课程文献中心 更多>>

关键词： 水蛭素   血瘀证   IgA肾病   网络药理学  

摘要： 目的基于网络药理学方法探讨水蛭素通过干预血瘀证治疗IgA肾病(IgAN)的通路及靶点。方法通过SuperPred与PALM-IST数据库获取水蛭素潜在靶点,使用Genecards和OMIM获取血瘀证与IgAN的相关靶点。将水蛭素和血瘀证的交集靶点导入String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络并进行拓扑学分析,以度值排序前10节点为血瘀证相关的水蛭素核心靶点。在Nephroseq数据库中分析水蛭素核心靶点与IgAN患者临床特征的相关性。结果水蛭素的204个靶点中有41个靶点与血瘀证(1047个靶点)相关,其中核心靶点为血管内皮生长因子A(VEGFA)、血管性血友病因子、丝氨酸蛋白酶抑制因子肽酶抑制因子、前列腺素内过氧化物合酶、凝血因子Ⅲ、凝血因子Ⅱ(F2)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、低氧诱导因子1(HIF1A)、基质金属蛋白酶2(MMP2)和雌激素受体1(ESR1)。相关性分析结果表明,IgAN患者肾小球中VEGFA、ESR1 mRNA表达与肾小球滤过滤(GFR)呈正相关,HIF1A mRNA表达与GFR呈负相关(均P<0.05);肾小管间质中VEGFA mRNA表达与血肌酐呈负相关,HIF1A mRNA表达与血肌酐呈正相关(均P<0.05);血液中HSP90AA1 mRNA表达与血肌酐呈负相关(P=0.006);肾小管中MMP2 mRNA表达与血肌酐呈正相关(P=0.002);血液中F2 mRNA表达与24 h尿蛋白量呈负相关,肾小管间质中ESR1 mRNA表达与24 h尿蛋白量呈负相关(均P<0.05)。结论VEGFA、F2、HIF1A、HSP90AA1、MMP2和ESR1是水蛭素干预血瘀证治疗IgAN的关键基因且与临床特征密切相关。

关键词： 鬼臼毒素   网络药理学   胃癌  

摘要： 目的利用网络药理学和实时荧光定量聚合酶链式反应(Quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)法研究鬼臼毒素对胃癌的作用机制。方法利用TCMSP、Pubchem、Swiss Target Prediction、Similarity ensemble approach、Pharmapper数据库预测鬼臼毒素作用于胃癌的潜在靶标,通过蛋白互作网络和富集分析法找到关键节点和作用的主要通路,并采用qRT-PCR实验验证潜在靶基因。结果通过查询多个数据库筛选获得15个胃癌特征基因(可能为鬼臼毒素的潜在靶标)。PPI网络图谱进一步显示,15个基因所对应的蛋白是鬼臼毒素作用于胃癌的关键靶标。通过GO富集分析和KEGG通路富集分析确定PI3K/AKT通路为主要作用通路。通过qRT-PCR验证发现,鬼臼毒素可以抑制与PI3K/AKT信号通路相关基因(CCND1、TP53、MET、RELA、EGFR、BCL2L1、IGF1R)的表达。结论鬼臼毒素可能通过PI3K/AKT信号通路发挥抗胃癌细胞生长的作用。

关键词： 网络药理学   胃复方   胃癌   PI3K/Akt  

摘要： 目的 基于网络药理学探究胃复方治疗胃癌的作用机制。方法 应用中药系统药理学数据库及分析平台、DrugBank、GeneCards等数据库检索胃复方所含12味中药的有效化学成分及治疗胃癌的潜在靶点,将潜在靶点导入DAVID数据库进行基因本体论(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,筛选出潜在的生物过程和涉及的信号通路。采用CCK-8及Western blotting对KEGG分析富集程度最大的信号通路进行验证。结果 胃复方治疗胃癌可能涉及以槲皮素、木樨草素为代表的88种有效活性成分,可能作用于以TP53、STAT3、Akt为代表的194个靶点。GO分析涉及148个生物过程,KEGG分析筛选出PI3K/Akt、TNF、HIF-1等信号通路。体外实验证实胃复方提取物可抑制人胃癌细胞HGC-27增殖,降低其p-PI3K、PI3K、p-Akt、Akt蛋白表达水平;而对于人正常胃黏膜上皮细胞GES-1,胃复方提取物可促进其增殖,上调其p-PI3K、PI3K、p-Akt、Akt蛋白表达。结论 本研究初步预测了胃复方治疗胃癌“中药-多成分-多靶点-多通路”的调控网络,并验证了胃复方提取物可能通过抑制PI3K/Akt信号通路相关蛋白的表达发挥抑制胃癌细胞增殖的作用,证明了网络药理学技术挖掘胃复方具有一定的可信度,但同时兼有不全面性,为进一步探索胃复方的作用机制奠定了基础。

关键词： 心肌纤维化   银杏叶   葶苈子   丝裂原活化蛋白激酶信号通路   核因子-κB   网络药理学   基因表达  

摘要： 目的:借助网络药理学分析,联合分子对接及基因表达芯片分析验证,探讨银杏叶-葶苈子延缓心肌纤维化的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台筛选银杏叶-葶苈子的有效成分和靶点,通过人类基因数据库(GeneCards)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取心肌纤维化的靶点。将有效成分靶点与心肌纤维化靶点分别导入Cytoscape 3.8.0软件构建药物-成分-靶点网络、STRING平台构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,再利用Cytoscape自带的网络分析工具计算网络拓扑参数,分析获取关键靶点。将交集靶点通过R软件进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。最后利用基因表达数据库(GEO)的芯片数据进行数据分析,并利用AutoDock软件进行有效成分与核心靶点分子对接,Pymol软件绘制分子对接模式图验证核心靶点。结果:通过相关数据库,获得药物有效成分39个,筛选出有效成分作用靶点116个,心肌纤维化靶点3322个。网络拓扑图分析获得转录因子P65(RELA)、雄性激素受体(AR)、前列腺素G/H合酶1(PTGS1)、肿瘤蛋白质P53(TP53)、核因子-κB(NF-κB)抑制剂α(NFKBIA)等关键靶点。GO分析主要涉及对化学应激的细胞反应、对类固醇激素反应、DNA结合转录因子结合、核受体活动、泛素蛋白连接酶等过程,KEGG富集分析主要有脂质和动脉粥样硬化、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路(MAPK)等信号通路。基因表达数据库分析验证表明,前6个核心靶点中,AR、RELA、TP53、NFKBIA、PTGS1差异有统计学意义(P<0.05)。分子对接结果显示主要活性成分与靶点均能自发结合且大部分结合能力良好。结论:银杏叶-葶苈子可能通过NF-κB、MAPK、PI3K/AKT信号通路等发挥抗炎、抗氧化应激作用,抑制成纤维细胞相关增殖和活化过程,减少细胞外基质沉积,从而发挥延缓心肌纤维化作用。

关键词： 银屑病   银地消庀汤   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:运用网络药理学及分子对接方法探究银地消庀汤治疗银屑病的潜在机制。方法:通过TCMSP平台、GeneCards等数据库获得银地消庀汤的活性成分、药物靶点、疾病靶点,将药物靶点、疾病靶点取交集获得共同靶点,构建“药物-活性成分-共同靶点”网络及蛋白质-蛋白质相互作用网络,并进行基因本体功能和京都基因与基因组百科全书通路富集分析。结果:银地消庀汤包含槲皮素、山柰酚、木犀草素等248种活性成分,涉及219个共同靶点,富集分析主要涉及调节脂质与动脉粥样硬化、肿瘤坏死因子信号通路、白细胞介素-17信号通路。结论:银地消庀汤治疗银屑病的潜在药理学机制及其活性化合物可能与脂质代谢、免疫调节、炎症诱导等多途径协同调节有关。

关键词： 桃红四物汤   兔退变软骨细胞   细胞凋亡   炎症反应   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨桃红四物汤对膝骨关节炎的作用机制,并通过实验进行验证。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选中药复方桃红四物汤的有效成分及对应的靶蛋白,将药物靶蛋白通过Uniprot数据库转换为对应的靶基因名称;以“Knee osteoarthritis”为关键词依次查询GeneCards、在线人类孟德尔遗传(OMIM)获得膝骨关节炎疾病靶点;并将药物靶基因与疾病靶基因相映射,利用Cytoscape 3.7.2软件,构建“药物有效成分-疾病靶点”交互网络。应用Network Analyzer插件进行拓扑参数分析,使用String数据库进行靶点间的蛋白互作分析,构建PPI网络图,采用基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析预测该方活性成分对膝骨关节炎的作用机制,应用AutoDock Vina对关键靶点及重要有效成分进行分子对接验证,根据分析结果进行实验验证。桃红四物汤含药血清2.5、5、10 g/kg组处理兔退变软骨细胞24 h后,检测细胞凋亡和白介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子(VEGF)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)及半胱氨酸蛋白酶-3(Caspase-3)的表达情况。结果:筛选得到桃红四物汤潜在活性成分44个,药物-疾病共同靶点110个;得到肿瘤坏死因子(TNF)、IL-6、磷酸化蛋白激酶(AKT1)、VEGFA、肿瘤蛋白P53(TP53)、IL-1β、MMP-9、Caspase-3、等是桃红四物汤作用于膝骨关节炎的核心靶点;分子对接技术筛选出Degree较高的前5位核心成分化合物分别是槲皮素、木犀草素、山柰酚、黄芩素、β-胡萝卜素;KEGG通路富集分析涉及PI3K/AKT、IL-17、TNF、P53、Wnt、等信号通路,GO富集分析在BP中主要包括对氧化应激反应、炎症反应、营养代谢过程的反应、凋亡信号通路的调控、等;CC中主要包括膜筏、膜微区和囊泡腔等;MF中主要包括脱氧核糖核酸(DNA)结合、转录因子结合、细胞因子受体结合和泛素样蛋白连接酶结合与桃红四物汤延缓关节软骨退变作用机制相关,分子对接结果表明靶点与成分具有较好结合性。体外实验表明,与模型对照组比较,桃红四物汤含药血清2.5、5、10 g/kg组兔退变软骨细胞的凋亡率均明显降低(P<0.05),IL-6、VEGF、MMP-9及Caspase-3的蛋白表达明显下调(P<0.05)。结论:本研究证实桃红四物汤抑制兔退变软骨细胞凋亡的作用机制较为复杂,其过程涉及多种潜在靶点、有效成分及信号通路,但其主要的机制可能与其同时调控炎症反应和异常血管新生有关。

关键词： 临床药理学   药学   教学改革   因材施教   专业差异  

摘要： 临床药理学是一门覆盖学科广、涉及内容多且理论性强的课程。为了促进学生将知识点内化于心,做到融会贯通,南方医科大学药学院根据实际教学情况,结合药学专业和临床药学专业的培养目标、专业需求的差异,针对这两个专业背景结合实际应如何开展临床药理学课程教学进行了探讨,从药学专业和临床药学专业的教学内容、课时、案例和教学方法等方面进行了相应的改革,以期做到因材施教,最大化启发学生学习能动性,提高临床药理学课程的教学质量。

关键词： 网络药理学   十八反   缺血性中风   作用机制  

摘要： 目的运用网络药理学方法探讨附子-半夏药对治疗缺血性中风的作用机制。方法通过TCMSP数据库收集药对的有效成分及作用靶点信息;运用Uniprot蛋白质数据库寻找蛋白质靶点和相应的人类基因;利用GeneCards数据库和OMIM数据库预测疾病靶点,运用Venny2.1取二者交集靶点;利用STRING、Cytoscape3.7.2绘制PPI网络;最后通过R软件进行GO以及KEGG分析,并使用Cytoscape3.7.2软件构建“成分-疾病靶点-通路图”。结果附子-半夏药对共同拥有β-谷甾醇、黄芩苷、豆甾醇、卡文定碱、松柏苷等主要活性成分通过脂质、粥样硬化、细胞凋亡及P53信号通路作用在AKT1、CASP3、PTGS2、TP53、PPARG等靶点上治疗缺血性中风。结论附子-半夏药对通过多靶点、多途径、多通路发挥防治缺血性中风的作用。