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关键词： 益肾壮腰丸   骨质疏松症   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学及分子对接探讨益肾壮腰丸治疗骨质疏松症的作用机制。方法:利用TCMSP数据库及HERB平台筛选益肾壮腰丸有效成分,在GeneCards数据库和OMIM数据库获得骨质疏松症的疾病靶点,从而构建“中药—成分—靶点”网络图。交集基因导入STRING平台构建蛋白互作网络图(PPI)并筛选出核心靶点。最后进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)分析,并通过分子对接验证结果。结果:筛选出益肾壮腰丸活性成分140个,基因靶点260个,疾病靶点1381个,其中核心靶点19个。GO分析结果显示,靶点蛋白主要富集在细胞周期、炎症、激素、脂质代谢等方面。KEGG分析结果显示,主要涉及细胞生长、分化及凋亡相关通路及炎症和脂质代谢的相关通路。分子对接结果显示,β-谷甾醇、异补骨脂甲素等有效成分与IL-6、TNF等核心靶点能有效结合。结论:益肾壮腰丸中的β-谷甾醇、异补骨脂甲素等有效成分可能通过作用于IL-6、TNF等核心靶点抑制破骨细胞分化,并促进成骨细胞生成,同时与减轻氧化应激、抑制炎症反应及激素调节密切相关,从而对骨质疏松起到一定改善作用。

关键词： 电子邮箱   机器翻译   学术不端行为   Word文档   英文摘要   授权书   单位公章   基金项目  

摘要： 结合本刊稿约及平时常见问题,编辑部温馨提示:1.投稿须登录本刊官网(https://***)上传稿件,并填写所有作者的姓名、单位、电话、电子邮箱等信息,文章撰写格式请参照本刊投稿要求。2.投稿时须上传著作权许可使用授权书和加盖单位公章的科研诚信承诺书,模版从官网下载。3.投稿时应确认作者顺序及作者署名单位,一般不得变更。如要添加、减少作者或变更作者顺序,需要提出充分的证据,否则直接做退稿处理。作者不宜太多,以对论文有实质性贡献为准。4.本刊启用了学术不端检测系统,凡有学术不端行为的论文,将立即通报作者单位并拉入本刊黑名单。5.来稿请采用Word文档格式;论文太大不利于编辑和专家审稿,大于10 MB时需进行压缩。6.文稿须同时提供中文和英文的题名、作者姓名、单位、摘要、关键词、基金项目、通信作者。杜绝使用机器翻译。为便于国际交流,英文摘要可以比中文摘要更详细。

关键词： 子宫内膜异位症   上皮-间质转化   琥珀散   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学研究琥珀散调控上皮-间质转化(epithelial mesenchymal transition,EMT)治疗子宫内膜异位症(endometriosis,EMs)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、SwissTargetPrediction数据库检索琥珀散的活性成分及靶点;利用人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、药物靶标数据库(therapeutic targetdatabase,TTD)以及DrugBank、PharmGkb数据库检索EMs和EMT靶点,并绘制韦恩图;通过Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-有效成分-靶点”网络;对关键靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。结果:共筛出琥珀散活性成分111个,主要包括山柰酚、槲皮素、黄芩苷等;获得“药物-疾病-表型”靶点198个;GO分析发现主要生物学过程富集在细胞对氧化应激的反应、对活性氧的反应等方面;KEGG分析发现主要富集在PI3K/AKT、MAPK、HIF-1等信号通路方面。结论:琥珀散调控EMT治疗EMS的作用机制可能与其抑制黏附、侵袭、血管生成等途径有关。

关键词： 靖咽丸   慢性咽炎   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的 基于网络药理学和分子对接技术探究靖咽丸治疗慢性咽炎的作用机制。方法 通过TCMSP数据库及药典补充获得靖咽丸的药物活性成分,使用Genecards,Drug Bank,OMIM,Disgenet数据库获得慢性咽炎疾病靶点,两者取交集,获得靖咽丸治疗慢性咽炎的治疗靶点,并对治疗靶点进行GO、KEGG富集分析。使用Cytoscape 3.9.1软件构建药物-成分-靶点网络,分析网络获得靖咽丸的关键药物成分。将治疗靶点上传至STRING数据库得到蛋白互作关系网络(PPI),分析PPI网络得到关键治疗靶点。最后,使用Auto Dock Vina软件对关键药物成分和关键治疗靶点进行分子对接,使用Discovery Studio(2019)对对接结果进行可视化分析。结果 靖咽丸中有119个药物化学成分,作用于269个靶点,慢性咽炎疾病靶点1253个,两者求交集获得134个治疗靶点。关键药物成分有甘草酸、川陈皮素、槲皮素、木犀草素、山奈酚、柚皮素、β-谷甾醇、薄荷脑等,关键治疗靶点为TNF、IL6、STAT1、NCF1,作用于TNF信号传导途径、PI3K-Akt信号通路、铂耐药性、IL-17信号通路等炎症通路,调控炎症反应和咽部细胞的修复。94%的分子对接结果的Affinity<-5.0 kcal·mol^(-1),提示关键靶点和关键药物成分之间有较好的结合活性。结论 靖咽丸主要通过甘草酸、川陈皮素、木犀草素等作用于TNF、IL6、STAT1、NCF1等靶点,调控TNF、PI3K-Akt等信号通路,减轻炎症反应。

关键词： 儿童   过敏性鼻炎   辛夷花散   临床研究   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:分析辛夷花散治疗过敏性鼻炎(AR)肺经伏热证患儿的临床疗效,基于网络药理学和分子对接技术初步探讨辛夷花散治疗儿童AR的机制。方法:临床研究方面,采用辛夷花散治疗35例AR肺经伏热证患儿,治疗2周后观察患儿临床症状及体征改善情况。机制研究方面,应用中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)筛选辛夷花散核心中药所含有的活性成分及存在的潜在靶点,利用CytoScape 3.10.1软件构建“中药-活性成分-靶点”网络图。检索DrugBank Online、在线人类孟德尔遗传数据系统(OMIM)及药物靶点数据库(TTD)、GeneCards等数据库中AR的疾病相关靶点。利用R语言4.3.2绘制“中药-疾病靶点”韦恩图,将交集靶点先导入STRING数据库,再导入CytoScape 3.10.1软件构建蛋白相互作用(PPI)网络图,筛选关键靶点。将关键靶点导入DAVID数据库进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。应用AutoDock 4.2软件开展关键中药化合物与关键靶点蛋白的分子对接,并通过PyMol 2.4.0软件达成对接结果可视化。结果:临床研究方面,治疗后总有效率为91.43%,其中显效21例,有效11例,无效3例。治疗后主要症状、次要症状及体征评分均下降(P<0.05)。机制研究方面,从辛夷花散核心中药中筛选出5个关键活性成分(槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇、豆甾醇、木犀草素等)及243个潜在靶点。筛选出AR相关靶点2426个,获得辛夷花散与AR交集靶点124个,筛选出肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素(IL)-6、RAC-α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT1)、IL-1β、前列腺素内过氧化物酶2(PTGS2)等5个关键靶点。GO富集结果显示,关键靶点主要富集在炎症应答及雌激素反应元件结合等方面。KEGG富集结果显示,关键靶点主要富集在IL-17信号通路、辅助T细胞(Th17)分化及TNF信号通路等。分子对接结果显示,25组结合能均≤-5.00 kcal/mol。结论:辛夷花散治疗儿童AR临床疗效显著,辛夷花散核心中药可能是通过多成分、多靶点、多通路达到治疗儿童AR的目的。

关键词： 珍宝丸   冠心病   缺血性脑卒中   网络药理   分子对接  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨珍宝丸“异病同治”治疗缺血性脑卒中和冠心病等心脑血管疾病的作用机制。方法:通过TCMSP、OMIM、GeneCards、DisGeNET数据库筛选珍宝丸治疗冠心病和缺血性脑卒中的潜在靶点,并通过STRING数据库进行PPI分析,使用Cytoscape 3.7.2软件对PPI网络进行拓扑分析,筛选出关键靶点。利用DAVID数据库进行GO和KEGG功能富集分析。通过构建“活性成分-靶点-通路”网络筛选出核心活性成分和核心靶点后,利用AutoDock Vina进行分子对接预测。结果:筛选后得到珍宝丸治疗冠心病和缺血性脑卒中的潜在靶点有74个;对PPI网络分析后得到10个关键靶点,包括TNF、IL-6、ALB、IL-1B、ICAM-1、TLR4、CXCL8、MMP9、TGFB1、PTGS2;GO和KEGG富集分析表明,与冠心病和缺血性脑卒中相关且排序靠前的通路有AGE-RAGE信号通路、脂质和动脉粥样硬化、流体剪切力与动脉粥样硬化等,主要与炎症反应、基因表达负调控、血管生成的正调控等生物过程有关。核心活性成分(2R)-7-羟基-5-甲氧基-N-乙酰色胺-黄酮类化合物-4-1、β-谷甾醇、谷甾醇、豆甾醇、甘草素与KDR、NOS2、PIK3CA、PPARG、PTGS2结合稳定。结论:基于网络药理学分析和分子对接的方法发现珍宝丸可以通过多靶点、多途径治疗冠心病和缺血性脑卒中,并且可能通过抗炎、抗氧化应激等作用,发挥“异病同治”效果。

关键词： 中国药理学会   弋矶山医院   皖南医学院   定量药理学   治疗学   中国临床药理学   特聘教授  

摘要： 《中国临床药理学与治疗学》是由中国科学技术协会主管、中国药理学会主办、皖南医学院弋矶山医院承办的国家级学术性月刊(ISSN 1009-2501,CN 34-1026/R),创刊于1996年6月,创刊人是全国著名定量药理学家孙瑞元教授,现任主编为国家杰出青年基金获得者复旦大学特聘教授黄志力。

关键词： 慢性肾脏病   溃疡性结肠炎   温脾汤   网络药理学   异病同治   分子对接  

摘要： 目的:通过网络药理学及分子对接探讨温脾汤对慢性肾脏病和溃疡性结肠炎的作用机制。方法:运用TCMSP数据库检索温脾汤的活性成分,利用SwissTargetPrediction平台预测靶点,在GeneCards、DisGeNET数据库中获得两种疾病的靶点,将上述靶点导入微生信网站中利用Venny图取交集,获得药物和疾病的共同靶点;将交集靶点导入STRING数据库获取蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)关系,导入Cytoscape 3.10.0,构建“药物-成分-疾病-靶点”网络,构建PPI网络进行分析;利用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并利用R语言将结果进行可视化分析;利用Autodock 4对核心靶点和关键成分进行分子对接。结果:温脾汤通过五味子酯乙鳞叶甘草素A、山柰酚等关键成分作用于白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、蛋白激酶B(AKT1)、肿瘤蛋白p53(TP53)、信号转导和转录激活因子(STAT3)等核心靶点,发挥抗炎、抗氧化应激、调节细胞凋亡等作用,涉及癌症通路、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B信号通路、晚期糖基化终末产物-糖基化终末受体信号通路等;分子对接结果表明关键成分和核心靶点具有良好的结合亲和力。结论:温脾汤通过多成分、多靶点、多途径治疗慢性肾脏病和溃疡性结肠炎。

关键词： 恒古骨伤愈合剂   骨折愈合   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:采用网络药理学以及分子对接技术分析恒古骨伤愈合剂促进骨折愈合的机制。方法:通过检索TCMSP等数据库获得恒古的主要化合物成分和靶点及疾病靶点。将药物和疾病共有靶点制作成韦恩图,建立PPI网络,对PPI网络进行拓扑分析,MC0DE版块进行聚类分析,筛选出核心基因。构建成分–疾病–靶点网络图。使用R4.0.3软件进行GO功能富集和KEGG信号通路富集分析,之后构建成分–疾病–通路–靶点网络。采用AutoDockTools 1.5.7软件将关键活性成分和核心靶点进行分子对接,运用PyMOL对对接结果进行可视化。结果:获得恒古相关药物化合物成分106个,相关靶点946个;骨折愈合靶点2519个,疾病和药物共有靶点164个。PPI网络中有164个节点,3347条边。拓扑分析总共筛选出个82关键靶点。MCODE聚类分析总共得到6个基因簇和5个核心基因,成分–疾病靶点拓扑分析筛选出5个关键成分。GO富集总共富集到2474条生物过程,160项分子功能相关,91项细胞组成相关。KEGG通路富集总共富集到168条信号通路。分子对接结果显示,恒古的活性成分与骨折愈合的靶点基因有着很好的结合作用。结论:恒古骨伤愈合剂促进骨折愈合具有多通路、多成分、多靶点、多机制的特点。Objective: To analyze the mechanism of Osteoking promoting fracture healing by network pharmacology and molecular docking technology. Methods: By searching TCMSP, Batman-TCM, NCBI and other databases, the main compounds, targets and disease targets of Osteoking were obtained. The selected common targets of drugs and diseases were made into Wayne diagram, and then imported into STRING database to obtain PPI network. The PPI network was imported into Cystoscape3.8.0, and the Network Analyzer tool was used for topology analysis, and MC0DE was used for cluster analysis to screen out the core genes and construct the component-disease-target network diagram. AutoDockTools1.5.7 software was used to make molecular docking between key active ingredients and core targets, and PyMOL was used to visualize the docking results. Results: 106 components and 946 related targets of Osteoking related drugs were obtained. There are 2519 targets for fracture healing, and 164 targets for diseases and drugs. There are 164 nodes and 3347 edges in PPI network. A total of 82 key targets were selected by topological analysis. A total of 6 gene clusters and 5 core genes were obtained by MCODE cluster analysis, and 5 key components were selected by component-disease target topology analysis. GO enriched a total of 2474 biological processes, 160 related to molecular functions and 91 related to cell composition. KEGG pathway is enriched to a total of 168 signal pathways. T

关键词： 健脾益肾方   肾性贫血   表皮生长因子受体   网络药理学   高效液相色谱-三重四极杆串联质谱   慢性肾脏病  

摘要： 目的基于高效液相色谱-三重四极杆串联质谱(HPLC-QQQ-MS/MS)、网络药理学、分子对接及实验验证研究健脾益肾方治疗肾性贫血的作用机制。方法采用HPLC-QQQ-MS/MS技术,测定健脾益肾方的化学成分,运用TCMIP v2.0等数据库预测健脾益肾方化学成分与肾性贫血的靶点、通路,绘制出“交集成分-交集靶点-通路”网络图,筛选出健脾益肾方治疗肾性贫血的核心靶点及核心成分,并通过分子对接和动物实验进一步验证核心靶点和成分。结果从健脾益肾方中共鉴定出11个化学成分,通过Draw Venn Diagram平台筛选得到81个交集靶点,提示丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、磷脂酰肌醇-3-激酶催化亚单位α(PIK3CA)、表皮生长因子受体(EGFR)、B细胞淋巴瘤/白血病-2(BCL2)、V-Ha-Ras肉瘤病毒癌基因同源物(HRAS)等为核心靶点,丹酚酸A、迷迭香酸、大黄酸、毛蕊异黄酮葡萄糖苷和毛蕊异黄酮为核心成分。分子对接结果显示,网络药理学预测的核心靶点和成分可靠性较高;动物实验表明,健脾益肾方显著改善慢性肾脏病大鼠肾损伤和血常规参数,通过抑制EGFR从而治疗肾性贫血。结论通过成分测定和网络药理学关联分析、分子对接及实验验证,阐明健脾益肾方通过抑制EGFR治疗肾性贫血的作用机制,为其临床应用提供参考依据。