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关键词： 《麻醉药理学》   课程设计   分阶段整合式教学   综合能力  

摘要： 探讨《麻醉药理学》课程设计对提升学生综合能力的效果。方法:以麻醉学专业学生为研究对象,其中96人为课程设计实验组,102人为传统教学对照组。两组分别采用不同课程教学设计,比较两组在形成性考核、终极性考核和综合成绩等方面的差异。结果:实验组在形成性考核、终极性考核和综合成绩上明显优于对照组,并具有统计学差异;实验组问卷调查显示80%以上的学生认为课程设计的阶段式教学对学习兴趣的培养及对学生在麻醉实践、思维创新、文献查阅、口头表达等能力的提升上有明显帮助。结论:分阶段整合式教学能提高学生学习《麻醉药理学》的综合能力,值得推广运用。

关键词： 小儿解感颗粒   高效液相色谱-四极杆静电场轨道阱高分辨质谱   移行成分   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于高效液相色谱-四级杆静电场轨道阱高分辨质谱(HPLC-Q-Exactive-MS)技术分析鉴定小儿解感颗粒血浆移行成分,并结合网络药理学探究其治疗流感相关疾病的作用机制。方法:采用Agilent ZORBAX SB-Aq色谱柱(4.6 mm×150 mm,5μm),流动相为甲醇(A)-0.1%甲酸水(B),梯度洗脱,结合Xcalibur 3.0分析软件,鉴别小儿解感颗粒血浆移行成分,利用Swiss Target Prediction数据库预测血浆移行成分作用靶点,采用OMIM、Disgenet、Genecards数据库预测流感相关疾病靶点,通过Cytoscape 3.9.1软件构建"移行成分-潜在靶点"网络,运用STRING数据分析平台对潜在靶点进行蛋白互作(PPI)网络分析,使用David数据库对潜在靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,采用AutoDocktools 1.5.6和Pymol 2.3.0软件对移行成分和关键靶点进行分子对接。结果:确定23个血浆移行成分,通过网络药理学分析获得小儿解感颗粒治疗流感相关疾病潜在靶点100个,并进行GO功能注释和KEGG通路分析,小儿解感颗粒治疗流感相关疾病的信号通路主要涉及C型凝集素受体、AGE-RAGE、PI3K-AKT、HIF-1等;分子对接结果表明,活性成分与主要靶点结合良好。结论:小儿解感颗粒中高车前素、木犀草素、甘草查尔酮B、黄芩素、异鼠李素、汉黄芩素等可能为发挥药效的活性物质,以上活性成分可能通过干预AKT 1、SRC等靶点,进而调节AGE-RAGE、PI3K-AKT、HIF-1等信号通路发挥治疗疾病的作用。

关键词： 功能性消化不良   抑郁情绪   数据挖掘   网络药理学   用药规律   作用机制  

摘要： 目的:基于数据挖掘与网络药理学探究中医药治疗功能性消化不良(FD)伴抑郁情绪的用药规律,预测核心药物的潜在作用机制,以期为临床治疗提供参考。方法:检索中国知网(CNKI)、万方数据(WANFANG DATA)、维普中文科技期刊数据库(VIP)中关于中医药治疗FD伴抑郁情绪的文献,对处方中药物进行使用频次、性味归经、关联规则及聚类分析。利用TCMSP和Uniprot数据库对核心药物成分靶点进行预测和规范,与疾病靶点取交集靶点后构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,基于DAVID数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:共纳入处方74首,中药90味。其中柴胡的使用频次最高;高频药物药味以辛、苦为主,药性以温、平为主,多归脾、肺、胃经;关联规则提示“柴胡-白芍”关联性最强;聚类分析将中药分为3类。网络药理学分析得到治疗FD伴抑郁情绪的核心药对“柴胡-白芍”,核心成分包括槲皮素、β-谷甾醇、异鼠李素、豆甾醇等,核心靶点为蛋白激酶Bα(AKT1)、肿瘤抗原p53(TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)等,信号通路主要涉及糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物及其受体(AGE/RAGE)信号通路、脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路等。结论:中医药治疗FD伴抑郁情绪多选用辛温及归脾、胃、肺经之品,核心药对“柴胡-白芍”通过多靶点作用于多通路防治FD伴抑郁情绪,为进一步发掘其潜在作用机制提供方向。

关键词： 蒲公英   乳腺增生   网络药理学   分子对接   PI3K-Akt信号通路  

摘要： 本研究应用网络药理学方法研究蒲公英治疗乳腺增生的作用靶点及作用路径,结合分子对接技术分析蒲公英中活性成分和关键靶点之间的亲和性。网络药理学结果发现蒲公英中的15个活性成分涉及的261个作用靶点与乳腺增生疾病关联的2455个作用靶点共有交集靶点90个(在蛋白质交互网络中包含89个相关靶点和1个无关靶点)。Cytoscope软件中cytoHubba插件获得的度值前10靶点与MOCDE插件获得的评分前10的靶点交集获得的CASP3、EGFR、ESR、ERBB2、MMP9和PTGS2靶点作为核心靶点。富集分析确定了284个具有统计学意义的基因本体论术语。京都基因与基因组百科全书分析了125条具有统计学意义通路,主要参与调控癌症通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、癌症中的小分子RNAs和化学致癌受体激活等。分子对接结果显示木犀草素、芹菜素和异鼠李素与核心靶点有很好的结合活性。蒲公英能够通过多路径、多靶点治疗乳腺增生,阐明了潜在作用机制,并为乳腺增生靶向治疗和乳腺癌预防提供重要启示。

关键词： 定量系统药理学   虚拟临床试验   机制建模与模拟   模型引导的药物研发   转化医学  

摘要： 基于定量系统药理学(quantitative systems pharmacology,QSP)模型的药物转化研究是国际上新兴的前沿药物研发范式。通过构建覆盖多个生理尺度中疾病关联机制及药物-靶点相互作用的数学模型,QSP可系统性整合多模态的临床前和临床层面数据,并从机制角度动态描述疾病发生发展过程及定量预测药物干预后产生的药效和不良反应。因此,QSP模型模拟和其衍生的虚拟临床试验分析已被用于指导新靶点和新治疗策略的发现与评估、临床试验方案设计、生物标志物筛选和个体化治疗等,其可在多个层面高效提升药物的临床转化成功率。QSP的理念在欧美发达国家的新药研发产业已经历十余年的发展和实际应用,并已逐渐成为现代模型引导药物研发模式中的重要部分,而其在国内仍处于起步初期。本文将全面介绍QSP这一前沿方向的内涵与进展及其在全球创新药研发中的实际应用案例,为推动我国QSP领域的发展以及原创新药的研发提供重要参考与指导。

关键词： 雷公藤   神经炎症   帕金森病   网络药理学  

摘要： 利用网络药理学和分子对接技术,从神经炎症的角度来探讨雷公藤治疗帕金森病(Parkinson’s Disease, PD)的作用机制。方法 本研究通过从公共数据库中药系统药理学数据库、OMIM和GeneCard数据库中获取整合雷公藤的主要炎性成分和PD的潜在作用靶点。利用STRING数据库构建蛋白相互作用网络图,并利用Cytoscape 3.9.1软件选出核心化合物及重要靶点。采用R包clusterProfile进行GO和KEGG富集分析,利用分子对接技术进一步预测雷公藤对PD的作用机制。 结果 从雷公藤中筛选出51个活性成分和15041个靶基因,PD靶基因4975个,取交集后得到雷公藤治疗靶基因108个,TNF和CXCL8是主要的炎性核心靶点。富集分析提示雷公藤主要通过脂质与动脉粥样硬化信号通路、病毒感染信号通路等发挥作用。分子对接显示,PD炎症靶基因CXCL8与雷公藤主要活动成分均有较高的结合活性。结论 本研究为进一步从神经免疫炎症机制来研究雷公藤治疗PD提供了重要作用和基础。

关键词： 加味参附颗粒   慢性心力衰竭   网络药理学   潜在靶点   作用机制  

摘要： 【目的】利用网络药理学预测加味参附颗粒治疗慢性心力衰竭(CHF)的潜在靶点及其作用机制。【方法】通过TCMSP和BATMAN数据库获取加味参附颗粒的相关活性成分和靶点,通过GeneCards、DisGeNET数据库遴选慢性心力衰竭相关的靶点,取交集靶点;运用STRING数据库进行靶蛋白互作分析。运用Metascape数据库对药物-疾病共同靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因百科全书(KEGG)富集分析。运用Cytoscape 3.9.1软件构建成分-靶点-通路网络图。【结果】筛选出加味参附颗粒中42个活性成分和435个直接作用的蛋白靶点,得到38个药物-疾病交集靶点。GO与KEGG富集分析结果显示,加味参附颗粒在血液循环、清除氧自由基、平滑肌细胞的调节、细胞和基因调控等多生物过程方面,通过IL-6、RELA、TNF、VEGFA、MMP-2、MAPK8、TP53、EDN1、MMP-9等核心靶点,流体剪切应力与动脉粥样硬化途径、AGERAGE、HIF-1、MAPK、IL-17、TNF、cAMP、钙等信号通路治疗慢性心力衰竭。【结论】加味参附颗粒可通过改善心脏供血、抑制炎症反应、抗氧化应激、抑制心肌重构、调节心肌细胞的代谢等方面多靶点多途径治疗慢性心力衰竭。

关键词： 白藜芦醇   结肠癌   网络药理学   网络分析   分子机制  

摘要： 本研究依托网络药理学,从多靶点、多途径的角度分析白藜芦醇(resveratrol, RES)治疗结肠癌的潜在机制。从Swiss Target Prediction、 TCMSP、 UniProt、 OMIM、 GeneCards和PubChem数据库中获取白藜芦醇治疗结肠癌的目标基因,使用Venn 2.1.0确定交集基因。通过STRING数据库构建蛋白质相互作用(protein-protein interaction, PPI)网络。使用Cytoscape软件对PPI网络相互作用进行拓扑分析。使用R程序包进行GO和KEGG富集分析,并筛选出相关信号通路。使用Autodock Vina软件进行分子对接分析。随后通过RT-qPCR、 Western blot和划痕实验进行体外验证。筛选得到白藜芦醇治疗结肠癌的潜在靶点152个,通过CytoHubba分析得到10个关键基因。GO富集分析显示,细胞膜是生物过程发生的主要场所。KEGG结果表明,PI3K/AKT是白藜芦醇治疗结肠癌的关键信号通路。分子对接结果显示白藜芦醇与关键靶蛋白之间结合力良好。RT-qPCR结果显示,白藜芦醇对关键基因起到了相应的调节作用。Western blot结果显示,白藜芦醇可以下调HT-29结肠癌细胞模型PI3K/AKT通路的表达。划痕实验显示,HT-29细胞的迁移受到白藜芦醇的抑制。本研究表明白藜芦醇可以通过多个靶点和途径发挥抗结肠癌作用,也显示了网络药理学在药物研究中的潜力。

关键词： 网络药理学   补元汤   分子对接技术   慢性阻塞性肺疾病  

摘要： 目的:应用网络药理学和分子对接技术探讨补元汤治疗慢性阻塞性肺疾病(Chronic Obstructive Pulmonary Disease,COPD)的作用靶点及分子机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和HERB数据库收集补元汤的化学成分及可能的相关靶点,从GeneCards、TTD、DrugBank及DisGeNET数据库中获得COPD相关靶点,两者取交集获得补元汤治疗COPD的共同靶点;利用Cytoscape 3.8.2建立药物-化学成分-共同靶点-疾病网络图;STRING 11.5数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络及提取关键靶点;Metascape数据库通过对关键靶点基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,建立补元汤治疗COPD靶点-信号通路网络;最后通过AutoDockTools 1.5.6软件实现对化学成分和关键靶点分子对接。结果:从补元汤中共获得116个化学成分,预测靶点2108个,其中与COPD有关靶点为872个,两者共同靶点有122个。槲皮素、豆甾醇、山柰酚等是补元汤主要化学成分,白细胞介素(Interleukin,IL)-6、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)等是其关键靶点,并通过晚期糖基化终末产物与其受体(Advanced Glycation End-product-Receptor for Advanced Glycation End Products,AGE-RAGE)、癌症、IL-17、缺氧诱导因子(Hypoxia Inducible Factor,HIF)-1、TNF等多种信号途径对COPD进行治疗。对接结果表明槲皮素和山柰酚与IL-6和AKT1具有明显的结合作用。结论:研究结果显示,国医大师洪广祥经验方补元汤在治疗COPD过程中,具有多成分、多靶点、多途径的特征,同时还可进一步增强COPD患者免疫功能,提高机体的免疫力,为治疗COPD机制提供新的参考和理论基础。

关键词： 苦参碱   炎症性肠病   斑马鱼   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:基于斑马鱼模型与网络药理学技术研究苦参碱治疗炎症性肠病(IBD)的作用机制。方法:以2,4,6-三硝基苯磺酸(TNBS)建立斑马鱼IBD模型,使用中性红染色、阿尔新蓝染色及中性粒细胞数量变化评估肠道吞噬功能、杯状细胞分泌及中性粒细胞聚集情况,利用相关试剂盒测定苦参碱(40、60 mg·L^(-1))对斑马鱼体内肿瘤坏死因子(TNF)-α与胆囊收缩素(CCK)含量变化;使用网络药理学及分子对接技术预测苦参碱治疗IBD的潜在作用机制;并通过实时荧光定量聚合酶链式反应(Real-time PCR)对相关靶点验证基因表达情况。结果:与模型组比较,苦参碱组能够呈剂量依赖性增加中性红染色面积(P<0.05,P<0.01),改善肠道吞噬功能;能够增加阿尔新蓝染色面积(P<0.05,P<0.01),影响肠道杯状细胞分泌;能够减少中性粒细胞数量(P<0.01)及缓解其聚集情况,显著减少TNF-α含量(P<0.01);苦参高剂量组显著增加CCK含量(P<0.01),苦参低剂量组CCK含量差异无统计学意义。网络药理学分析得到苦参碱治疗IBD潜在靶点28个,蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析得度值排名前5的靶点分别为α7烟碱乙酰胆碱受体(CHRNA7)、多巴胺受体D1(DRD1)、烟碱型乙酰胆碱α4亚型(CHRNA4)、溶质载体家族6成员3(SLC6A3)、代谢型谷氨酸受体5(GRM5);京都基因与基因组百科全书(KEGG)结果显示,苦参碱治疗IBD可能与神经活性配体-受体相互作用(neuroactiveligand-receptorinteraction)、胆碱能突触(cholinergic synapse)、中性粒细胞胞外诱捕网形成(neutrophil extracellular trap formation)相关,且Real-time PCR结果表明苦参碱能够影响相关靶点基因表达水平。结论:苦参碱对炎症性肠病具有一定的治疗作用,能够影响IBD炎症反应,其治疗作用可能与神经活性配体-受体相互作用等通路相关。