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关键词： 灯盏细辛   缺血性脑卒中   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:通过网络药理-分子对接探讨灯盏细辛防治缺血性脑卒中的潜在分子作用机制。方法:通过中草药系统药理平台(TCMSP)数据库筛选灯盏细辛的活性成分及潜在作用靶点;通过在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、生物信息学和化学信息学数据库(DrugBank)、人类基因综合数据库(GeneCards)检索缺血性脑卒中相关靶点。蛋白质数据库(Uniprot)对靶点标准去重,导入韦恩(Venny)在线平台,得到两者交集靶点。通过基因间功能关联数据库(STRING)和Cytoscape 3.7.1软件对交集靶点进行蛋白相互作用(PPI)可视化分析;接着对交集靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。AutoDock Vina1.5.6软件对关键活性成分与核心靶点进行分子对接验证并实现对接结果的可视化。结果:获取灯盏细辛11个有效成分及176个作用靶点;缺血性脑卒中相关靶点690个,二者的交集靶点69个。通过PPI网络可视化分析,根据度值大小筛选出肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、白细胞介素-1β(IL-1β)、血管内皮生长因子A(VEGFA)等10个核心基因。KEGG富集到高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等。根据度值大小选取排名前三的有效活性成分及排名前五的靶蛋白,分子对接结果显示之间具有较好的结合能力。结论:灯盏细辛治疗缺血性脑卒中可能通过有效成分槲皮素、山奈酚、木犀草素,作用IL-6、IL-1β、TNF、VEGFA、AKT1等多靶点,通过IL-17、TNF等多条信号通路发挥作用,有着多成分、多靶点、多通路的特点。

关键词： 瓜子金   脑缺血   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学探讨瓜子金对脑缺血疾病治疗的作用机制。方法通过TCMSP数据库挖掘出瓜子金中所含有的化学有效成分及作用靶点并经Uniprot数据库标准化,运用Cytoscape3.8.0软件构建活性成分-关键靶点网络可视图。再利用OMIM、TTD、TCMSP、ETCM、DisGeNET和GeneCards数据库检索脑缺血相关基因,利用韦恩图筛选出瓜子金中活性成分治疗脑缺血的作用靶点,利用Cytoscape3.8.0软件构建药物-疾病-靶点网络可视图。利用R语言cluster Profiler包进行蛋白互作用PPI网络分析,以及GO功能和KEGG通路富集分析,并验证网络分析结果。结果从瓜子金所含59个皂苷成分和41个黄酮类成分中筛选得到4个活性化合物及147个潜在靶点,4个活性成分分别是常春藤皂苷元、槲皮素、山奈酚、1,3,7-三羟基-9H-氧杂蒽-9-酮。脑缺血中相关靶点有1671个,利用VENN图筛选出药物-疾病共同靶点105个。GO功能富集分析,包括生物学过程119条;KEGG通路富集分析显示163条通路,主要涉及血脂和动脉粥样硬化、糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路、肿瘤坏死因子信号通路、IL-17信号通路等。结论瓜子金对治疗脑缺血具有多成分、多靶点和多通路的作用特点,为瓜子金临床应用治疗脑缺血提供了思路和方法。

关键词： 网络药理学   分子对接   鸡血藤   糖尿病肾病  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接探讨鸡血藤治疗糖尿病肾病(DKD)的潜在作用机制。方法通过检索多个数据库筛选出鸡血藤活性成分和核心靶点,借助Drugbank、TTD、OMIM、Genecard、PharmGkb数据库收集DKD作用靶点,运用Venny 2.1.0获取鸡血藤与DKD的交集靶点基因。使用STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,并使用Cytoscape软件和CytoNCA插件进行分析筛选出核心靶点。然后进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。最后,使用AutoDock Tools软件通过分子对接技术验证活性化合物与核心靶点的结合能力。结果挖掘出24种鸡血藤的关键活性成分,DKD靶点12818个,有48个二者的交集靶点基因。筛选出鸡血藤活性成分3种(芦荟大黄素、木犀草素、甘草查尔酮a),核心靶点基因4种[热休克蛋白90 Alpha家族A级成员1(HSP90AA1)、MYC原癌基因(MYC)、肿瘤蛋白p53(TP53)、信号传感器和转录激活剂3(STAT3)]。GO功能共富集498个条目,KEGG通路共富集61个条目。分子对接技术验证了3种活性化合物与其作用的关键靶点具有可靠的亲和力。结论推测鸡血藤治疗DKD具有多成分-多靶点-多途径的特点,为进一步研究鸡血藤治疗DKD的分子机制提供了新的思路。

关键词： 湿疹   数据挖掘   中药   网络药理学   炎症因子  

摘要： 目的 利用数据挖掘及网络药理学方法探讨近现代名老中医治疗湿疹的用药规律及其作用机制。方法 收集《中国百年百名中医临床家丛书》《全国名老中医医案医话医论精选》《跟名师学临床系列丛书》中治疗湿疹的方剂,利用Excel2021、IBM SPSS Modeler 18.0等软件对药物频次、功效类别、性味归经等进行统计,并进行关联规则分析。利用TCMSP、 UniProt、 GeneCards、 DrugBank、PharmGKB数据库分别筛选中药活性成分及湿疹相关靶点;利用Venn图获取药物与疾病的交集靶点;利用Cytoscape3.9.1构建“药物-活性成分-靶点”网络;利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,利用Cytoscape3.9.1的CytoNCA插件进行拓扑分析,筛选核心靶点;采用Metascape数据库进行GO功能及KEGG通路富集分析。结果 共纳入方剂46首,包含中药120种,高频中药有甘草、苍术、白鲜皮等;药物功效类别以清热药、补虚药、利水渗湿药为主;药性以寒为主,药味以苦居多,归经主入肝经、胃经、肺经;药物关联规则分析中,置信度及支持度较高的药对为“苍术-土茯苓-薏苡仁”。经筛选获得3味中药有效成分25个;湿疹相关靶点3 933个,二者交集靶点104个;主要成分有槲皮素、汉黄芩素、β-谷甾醇等;核心靶点涉及RELA、TNF、IL6等;GO功能富集分析得到生物过程1 457个条目,细胞组分57个条目,分子功能123个条目;KEGG通路富集分析得到189条通路,主要涉及AGERAGE信号通路、NF-κB信号通路等。结论 苍术-土茯苓-薏苡仁可通过作用于TNF、IL6等靶点,调控NF-κB信号通路,发挥抗炎作用,在治疗湿疹中发挥重要作用。

关键词： 网络药理学   枳实   杏仁   药对   便秘   作用机制  

摘要： 目的:利用网络药理学及分子对接探讨枳实-杏仁药对治疗便秘的作用机制。方法:在中药系统药理学数据库与分析平台、GeneCards、OMIM、PharmGKB、TTD、DrugBank、R软件4.1.1、STRING和Cytoscape 3.8.2等平台筛选药对有效成分与便秘的共有靶点、绘制蛋白质-蛋白质相互作用网络图,从而得出主要有效成分和核心共有靶点。再利用Autodock软件将最终获得的药对主要成分与便秘疾病核心共有靶点进行分子对接,通过两者的关联性及结合亲密度分析枳实-杏仁药对治疗便秘的作用机制。结果:枳实-杏仁药对主要包含41个活性成分,对应82个靶点;获得便秘靶点1526个,药对对应靶点与便秘作用靶点相互匹配后,最后取得60个共有靶点;药对有效成分进一步筛选后最终得到33个有效成分。枳实-杏仁药对中的木犀草素、甘草酚等活性成分作用于便秘疾病丝裂原激活的蛋白激酶1、糖原合成酶激酶3β等靶点蛋白,并通过干预磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B、雌激素信号等信号通路发挥作用。分子对接显示,有效成分与共有靶点的结合效果较好。结论:本研究为进一步探讨枳实-杏仁药对治疗便秘提供了理论参考。

关键词： 课程思政   药理学   医疗纠纷   案例教学   深度学习  

摘要： 目的探讨基于课程思政和深度学习理念的药理学教学模式。方法以吗啡药理学的教学为例,通过混合多元教学设计,从医疗纠纷案例入手,复合导入式、启发式教学设计及癌痛三阶梯疗法的思政教育模式等,融入思政元素,构筑情境式深度学习模块。结果与结论在案例教学情境中,学生积极学习,建构了药物-临床-合理用药知识体系,掌握了药物作用的关键环节,提升了解决问题的能力;同时,教师在教学中完成了价值塑造、知识传授和高阶思维能力培养的统一,提高了教学效果。

关键词： 高原肺水肿   小青龙汤   人参汤   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接技术分析小青龙汤合人参汤抗高原肺水肿的作用机制。方法:通过TCMSP获取小青龙汤合人参汤主要活性成分及其靶点;通过OMIM、Genecards和DisGeNET数据库获取高原肺水肿主要作用靶点;通过Venn Diagram得到小青龙汤合人参汤与高原肺水肿的共同靶点;利用String数据库获得数据,用Cytoscape3.9.1建立蛋白质互作(PPI)网络;采用David数据库分析生物过程及信号通路,采用Cytoscape3.9.1软件构建“活性成分–靶点”网络,并运用AutoDock及Pymol对关键靶点与相应活性成分进行分子对接验证。结果:从小青龙汤合人参汤中筛选得到159种活性成分及329个作用靶点,与887个高原肺水肿相关靶点取交集,得到62个共同靶点,GO功能富集分析中生物过程(BP)得到214条,分子功能(MF)得到25条,细胞成分(CC)得到13条;KEGG信号通路富集分析获得93条。结论:小青龙汤和人参汤防治高原肺水肿的核心活性成分为槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等,关键靶点为IL6、TNF、VEGFA等;小青龙汤合人参汤防治高原肺水肿主要涉及HIF-1信号传导途径、脂质和动脉硬化、Toll样受体信号通路、TNF信号传导途径等。

关键词： 小柴胡汤   网络药理学   分子对接   糖尿病胃轻瘫   作用机制  

摘要： 目的研究小柴胡汤治疗糖尿病胃轻瘫的作用机制。方法基于网络药理学和分子对接,通过检索中药系统筛选小柴胡汤的活性成分、靶点,在数据库中获得糖尿病胃轻瘫相关靶点,并筛选小柴胡汤活性成分与糖尿病胃轻瘫的共同靶点;构建“药物-成分-靶点-疾病”网络,将筛选出的关键靶基因导入在线平台,建立蛋白与蛋白相互作用网络,并进行分析,以研究其作用机制。结果共发现小柴胡汤治疗糖尿病胃轻瘫有30个可能的重要靶点;GO富集分析得到与糖尿病胃轻瘫相关的53个细胞生物学过程(P<0.05);KEGG富集分析得到与糖尿病胃轻瘫相关的97条通路(P<0.05)。结论小柴胡汤对糖尿病胃轻瘫的治疗作用可能是多靶点、多途径、多机制的,本研究结果为小柴胡汤的临床应用提供了更多证据支持。

关键词： 消瘿散结方   甲状腺结节   网络药理学  

摘要： 目的通过现代网络药理学方法探析消瘿散结方治疗甲状腺结节的作用机制。方法通过TCMSP、TCMID、TCM Database@Taiwan及symMap数据库检索消瘿散结方的主要有效成分,利用pubchem数据库查找其化合物与分子结构,在Swiss Target Prediction数据库检索其作用靶点,通过GeneCards和DisGeNet数据库检索甲状腺结节疾病相关基因,直接对药物靶位基因和相关疾病基因序列进行韦恩分析,利用Cytoscape软件实现可视化并分析筛选出核心基因组,最后在DAVID数据库中进行富集分析,对复方药物潜在的治疗作用靶点可进行GO功能分析和KEGG通路分析。结果检索到复方药物组合的主要有效化合物199个、作用靶点342个;符合条件的甲状腺结节疾病基因1218个,其中108个是消瘿散结方治疗甲状腺结节的潜在作用靶点。通过GO功能和KEGG通路分析发现消瘿散结方治疗甲状腺结节是通过PI3K-Akt、Rap1、EGFR、MAPK及HIF-1等信号通路发挥作用。消瘿散结方治疗甲状腺结节的重要基因为AKT1、VEGFA、TNF、SRC及EGFR等。结论通过现代网络药理学方法发现消瘿散结方药对组合治疗甲状腺结节的药物作用机制涉及多靶点与通路,可能与细胞增殖、凋亡与黏附、血管生长因子、炎性因子及糖代谢与癌症因子等相关。

关键词： 附子理中汤   溃疡性结肠炎   质量控制   网络药理学   Q-marker   靶点   通路  

摘要： 目的基于高分辨质谱仪、靶向定量代谢组学技术和网络药理学探讨附子理中汤(FZLZD)治疗溃疡性结肠炎(UC)的活性成分及作用机制。方法首先,通过高分辨液质联用仪对附子理中汤进行定性检测,将其测定的成分进行验证并结合有关文献报道筛选出可能活性化合物;然后利用靶向定量代谢组学技术、结合多元统计分析方法,对筛选出的化合物进行靶向定量;最后运用网络药理学预测附子理中汤治疗溃疡性结肠炎可能的机制。结果本研究共获得苯甲酰新乌头原碱、苯甲酰乌头原碱、白术内酯Ⅰ、白术内酯Ⅱ、白术内酯Ⅲ、党参炔苷、8-姜酚、10-姜酚、甘草苷、甘草素、甘草酸、6-姜烯酚、苯甲酰次乌头原碱、乌头原碱、6-姜酚、次乌头碱、腺苷、异甘草苷、异甘草素和甘草次酸20个活性成分,各不同来源的附子和甘草的活性成分含量差异较大,附子理中汤治疗溃疡性结肠炎与癌症通路、癌症中的蛋白聚糖、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性、AGE-RAGE信号通路,以及IL-6、IL-8等炎症通路有关。结论虽然各来源都选用合格中药,但质量标志物的含量范围会影响其临床效果;将附子、甘草含量差异较大的活性成分:甘草酸、异甘草素、甘草素、苯甲酰次乌头原碱、甘草苷、甘草次酸作为主要筛选中的Q-marker;此研究有助于对中药不同来源及其主要活性成分含量进行质量控制,对中药-疾病可能的通路靶点进行预测,为后续进一步的药理作用及机制研究提供依据。