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关键词： 桃红四物汤   子宫异常出血   蛋白激酶B   TNF-α   IL-6  

摘要： 目的探讨桃红四物汤治疗子宫异常出血(AUB)的潜在生物学机制。方法通过中药系统药理数据库(TCMSP)筛选TSD的活性化合物及其靶点,运用GeneCards、OMMI等数据库数据库筛选AUB靶点,确定交集基因;构建靶点网络和蛋白质相互作用(PPI)网络,采用米非司酮、米索前列醇联合复制AUB模型,对关键蛋白进行体内验证。结果筛选得到TSD活性成分69个,对应靶点224个,AUB相关靶点3271个,交集靶点164个。实验结果显示,TSD可显著减少大鼠子宫的出血量和出血时间,降低模型大鼠血清中IL-6和TNF-α,下调Akt1、TNF-α蛋白的表达。结论TSD对AUB的治疗作用可能与降低IL-6和TNF-α炎症因子的水平、下调Akt1和TNF-α蛋白表达有关,为进一步开展TSD治疗AUB的机制研究提供了新思路与方法。

关键词： 网络药理学   分子对接   软儿梨   止咳化痰   炎症因子  

摘要： 采用网络药理学方法预测软儿梨止咳化痰作用及其机制,并采用分子对接和动物实验对预测结果予以验证。通过文献调研和TCMSP等数据库筛选得到软儿梨的成分与作用靶点,与GeneCards数据库中“咳嗽(cough)”和“痰(sputum)”相关的两组基因相映射,得到软儿梨止咳化痰作用的靶点基因。通过Metascape平台对靶点基因进行GO和KEGG富集分析;通过STRING数据平台构建靶点基因间PPI网络;利用Cytoscape插件CytoHubba筛选软儿梨止咳化痰作用Top10基因,并通过Metascape数据平台对Top10基因进行KEGG通路富集以预测软儿梨止咳化痰作用可能涉及的信号通路。通过Autodock Vina对预测所得Top10基因蛋白和软儿梨Top3活性成分进行分子对接;最后通过氨水引咳试验和酚红排泄试验对预测所得结果进行验证。经多数据库联合分析,发现软儿梨中已见报道的化学成分有51个,对应作用靶点282个,其中80个与止咳化痰作用有关,根据Degree值筛选出的Top10基因主要富集在与感染和免疫相关通路上。分子对接试验证明Top10基因与PPI网络中排名前3位的化学成分(咖啡酸、芦丁、戊醛)有较强的结合活性。动物实验证明软儿梨可以明显抑制小鼠氨水引发的咳嗽反应,降低血清中IL-6和IL-13水平,增加小鼠气管酚红的排泄量。PCR和WB检测发现,软儿梨可降低炎症相关基因IL6、IL1B、VEGFA、PTGS2、MAPK3的mRNA水平和蛋白表达,软儿梨的止咳化痰作用可能与降低炎性基因表达,减少致炎因子释放有关。

关键词： 鹿茸   骨质疏松   成骨细胞   网络药理  

摘要： 本研究基于网络药理学结合体外细胞试验,探究鹿茸抗骨质疏松症(Osteoporosis,OP)的作用机制。通过中药系统药理学成分分析平台(BATMAN-TCM)、中国知网和Web of Science等文献检索数据库对鹿茸主要成分进行收集,随后利用Swiss Target Prediction、SEA、Drugbank和Therapeutic Target Database(TTD)等数据库获得成分预测靶点和OP疾病靶点,交集后确定鹿茸抗OP关键核心靶点;应用Cytoscape 3.7.1软件中Clue GO插件和Metascape数据库对核心靶点进行GO和KEGG通路分析,并构建多层次网络图,分析拓扑参数;利用AutoDock软件将主要的活性成分与核心靶点进行分子对接验证,同时应用成骨细胞(MC3T3-E1)进一步验证鹿茸抗OP作用和网络药理学所得结果。网络药理学方法结合文献检索,最终确定鹿茸成分58个,预测成分靶点1331个,OP疾病靶点106个,筛选出SRC、IL6、TNF和PTGS2等鹿茸抗OP核心靶点33个;其主要参与流体剪切应力的细胞反应和药物跨膜转运等4个生物学过程;调控类固醇激素生物合成和雌激素信号等7类41条KEGG通路发挥作用;细胞试验验证了鹿茸具有很好的抗OP活性;分子对接和q-PCR验证了鹿茸抗OP作用机制。本研究明确了鹿茸多成分及多靶点的作用特点,为下一步其抗OP研究与产品开发提供理论依据。

关键词： 老年   黄芪   原发性肌肉减少症   网络药理学  

摘要： 目的原发性肌肉减少症,是一种与年龄相关的骨骼肌疾病。本文旨在探讨黄芪对原发性肌肉减少症的有效活性成分和治疗靶点。方法本研究采用网络药理学方法探究黄芪治疗肌肉减少症的作用机制。首先,在中药系统药理学数据库(TCMSP)和蛋白质数据库(Uniprot)中,筛选黄芪的有效活性成分及其对应基因靶点。接着,通过GeneCard、OMIM、PharmGkb、TTD这4个数据库,收集原发性肌肉减少症相关的基因靶点。然后,将药物基因靶点和疾病相关基因取交集,以构建黄芪-有效成分-肌少症-靶基因调控网络。在String平台绘制交集基因靶点的蛋白互作(Protein-protein interaction,PPI)关系图,通过基因本体(Gene ontology,GO)富集分析黄芪-原发性肌肉减少症交集靶点的特征生物学性质,并进行京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析。结果从数据库中获得黄芪的20个有效活性成分,181个黄芪作用靶点,498个原发性肌肉减少症相关基因靶点,取交集后共获得16个关键靶点,对这16个靶点进行GO和KEGG通路富集分析发现,黄芪可能通过抗氧化、抗炎和调节免疫功能,以介导细胞对氧化应激的反应、细胞对化学应激的反应等信号通路发挥治疗作用。结论黄芪可能通过其多种有效成分作用于多个基因靶点,从而改善老年性肌肉减少症的症状。这为黄芪在临床治疗老年性肌肉减少症中的应用提供了理论支持。

关键词： 育心保脉   甘松   室性早搏   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:通过网络药理学及分子对接技术对在育心保脉理论指导下甘松作用于室性早搏的有效成分及对应靶点通路的探究,并研究其潜在的分子机制。方法:利用TCMSP及文献筛选甘松有效成分并通过SwissTargetPrediction数据库预测其作用靶点;通过GeneCards数据库、OMIM数据库、DrugBank数据库和DisGeNET数据库获取室性早搏(premature ventricular contraction,PVC)有关的作用靶点;取交集得到甘松作用于室性早搏的靶点基因。使用Cytoscape 3.9.1软件建立甘松作用于PVC的“药物-成分-靶点-疾病”网络图。使用STRING数据库构建蛋白质互作(PPI)网络,并将获得的数据信息导入至Cytoscape 3.9.1筛选获得关键靶点。使用DAVID数据库进行GO功能和KEGG通路的富集分析。利用Autodock Vina软件进行分子对接。结果:共筛选出甘松11种有效成分以及304个作用靶点,获得PVC靶点3982个,两者取交集共得到181个共同靶点,网络分析显示,甘松作用于PVC的主要有效成分为金合欢素、柚皮素、隐丹参酮、α-香附酮、β-谷甾醇和甘松新酮,核心靶点为VEGFA、AKT1、TP53、PTGS2、STAT3。GO功能富集分析(P<0.05)共获得833个条目;KEGG通路富集分析(P<0.05)共获得153条信号通路,其中在PI3K-Akt信号通路、脂质和动脉粥样硬化、Rap1信号通路等富集较多。分子对接结果表明,甘松主要有效成分与核心靶点均有较好的结合性。结论:甘松可能在抑制心肌结构重构、减少心肌细胞凋亡和纤维化、对抗心肌缺血后再灌注损伤、减缓血管平滑肌细胞复制衰老和增殖迁移方面发挥治疗PVC的作用,而这与育心保脉理论内涵相一致。

关键词： 病例导入   翻转课堂   思维导图   三合一教学法  

摘要： 药理学教学一直面临着知识点繁多且抽象、理论与临床应用难以衔接的挑战。本文探讨并实践了一种新型教学模式——“病例导入+翻转课堂+思维导图”三合一教学法。首先,通过病例导入,刺激学生自主探索药理学知识的兴趣;其次,翻转课堂转变了学生角色,使其在课前自学,在课上深入讨论,强化了学生的主动学习与参与;最后,利用思维导图的视觉工具,帮助学生整合信息,形成系统性知识结构。旨在通过创新教学策略,提高药理学的教学质量与效率。教学实践证明,此种三合一教学法有效培养了学生的临床思维,提高了学生学习的积极性,加强了学生理论知识与临床实践的紧密结合。期望通过这一教学模式的探索与应用,能为药理学及其他基础医学课程教学提供参考和启示。

关键词： 苍术香连散   网络药理学   分子对接   湿热泄泻  

摘要： 【目的】基于网络药理学和分子对接技术探究苍术香连散治疗猪湿热泄泻的作用机制。【方法】通过中药系统药理学数据库(TCMSP)、文献收集获取苍术香连散的活性成分和相关作用靶点;通过GeneCards、OMIM和DisGeNET数据库获取猪湿热泄泻的相关靶点。利用Cytoscape 3.9.1软件绘制苍术香连散成分-靶点网络图。通过STRING数据库进行交集靶点蛋白互作(PPI)分析,用Cytoscape 3.9.1软件构建PPI网络并进行拓扑分析获取核心靶点;通过DAVID数据库进行GO功能和KEGG信号通路富集分析。在AutoDock Vina软件上对药物关键活性成分与核心潜在作用靶点进行分子对接模拟。【结果】经过筛选共获得药物有效成分靶点149个,疾病靶点1246个,其交集靶点50个。PPI网络分析结果显示,肿瘤坏死因子(TNF)、细胞肿瘤抗原p53(TP53)、白细胞介素-6(IL6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、基质金属蛋白酶-9(MMP9)等为药物作用于疾病的关键靶点。GO功能分析显示,生物过程有129个条目,细胞组分有7个条目,分子功能有17个条目。KEGG富集分析结果显示,该药物主要通过影响IL17、Toll样受体、TNF等信号通路发挥治疗作用。分子对接结果显示,药物核心有效成分与疾病关键靶点蛋白结合能均<-5.0 kJ/mol。【结论】苍术香连散可能通过槲皮素、汉黄芩素、R-四氢小檗碱等成分作用于TNF、TP53、IL6、VEGFA等靶点影响TNF、IL17等主要炎症相关信号通路治疗猪湿热泄泻。

关键词： 泽泻饮   网络药理学   “酒风”   分子对接   作用机制  

摘要： 目的通过网络药理学探讨泽泻饮治疗“酒风”的作用机制。方法利用多个数据库收集泽泻饮治疗“酒风”的活性成分和交集靶点,随后构建蛋白互作网络图、药物-活性成分-交集靶点网络图,并进行富集分析和分子对接验证。结果筛选出6个核心活性成分,分别为山柰酚、槲皮素、泽泻醇A、23-乙酰泽泻醇B、泽泻醇C、白术内酯I,IL-1β、TNF、AKT1、MAPK3等8个关键靶点。通过Metascape数据库分析后得到450条GO生物过程及192条KEGG相关信号通路,主要涉及癌症通路、TRP通道的炎症介质调节、AMPK信号通路等。核心活性成分与关键靶点的结合能力较好。结论通过网络药理学和分子对接验证,发现其可以通过山柰酚、槲皮素、泽泻醇A、23-乙酰泽泻醇B、泽泻醇C、白术内酯I等成分作用于IL-1β、TNF、AKT1、MAPK3等靶点发挥抗炎、免疫、调控细胞增殖凋亡等作用,为今后进一步研究“酒风”提供依据。

关键词： 网络药理学   沙苑子   肿瘤   有效成分  

摘要： 目的利用网络药理学方法探讨中药沙苑子潜在抗肿瘤的作用机制。方法通过数据库TCMSP网站检索出沙苑子中所含的有效成分、靶点,利用GeneCards、Disgenent、OMIM疾病数据库查找有关的肿瘤疾病靶点,在Uniport数据库中进行数据挑选,使用Cytoscape软件制作中药-有效成分-靶点-疾病网络与疾病靶点网络图,利用STRING网站对蛋白质相互作用网络图进行构建。利用Metascape网站对相关的靶点进行GO及KEGG富集分析,了解沙苑子抗肿瘤可能的生物过程及其通路,并对KEGG信号通路进行可视化分析。结果筛选得到沙苑子10个有效成分、126个靶点,β-谷固醇、芒柄花素等化合物是中药沙苑子抗肿瘤的主要活性成分。KEGG分析结果表明沙苑子对AGE-RAGE、TNF、IL-17等10个信号通路与治疗肿瘤疾病的作用存在相关联系。结论基于网络药理学分析,表明沙苑子可能通过多成分、多靶点、多通路来治疗相关肿瘤疾病。初步推测了沙苑子抗肿瘤的主要靶基因和通路,为后续进一步探讨沙苑子靶向抑制肿瘤细胞提供新思路。

关键词： 胃癌   山药   网络药理学  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接探讨山药治疗胃癌的潜在靶点及作用机制。方法通过网络公开数据库筛选出山药的有效成分和潜在靶点及胃癌的相关基因,并绘制二者的交集基因,在Cytoscape 3.8.0中完成山药有效成分-靶点-胃癌的可视化分析,运用药物与疾病的交集基因构建蛋白质-蛋白质互作网络图(protein-protein interaction,PPI),并采用拓扑分析得到核心靶点,使用Rx644.1.2进行基因本体(gene ontology,GO)生物学过程富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,利用AutoDock 1.5.7软件和PyMOL软件完成中药成分和疾病靶点间的分子对接。结果共筛选出山药的有效成分12个及潜在靶点119个,与胃癌的共同靶点56个。拓扑分析筛选出TP53、HSP90AA1、AKT1可能为山药治疗胃癌的关键靶点。GO富集分析一共得到1417个条目,KEGG富集分析共筛选出112条通路。分子对接结果显示AKT1与豆甾醇结合活性最强。结论初步揭示了山药通过多项成分、多个靶点及多条通路发挥对抗胃癌的作用,其药物成分和靶点可有效结合。