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关键词： 柴胡银翘散   网络药理学   分子对接   发热性疾病   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学及分子对接技术探讨柴胡银翘散治疗发热性疾病的作用机制。方法利用TCMSP数据库筛选柴胡银翘散活性成分,并通过文献搜索进行补充。利用Swiss Target Prediction对活性成分进行靶点预测。在OMIO、TTD、Disgnet数据库收集发热相关靶点。利用Venny在线网站取得药物活性成分靶点与疾病靶点交集得到潜在核心靶点,并制作韦恩图。运用String数据库获得潜在核心靶点PPI。利用Metascape进行GO分析及KEGG分析,选取前10作为核心通路。使用Cytoscape软件的CMODE插件选取PPI的核心网络,并将其中靶点作为核心靶点来源之一。通过Cytoscape软件构建药物-成分-靶点网络,选取度值前20作为核心成分。通过Autodock软件对核心靶点与核心成分进行分子对接。结果共获得166个柴胡银翘散的活性成分,关键成分有表小檗碱、金合欢素、光甘草定等;潜在核心靶点225个,关键靶点有PIK3R1、HSP90AA1、PDGFRB等。GO富集分析提示该方治疗发热性疾病主要涉及对外界刺激反应的正向调节、对脂多糖的反应、蛋白质磷酸化、膜阀、蛋白激酶活性等生物学过程,KEGG富集分析提示该方主要通过PI3K-Akt信号通路、NF-kappa B信号通路、JAK-STAT信号通路等免疫炎症调节通路治疗感染发热性疾病。结论柴胡银翘散通过多成分,多靶点,多通路发挥对发热性疾病的治疗作用。

关键词： 药理学教学   药物发现史短视频   思政教育  

摘要： 文章首先阐述了药物发现史短视频在药理学教学中应用的意义,然后提出了药物发现史短视频在药理学教学中应用的策略,包括制作药物发现史短视频、药物发现史短视频在教学中的应用,最后分析了药物发现史短视频在药理学教学中应用的效果。

关键词： 鼻炎   中医药   用药规律   数据挖掘   网络药理学  

摘要： 目的:基于数据挖掘与网络药理学研究鼻炎患者中药处方用药规律以及核心药物的作用机制。方法:收集武汉市第六医院2023年1-12月中医门诊就诊的鼻炎患者中药处方,运用Microsoft Office Excel、SPSS 25.0、Apriori算法对中药使用频次、使用剂量、性味归经、功效分类以及关联规则、系统聚类进行分析,以选择出核心中药。使用分析平台(TCMSP)及UniProt数据库进行核心药物靶点预测;通过DrugBank、GeneCards数据库进行鼻炎靶点预测;运用Venny 2.1.0平台得出交集靶点;运用软件Cytoscape 3.7.0构建“药物-成分-靶点”网络,并对核心中药的主要活性成分进行预测;通过STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络图并筛选出关键靶点:运用Metascape数据库,对交集靶点基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果:共收集处方222首,包含279味中药,应用频率前3位为白芷(158次),辛夷(145次),炒苍耳子(134次);药性以温、寒、平为主;药味以甘、辛、苦为主;中药饮片主要归经为肺、脾、胃、肝;多为解表药、补虚药、清热药。综合关联分析以及用药频次得出治疗鼻炎核心药物为炒苍耳子、白芷、辛夷、防风、茯苓、黄芪、陈皮、麸炒白术、薄荷。聚类分析得出5个聚类处方。网络药理学分析显示,核心药物靶点基因为254个,鼻炎靶点基因预测为871个,核心药物-鼻炎交集靶点78个,核心药物有效活性成分为槲皮素、辛夷脂素、β-谷甾醇等,核心中药治疗鼻炎关键靶点为TNF、IL-6、AKT1、IL-1β、PTGS2,GO功能分析得到1362个生物过程、50个细胞组分、106个分子功能,KEGG分析得到171条信号通路。结论:中药治疗鼻炎多为解表药、补虚药、清热药,用药特点为中医药治疗鼻炎患者提供思路。治疗鼻炎核心中药为炒苍耳子、白芷、辛夷、防风、茯苓、黄芪、陈皮、麸炒白术、薄荷。预测出核心中药通过多成分、多通路、多靶点来治疗鼻炎。

关键词： 人参-鹿茸药对   肾脑同治   肾阳虚证   分子对接   器官定位  

摘要： 本研究基于“肾脑同治”的中医基础理论,应用网络药理学分析,探讨人参-鹿茸药对防治肾阳虚证的物质基础与分子机制。利用TCMSP平台、Gene Cards数据库获取此药对的活性成分及作用靶点,利用SoFDA平台获取肾阳虚证相关靶点,Metascape数据库获取所涉及的信号通路信息,Cytoscape软件构建“病证-药物-成分-靶点-通路”网络,BioGPS数据库获取靶点在人体各器官中表达情况,联合STRING数据库生物信息学网站进行核心活性成分与关键靶标的筛选并进行分子对接。筛选出人参-鹿茸药对中117种活性成分,其中包括17-β-雌二醇、三磷酸腺苷、十六烷酸等9种核心活性成分,与肾阳虚证相关的150个预测靶点,其中包括APOE、B2M、APP等11个核心预测靶点,在肾、脑、肾上腺中表达情况相似,表达量较高的有APOE、B2M等17个靶点,以及主要与PI3K-Akt信号通路和神经内分泌网络相关。本文应用生信分析研究人参-鹿茸防治肾阳虚症的分子机制,并为其“肾脑同治”理论提供科学依据。

关键词： 艾叶   功能性便秘   活性成分   网络药理学  

摘要： 目的 采用网络药理学方法探讨艾叶治疗功能性便秘(FC)的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索艾叶的相关活性成分,通过GeneCards获取FC的疾病靶点基因,采用Cytoscape软件构建中药-成分-靶点-疾病网络图。通过交互靶点GO和KEGG富集分析研究艾叶和FC的相关生物学过程和信号通路。将艾叶的关键活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果 共筛选出药物靶点301个,活性成分8个,疾病靶点1 842个,药物-疾病共有靶点72个。艾叶治疗FC的核心靶点基因为AKT1、SRC、EGFR、VEGFA、MAPK1。GO功能富集分析得到222个条目,其中细胞组分(CC)47个,生物过程(BP)98个,分子功能(MF)77个。KEGG通路富集分析到120条信号通路,癌症的途径、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性、癌症中的蛋白多糖、化学致癌作用-受体激活等通路可能与艾叶防治FC密切相关。分子对接验证表明,部分活性成分与核心靶点具有良好的对接活性。结论 艾叶中的多种活性成分能够作用于多个潜在靶点,并通过多条信号通路发挥治疗FC的作用。

关键词： 五味子   支气管哮喘   层次分析-熵权法   指纹图谱   网络药理学   质量标志物  

摘要： 基于层次分析(analytic hierarchy process,AHP)-熵权法(entropy weight method,EWM)、指纹图谱和网络药理学分析五味子治疗支气管哮喘潜在的质量标志物(Q-marker)。应用AHP-EWM对五味子的质量标志物进行量化辨识,应用AHP对一级指标有效性、可测性和特有性进行权重分析,EWM分析各项下的二级指标。进一步通过指纹图谱结合网络药理学,得到“成分-靶点-通路”关联网络,筛选出五味子治疗支气管哮喘的成分,最终确定五味子醇甲、五味子甲素、五味子乙素3个成分是五味子治疗支气管哮喘的潜在质量标志物。该研究首次综合运用AHP-EWM、指纹图谱和网络药理学方法,筛选出五味子在治疗支气管哮喘中的关键质量标志物,为五味子的质量标准提升提供科学依据,为研究五味子治疗支气管哮喘的物质基础奠定基础。

关键词： 光开关染料   药物活性   光控药物   光药理学  

摘要： 光控药物可以实现对药物活性的高时空分辨调控,提升药物选择性,在疾病精准治疗方面展现出广阔的应用前景。然而,基于传统光开关染料的光控药物往往受限于光调控-药物活性难以协同、生理环境毒性大、稳定性差等瓶颈,难以满足活体应用需求。药物活性光开关染料兼具药物活性及光开关性能,以此构建的新型光控药物可以实现光控单元与药物活性“一体化”,协同光反应性能与药物活性,有效提升光控药物设计效率与生物相容性。本文围绕光调控效率、生物相容性这两个关键性能,对近年来报道的基于药物活性光开关染料构建的新型光控药物及其生物应用进行归纳总结,对不同种类的光开关染料特性进行概括与评价,最后对未来光控药物设计及光药理学应用前景进行了展望。

关键词： 狼毒大戟   甲状腺癌   网络药理学   分子对接   岩大戟内酯A   表皮生长因子受体/Janus激酶/信号转导因子和转录激活因子3信号通路  

摘要： 目的基于网络药理学、分子对接技术和实验验证探究狼毒大戟治疗甲状腺癌的作用机制。方法通过SwissADME、Swiss Target Prediction数据库筛选狼毒大戟活性成分和相关作用靶点;利用GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库筛选甲状腺癌靶点基因;基于STRING平台和Cytoscape软件构建蛋白互作网络(PPI)、狼毒大戟–有效活性成分–交集靶点网络以及筛选核心靶点;使用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能注释分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用AutoDockTools软件对狼毒大戟核心成分和关键靶点进行分子对接验证;Western blotting分析狼毒大戟对表皮生长因子受体(EGFR)/Janus激酶(JAK2)/信号转导因子和转录激活因子3(STAT3)信号通路的作用。结果共获得狼毒大戟潜在活性成分38种、成分靶点488个,甲状腺癌靶点3050个,交集靶点175个;狼毒大戟治疗甲状腺癌的生物过程包括磷酸化、蛋白磷酸化、细胞群增殖正调控等,相关信号通路涉EGFR/JAK2/STAT3、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(Akt)、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、EGFR、肿瘤坏死因子(TNF)、高级糖基化终末产物–受体(AGE-RAGE)、凋亡、Th17细胞分化等信号通路;分子对接结果表明狼毒大戟治疗甲状腺癌的核心成分与JAK2、EGFR、STAT3具有显著的亲和力,结合性能稳定;Western blotting实验提示岩大戟内酯A呈浓度相关性抑制EGFR/JAK2/STAT3信号通路。结论狼毒大戟可能通过调控多个关键靶点、多种生物学过程和多条信号通路,尤其是EGFR/JAK2/STAT3信号通路发挥抗甲状腺癌效应,为今后深入研究狼毒大戟对甲状腺癌的调控机制提供理论依据。

关键词： 补阳还五汤   动脉粥样硬化   网络药理学   分子对接   PI3K/AKT/p38信号通路  

摘要： 目的通过网络药理学、分子对接及动物实验探讨补阳还五汤防治动脉粥样硬化(AS)的作用靶点及机制。方法通过TCMSP、HERB、UniProt、PubChem、SwissADME、SwissTargetPrediction数据库获取并筛选补阳还五汤活性成分和作用靶点,应用DrugBank、GeneCards、DisGeNET、OMIM、PharmGKB、TTD数据库获取AS相关靶点,借助R语言获取药物与疾病共同靶点,利用STRING11.5数据库进行蛋白相互作用网络分析,运用Cytoscape3.9.1软件进行网络拓扑参数分析以获取核心靶点,利用DAVID平台对交集靶点进行GO及KEGG通路富集分析,将核心基因与补阳还五汤主要活性成分通过AutoDock Vina 1.5.7软件进行分子对接。建立AS小鼠模型并予补阳还五汤干预,采用油红O染色观察小鼠主动脉窦脂质含量,Western blot检测PI3K/AKT/p38信号通路表达,ELISA检测小鼠血清肿瘤坏死因子(TNF)-α、白细胞介素(IL)-17含量。结果共获取补阳还五汤活性成分104个、作用靶点283个,AS相关靶点5347个,获得药物与疾病共同靶点218个,补阳还五汤治疗AS的关键活性成分为槲皮素、山柰酚、黄芩素等,核心靶点有TP53、MAPK1、AKT1等,主要通过PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等发挥作用。分子对接结果表明,槲皮素、木犀草素、山柰酚、黄芩素与靶点TP53、HSP90AA1、MAPK1、AKT1、RELA均有较好的亲和力,MAPK1与黄芩素和木犀草素具有强烈的结合活性。实验结果显示,补阳还五汤能减少AS小鼠主动脉窦脂质含量,降低小鼠血清TNF-α、IL-17含量(P<0.01),明显下调PI3K、p-AKT、p-p38蛋白表达(P<0.05,P<0.01)。结论补阳还五汤防治AS的作用机制可能与调控PI3K/Akt/p38信号通路表达,进而减轻炎症反应有关。

关键词： 丹溪痛风方   痛风性关节炎   网络药理学   分子对接   抗炎作用  

摘要： 目的利用网络药理学、分子对接技术及动物实验探究丹溪痛风方(DanxiTongfeng Decoction,DXTFD)治疗痛风性关节炎(Gouty arthritis,GA)的抗炎作用及机制。方法使用TCMSP数据库筛选DXTFD活性成分和靶点;通过TTD、DrugBank、OMIM以及GeneCards数据库筛选GA相关靶点;取交集后,利用Cytoscape 3.8.0和STRING数据库构建PPI网络;将核心靶点通过R语言进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。运用AutodockVina 1.5.7进行分子对接,预测有效成分和疾病靶点的结合能力。针对网络药理学筛选的部分核心靶点(IL-6、IL-8),我们设计了GA大鼠模型动物实验,检测了GA大鼠模型滑膜组织的病理形态及血清炎症因子(IL-6、IL-8)水平,进一步验证丹溪痛风方治疗痛风性关节炎的抗炎作用及机制。结果筛选获得DXTFD活性成分132个,靶点776个,疾病靶点375个,交集靶点99个;GO富集分析主要在炎症反应、类固醇代谢、脂肪酸代谢等生物学调控方面;KEGG富集分析得到信号通路132条,主要涉及NOD样受体信号通路;活性成分香叶木素、黄芩素与TNF、IL6、PTGS2、MAPK3靶点结合能力良好;动物实验表明,DXTFD可以通过抑制GA大鼠体内炎症因子IL-6、IL-8的表达发挥药效。结论DXTFD可能通过多成分、多靶点抑制炎症反应防治痛风性关节炎。