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关键词： 单纯性肥胖   防己黄芪汤   网络药理学   分子对接   张仲景   《金匮要略》  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨防己黄芪汤治疗单纯性肥胖的作用机制。方法:运用中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)获取防己黄芪汤组方中药有效活性成分及作用靶点。通过GeneCards数据库和在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)获取单纯性肥胖的疾病靶点。通过Omicshare平台将单纯性肥胖疾病靶点与防己黄芪汤有效成分相关靶点取交集,即为防己黄芪汤治疗单纯性肥胖的潜在作用靶点。将潜在作用靶点和其对应的活性成分、中药导入Cytoscape 3.9.1软件,构建“中药-活性成分-潜在靶点”网络,拓扑分析筛选关键活性成分。将潜在作用靶点导入STRING数据库获得蛋白互作网络分析结果,并运用Cytoscape 3.9.1软件进行可视化获得蛋白质互作网络(protein-protein interaction networks,PPI),拓扑分析筛选核心靶点。采用R软件对潜在作用靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析。利用AutoDockVina软件对关键活性成分和核心靶点进行分子对接。结果:通过TCMSP平台获得防己黄芪汤有效活性成分101个,相应靶点110个。基于GeneCards和OMIM数据库获得单纯性肥胖疾病靶点1195个。将疾病靶点与活性成分相关靶点取交集,获得防己黄芪汤治疗单纯性肥胖的潜在作用靶点61个。“中药-活性成分-疾病靶点”网络拓扑分析获得槲皮素、山柰酚、异鼠李素、芒柄花黄素为关键活性成分。PPI网络分析筛选出白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(peroxisome proliferator activated receptor gamma,PPARG)、血管内皮生长因子A(vascular endothelial growth factor A,VEGFA)等8个核心靶点。GO功能富集分析显示在生物过程中,靶点富集在类固醇激素反应、对酮的反应等;细胞成分中,靶点富集在薄膜筏、膜微区等;而分子功能中,靶点富集在核受体活性、转录因子活性等。KEGG通路富集分析显示靶点主要富集在胰岛素抵抗、非酒精性脂肪性肝病等相关通路。分子对接显示关键活性成分与核心靶点具有良好的结合活性。结论:防己黄芪汤可能通过槲皮素、山柰酚、异鼠李素等关键活性成分作用于CASP3、PPARG、EGFR等核心靶点调控胰岛素抵抗、IL-17等信号通路发挥治疗单纯性肥胖的作用。

关键词： 肝癌   和木化癥汤   网络药理学   免疫调节   T细胞   B细胞  

摘要： 目的:基于网络药理学分析方法从“成分-靶点-通路”角度探讨和木化癥汤抗肝癌的物质基础及免疫调节功能。方法:通过TCMSP及Batman-TCM数据库筛选和木化癥汤的有效组分及其对应的药物作用靶点,在GeneCards、NCBI和DisGeNET数据库中筛选出肝癌的疾病靶点。通过STRING数据库构建和木化癥汤和肝癌的共同靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。通过Cytoscape软件对PPI网络及药物-疾病网络进行可视化展示。利用GSEA数据库探讨上述靶点的基因本体功能和KEGG通路富集分析。结果:通过数据库筛选,可获得和木化癥汤的268个基因靶点,4883个肝癌靶点基因,二者共同的靶点基因有197个。通过化合物-靶点网络和PPI网络筛选出与肝癌相关度较大的和木化癥汤核心成分是quercetin(槲皮素)、kaempferol(山柰酚)、wogonin(汉黄芩)、baicalein(黄芩素)、isorhamnetin(异鼠李素)及beta-sitosterol(β-谷甾醇)等,其核心靶点为MAPK1、AKT1、HSP90AA1、JUN、RELA、ESR1、FOS、MAPK14、IL-6及RXRA等。和木化癥汤参与肝癌T细胞及B细胞的活化、增殖、分化、迁移、自稳、凋亡及其调控过程,并涉及参与IL-17 signaling pathway、TNF signaling pathway、Th17 cell differentiation及Chemokine signaling pathway等信号通路。结论:和木化癥汤可通过调节T细胞及B细胞免疫功能发挥抗肝癌效应。

关键词： 临床药理学   课程思政   教学改革   医学院校   临床药学专业   实践  

摘要： 课程思政是以“立德树人”为根本任务,通过将专业课程教育与传统思政教育有机结合,所形成的创新型教育模式。作为临床药学专业的核心课程,临床药理学开展课程思政意义重大。文章从课程思政教学总体设计、实践思路、实践方法、实践改革内容等方面展开讨论,以具体教学章节开展课程思政实践设计与案例分析,同时结合学生对课程教学评价与反馈、教学实践效果以及实践示范性,探讨如何在医学院校开展临床药理学课程思政的建设与实践工作,从而为培养“懂医精药强用”且具有爱国情怀和社会责任感、“人民至上生命至上”信念的药学人才提供有力的支撑。文章可为药学相关专业课程思政改革提供参考。

关键词： 脑血疏口服液   缺血性卒中   网络药理学   分子对接技术   分子机制  

摘要： 目的采用网络药理学和分子对接技术探索脑血疏口服液治疗缺血性卒中的药效物质基础与潜在作用机制。方法基于脑血疏口服液与缺血性卒中的共同靶点构建“单味药-活性成分-作用靶点”网络;通过String数据库构建蛋白互作(PPI)网络;Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路注释与富集分析;分子对接分析预测关键的活性成分与靶点的结合互作。结果“单味药-活性成分-作用靶点”网络中获得脑血疏口服液治疗缺血性卒中的可能活性成分29个,作用靶点67个,其中关键活性成分包括山柰酚、β-胡萝卜苷、胡萝卜苷等;PPI网络分析获得AKT1、PTGS2、EGFR、SRC等关键靶点,其中山柰酚与以上四个关键靶点均有较高的亲和力;脑血疏口服液治疗缺血性卒中的机制可能主要涉及激酶活性、炎症反应、氧化应激应答、免疫系统过程等多种分子功能和生物过程,以及EGFR酪氨酸激酶抑制剂抗性、PI3KAkt信号通路等165个通路。结论脑血疏口服液通过多成分、多靶点、多通路和功能的复杂网络调控炎症反应、血管损伤、神经元损伤或凋亡及脑损伤等防治缺血性卒中,为其后续深入药理学研究奠定了基础。

关键词： 糖尿病胃轻瘫   消渴   痞满   呕吐   半夏   网络药理学   分子对接   信号通路  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接技术探讨半夏治疗糖尿病胃轻瘫(DGP)的可能作用机制。方法:从中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)中检索半夏的活性成分和对应靶点,利用SwissTargetPrediction对半夏活性成分进行靶点预测补充;从Genecards、TTD、NCBI数据库中检索DGP相关靶点基因;取半夏活性成分与DGP的交集靶点,利用Cytoscape 3.8.0构建“半夏活性成分-交集靶点”网络;借助Cytoscape 3.8.0的BisoGenet构建交集靶点的蛋白互作(PPI)网络图,利用CytoNCA对PPI网络进行拓扑分析并筛选核心靶点;借助ClueGO对核心靶点进行基因本体(GO)功能富集和京都基因组与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用Autodock 4.2软件对关键活性成分与核心靶点进行分子对接。结果:半夏13个活性成分靶点与DGP相关靶点的交集靶点共68个;PPI网络拓扑分析得到核心靶点327个;核心靶点的GO功能富集分析显示其与黏着斑、泛素蛋白连接酶结合及mRNA分解代谢过程等调控相关;KEGG通路富集分析显示其与细胞周期、甲状腺激素信号通路和低氧诱导因子-1等信号通路相关。分子对接结果显示,相比于西沙必利,黄芩素和环(L-酪氨酰-L-苯丙氨酰)与关键核心靶点丝裂原活化蛋白激酶1和蛋白激酶1具有更低的结合能。结论:半夏通过多成分、多靶点、多通路的潜在作用机制,发挥调控血糖、促进胃肠道运动、保护胃黏膜等抗DGP的可能治疗作用。

关键词： 黑骨藤   网络药理学   分子对接   阿尔茨海默病  

摘要： 目的运用网络药理学及分子对接技术,探究苗药黑骨藤治疗阿尔茨海默病(AD)的活性成分和潜在作用机制。方法通过文献搜集苗药黑骨藤的化学成分,利用中药系统药理学数据库(TCMSP)和Swiss ADME数据库筛选黑骨藤的主要活性成分,采用Swiss Target Prediction和SEA数据库预测活性成分的作用靶点。通过GeneCards、OMIM数据库检索AD相关靶点,经Venny2.1.0获取成分-疾病交集靶点,结合STRING数据库和Cytoscape3.8.0软件对交集靶点进行蛋白互作(PPI)网络分析。再借助HIPLOT数据库对交集靶点进行基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。最后,利用AutoDock Tools1.5.6软件将潜在成分与核心靶点进行分子对接。结果苗药黑骨藤的活性成分共24个,对应靶点574个,1513个AD靶点,交集靶点159个;GO分析得到2661条生物过程,587条分子功能,311条细胞成分;KEGG分析得到AD主要参与神经退行性疾病-多发性疾病途径、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、癌症中的蛋白多糖等相关通路。分子对接结果显示,山柰酚、槲皮素、汉黄芩素、丹参酮ⅡA、杠柳苷元等与类固醇受体辅助活化因子(SRC)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)3、血管内皮生长因子(VEGF)A蛋白等具有较强结合能力。结论通过成分-靶点-通路网络及分子对接验证,筛选出黑骨藤抗AD的有效成分,并探究其抗AD作用机制,为苗药黑骨藤抗AD的新药开发和应用提供思路和理论依据。

关键词： 网络药理学   分子对接   正常压力性脑积水   脑积水方  

摘要： 目的:运用网络药理学与分子对接的方法探讨脑积水方治疗正常性压力脑积水(Normal Pressure Hydrocephalus,NPH)的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索并筛选出脑积水方的有效成分及作用靶点。通过在GeneCards数据库、DrugBank数据库、OMIM数据库检索出NPH相关靶点,使用韦恩图获得脑积水方药物与NPH的交集靶点。使用STRING 12.0数据库获得蛋白质-蛋白质相互作用网络信息。使用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-有效成分-靶点”网络图与蛋白质-蛋白质相互作用网络图,通过DAVID v6.8数据库对共同靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析。使用SYBYL-X 2.1.1软件进行分子对接。结果:共筛选出脑积水方2中6个有效成分,56个药物与疾病交集靶点,核心靶点为肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、白细胞介素-6(Interleukin-6,IL-6)、JUN原癌基因(Jun Proto-Oncogene,JUN)、前列腺素氧化环化酶2(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase 2,PTGS2)、表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)。GO功能分析主要涉及管生成、凋亡过程、胞外基质、细胞表面、白酶结合、蛋白质丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸激酶活性等生物过程,KEGG分析主要涉及流体剪切应力与动脉粥样硬化、脂质与动脉粥样硬化、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(Phosphatidylinositol 3 Kinase-Akt,PI3K-Akt)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-activated Protein Kinase,MAPK)信号通路。分子对接结果显示,花生四烯酸与JUN、花生四烯酸与EGFR、花生四烯酸与IL-6、花生四烯酸与TNF、槲皮素与PTGS2之间有均有着较强的结合能力。结论:本研究初步阐释了脑积水方通过多成分、多靶点治疗NPH的潜在机制。

关键词： 网络药理学   分子对接   糖尿病脑病   异甘草素  

摘要： 目的 基于网络药理学分析和体外实验探讨异甘草素(Isoliquiritigenin,ILG)治疗糖尿病脑病(Diabetic encephalopathy,DE)的作用机制。方法 利用HERB数据库和SwissTargetPrediction数据库预测ILG的作用靶点,再通过GeneCards、OMIM和PharmGkb获取DE相关疾病靶点,并通过Venny软件获得ILG作用靶点与DE相关疾病靶点的交集靶点;借助STRING数据库绘制PPI网络,使用Cytoscape 3.9.1软件筛选出核心靶点;利用R 4.0.3软件进行GO功能和KEGG信号通路富集分析;最后使用分子对接技术和体外实验进行验证。结果 共筛选出65个ILG-DE交集靶点;通过拓扑分析,得到8个核心靶点为EGFR、ESR1、PTGS2、PPARG、GSK3β、CDK2、PIK3R1和F3。GO功能和KEGG通路富集分析显示LIG抗DE涉及多个生物学过程,影响多种细胞组分和分子功能,如对脂多糖的反应、蛋白磷酸化、蛋白激酶活性、蛋白丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸激酶活性等。涉及的信号通路包括PI3K-Akt信号通路、癌症中的蛋白多糖信号通路、内分泌抵抗通路等。分子对接结果显示8个核心靶点与ILG均有较好的结合,其中GSK3β与ILG的结合能为-7.22 kcal·mol~(-1)。体外实验表明ILG可以改善SH-SY5Y细胞高糖损伤,并激活P13K/AKT/GSK3β信号通路。结论 ILG可能通过作用于GSK3β调控P13K/AKT/GSK3β信号通路,进而改善DE。

关键词： 网络药理学   孟河医派   天冬   青黛  

摘要： 目的探讨孟河医派“青黛拌天冬”作用机制。方法检索数据库获得天冬、青黛的活性成分、作用靶点、疾病相关等信息,构建“药物-成分-靶点”“靶点-疾病”及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,研究“青黛拌天冬”的作用机制。结果“药物-成分-靶点”网络包含158个节点,关键活性成分有来自天冬中的槲皮素、7-甲氧基-2-甲基异黄酮、豆甾醇、石吊兰素和青黛中的靛玉红、色胺酮及两者共有成分β-谷甾醇,而关键靶点涉及前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、前列腺素内过氧化物合酶1(PTGS1)、单胺氧化酶B(MAOB)、β_(2)肾上腺素受体(ADRB2)、蛋白激酶(cAMP)激活催化亚基α(PRKACA)等。PPI网络中关键靶点涉及肿瘤坏死因子(TNF)、Jun原癌基因(JUN)、雌激素受体α基因(ESR1)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)等。GO条目中生物过程相关条目有115个,分子功能相关条目有33条,细胞组成相关条目有35个。KEGG通路涉及肿瘤信号通路、神经活性配体-受体相互作用通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化等。结论初步预测了以青黛拌衣天冬可在癌症、心血管、神经及炎症等多方面发挥优势效用,为天冬临床运用拓展提供参考。

关键词： 润肠通便合剂   便秘   物质基础   作用机制   网络药理学  

摘要： 目的:采用网络药理学理论与方法从成分-靶点-通路的角度分析润肠通便合剂治疗便秘的作用机制。方法:利用TCMSP数据库获取润肠通便合剂的主要化学成分及其对应靶点,并借助Uniprot数据库转化为标准基因;通过GeneCards与DisGeNET数据库获取便秘的相关靶点,将润肠通便合剂的主要成分靶点与便秘相关的靶点进行匹配映射,然后得到润肠通便合剂治疗便秘的关键靶点。利用STRING网站,获得关键靶点的PPI网络图;通过R语言的clusterProfiler包进行GO富集分析与KEGG信号通路分析,利用Cytoscape软件构建成分-靶点网络、中药-关键成分-关键靶点网络,并计算网络拓扑参数。结果:润肠通便合剂治疗便秘的关键成分有26个,包括槲皮素、β-谷甾醇及山柰酚等,关键靶点22个,包括IL-6、FOS及IL1B等。通过富集分析得到IL-17、Toll-like及TNF等21条信号通路。结论:润肠通便合剂通过多成分-多靶点-多通路来发挥治疗便秘的整体作用,为润肠通便合剂治疗便秘的物质基础及作用机制提供了理论依据。