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关键词： 交泰调脉方   动脉粥样硬化   网络药理学  

摘要： 运用网络药理学挖掘交泰调脉方治疗动脉粥样硬化的潜在靶点及其相关机制及作用,为交泰调脉方临床应用提供理论参考依据。方法 利用TCMSP数据库筛选确定交泰调脉方药物成分,利用Swiss Target Prediction数据库预测药物作用靶点并进行筛选,利用OMIM、GeneCards、DRUGBANK、DisGeNET数据库查找动脉粥样硬化疾病作用靶点,确定交集基因,通过STRING数据库构建PPI蛋白互作网络。使用Cytoscape3.9.0软件对“PPI”网络相互作用进行拓扑分析,并构建“药物-成分-靶点图”网络图,采用Network Analyzer对活性成分进一步分析。用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析,利用Cytoscape3.9.0软件构建“相关靶点-通路关系”。用AutoDock Vina软件对接筛选后的药物成分和靶点,以验证网络分析结果的可靠性。结果 交泰调脉方活性成分靶点与动脉粥样硬化疾病靶点有112个共有靶点,其中筛选后得到主要活性成分14个。通过“PPI”网络图得到核心靶点AKT1、STAT3、EGFR、PPARG、PTGS2、MMP9、KDR、AR、PPARA、EZH2、MAPK14等。通过富集分析得到主要信号通路55条,其中包括内分泌抵抗通路、5-羟色胺能突触通路、PPAR信号通路等。对筛选后的药物成分和靶点做分子对接,亲和力<-4.0 kcal/mol显示交泰调脉方筛选的活性成分和获得的治疗动脉粥样硬化潜在靶点有较强的亲和能力。结论 交泰调脉方可通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗动脉粥样硬化的作用。

关键词： 网络药理学   芍药甘草汤   子宫腺肌病   细胞增殖   细胞凋亡   细胞迁移  

摘要： 目的研究芍药甘草汤对子宫腺肌病(adenomyosis,AM)间质细胞的影响,并基于网络药理学探讨芍药甘草汤治疗AM的分子机制。方法原代培养AM原代间质细胞,制备芍药甘草汤SD大鼠含药血清,采用随机数字法将其分为空白组、正常血清组、芍药甘草汤含药血清低、中、高剂量组。采用MTT法检测芍药甘草汤含药血清对AM间质细胞增殖的影响;采用划痕实验检测AM间质细胞的迁移情况;采用流式细胞术检测AM间质细胞的凋亡情况;采用网络药理学方法研究芍药甘草汤治疗AM的主要活性成分、关键靶点和通路。结果与干预24 h后比较,干预48 h后芍药甘草汤含药血清低、中、高剂量各组AM间质细胞增殖率均降低(P<0.05),筛选出48 h干预时间的细胞进行后续实验;与空白组、正常血清组比较,干预24 h后芍药甘草汤含药血清中、高剂量组AM间质细胞增殖率降低(P<0.05),干预48 h后芍药甘草汤含药血清低、中、高剂量组AM间质细胞增值率降低、迁移距离缩短、凋亡率升高(P<0.05)。与芍药甘草汤含药血清低剂量组比较,干预48 h后芍药甘草汤含药血清中、高剂量组AM间质细胞增殖率降低、迁移距离缩短、凋亡率升高(P<0.05);与芍药甘草汤含药血清中剂量组比较,干预48 h后芍药甘草汤含药血清高剂量组AM间质细胞增殖率降低、迁移距离缩短、凋亡率升高(P<0.05)。网络药理学提示芍药甘草汤治疗AM的中药成分涉及98个中药成分,58个关键靶点,其中核心靶点有13个,主要作用于磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B信号(Phosphatidylinositol 3-kinase-RAC serine/threonine-protein kinase,PI3K-Akt)通路、局部黏附、缺氧诱导因子-1信号(hypoxia-inducible factor 1,HIF-1)通路、雌激素信号通路、类固醇激素生物合成、丝裂原活化蛋白激酶信号(mitogen-activated protein kinase,MAPK)通路、卵巢类固醇合成等130条信号通路。结论芍药甘草汤通过抑制AM间质细胞增殖、迁移,促进AM间质细胞凋亡从而发挥治疗作用,其效果呈浓度和时间依赖性;芍药甘草汤可能通过多成分、多靶点、多信号通路相互作用抑制AM的发生发展,缓解痛经,为下一步深入探讨芍药甘草汤治疗AM的起效靶点和具体调控机制提供科学依据。

关键词： 五苓散   拆方   网络药理学   肾功能   配伍   实验验证  

摘要： 目的:应用传统中医药拆方理论和现代网络药理学分析方法考察经典利湿名方五苓散(茯苓、猪苓、泽泻、白术、桂枝)保护肾功能的配伍合理性。方法:应用中医药方剂配伍中的“君-臣-佐”法则将五苓散进行拆方分组,在TCMSP网站获取君药、臣药、佐药的活性化合物,并在TCMSP、SWISS Target Prediction平台获取这些化合物的作用靶点,在Genecards、DisGeNET、OMIM数据库获取保护肾功能靶点,药物与功效靶点取交集后得到五苓散各拆方组保护肾功能的作用靶点,将这些作用靶点按照“君-臣-佐”进行拆分,进行相关蛋白互作、作用通路及生物功能分析,并基于拆方网络药理学分析结果,考查“君-臣-佐”对特征性共表达基因的影响,以佐证其联合增效的作用。结果:五苓散“君-臣-佐”共同调控核心靶点蛋白激酶B(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白介素6(IL6)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体1(ESR1)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)等发挥保护肾功能作用,其中臣药白术特征性调控核心靶点为白介素1β(IL1B)、髓过氧化物酶(MPO)、CA9,佐药桂枝特征性调控核心靶点为基质金属蛋白酶9(MMP9)、醛糖还原酶(AKR1B1)、芳香烃受体(AHR),君药保护肾功能主要作用通路为糖尿病并发症中的cAMP信号通路、AGE-RAGE信号通路、cGMP-PKG信号通路、等,“臣-佐”还特征性贡献了糖尿病心肌病、脂肪细胞脂解调节、TRP通道炎症介质调节、等作用通路,“臣-佐”中的差异靶点IL1B、血红素加氧酶-1(HMOX1)、Toll样受体4(TLR4)、F3、MMP9、组蛋白脱乙酰基酶2(HDAC2)可增强对PI3K-AKT信号通路、Rap1信号通路、甲状腺激素信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路、MAPK信号通路等的调控,差异靶点毒蕈碱型胆碱受体M3(CHRM3)、MPO、TLR4、等也参与细胞对氮化合物的反应、细胞对有机氮化合物的反应。细胞实验验证表明,君-臣-佐组对Tlr4、Il1b、Mmp9 mRNA特征性靶点的下调较君组更强。结论:拆方网络药理学分析表明,五苓散“君-臣-佐”具有良好的配伍合理性,君药、臣药、佐药相辅相成,共奏保护肾功能之功。

关键词： 运脾治鼻   网络药理学   腺样体肥大   机制研究   苍术酮   氧化应激  

摘要： 目的基于网络药理学方法探讨运脾药对“苍术-薏苡仁”治疗儿童腺样体肥大(adenoidal hypertrophy,AH)的药理机制。方法筛选“苍术-薏苡仁”的活性成分及相关靶点,构建“药物-成分-靶点”可视化网络图;检索儿童AH疾病相关靶点,构建“药物-疾病”交集靶点PPI网络;对核心靶点进行富集分析,并构建“靶点-通路”网络;Western blot法检测不同组别小鼠脾组织中目标靶点蛋白表达,验证苍术酮通过HIF-1α-sumoylation调节炎症因子的表达。结果得到“苍术-薏苡仁”药物靶点71个,儿童AH疾病相关靶点337个,“药物-疾病”交集靶点30个;“苍术-薏苡仁”主要活性成分为豆甾醇、苍术酮等,其参与的生物学过程有管形态形成、对激素的反应等,涉及的细胞成分有膜筏、转录调节因子复合物等,相关靶点功能主要富集于转录因子结合、蛋白质结构域特异性结合等,其涉及的主要信号通路有HIF-1信号通路、VEGF信号通路等;动物实验结果显示苍术酮治疗组SUMO-1、HIF-1α、VEGF及VEGF-R蛋白表达量均较模型组下调(P<0.05)。结论“运脾法”治疗儿童AH是通过多成分、多靶点、多通路实现的,主要从抗炎、免疫调节、抗氧化等方面发挥其治疗儿童AH的作用。

关键词： 胆管癌   中医证候   疏肝健脾   清热祛湿   肝郁脾虚证   肝胆湿热证   湿热蕴蒸证   热毒炽盛证   脾阳虚衰证  

摘要： 胆管癌是由胆汁淤积、胆管结石、肝硬化、自身免疫性肝病、肝炎等前置病变恶化发展而来的重大疾病。通过对临床诊疗中常见的5种胆管癌中医证型进行总结,分析各证型胆管癌的临床常用方药。通过频次与用药规律分析,筛选出关键中药,并根据其功效归纳为疏肝健脾、清热祛湿与其他功效中药,并从现代药理学角度总结了相关研究进展。通过系统梳理胆管癌辨证论治的用药规律,为胆管癌临床诊疗和抗胆管癌中药创新药物研发提供参考。

关键词： PBL   药理学   教学方法   医药学教育  

摘要： 在医药学教育中,药理学是一门主要的学科,是与药学、临床医学紧密联系的桥梁。PBL教学法是一种创新的教学方法,学生通过PBL教学方法对教学过程中存在的独立、复杂的问题进行进一步的探究,从而培养学生独立思考问题的能力和独立解决问题的能力,并从中获得药理学学科中的知识和技能。PBL教学法可以增强学生对药理学知识的掌握。文章浅述几点PBL教学法在药理学教学过程中运用的策略,以供借鉴。

关键词： 多囊卵巢综合征   苓桂术甘汤   网络药理学   分子对接技术   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接探究苓桂术甘汤治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome,PCOS)的作用机制。方法采用中药系统药理学数据库TCMSP和已发表文献筛选苓桂术甘汤方有效活性成分,通过在线人类孟德尔遗传数据库(GeneMap)、DisGeNET数据库、人类基因数据库(Gencards)以及DrugBank数据库检索PCOS的靶点。利用Venny 2.1.0在线平台获取药物疾病交集靶点。运用Cytoscape 3.9.1软件构建“药物-活性成分-潜在靶点”网络图。通过STRING数据库构建PPI网络图。依托DAVID数据库对药物疾病交集靶点进行KEGG富集分析和GO的生物功能分析。借助Chem 3D、AutoDock Tools、Vina 1.1.2以及Pymol软件对药物关键活性成分和疾病的重要靶点进行分子对接。结果共筛选出交集靶点348个,核心靶点11个,对应着4种中药的144个有效活性成分。通过GO分析得到1660条生物过程。KEGG富集分析得到187条信号通路。将药物关键活性成分及疾病关键靶点进行分子对接。结论苓桂术甘汤中的关键成分通过PI3K/Akt、HIF-1、FoxO、胰岛素抵抗等信号通路治疗PCOS及其引发的代谢紊乱性疾病。

关键词： 小儿风热清合剂(口服液)   甲型流感   网络药理学   分子对接   活性成分  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接方法,筛选小儿风热清合剂(口服液)防治甲流的活性成分、潜在靶点和作用机制。方法首先从中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)及BATMEN-TCM数据库获取小儿风热清合剂(口服液)成分数据及预测靶点,从GeneCards数据库获得甲型流感治疗靶点。随后通过功能富集揭示潜在靶点涉及的功能,并利用Cytoscape软件构建“药材–活性成分–潜在靶点”网络,基于STRING数据库构建潜在靶点的蛋白相互作用网络。最后对关键靶点与成分进行分子对接验证。结果共筛选到小儿风热清合剂(口服液)活性成分192个,潜在靶点141个。基于“药材–活性成分–潜在靶点”网络以及分子对接技术,筛选到排名靠前的关键活性成分17个,排名靠前的核心靶点分别为前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、热休克蛋白(HSP90AA1)、前列腺素内过氧化物合酶1(PTGS1)、一氧化氮合酶2(NOS2)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARG)、肾上腺素能受体β2(ADRB2)。共筛选出2747个基因本体条目,富集到176条与药物防治甲型流感相关的通路。小儿风热清合剂(口服液)防治甲型流感作用主要与外界刺激应答、信号转导、氧化应激和病毒感染通路等相关。分子对接结果显示,核心靶点与活性成分间结合稳定。结论小儿风热清合剂(口服液)可能通过抑制甲型流感病毒增殖、抑制机体炎症和调节免疫等多种途径,发挥对甲型流感的防治作用。

关键词： 年龄相关性黄斑变性   决明子   网络药理学   生物信息学   分子对接  

摘要： 目的:对决明子治疗年龄相关性黄斑变性作用机制进行网络药理学分析与分子对接预测。方法:运用中医药系统药理学数据库及分析平台(TCMPS)数据库检索所需决明子有效药物成分,SwissTargetPrediction数据库获取其相关基因靶点。在DisGeNET数据库与GeneCards数据库中以关键字“Age-related macular degeneration”检索获得疾病相关基因。所有基因靶点在绘制Venn图筛选后,导入Cytoscape 3.8.0软件中构建决明子-化学活性成分-靶点可视化网络图谱。在STRING平台绘制蛋白质相互作用可视化网络,从DAVID在线数据库中获得GO生物功能富集分析与KEGG通路富集分析结果。计算机模拟关键蛋白靶点和药物成分的分子对接。结果:共检索到大黄酸、决明素等决明子有效活性成分9个,对应基因靶点208个,年龄相关性黄斑变性基因靶点1977个,两者交集基因靶点75个;GO生物功能与KEGG通路富集分析分别得到518个条目与146条通路。结论:决明子可通过影响PI3K-Akt信号通路、脂质与动脉粥样硬化等通路作用于TP53、TNF、MYC等靶点治疗年龄相关性黄斑变性;其治疗作用可能是多靶点、多通路且由其中多种成分介导的。

关键词： 糖尿病肾病   网络药理学   苍术   黄柏   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨苍术-黄柏药对治疗糖尿病肾病(diabetic kidney disease,DKD)的有效成分、潜在作用靶点及作用机制。方法:通过中药系统药理学平台检索苍术-黄柏药对的有效成分、潜在作用靶点,在人类基因数据库和人类孟德尔遗传数据库数据库筛选与糖尿病肾病有关的疾病靶点,然后绘制Venn图,得出苍术-黄柏药对治疗DKD的共同靶点,借助Cytoscape 3.7.2构建“药对成分-靶点-疾病”可视化网络。利用STRING平台绘制交集靶点PPI网络,并利用MCODE插件筛选核心子网络,在David数据库针对核心靶点进行GO及KEGG通路富集分析。结果:检索筛选出苍术-黄柏药对有效活性成分28个,潜在作用靶点202个,其中,苍术-黄柏药对治疗DKD的133个,通过PPI核心子网络发现包括JUN、MMP9、CXCL8、TNF、VEGFA、PTGS2、AKT1、IL-6等在内的52个靶点可能是药对治疗DKD的核心靶点,KEGG通路富集分析发现苍术-黄柏药对治疗DKD的作用机制可能与磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3 kinase-protein kinase B,PI3K-Akt)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、Toll样受体(toll-like receptor,TLR)及缺氧诱导因子1(hypoxia inducible factor-1,HIF-1)等88条信号通路有关。结论:苍术-黄柏药对治疗DKD体现了多成分、多靶点、多途径的特点,为进一步探讨其作用机制提供了参考。