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关键词： 变应性鼻炎   麻黄附子细辛汤合肾四味汤   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:运用网络药理学和分子对接技术探讨麻黄附子细辛汤合肾四味汤治疗变应性鼻炎(AR)的作用机制。方法:利用TCMSP数据库,获取并筛选麻黄附子细辛汤合肾四味汤的活性成分和潜在靶点;通过多个数据库挖掘AR的相关靶点,并与麻黄附子细辛汤合肾四味汤的潜在靶点取交集,获得麻黄附子细辛汤合肾四味汤治疗AR的核心靶点,同时进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络构建,利用R语言对核心靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用分子对接技术将主要活性成分与核心靶点进行分子对接。结果:麻黄附子细辛汤合肾四味汤中的67个有效成分可以通过白细胞介素-17受体通路、Toll样受体通路、低氧诱导因子受体通路(HIF-1 Signaling Pathway)等多种受体通路治疗AR。分子对接结果显示槲皮素与基质金属蛋白酶9(MMP9)、木犀草素与白细胞介素-6大分子蛋白有良好的结合性。结论:麻黄附子细辛汤合肾四味汤可以从多靶点、多通路治疗AR,为后续研究提供了新的方向。

关键词： 红景天   网络药理学   颗粒细胞   红景天苷   自噬   PI3K/AKT信号通路  

摘要： 目的基于网络药理学和实验验证探究红景天调控颗粒细胞自噬的潜在作用靶点和作用机制。方法借助数据库获取红景天的活性成分、作用靶点以及自噬相关靶点,建立成分-靶点网络图,蛋白质互作网络图,对关键靶点进行基因和信号通路的富集分析并且对活性成分和核心靶点进行分析对接,探究红景天调控颗粒细胞自噬的可能作用机制;使用Western blotting、RT-PCR、透射电镜以及双标腺病毒检测红景天重要活性成分对颗粒细胞自噬的作用。结果获取红景天有效成分7个,作用靶点441个,细胞自噬相关靶点796个,富集分析得到生物过程834个,细胞成分60个,分子功能69个,以及信号通路150条;分子对接结果表明红景天活性成分与核心作用靶点AKT1、ERBB2、PIK3CA、PIK3R1均能形成稳定靶向结合作用。实验结果表明红景天重要活性成分红景天苷具有促进自噬小体和自噬溶酶体形成的作用,并且抑制了Pl3K/AKT信号通路的活动。结论红景天调控颗粒细胞自噬具有多成分-多靶点-多通路的作用特点,其机制与红景天苷调控PI3K/AKT信号通路有关。

关键词： 海巴戟   网络药理学   过氧化物酶体增殖物激活受体γ   胆固醇逆转运   动脉粥样硬化  

摘要： 运用网络药理学探究海巴戟治疗动脉粥样硬化(atherosclerosis,AS)的机制及实验验证研究。利用CMAUP、TCMSP、SwissADME数据库检索并筛选海巴戟的活性成分,分别在GeneCards、OMIM、TTD、PharmGKB及Drugbank数据库中设置筛选条件检索去重后得到AS靶点。通过STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI),采用R语言对交集靶点进行GO和KEGG富集分析。构建THP-1源性巨噬细胞模型进行体外实验验证,通过CCK-8实验筛选海巴戟给药浓度,采用油红O染色和22-NBD-Cholesterol细胞荧光方法检测海巴戟干预后模型细胞内胆固醇含量的变化,再使用RT-PCR、WB实验检测和验证所预测的信号通路。结果显示从海巴戟中共筛选出活性成分59个,靶点332个,参与治疗AS的交集靶点154个,包括PPARG、MMP9、IL-6、CCL2等;GO富集分析得到2844个条目,前10个条目主要包括调节细胞膜受体与核受体等生物学功能,KEGG富集分析得到182个条目,前20个条目主要包括脂质代谢与动脉粥样硬化、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路等。在验证实验中,首先利用CCK-8实验筛选出了合适的海巴戟浓度(10、20、40μg/mL),油红O染色和22-NBD-Cholesterol细胞荧光结果显示海巴戟可促进THP-1源性巨噬细胞内胆固醇流出,且呈剂量依赖性;RT-PCR、WB结果显示海巴戟可激活PPARγ信号通路,增加PPARγ和ATP结合盒转运蛋白A1(ABCA1)的表达。GW9662阻断PPARγ信号通路后海巴戟促进THP-1源性巨噬细胞内胆固醇的流出能力下降,且PPARγ和ABCA1表达随之下调。因此,运用网络药理学结合实验验证揭示海巴戟可能通过激活PPARγ信号通路促进THP-1源性巨噬细胞胆固醇的流出而改善AS。

关键词： 冠状动脉粥样硬化性心脏病   人参-五味子   网络药理学   数据库   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接研究人参-五味子药对治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)的作用机制。方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索人参和五味子的化学成分,并进行筛选,通过PharmMapper和STRING数据库进行药物化学成分靶点的预测,再结合CytoScape软件绘制出可以反映药物、化学成分和靶点之间联系的网络图;通过PharmGKB、TTD、GeneCards、DisGENET和OMIM数据库获得冠心病的相关靶点。制作韦恩图得到药物与疾病之间的交集而获取共同靶点,利用STRING数据库和CytoScape软件绘制药物疾病共同靶点的蛋白质-蛋白质相互作用网络并进行可视化分析。通过R语言对共同靶点进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体论(GO)富集分析,研究筛选出人参-五味子治疗冠心病的关键信号通路,最后根据高拓扑分析选择核心有效成分与核心靶点进行分子对接验证。结果:共获得人参-五味子药对30个活性成分,药物靶点188个,冠心病靶点1632个,两者共同靶点65个,其中度值比较高的有白蛋白(Albumin,ALB)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/threonine-protein Kinase 1,AKT1)、白细胞介素-1β(Interleukin-1β,IL-1β);涉及通路主要有脂质与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的晚期糖基化终末产物(Advanced Glycation End-product,AGE)与其受体(Receptor for Advanced Glycation End-products,RAGE)信号通路等通路;分子对接结果显示,主要有效成分山柰酚与核心靶点ALB、AKT1、IL-1β能较好结合。结论:人参-五味子药对能够治疗冠心病,可能是其主要靶点ALB、AKT1、IL-1β等通过保护血管内皮细胞、进行抗炎反应、缓解动脉粥样硬化等方面来实现的。

关键词： 柴胡-香附   异病同治   阿尔茨海默病   癫痫   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的 采用网络药理学及分子对接的方法探究“柴胡-香附”药对治疗阿尔茨海默病(alzheimer disease,AD)和癫痫(epilepsy,EP)的作用机制,为“柴胡-香附”药对“异病同治”AD和EP提供循证医学依据。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索柴胡与香附药物有效成分,并通过UniProt数据库得到药物靶点,利用GeneCards、OMIM数据库分别得到AD、EP相关疾病靶点,使用Cytoscape 3.7.2构建疾病-药物-成分-靶点网络;通过R语言对靶点进行GO富集分析和KEGG通路富集分析。将疾病-药物-成分-靶点网络的关键成分与交集靶点PPI网络关键靶点运用Pymol软件进行分子对接。结果 筛选得到柴胡-香附药对的有效成分31种(重复成分4种),相关药物靶点814个;AD疾病靶点1916个,EP疾病靶点2782个;药物与AD、EP直接相关的交集靶标分别为125、85个;柴胡-香附可能主要通过调控IL-17信号通路、AGE-RAGE信号通路及TNF通路等作用于AKT1、CASP3、TP53、VEGFA、ESR1、FOS、IL6、TNFH等靶点对阿尔茨海默病和癫痫发挥作用,关键靶点与核心成分分子对接大多可形成稳固结构。结论 柴胡-香附通过多靶点、多通路发挥了对AD和EP“异病同治”的药效作用。

关键词： 中职教学   药理学实验   创新能力   育人质量  

摘要： 中职学校需通过教学改革提升育人能力,并在此基础上,面向各个领域输出人才,只有学生具备创新能力,才能更好的运用自身本领在社会建设、经济发展的过程中贡献一份力量。创新是时代进步的动力,亦是学生必备素养,如何在中职教学活动中培养学生的创新能力,成为了教师要解决的问题之一。本文通过探析中职药理学实验教学中教师培养学生创新能力的策略,以期为提高中职育人质量提供参考。

关键词： 汉黄芩素   糖尿病视网膜病变   AGE-RAGE通路   网络药理学  

摘要： 目的基于网络药理学筛选汉黄芩素治疗糖尿病视网膜病变(diabetic retinopathy,DR)的特征靶点和分子通路,并通过细胞实验对关键靶点进行初步验证,阐述汉黄芩素治疗DR的作用机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharma-cology Database and Analysis Platform,TCMSP)筛选出汉黄芩素的作用靶点,利用比较毒理学数据库(Comparative Toxicogenomics Database,CTD)、人类基因功能和网络分析数据库(Human Gene Function and Network Analysis Database,GenCLiP)、DisGeNET和GeneCards数据库筛选出DR的相关作用靶点,利用STRING数据库及Cytoscape 3.6.1软件构建蛋白相互作用网络(Protein-Pro-tein-Interaction-Network,PPI),利用注释可视化和集成发现数据库(Database for Annotation Visual-ization and Integrated Discovery,DAVID)对靶点进行基因本体(Gene Ontology,GO)注释和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析。最后通过汉黄芩素干预高浓度D-葡萄糖诱导ARPE-19细胞病变模型实验初步验证相关通路中的核心靶点,在光镜下观察细胞形态,用细胞增殖及毒性检测试剂盒(cell counting Kit-8,CCK8)检测细胞存活率,采用实时荧光定量聚合酶链反应(real time quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)法分析靶点基因的表达量。结果筛选出汉黄芩素的潜在靶点204个,与DR相关的靶点313个,汉黄芩素靶点与DR靶点交集后获得30个核心靶点。GO富集分析显示,汉黄芩素主要涉及渗透胁迫响应、膜筏和胰岛素受体底物结合等生物过程。KEGG靶点分析显示,糖尿病并发症的晚期糖基化终末产物-晚期糖基化终末产物受体(advanced glycation end-advanced glycation end receptor,AGE-RAGE)、内分泌抵抗、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)酪氨酸激酶抑制剂抵抗和白细胞介素-17(interleukin-17,IL-17)等信号通路基因富集较多。最后,通过体外ARPE-19细胞实验成功验证糖尿病并发症的AGE-RAGE信号通路中蛋白激酶B(protein kinase B,AKT1)、B淋巴细胞瘤-2基因(B-cell lymphoma 2,BCL2)和胱天蛋白酶3(caspase-3,CASP3)是重要靶点,提示汉黄芩素对DR有显著改善作用。结论利用网络药理学揭示了汉黄芩素通过多靶点、多通路的形式治疗DR疾病,通过体外细胞实验成功验证了AGE-RAGE信号通路中的核心靶点,为进一步阐释汉黄芩素治疗DR的作用机制提供了科学依据。

关键词： 黄芪   丹参   肝纤维化   网络药理学   动物实验   药理作用分子作用机制  

摘要： 目的采用网络药理学探讨黄芪-丹参治疗肝纤维化的潜在作用机制,并通过小鼠体内实验进行验证。方法利用中药系统药理学数据库和疾病靶点数据库筛选黄芪-丹参的主要活性成分及其作用靶点,并进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,选择磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)通路,利用Cytoscape3.7.2软件构建黄芪-丹参的核心成分-关键靶点-目标通路的网络图。将50只SPF级KM小鼠,随机分成正常对照组,模型组,黄芪-丹参低、中、高剂量(2.5、5.0和10.0 g·kg^(-1)·d^(-1),黄芪丹参生药质量比11)组,每组10只。检测实验处理前后小鼠体重、肝重、肝脏组织病理以及关键靶蛋白和mRNA表达水平变化。结果黄芪-丹参活性靶点与肝纤维化疾病靶点映射得到183个共有靶点。通过“黄芪丹参核心成分-关键靶点-目标通路”网络分析,血管内皮生长因子α(VEGFA)、碱性成纤维细胞生长因子2(FGF2)、表皮生长因子受体(EGFR)、有丝分裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)和糖原合成酶激酶3β(GSK-3β)为关键靶点。与模型组相比,黄芪-丹参各剂量组肝纤维化情况均有缓解,EGFR、MAPK1、VEGFA和GSK-3β的mRNA表达水平均显著降低(P<0.05),FGF2的mRNA表达水平显著升高(P<0.05);高剂量组的AKT、p-PI3K,中剂量组的p-AKT、PI3K,低剂量组的p-AKT和p-PI3K蛋白表达水平显著升高(P<0.05)。结论黄芪-丹参的核心成分可能通过调控PI3K/AKT/mTOR通路作用于VEGFA、FFG2、EGFR、MAPK1和GSK-3β而改善肝纤维化。

关键词： 盐肤木   冠心病   网络药理学   分子对接技术  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接技术,探讨盐肤木治疗冠心病的潜在作用机制及药效物质基础。方法:通过检索文献获取盐肤木的活性成分,并采用Swiss Target Prediction收集其靶点,通过GeneCards、OMIM、PharmGKB、DrugBank、NCBI数据库获取冠心病相关靶点。将药物与疾病靶点取交集输入STRING数据库建立蛋白质相互作用(PPI)网络,并通过拓扑分析筛选核心靶点。利用Cytoscape构建“成分—靶点”网络,筛选关键成分。通过R4.1.3进行GO功能富集和KEGG通路富集分析,基于AutoDock软件将核心成分和核心靶点进行分子对接,并运用PyMol软件实现结果可视化。结果:盐肤木的16个活性成分中共有397个潜在靶点,与冠心病相关靶点276个,通过拓扑分析筛选出AKT1、SRC、STAT3为本研究的核心靶点,咖啡酸、紫铆素、根皮素、鞣花酸、槲皮素等是盐肤木治疗冠心病的关键成分。GO富集分析显示其功能涉及氧化应激、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶活化等,KEGG富集主要与PI3K/Akt信号通路、脂质和动脉粥样硬化通路等有关。分子对接结果显示,5个关键成分与3个核心靶点均具有较好的亲和力。结论:盐肤木的关键活性成分包括咖啡酸、紫铆素、根皮素、鞣花酸、槲皮素等,可作用于AKT1、SRC、STAT3等核心靶点,并通过调节PI3K/Akt等多条信号通路发挥治疗冠心病的作用。