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关键词： 大黄   网络药理学   脓毒症   心肌损伤   线粒体   机制  

摘要： 目的 研究大黄对脓毒症心肌损伤和线粒体功能障碍的保护作用。方法 网络药理学方法预测大黄与脓毒症心肌损伤的相关靶点,进行网络构建和蛋白质-蛋白质互作(PPI)分析,功能富集分析,构建活性成分-靶点-通路-疾病复方网络图。构建脂多糖(LPS)诱导的心肌损伤细胞模型,并将其分为正常对照组、LPS处理组和LPS+大黄组(5μmol/L、10μmol/L、15μmol/L)三组。CCK-8试剂盒检测细胞增殖,流式细胞术分析细胞凋亡,MitoSOX线粒体超氧化物红色荧光探针测定线粒体活性氧(ROS)含量,线粒体膜电位荧光探针JC-10检测线粒体膜电位水平,荧光探针Calcein AM检测线粒体通透性转换孔开放程度,透射电镜分析线粒体超微结构,蛋白质印迹(Western Blot)法测定相关蛋白表达水平。结果 (1)网络药理学结果表明,共有21个靶点与大黄治疗脓毒症心肌损伤相关。PPI构建网络显示,细胞肿瘤抗原p53(TP53)、胱天蛋白酶3(CASP3)、白细胞介素-1β(IL-1β)、髓细胞增生原癌基因(MYC)、肿瘤坏死因子(TNF)、凋亡蛋白(BAX)和抗凋亡蛋白(Bcl-2)是关键靶点。基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析表明,磷酯酰肌醇3激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)通路在大黄调控脓毒症心肌损伤过程中起重要作用。(2)与对照组比较,LPS处理组细胞增殖能力下降且心肌细胞凋亡增加,线粒体ROS含量增加,线粒体膜电位降低,线粒体通透性转换孔开放,线粒体超微结构破坏。大黄可逆转LPS对心肌细胞的上述损伤效应。(3)在LPS诱导的脓毒症心肌损伤细胞模型中,磷酸化磷酯酰肌醇3激酶(p-PI3K)、磷酸化蛋白激酶B(p-AKT)、CASP3和BAX的蛋白表达水平增加,而Bcl-2的蛋白表达水平降低。大黄可逆转上述表达,以10μmol/L效果最显著。结论 大黄通过PI3K/AKT通路调控心肌细胞线粒体氧化应激,减少细胞凋亡,降低脓毒症引起的心肌损伤。

关键词： 药膳   枸杞-桑椹-覆盆子汤   糖尿病肾病   网络药理学   分子对接   分子机制   抗氧化能力  

摘要： 传统食物与中药结合而成的特殊膳饮“枸杞-桑椹-覆盆子汤”是中华民族食疗养生文化瑰宝,其成分桑椹、枸杞和覆盆子具有降血脂、降血糖和治疗肾病等多种生理活性功能,对糖尿病肾病具有潜在的防治作用。采用网络药理学、分子对接和抗氧化测试等技术对其治疗糖尿病肾病的分子机制进行研究。运用TCMSP数据库进行“枸杞-桑椹-覆盆子汤”的活性成分及作用靶点收集,在GeneCards、OMIM、TTD和DisGeNET数据库获取糖尿病肾病相关靶点。取活性成分和疾病交集靶点,运用STRING数据库和Cytoscape 3.8.0构建“活性成分-疾病靶点”相互作用网络。基于相互作用网络,利用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并借助Cytoscape 3.8.0中的MCODE和CytoHubba进行关键靶点筛选。利用AutoDock Vina对关键靶点与活性成分进行分子对接,评估关键靶点与活性成分之间的结合能力与作用模式。基于糖尿病肾病-“枸杞-桑椹-覆盆子汤”共同作用靶点与核心团簇分析,筛选出β-谷甾醇、大豆黄素、桑色素、槲皮素、β-胡萝卜素和鞣花酸为活性作用成分,IL6、IL1B、PPARG、MMP9和VEGFA为核心作用靶点,分子对接结果显示,主要活性成分与靶点均具有较高结合能。通过“枸杞-桑椹-覆盆子汤”提取物对1,1-二苯基-2-三硝基苯肼(DPPH)自由基、羟基自由基和2,2-联氮-双-3-乙基苯并噻唑啉-6-磺酸(ABTS)阳离子自由基清除能力测试试验发现“,枸杞-桑椹-覆盆子汤”具有较高的抗氧化能力,对糖尿病肾病可起到保护作用。该研究初步揭示了“枸杞-桑椹-覆盆子汤”以“多成分-多靶点-多通路”模式协同治疗糖尿病肾病的作用机制与抗氧化机制,为传统药膳“枸杞-桑椹-覆盆子汤”的产业化应用提供了理论依据。

关键词： 网络药理学   LC-Q-TOF/MS   青娥丸   抑郁症   有效成分   雌激素受体  

摘要： 目的UHPLC-Q-TOF-MS技术明确青娥丸的入血成分,结合网络药理学探讨青娥丸抗抑郁的有效成分及作用机制。方法采用UHPLC-Q-TOF-MS识别青娥丸入血成分,结合PharmMapper、DisGeNet、GeneCards等数据库以及Cytoscape、ClusterProfiler程序,筛选了青娥丸抗抑郁的核心药效成分与重要靶点,并进行GO及KEGG分析。通过Circlize构建成分-靶点-通路图筛选出核心靶点,应用Autodock vina分子对接结合蛋白免疫印迹法验证。结果青娥丸水提物中的18个入血成分,可干预50个潜在抗抑郁靶点;其中入血成分中9个为可干预多个靶点的核心成分,26个为受多个成分调控的重要靶点;京尼平苷酸、异补骨脂素等9个核心成分可能通过调控26个重要靶点,进而通过PI3K-AKT、雌激素等信号通路发挥抗抑郁作用;EGFR、AKT1为参与多个通路的核心靶点,ESR1和ESR2为受多个核心成分干预的关键靶点;分子对接结果提示,9个核心成分中7个与靶点亲和作用良好;蛋白免疫印迹法证实青娥丸对ESR1和ESR2编码蛋白确有调控作用。结论初步阐明青娥丸抗抑郁的潜在药效物质和作用机制,为筛选青娥丸的抗抑郁药效成分及深入阐明其作用机制提供了科学的理论依据。

关键词： 慢性肾脏病   数据挖掘   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:通过数据挖掘探讨中药复方治疗慢性肾脏病(chronic kidney disease,CKD)的用药规律,基于网络药理学和分子对接技术对核心中药治疗CKD的作用机制进行分析。方法:从中国知网、维普中文期刊数据库、万方数据知识服务平台获取运用中药复方治疗CKD的文献,运用Excel、SPSS Modeler 18.0、IBM SPSS Statistics 26软件分别进行中药频次统计、关联规则分析和聚类分析,筛选核心中药;检索TCMSP、OMIM等数据库获得核心中药的活性成分及作用靶点、疾病靶点,上传药物与疾病交集靶点至STRING在线平台,构建共同靶点蛋白质互作网络;运用AutoDock Tools 1.5.7软件对核心成分与靶点进行分子对接。结果:检索获得119首处方,涉及194味中药,17味中药使用频次≥20次,核心药物为黄芪、白术、茯苓、党参、大黄、川芎。对使用频次≥20次的中药进行聚类分析,可聚为3类,第1类:黄芪、甘草、山药、党参、茯苓、土茯苓;第2类:熟地黄、当归、生地黄、菟丝子、山茱萸、淫羊藿;第3类:半夏、白术、大黄、川芎、丹参。对度值排名靠前的药物活性成分β-谷甾醇(beta-sitosterol)、肉豆蔻酮(myricanone)、槲皮素(quercetin)、常春藤皂苷元(hederagenin)、3β-乙酰氧基苍术酮(3β-acetoxyatractylone)、木犀草素(luteolin)与关键靶点VEGFA、TP53、IL6、JUN、TNF进行分子对接,其中,槲皮素与TNF结合最稳定,其次为槲皮素与IL6,槲皮素、木犀草素来自于黄芪、党参。结论:中药复方治疗CKD以健脾补肾为本,活血、除湿、泄浊治其标为原则。核心药物可能是通过调控炎症、肾脏纤维化等信号通路,作用于VEGFA、IL6、TNF等靶点发挥治疗作用。

关键词： 青蒿   肾阴虚   糖皮质激素性骨质疏松   地塞米松   成骨细胞  

摘要： 目的 通过网络药理学和体外实验,对青蒿治疗肾阴虚型糖皮质激素性骨质疏松(GIOP)的潜在作用靶点及相关信号通路进行预测和初步验证。方法 通过TCMSP数据库和Uniprot数据库获取青蒿药物靶点并确定目标靶点基因名;通过GeneCards数据库、OMIM数据库和Drugbank数据库获取肾阴虚型GIOP的靶点基因,与药物靶点基因交叉分析获得共同作用靶点基因;利用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并利用Cytoscape软件进行可视化分析和核心靶点筛选;通过Metascape数据库对所有共同靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,最后通过体外实验对预测结果进行验证。结果 筛选出98个青蒿治疗肾阴虚型GIOP的作用靶点,其中核心基因17个。GO和KEGG功能富集分析结果表明,青蒿治疗肾阴虚型GIOP与激素应答、细胞死亡的正向调节和细胞外刺激应答等生物过程,以及PI3K/AKT、AGE/RAGE、MAPK和IL-17等信号通路有关,其中PI3K/AKT信号通路上富集的基因数最多。体外实验结果显示,青蒿可以促进地塞米松(DEX)损伤的成骨细胞的增殖,提高碱性磷酸酶(ALP)活性,激活PI3K/AKT通路,促进AKT的磷酸化。结论 青蒿治疗肾阴虚型GIOP具有多靶点-多通路的特点,可以通过多条途径促进成骨细胞的增殖、分化,其中PI3K/AKT信号通路是一条重要的通路,青蒿治疗肾阴虚型GIOP可能与其能够促进PI3K/AKT信号通路,促进AKT的磷酸化有关。

关键词： 网络药理学   分子对接   橙皮素   乳腺癌   PI3K/AKT信号通路  

摘要： 目的基于网络药理学、分子对接和体外实验探讨橙皮素(Hes)治疗乳腺癌疾病的分子机制。方法通过TCMSP、Swiss Target Prediction、PharmMapper数据库筛选Hes作用靶点,GeneCards、OMIM、TTD数据库检索乳腺癌疾病相关靶点。采用Venny 2.1在线获取药物与疾病共同靶点;Cytoscape 3.7.2软件建立药物-靶点-信号通路-疾病网络;STRING数据库在线绘制蛋白互作网络;Metascape数据库进行GO和KEGG通路富集分析;Pymol和AutoDock软件预测分子结合能力;体外实验验证网络预测结果并探讨Hes抑制乳腺癌MDA-MB-231细胞生长的潜在机制。结果网络筛选Hes抗乳腺癌疾病共同靶点36个,GO富集获得487个条目,包括生物过程414个、分子功能55个、细胞组分18个;KEGG通路富集获得40条通路,大多涉及癌症相关途径和主要信号通路PI3K/AKT等;分子对接显示Hes与PI3K/AKT信号通路的关键靶点具有良好结合活性。体外实验显示Hes能够抑制MDA-MB-231细胞增殖,促进凋亡;降低PI3K、AKT、Bcl-2和MET的表达。结论Hes可能通过多靶点抑制PI3K/AKT信号通路的激活,影响乳腺癌细胞的增殖与凋亡。

关键词： 网络药理学   分子对接   达立通颗粒   功能性消化不良   作用机制  

摘要： 目的:达立通颗粒运用网络药理学研究和分子对接技术研究其功能性消化不良(Functional dyspepsia,FD)的作用机制。方法:应用TCMSP等数据库筛选达立通颗粒中各药物主要活性化学成分与FD靶点相关性,构建“中药-化学成分-靶基因-疾病”网络,再构建蛋白互作关系网络,GO功能富集与KEGG信号通路富集,最后进行分子对接。结果:筛选出的活性化学成分与功能性消化不良共有133个靶点,通过125条通路作用于功能性消化不良。结论:达立通颗粒通过多成分,多靶点,多通路治疗FD。

关键词： 药理学   混合式教学模式   应用效果  

摘要： 混合式教学模式在中职药理学教学中的应用效果。方法 回顾性整理2022年1月-2022年12月本校药剂专业药大七班药理学课程学生70名为研究对象,依据课程学习时间划分为两个小组,对照组(常规教学模式,n=35)和观察组(混合教学模式,n=35)。分析比对教学效果。结果 观察组考核成绩、学习积极性、自我效能感评分、教学满意度均好于对照组(P〈0.05)。结论 混合式教学模式可以提升药剂专业学生考核成绩,调动其学习积极性,提高学生自我效能感、满意度,值得推广。

关键词： 肤疾洗剂   瘙痒症   网络药理学   分子对接   分子机制   生物碱   柠檬苦素  

摘要： 目的 采用网络药理学和分子对接方法探究肤疾洗剂治疗皮肤瘙痒症的活性成分、关键作用靶点及潜在的分子机制。方法 运用TCMSP、Swiss Target Prediction、GeneCards数据库及文献报道对肤疾洗剂中活性成分、作用靶点及疾病靶点进行检索,Cytoscape软件进行成分–靶点网络图构建,通过DAVID数据库,进行基因本体(GO)功能分析与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后通过分子对接预测活性成分与靶点蛋白的结合能力。结果 获得肤疾洗剂61种有效成分和1 049个作用靶点,瘙痒症疾病靶点1 621个,其中肤疾洗剂146条信号通路,主要富集在癌症通路、磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)等。分子对接结果显示核心成分与关键靶点具有较好的结合活性。结论 肤疾洗剂具有抑制炎症、免疫调控作用,其发挥作用的主要活性成分为生物碱类、柠檬苦素类和黄酮类等,涉及的主要靶点有蛋白激酶1(Akt1)、CXC趋化因子配体8(CXCL8)、黏着连接蛋白β1(CTNNB1)、表皮生长因子受体(EGFR)、肿瘤坏死因子(TNF)等,符合中药复方多成分、多靶点、多途径的特点,为后续研究提供参考。

关键词： 降脂通络软胶囊   高脂血症   网络药理学   分子对接   姜黄素   PI3K-Akt通路  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探讨降脂通络软胶囊治疗高脂血症的潜在作用机制。方法利用TCMSP及SwissADME数据库检索、筛选并结合相关文献查找降脂通络软胶囊的活性成分;通过SwissTargetPrediction数据库预测活性成分的作用靶点,构建“药物-活性成分-预测靶点”网络。利用Genecards、DisGeNET和OMIM数据库检索、筛选高脂血症的疾病相关靶点;将高脂血症的疾病相关靶点和降脂通络软胶囊活性成分预测靶点进行对比,取二者的交集,作为降脂通络软胶囊治疗高脂血症的潜在作用靶点;构建“活性成分-潜在作用靶点-疾病”网络。通过STRING数据库构建潜在作用靶点的蛋白相互作用(PPI)网络,筛选出降脂通络软胶囊治疗高脂血症的关键靶点,并对关键靶点进行GO功能及KEGG通路富集分析,筛选出核心通路。构建降脂通络软胶囊治疗高脂血症的“活性成分-关键靶点-核心通路-疾病”网络,筛选出核心活性成分及核心靶点。采用Autodock Tools 1.5.7软件对核心活性成分及核心靶点进行分子对接验证。结果检索、筛选到降脂通络软胶囊中姜黄素类活性成分共20个,预测得到412个作用靶点;共筛选出1734个高脂血症疾病相关靶点;得到139个降脂通络软胶囊治疗高脂血症的潜在作用靶点(共有靶点);通过潜在作用靶点PPI网络筛选得51个关键靶点。GO功能富集到2232个条目,其中涉及2013个生物过程、143个分子功能、76个细胞组成相关条目;KEGG通路富集分析共得到155条通路。3个核心靶点EGFR、RAF1、PIK3CA与8个核心活性成分姜黄素、去甲氧基姜黄素、双去甲氧基姜黄素等具有良好的结合活性。结论降脂通络软胶囊可能通过姜黄素、去甲氧基姜黄素等核心活性成分,作用于EGFR、RAF1、PIK3CA等核心靶点,通过PI3K-Akt通路、脂质和动脉粥样硬化通路等多条信号通路发挥对高脂血症的治疗作用。