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关键词： 兴安升麻   化学成分   促进皮肤伤口愈合   网络药理学   作用机制  

摘要： 为了深入挖掘兴安升麻生理功能,本研究采用醇提法提取活性成分,通过HPLC-MS分析兴安升麻的化学成分并基于网络药理学探讨其对皮肤伤口的促愈机制。结果表明,兴安升麻中鉴定出125种化学成分,其中萜类、苯丙素类及酮类化合物含量较多,主要包括隐绿原酸、绿原酸、白术内脂Ⅲ等活性成分,可作用于一个或多个靶点,EGFR、KDR、F2可能为促愈过程中发挥作用的重要靶点,且橘皮素、山姜素、5-去甲川陈皮素等活性成分可能在此过程中发挥重要作用,说明兴安升麻具有多成分、多靶点作用于促进皮肤伤口愈合的特性;兴安升麻可能通过VEGF、EGFR和TNF信号通路调控相关因子和蛋白的表达,发挥对皮肤伤口的促愈作用。本研究探明了兴安升麻醇提物的主要活性成分,并基于网络药理学预测了促进皮肤伤口愈合的作用机制,为后续兴安升麻的开发利用提供试验及理论基础。

关键词： 布地奈德   肾小球肾炎,IgA   IgA肾病   网络药理学   信号通路  

摘要： 背景IgA肾病是我国及世界范围最常见的原发性肾小球肾炎,25%~30%的患者在确诊后20年内会进展至终末期肾病。目前尚无针对IgA肾病有效且安全的治疗方案。近年来针对IgA肾病治疗的新药研究进展迅速,其中靶向迟释布地奈德胶囊是全球首个IgA肾病对因治疗药物。目的基于网络药理学探究皮质类固醇布地奈德肠溶胶囊治疗IgA肾病的作用机制。方法通过Chemical Book平台筛选布地奈德的作用靶点;并利用GeneCards和CTD数据库获取IgA肾病的相关靶点。通过韦恩图取交集获得布地奈德-IgAN共同靶点。构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,对交集靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果筛选出布地奈德作用靶点242个,IgA肾病候选靶点1443个,交集靶点146个。PPI网络核心靶点15个:白介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、白介素10(IL-10)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、表皮生长因子受体(EGFR)、白介素1B(IL-1B)、白介素4(IL-4)、白介素8(CXCL8)、1号染色体的基因(JUN)、白介素13(IL-13)、白介素2(IL-2)、趋化因子2(CCL2)、TOLL样受体4(TLR4)、集落刺激因子2(CSF2)、白蛋白(ALB)。富集分析共获得1646个GO富集结果,174条KEGG信号通路,其中生物过程(BP)主要涉及磷酸化的正向调节、炎症反应、细胞运动的正向调节等,细胞组成(CC)主要涉及细胞质囊泡腔、囊腔、分泌颗粒腔等,分子过程(MF)主要涉及信号受体激活活性、信号受体调节活性、受体配体活性等。KEGG信号通路主要涉及白介素17信号通路、细胞因子-细胞因子受体相互作用、癌症中的通路、肿瘤坏死因子信号通路等。结论本研究初步验证布地奈德可通过IL-6、TNF、IL-10、VEGFA、EGFR等靶点作用于细胞因子-细胞因子受体相互作用通路、白介素17信号通路、癌症中的通路、肿瘤坏死因子信号通路等多条信号通路治疗IgA肾病,为布地奈德的进一步研究及临床实践提供理论依据。

关键词： 六君二陈解毒汤   非小细胞肺癌   网络药理学   分子   对接  

摘要： 目的利用网络药理学方法和分子对接技术,探究六君二陈解毒汤治疗非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)的潜在作用机制。方法基于网络药理学方法检索TCMSP数据库收集六君二陈解毒汤的药物活性成分,并预测其作用靶点;检索GenCards、OMIM、PharmGKB数据库获得NSCLC疾病靶点;使用Venny(2.1)在线工具获得药物活性成分与疾病的交集靶点后,通过STRING数据库构建蛋白互作图并做拓扑学分析;使用Cytoscape Version(3.9.2)软件的MCODE插件对核心靶点进行聚类分析;使用DAVID数据库对核心靶点进行GO生物功能和KEGG通路富集分析;运用Kaplan-Meier Plotter数据库对核心靶点进行生存分析。基于分子对接技术使用AutoDock(1.5.6)软件对网络药理学预测结果进行分子对接验证。结果基于网络药理学方法得到六君二陈解毒汤的主要活性成分198个、潜在作用靶点968个;检索疾病数据库收集筛选得到NSCLC靶点1093个,取交集后得到NSCLC治疗靶点12个。蛋白互作图和拓扑学分析结果显示,EGFR、CAV1、PTEN等10个靶点可能是六君二陈解毒汤治疗NSCLC的核心靶点。聚类分析得到1个具有相似功能的子簇,涉及PARK2、MCL1、EGFR等8个核心靶点。GO生物功能和KEGG通路富集分析表明,六君二陈解毒汤通过影响癌症信号通路和FAK、PI3K-act等信号通路发挥作用。生存分析结果显示,EGFR、CAV1、PTEN、MCL1、MET、RASA1、VCAM1核心靶点的表达与NSCLC患者总生存率有关。基于分子对接技术得到六君二陈解毒汤活性成分中β-谷甾醇与核心靶点MCL1有较好的结合能力,其结合能为-4.33 kJ/mol。结论基于网络药理学方法预测出六君二陈解毒汤主要通过槲皮素、β-谷甾醇、木犀草素等药物活性成分作用于EGFR、CAV1、MCL1等核心靶点发挥治疗作用;通过分子对接技术证明,活性成分β-谷甾醇与核心靶点MCL1密切相关。

关键词： 玉蝴蝶祛斑膏   网络药理学   黄褐斑   机制   化学成分   槲皮素  

摘要： 目的:采用网络药理学的分析方法,探讨玉蝴蝶祛斑膏治疗黄褐斑疾病的作用机制。方法:通过TCMSP数据库收集玉蝴蝶祛斑膏潜在有效活性化合物,并通过Swiss Target Prediction数据库筛查其潜在有效活性化合物的人类潜在有效靶点蛋白;在DisGeNET、GeneCards、TTD等数据库筛查黄褐斑的疾病靶点蛋白;通过STRING数据库构建蛋白–蛋白互作网络数据,并利用Cytoscape软件进行可视化拓扑结构分析,将关键靶点蛋白通过DAVID数据库进行基因功能和通路富集分析。结果:筛选得到玉蝴蝶祛斑膏中潜在有效活性成分66个,所对应潜在靶点蛋白478个,与黄褐斑疾病相关疾病靶点蛋白120个。“成分–靶点”网络图提示槲皮素、黄芩素等是玉蝴蝶祛斑膏治疗黄褐斑疾病的关键成分。GO富集分析结果显示,共有225个条目与生物过程相关,共有40个条目与细胞组成相关,共有63个条目与分子功能相关;富集分析显示,参与治疗黄褐斑疾病的关键靶点蛋白主要与131条通路相关联,其主要涉及癌症通路、癌症蛋白聚糖通路等。其中癌症通路的P值最高。结论:文章利用网络药理学多成分、多靶点、多维度、多途径的分析方法,较为全面地阐明了玉蝴蝶祛斑膏治疗黄褐斑疾病的作用特点,初步揭示了玉蝴蝶祛斑膏治疗黄褐斑疾病的有效基础物质和作用机制,为后续研究提供思路与依据。

关键词： 阴道炎   完带汤   网络药理学   作用机制  

摘要： 基于网络药理学探讨完带汤治疗各种阴道炎的作用机制。方法 使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP数据库)筛选出关于完带汤中所有药物的有效成分及作用靶点,利用UniProt Archive数据库进行基因名称规范。在人类基因综合分析数据库(GeneCards数据库)、药学资源数据库(Drugbank数据库)中提取有关阴道炎疾病的相关靶点并进行去重合并。将完带汤中所有药物的靶点与阴道炎疾病的靶点合并取交集后以Venn 图展示。利用Cytoscape软件进行构建“药物-活性成分-疾病靶点”的网络图,并利用其中的插件CytoNCA进行构建有关药物和疾病的核心靶点图。运用基因蛋白相互作用数据库(String数据库)构建蛋白互作 PPI 网络图。采用生物信息数据库系统( DAVIDA 数据库)对完带汤与阴道炎共有的靶点进行GO功能和KEGG富集功能分析,得到基因靶点参与的生物学过程和中药抗阴道炎的信号通路相关结果。结果 完带汤包含198个药物活性成分,所涉及的作用靶点共252个, 阴道炎疾病相关靶点859个,绘制Venn 图得到完带汤与阴道炎疾病交集基因94个,基因蛋白相互作用分析得到5个核心靶点基因。GO富集分析完带汤治疗阴道炎疾病的相关核心靶点基因主要分布细菌来源分子、氧化应激反应等方面。KEGG通路富集发现治疗完带汤的作用机制可能与肿瘤通路、AGE-RAGE信号通路、化学致癌–受体激活通路等相关。结论 完带汤具有多个成分、多个靶点、多条通路影响阴道炎的发生与发展。

关键词： 蒙药学   实验课   教学改革  

摘要： 蒙药学专业主要培养学生掌握蒙药药材鉴定、加工炮制、制剂和配伍等基本技能,认识和了解蒙药的应用原则、方法、药物的作用机理、药理作用,培养学生综合素质及较强的实际应用能力。蒙药药理学实验课程是蒙药学专业课程的重要组成部分,蒙药药理学实验教学改革是一个值得探讨和研究的课题,分析蒙药学实验课程教学中存在的问题,在教学内容、教学模式、考核体系等方面进行了改革与探索,提出了一些教学改革方法和措施,以期为蒙药学专业蒙药药理学实验课程建设与改革提供参考。

关键词： 中文核心期刊要目总览   生物学文摘   中国毒理学会   中国药理学会   北大图书馆   核心学术期刊   药学专业   医学研究院  

摘要： 《中国药理学与毒理学杂志》是由中国药理学会、中国毒理学会和军事医学研究院毒物药物研究所共同主办的高级学术性刊物,1986年创刊,2016年由双月刊改为月刊。被北大图书馆评为药学专业中文核心期刊(中文核心期刊要目总览),同时还是中国科技核心期刊、中国核心学术期刊和中国生物医学核心期刊等。本刊被美国《生物学文摘(预评)》(BAP)和美国《化学文摘》(CA)等十余家数据库收录。

关键词： 健脾理气抑瘤方   肝细胞癌   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的运用网络药理学方法探讨健脾理气抑瘤方治疗老年肝细胞癌的作用机制。方法利用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)数据库获得健脾理气抑瘤方潜在活性成分,并获取活性成分对应潜在药物靶点,利用UniProt数据库收集靶点对应基因名。分别在DrugBank数据库、人类在线孟德尔遗传数据库(OMIM)、GeneCards、TTD与DisGenet数据库5个数据库中搜集肝细胞癌相关靶点信息,利用Evenn在线平台筛选两者的交集基因,String平台构建蛋白相互作用(PPI)网络,Metascape进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析与基因本体论(GO)分析。CytoScape构建“健脾理气抑瘤方活性成分—抗肝细胞癌靶点”网络拓扑图,利用CytoNCA插件筛选核心成分。最后利用AutoDockTools、Autodock vina进行分子对接,PyMol软件对分子对接结果进行可视化处理。结果选出健脾理气抑瘤方活性成分47个,成分靶点880个。疾病靶点4351个,交集靶点159个,GO分析419个条目,共得到188条KEGG信号通路,关键成分包括槲皮素、木犀草素、山奈酚、黄芩素、异鼠李素。治疗肝细胞癌的核心靶点共有5个,分别为ESR1、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)1、MYC、MAPK14、TP53。分子对接结果显示关键成分与交集靶点结合良好。结论健脾理气抑瘤方中多种活性成分通过调控磷脂酰激酶3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt),核转录因子(NF)-κB、乙型肝炎通路、血管内皮生长因子(VEGF)、缺氧诱导因子(HIF)-1等信号通路作用于肝癌细胞,ESR1、MAPK1、MYC、MAPK14、TP53是健脾理气抑瘤方治疗老年肝细胞癌的关键靶点。

关键词： 葛根芩连汤   抗生素相关性腹泻(AAD)   肠道菌群   网络药理学   肠道屏障   炎症因子   白细胞介素(IL)  

摘要： 目的:通过16S rRNA测序与网络药理学探究葛根芩连汤(GQT)对抗生素相关性腹泻(AAD)肠道菌群的作用机制。方法:将60只SD大鼠随机平均分为空白组、模型组、丽珠肠乐组(0.15 g·kg^(-1))、葛根芩连汤高、中、低剂量组(10.08、5.04、2.52 g·kg^(-1)),除空白组外,各组每日均给予克林霉素(250 mg·kg^(-1))灌胃造模,连续7 d。造模成功后,各给药组按剂量灌胃对应药物,1次/d,持续14 d,空白组与模型组给予等体积生理盐水灌胃。通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选GQT活性成分及作用靶点,利用人类基因数据库GeneCards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库、药物遗传学与药物基因组学知识库(PharmGKB)、药品生物信息学和化学信息学数据库DrugBank、疾病相关的基因与突变位点数据库DisGeNET检索AAD疾病靶点,通过R软件分析获得“药物-疾病”共有靶点。利用STRING数据库分析靶点蛋白质-蛋白质相互作用关系,并进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过苏木素-伊红(HE)染色观察大鼠结肠病理学改变,并结合16S rRNA测序AAD结肠内容物菌群结构验证网络药理学结果。结果:通过网络药理学从GQT中筛选出238个活性成分作用于276个成分靶点,其中槲皮素、葛根素、汉黄芩素、芹黄素为GQT主要核心成分,AAD疾病靶点1097个,药物-疾病交集靶点127个。蛋白质-蛋白质相互作用网络主要包括蛋白激酶B1(Akt1)、白细胞介素-6(IL-6)及IL-1β等核心靶点,主要富集于IL-17信号通路。通过动物实验验证发现,与空白组比较,模型组结肠结构严重异常,肠道上皮柱状细胞损伤、杯状细胞减少、大量炎症细胞浸润;与模型组比较,GQT高剂量组结肠结构有所改善,但仍存在异常;GQT中、低剂量组和丽珠肠乐组结肠结构明显改善,达到正常水平。GQT可改善AAD肠道菌群结构多样性,在门水平增加厚壁菌门Firmicutes丰度,降低拟杆菌门Bacteroidetes丰度,在属水平增加乳酸杆菌属Lactobacillus丰度,降低普雷沃氏菌属Prevotella与拟杆菌属Bacteroides丰度,其中乳酸球菌属Lactococcus可作为GQT治疗AAD的生物标记物,通过菌群功能代谢预测发现GQT可促进肠道中醋酸与乳酸代谢途径。结论:GQT可能通过槲皮素、汉黄芩素等关键成分作用于Akt1及IL-6等靶点,激活IL-17信号通路,同时改善肠道乳酸球菌属丰度及醋酸、乳酸代谢途径,从而发挥修复肠道屏障的作用来治疗AAD。

关键词： 黄芪桂枝五物汤   紫杉醇   神经毒性   网络药理学  

摘要： 目的使用网络药理学的方法探究黄芪桂枝五物汤干预紫杉醇诱导的周围神经毒性的机制。方法通过中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)获得黄芪桂枝五物汤的有效活性成分及其作用靶点,汇总DrugBank数据库、OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)数据库、PharmGkb(PharmacogenomicsKnowledgebase,PharmGkb)数据库、TTD(Therapeutic Target Database,TTD)数据库、GeneCards数据库中有关紫杉醇诱导周围神经毒性的相关疾病靶点,Cytoscape 3.7.2用于构建复方有效成分—靶点网络,将作用靶点导入String数据库构建PPI(Protein-protein interaction,PPI)蛋白互作网络,再通过DAVID(Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery,DAVID)数据库进行GO、KEGG富集,最后进行分子对接验证。结果获得了黄芪桂枝五物汤中有效活性成分74个,干预神经毒性的潜在靶点76个,复方有效活性成分—作用靶点网络显示槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇等与靶点具有较多的对应关系,TP53、AK1、JUN是蛋白互作网络中degree值较高的蛋白,GO富集与KEGG富集显示细胞对氧化应激的反应、膜筏、结合DNA转录因子、铂耐药是复方干预神经毒性的主要途径。PPI中关键靶点蛋白与活性成分的分子对接结果良好。结论初步研究了黄芪桂枝五物汤干预紫杉醇周围神经毒性的作用机制,探明了黄芪桂枝五物汤可以通过多个靶点、多条通路来发挥干预紫杉醇周围神经毒性的作用。