课程文献中心 更多>>

关键词： 膝骨关节炎   牛膝   杜仲   桑寄生   网络药理学  

摘要： 目的:利用网络药理学平台整合分析牛膝-杜仲-桑寄生治疗膝骨关节炎(KOA)的分子机制,为药组的使用提供理论依据。方法:通过TCMSP平台筛选药组有效成分及靶点,与KOA靶点取交集制作韦恩图,构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,筛选关键成分和核心基因,对核心靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:筛选出药组有效成分41种,作用靶点239个;主要有槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、黄芩素、汉黄芩素、β-胡萝卜素等关键成分;磷酸激酶B1(AKT1)、半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、血管内皮生长因子(VEGF)等核心基因。关键信号通路有晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)通路、TNF通路、脂肪与动脉粥样硬化通路、磷脂酰肌醇3-激酶/磷酸激酶B(PI3K/Akt)通路等,分子对接结果显示活性成分与核心基因结合能力较强。结论:牛膝-杜仲-桑寄生药组可以通过多靶点、多通路发挥抗炎、抗氧化、调控细胞凋亡及稳定关节内环境的作用,达到治疗膝骨关节炎的目的。

关键词： 四妙丸   网络药理学   腰椎间盘突出症   药物作用机制  

摘要： 目的:采用网络药理学的研究方法,对四妙丸用于治疗腰椎间盘突出症(LDH)的药理作用以及机制问题进行研究和探讨。方法:借助TCMSP平台筛选出四妙丸活性药物成分及靶标预测。从OMIM数据库、GeneCards数据库、Drugbank数据库中检索出疾病靶标。采用R软件确定了四妙丸-LDH的交集靶点并利用STRING网站进行蛋白互作。利用Cytoscape软件构建了药物成分-交集靶点网络。最后在R软件将交集靶标进行富集分析。结果:分析研究显示共挖掘到了四妙丸中活性药物成分75种及预测靶点2902个、399个LDH疾病相关靶点,取交集后得到四妙丸-LDH交集靶点45个,分析得到MAPK14、MAPK1、IL6、ESR1、FOS和JUN可能为核心靶点,汉黄芩素、槲皮素可能为四妙丸治疗LDH的关键活性化合物。GO富集分析得到GO条目2004个,KEGG分析得到AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等可能为作用通路。结论:四妙丸中有多个对LDH有抑制作用的药效成分,多成分多靶标共同作用是其作用机制。

关键词： 白花蛇舌草   膀胱肿瘤   网络药理学   分子机制   信号通路  

摘要： 应用网络药理学技术探讨白花蛇舌草治疗膀胱肿瘤的作用机制;方法 通过TCMSP、PubChem、SwissTargetPrediction网站检索、比较、筛选出白花蛇舌草的作用靶点;利用DisGENT、Genecards和TTD数据库预测和筛选膀胱肿瘤的作用靶点,两者取交集在Venny 2.1.0中得到白花蛇舌草治疗膀胱肿瘤的靶点交集图;将 Venny 2.1.0 中得到的“药物-疾病”交集靶点导入 STRING 12.0 网站和 Cy-toscape 3.9.1软件中构建蛋白互作网络(protein-protein interaction network,PPI)分析其网络拓扑结构;通过DIVAD数据库进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclo- pedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,预测其作用机制;结果 白花蛇舌草的活性成分中有3个成分可被肠道有效吸收,涉及299个靶点,分列去除重复最后保留247个靶点。膀胱肿瘤涉及1455个基因,分列去除重复最后保留1212个靶点,药物与疾病得交集基因有94个。关键靶点涉及STAT3、AKT1、PIK3CA、CCND1 等;潜在靶点多富集在PI3K-AKT 信号通路、FoxO信号通路、Thyroid hormone信号通路和Estrogen Prolactin信号通路;结论 白花蛇舌草作用于膀胱肿瘤时可能通过调节GAPDH 、AKT1、EGFR及STAT3等关键蛋白,干预PI3K-Akt信号通路、FoxO信号通路、雌激素信号通路参与细胞增殖、凋亡与自噬,抑制病毒复制、膀胱肿瘤细胞增殖从而治疗膀胱肿瘤,提示了治疗膀胱肿瘤的关键机制和途径。

关键词： 抑郁症   天然冬虫夏草   多糖   网络药理学  

摘要： 抑郁症作为一种常见的精神障碍性疾病已经严重危害人类的健康,其发生发展过程伴随着严重的免疫紊乱现象。而天然冬虫夏草多糖具有良好的免疫调节药理活性,因此,本研究采用网络药理学联合分子对接技术,对天然冬虫夏草多糖抗抑郁作用的潜在机制进行了研究。研究结果表明,天然冬虫夏草多糖可能通过调节PI3K-AKT、HIF-1和JAK-STAT等通路及EGFR、STAT3、PRKACA、TP53和IL-1β等靶点,发挥了其免疫调节功能,从而实现抗抑郁作用。

关键词： 菊苣   活性成分   网络药理学   抗菌   靶点   信号通路  

摘要： 文章旨在运用网络药理学方法探究菊苣抗菌作用机制。首先通过TCMSP数据库筛选出菊苣的有效活性成分及其对应靶点蛋白,然后利用GeneCards数据库获取抗菌靶点,保留与药物靶点的交集部分,使用Cytoscape 3.7.2软件完成活性成分—靶点—疾病网络图的构建。然后通过STRING数据库的应用,构建共同靶点的蛋白质—蛋白质相互网络图,进而在Metascape数据库的支持下,完成GO富集分析、KEGG通路富集分析等操作。最后合计筛选出12个菊苣活性成分、156个靶点(去掉重复以后)、884个抗菌靶点,其共同靶点有46个,对应的活性成分有9个。GO分析结果显示,菊苣抗菌关键靶点基因的生物过程富集在平滑肌细胞增殖的调控、神经元死亡的调控、蛋白质磷酸化的正向调控上,分子功能富集在一氧化氮合酶调节活性上,细胞组分富集在富ficolin-1颗粒腔和细胞膜筏上。KEG通路富集分析结果表明,抗菌关键靶点主要出现在癌症通路方面,其次为脂质和动脉粥样硬化,人巨细胞病毒感染、南美锥虫病、卡波氏肉瘤等相关疱疹病毒感染,血流剪切力与动脉粥样硬化,JAK-STAT信号通路、甲型流感等信号通路,这系列结果表明菊苣有效成分可利用多生物路径、多条信号通路发挥效果,保持抗菌作用。文章结合网络药理分析菊苣抗菌的具体成分,研究多成分、多靶点、多路径的基本特征,客观判断菊苣抗菌活性的作用机制,希望能够为后期抗菌作用研究工作的开展提供依据。

关键词： 心肌梗死   芪参益气滴丸   分子对接   免疫浸润   网络药理学   GEO芯片  

摘要： 目的使用GEO数据库和网络药理学方法探讨芪参益气滴丸(QSYQ)干预心肌梗死(MI)的疗效基础和作用机制。方法GEO数据库筛选MI差异基因;TCMSP数据库以及文献检索筛选QSYQ的相关活性成分,SwissTargePrediction数据库预测成分的靶点;对差异基因和成分靶点取交集,Cytoscape软件构建“活性成分-交集靶点”调控网络;STRING数据库构建蛋白互作网络,Cytoscape中MCODE插件对网络进行分析,得到显著基因模块;clusterProfiler等R包对交集靶点进行GO功能和KEGG通路富集分析;AutoDock Vina进行成分-靶点的分子对接。CIBERSORT算法对GEO数据进行免疫浸润分析,并对关键基因表达量和免疫细胞含量进行Spearman相关性分析。结果共得到MI差异基因687个,活性成分靶点777个,交集靶点48个。PTGS2、MMP9、STAT3可能为QSYQ治疗MI的关键靶基因,分子对接模拟了与之对接最好的三个有效成分,分别为隐丹参酮、山奈酚、木犀草素。KEGG结果表明,交集靶点主要富集在NF-κB信号通路、TNF信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化等通路上。关键基因与活化的肥大细胞、中性粒细胞、活化的自然杀伤细胞具有显著正相关(P<0.05),与未活化的CD4记忆性T细胞呈显著负相关(P<0.05)。结论QSYQ治疗心肌梗死是以多成分、多靶点、多通路的方式进行的,研究初步确定了QSYQ疗效的物质基础、关键靶标和通路,以期为后续研究提供参考。

关键词： 瓜蒌桂枝汤   网络药理学   脑卒中   炎性反应   活性成分   作用机制  

摘要： 目的:探讨瓜蒌桂枝汤治疗脑卒中后炎性反应的活性成分和作用机制。方法:利用中药系统药理学技术平台(TCMSP)筛选瓜蒌桂枝汤活性成分和靶点,并借助Cytoscape 3.9.0软件构建“成分-靶点”网络图,运用人类基因数据库(GeneCards)、药物靶标数据库(TTD)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)筛选作用于脑卒中、炎性反应的靶点,利用STRING平台构建靶蛋白相互作用网络,通过DAVID 6.8平台对关键靶点进行KEGG和GO功能分析,预测其作用机制。结果:成分-靶点网络包含101个化合物和相应靶点210个。GO功能富集分析得到GO条目279个,其中生物过程(BP)199个,细胞组成(CC)31个,分子功能(MF)49个。KEGG通路富集涉及HIF-1、肿瘤坏死因子(TNF)、疟疾、核转录因子κB(NF-κB)信号通路等。结论:本研究利用网络药理学方法初步探讨瓜蒌桂枝汤治疗脑卒中后炎性反应的活性成分和作用机制,为进一步研究提供方向。

关键词： 人兽共患病   网络药理学   药物靶标   作用机制   综述  

摘要： 人兽共患病是一类可以从动物向人类传播的感染性疾病,约60%的人类感染为动物源性,目前全球已知有250余种人兽共患病,最不发达国家20%的人体疾病和死亡归因于人兽共患病。人兽共患病对人类和动物健康均造成了严重危害,是人类社会经济发展的持续挑战。网络药理学是一门基于系统生物学理论、生物系统网络分析和多靶点药物分子设计特异性信号节点选择的新兴学科,通过整合计算机分析、体内和体外实验及大量数据,发现新的药物靶点、揭示药物作用分子机制。目前,网络药理学已广泛用于临床医学、生命科学、药学、中医药等多个学科领域,对于揭示复杂疾病发病机制、挖掘药物靶标、阐明药物作用机制等均发挥了重要作用。本文主要就网络药理学在人兽共患病研究领域中的应用进展进行综述,从而为人兽共患病防控提供借鉴。

关键词： 课程思政   药理学   OBE   教学模式  

摘要： 将以学生为中心,以学生成果为导向,以持续改进为重点的OBE的三大教育理念引入药理学课程教学中,同时深入挖掘课程中的思政元素,将其与专业课内容深度融合,从而将知识传授与能力培养相结合,引导学生塑造正确的世界观、人生观和价值观。

关键词： 网络药理学   分子对接   桂芍葛芎汤   偏头痛  

摘要： 目的应用网络药理学和分子对接方法探讨桂芍葛芎汤治疗偏头痛的作用机制。方法采用TCMSP数据库中检索桂芍葛芎汤药物的相关活性成分,通过GeneCards数据库获取偏头痛的疾病靶点基因,采用Cytoscape构建桂芍葛芎汤-偏头痛-潜在靶点网络图。通过交互靶点基因本体(GO)和京都基因组与基因组百科全书通路(KEGG)富集分析研究桂芍葛芎汤和偏头痛的相关生物学过程和信号通路。将桂芍葛芎汤的关键活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果筛选出药物靶点958个,涉及活性成分共104个。偏头痛靶点3736个,桂芍葛芎汤治疗偏头痛的潜在作用靶点416个。桂芍葛芎汤治疗偏头痛的核心靶点基因为白蛋白(ALB)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、甘油醛3-磷酸脱氢酶(GAPDH)。神经活性配体-受体相互作用、血清素能突触、钙信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、癌症的途径等通络可能与桂芍葛芎汤防治偏头痛密切相关。通过分子对接验证表明部分活性成分与核心靶点之间具有良好的对接活性。结论花旗松素、β-谷甾醇、谷甾醇、儿茶酚、过氧麦角甾醇等作为桂芍葛芎汤治疗偏头痛的主要活性成分,通过作用于ALB、TNF、IL-6、AKT1、GAPDH等关键靶点,调控神经活性配体-受体相互作用、血清素能突触、钙信号通路、cAMP信号通路、癌症的途径等通路发挥作用。本研究体现了中药复方具有多成分、多通路、多靶点的特点,为进一步深入的临床研究提供科学依据。