者取交集,即为白藜芦醇抗脊髓损伤的作用靶点。利用STRING网站和cytoscape软件构建交集靶点蛋白的互作网络图(PPI)。根据网络中拓扑参数的大小筛选关键作用靶点。使用DAVID网站进行GO和KEGG分析。通过免疫组化、RT-qPCR实验验证白藜芦醇对脊髓损伤模型大鼠中部分关键靶点的调控作用。结果:共获得白藜芦醇抗脊髓损伤作用靶点48个,其中关键作用靶点8个即AKT1、TNF、VEGFA、IL-1B、IL-6、JUN、CASP3、HIF1A。KEGG分析富集显著的通路主要有:TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、IL-17信号通路等。动物实验发现,白藜芦醇对脊髓损伤后大鼠运动功能具有明显改善作用,并可明显干预AKT1、TNF、VEGFA mRNA表达。结论:白藜芦醇可能通过作用于AKT1、TNF、VEGFA等靶点,调控TNF信号通路、PI3K-Akt信号通路、IL-17信号通路等发挥抗脊髓损伤作用。

关键词： 甘草   糖皮质激素耐药性   慢性阻塞性肺疾病   支气管哮喘   网络药理学   分子对接  

摘要： 以慢性阻塞性肺病(COPD)和支气管哮喘为示范,运用网络药理学和分子对接技术探究甘草抗糖皮质激素耐药的分子机制.通过TCMSP数据库检索甘草潜在有效成分和作用靶点,利用Uniprot数据库查询靶点对应基因,并利用Cytoscape3.9.1软件构建成分-靶点(基因)可视化网络.应用GeneCards、OMIM、NCBI-gene数据库检索糖皮质激素耐药靶点或不敏感靶点(glucocorticoid resistance target or insensitive target,GROI)、COPD靶点、哮喘靶点,在String数据库构建交集靶点的蛋白互作(PPI)网络,并通过Centiscape2.2计算得到核心靶点,利用Metascape数据库对核心靶点进行富集分析,采用分子对接技术对潜在有效成分和目标蛋白进行验证.共获得甘草成分87个及其对应靶点230个、GROI靶点基因3992个、COPD靶点基因791个、哮喘作用靶点基因1988个.核心靶点基因为IL6、TP53、VEGFA、MMP9和JUN等.甘草发挥作用的潜在有效成分为槲皮素、山奈酚、柚皮素和芒柄花素等.GO分析结果表明,甘草抗糖皮质激素耐药机制主要涉及氧化应激、生长因子刺激、细胞增殖、迁移、死亡、分化、DNA结合转录因子活性的调节等生物学过程.KEGG通路富集分析表明,甘草通过调节脂质及动脉粥样硬化通路、MAPK信号通路、HIF-1信号通路和FoxO信号通路等发挥增效减毒作用.分子对接技术验证了槲皮素、山奈酚、柚皮素和芒柄花素与核心靶点蛋白IL6、TP53、VEGFA、MMP9和JUN具有较高的亲和力.

关键词： 补肾健脾方   2型糖尿病   GEO基因芯片   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的 基于GEO基因芯片、网络药理学及分子对接技术探讨补肾健脾方治疗2型糖尿病(T2D)的作用机制。方法 通过SymMap、TCMID、TCMSP和TCM-ID数据库获取补肾健脾方有效成分及对应靶点,通过GeneCards、OMIM数据库获取T2D相关靶点,采用Cytoscape3.7.2软件构建蛋白相互作用(PPI)网络。利用GEO数据库筛选T2DM核心靶点基因并进行基因富集分析;通过STRING数据库筛选核心靶点,并进行GO功能和KEGG通路富集分析。最后运用AutoDock软件对有效成分与核心靶点进行分子对接验证。结果 共筛选出补肾健脾方有效成分1 230种,靶点594个,主要活性成分包括β-谷甾醇、山嵛酸酯、槲皮素等。预测得到补肾健脾方治疗T2D潜在作用靶点9个,包括VEGFA、IL1B、COL1A1、CXCL8等。GO功能及KEGG通路富集分析结果显示,补肾健脾方治疗T2D主要涉及糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、类风湿关节炎、非酒精性脂肪肝等通路。分子对接结果表明,有效成分β-谷甾醇、槲皮素与VEGFA、IL1B、COL1A1等核心靶点有较强结合能力。结论 补肾健脾方中多种活性成分可能通过AGE-RAGE、类风湿关节炎等信号通路,调控VEGFA、IL1B、COL1A1等靶点治疗T2D。

关键词： 网络药理学   鸡血藤   海风藤  

摘要： 目的:通过数据挖掘“鸡血藤-海风藤”抗风湿的物质基础及作用机理。方法:通过TCMSP数据库获取“鸡血藤-海风藤”药对的成分,并以OB≥30%、DL≥0.18进行筛选,获取筛选后有效成分的基因靶点,在OMIM、TTD、CTD、Gene Cards等数据库中以“rheumatoid”为关键词进行疾病靶点检索,两者取交集,利用Cytoscape-v 3.8.2软件绘制网络图,利用R语言进行GO和KEGG富集分析,并分析相关数据。结果:共获得45个有效成分和24个共有关键靶点。通过药物-成分-疾病-靶点网络结果分析,其有效成分可能为木犀草素、芒柄花黄素、β-谷甾醇;关键靶点可能是PTGS2、PTGS1、MAPK14,主要富集于TH17细胞分化、PI3K-Art和TNF等信号通路。结论:“鸡血藤-海风藤”药对中的木犀草素、芒柄花黄素、β-谷甾醇等成分很可能通过PTGS2、PTGS1、MAPK14等靶点作用于TH17细胞分化、PI3K-Art和TNF等多条信号通路发挥抗风湿作用。

关键词： 黄连膏   指纹图谱   特应性皮炎   网络药理学   经典名方   小檗碱  

摘要： 目的:建立黄连膏的指纹图谱,结合网络药理学和实验验证分析其治疗特应性皮炎(Atopic dermatitis,AD)的机制,预测其潜在的质量标志物(Q-Marker),为其质量控制和临床应用提供依据。方法:建立黄连膏的HPLC指纹图谱,对共有峰进行指认和归属,应用网络药理学筛选和分析黄连膏相关成分的作用靶点和通路,预测其抗AD潜在的Q-Marker;建立1-氯-2,4-二硝基苯(DNCB)诱导的AD小鼠模型,对预测结果进行验证。结果:指纹图谱共标定23个共有峰,并指认出5个色谱峰;将5个成分经网络药理学分析,筛选出EGFR、IL-10、PTGS2、VCAM1、STAT3、ICAM1等作用靶点,癌症的途径、脂质与动脉粥样硬化、TNF信号通路、细胞凋亡等关键信号通路,以“Q-Marker五原则”为核心,结合指纹图谱及网络药理学分析结果,初步预测小檗碱、姜黄素、藁本内酯、芝麻素、芝麻酚为黄连膏潜在的Q-Marker。动物实验验证,黄连膏能有效改善AD模型小鼠皮损(p<0.001),减少抓挠次数(p<0.001),降低血清炎症因子IL-6,IFN-γ,TNF-α水平(p<0.001),减轻皮肤角化过度和表皮及真皮的增厚,减少肥大细胞数量。结论:本研究建立的HPLC指纹图谱方法稳定可行,结合网络药理学及实验验证发现黄连膏中5个成分与其抗皮炎功效密切相关,为黄连膏的质量控制提供参考,同时也为黄连膏药效关联物质基础的研究及作用机制的探索奠定基础。

关键词： 大黄蛰虫丸   结直肠癌   网络药理学  

摘要： 目的:探讨大黄蛰虫丸治疗结直肠癌的药效物质基础以及作用机理。方法:利用TCMSP、TCMID系统并通过文献研究,以获得大黄蛰虫丸的主要化学成份及其功效靶位。再根据GeneCards中的结直肠癌药物靶位、DrugBank中的结直肠癌阳性药功能靶位相结合,证明大黄蛰虫丸功效靶位与结直肠癌之间的相互作用。借助Cytoscape3.7.1软件构建“组分-靶点”网络模型。最后,借助DAVID将主要靶点映射KEGG通路上,进一步阐释主要靶点与大黄蛰虫丸治疗结直肠癌的潜在联系。结果:“组分-靶点”网络包含226个化学组分和相应靶点34个(其中关键药效组分7个,主要靶点26个),主要靶点涉及NOS2、PPARG、PIK3CG、F2、GSK3B、CDK2、PGR、CHEK1等。映射KEGG通路111条(P<0.05),涉及的通路有PI3K-Akt通路、TNF通路、VEGF通路等。结论:结合文献和预测结果分析,榭皮素、L-尿苷为大黄蛰虫丸发挥抗结直肠癌作用的关键药效分子,其机制可能与PI3K-Akt信号通路有关。

关键词： 健脾益肾化痰方   网络药理学   分子对接   肺癌  

摘要： 运用网络药理学和分子对接技术探讨健脾益肾化痰方治疗肺癌的分子机制.通过TCMSP、化学专业数据库收集健脾益肾化痰方的活性成分,并通过PubChem、Swiss Target Prediction数据库获取活性成分的靶点,Gene Cards、Gene、CTD数据库收集肺癌相关靶点,将肺癌相关靶点与健脾益肾化痰方活性成分靶点取交集即为健脾益肾化痰方治疗肺癌的潜在靶点.利用Cytoscape软件构建健脾益肾化痰方干预肺癌的中药复方网络图、STRING数据库构建潜在靶点的蛋白质互作网络、Cytoscape进行可视化、Metascape数据库对健脾益肾化痰方抗肺癌的潜在靶点进行GO功能富集和KEGG通路富集分析.选取Degree排名前6位的活性成分与靶点分别运用AutoDockTools进行分子对接及可视化.结果筛选到111个健脾益肾化痰方相关活性成分,涉及966个靶点,其中与肺癌相关的靶点有373个.健脾益肾化痰方可能通过β-谷甾醇、豆甾醇、苏齐内酯等核心成分,作用于SRC、MAPK1、ATK1等核心靶点,干预肺癌中肿瘤通路、PI3K-AKT信号通路和肿瘤中的蛋白聚糖等信号通路,参与了细胞迁移的正调控、细胞运动的正调节、细胞成分运动的正调节等生物过程以干预肺癌.表明健脾益肾化痰方可能通过多靶标、多途径干预肺癌.其核心成分可能是β-谷甾醇、豆甾醇、苏齐内酯等.为进一步研究健脾益肾化痰方防治肺癌的机制提供理论支持.

关键词： 以学生为中心   信息化   药理学   教学  

摘要： 随着医药学知识领域的进步和不断发展,在网络信息化时代的背景下,为适应时代的发展,转变传统的教学模式就显得尤为重要。本文旨在探索在医药类专业学生的药理学教学中,采用“以学生为中心”的信息化教学模式,通过对教学形式改革、教学内容改革、教学评价改革等环节来进行设计及改革。实践证明,“以学生为中心”的信息化教学模式改革在药理学教学中的应用,不仅可以提高教学质量,还可以使学生在学好药理学专业知识的同时促进综合素养的全面发展。