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关键词： 石吊兰   结核病   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:探讨石吊兰治疗结核病的潜在活性成分及其作用机制。方法:借助Swiss ADME、PubChem、Swiss Target Prediction、SEA Search Server、UniProt等数据库检索石吊兰活性成分及其对应靶点,通过GeneCards、OMIM及Drugbank数据库检索结核疾病相关靶点,并经Venny 2.1.0获取成分-疾病交集靶点。采用Cytoscape 3.9.1软件和String数据库进行“药物-成分-靶点”网络和蛋白质相互作用(PPI)网络的构建与分析,并筛选PPI网络中的核心靶点。运用Metascape数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并通过Cytoscape 3.9.1软件构建“成分-靶点-通路”网络。最后,利用AutoDock Tools 1.5.7软件将潜在成分与核心靶点进行分子对接。结果:共筛选出石吊兰的活性成分30个、对应靶点510个、结核疾病相关靶点1050个、活性成分与结核病的交集靶点119个。PPI网络共筛选得核心靶点36个,包括STAT3、MAPK1、AKT1、TNF、SRC等。GO功能富集条目共558个(P<0.05),其中生物过程353个、分子功能114个、细胞组分91个;KEGG通路富集分析共得到156个条目(P<0.05),主要涉及癌症、甲型流感、糖尿病中AGE-RAGE、乙型肝炎、结核等信号通路。分子对接结果显示,石吊兰中石吊兰素、去甲氧基苏打基亭、5,7,3′-二羟基-6,8,4′-三甲氧基黄酮、槲皮素等活性成分与STAT3、MAPK1、AKT1等蛋白的结合能均小于-5 kcal·mol^(-1),均具有较强的结合活性。结论:本研究初步探讨了石吊兰抗结核的活性成分及相关信号通路,其作用机制涉及多个靶点基因及通路,与中药多成分、多靶点、多通路协同作用的治病特点不谋而合,为石吊兰抗结核的进一步研究提供了理论依据。

关键词： 深绿卷柏   喉癌   UPLC-Q-TOF-MS   网络药理学   分子对接技术   实验验证  

摘要： 目的:研究深绿卷柏富含双黄酮部位治疗喉癌的作用机制。方法:运用UPLC-Q-TOF-MS对深绿卷柏富含双黄酮部位(SD-BFRE)进行化学成分分析并通过PharmMapper数据库进行靶点预测,通过检索OMIM、GeneCards和DrugBank数据库收集喉癌相关靶点,利用Venny 2.1.0在线平台将二者取交集获得潜在靶点。使用STRNG平台对潜在靶点进行蛋白相互作用分析,通过DAVID数据库进行GO功能分析和KEGG通路分析,使用Cytoscape 3.8.0软件构建PPI网络和“成分-靶点-通路”网络。通过SYBYL-X 2.0软件对所有成分和核心靶点进行分子对接验证并通过Discovery Studio 4.5软件进行可视化。采用MTT法测定细胞活力和Western blot法验证SD-BFRE对喉癌细胞系富集关键通路相关蛋白表达的影响。结果:鉴定化合物14个,药物靶点72个,喉癌相关靶点2366个,潜在靶点49个。GO分析得到181个P≤0.05的条目,KEGG分析共得到74条P≤0.05的通路,主要涉及IL-17、FoxO、TNF和PI3K-Akt信号通路等,分子对接结果显示92.9%有较好的对接活性。细胞实验结果表明,SD-BFRE可显著抑制p-Akt和p-Bad的表达,与网络药理学预测结果基本一致。结论:运用UPLC-Q-TOF-MS结合网络药理学及实验验证分析了SD-BFRE治疗喉癌的作用机制,为进一步深入研究提供参考。

关键词： 月经后期   用药规律   数据挖掘   网络药理   中药   治疗  

摘要： [目的]探究何赛萍教授治疗月经后期的临床用药规律,预测核心药物的潜在作用机制。[方法]搜集2019年1月1日至2021年6月30日何教授门诊诊治的月经后期女性的初诊处方,建立处方数据库。应用Excel 2013和SPSS 26.0软件对处方进行频次统计、聚类和关联规则分析,并利用网络药理学技术预测核心药物组合的作用机制。[结果]共纳入120首有效处方,包括154味中药。频次前5的药味为当归、白术、梅花、茯苓和菟丝子,多味甘、辛,性平,归脾、肝、肺经。结果显示,“当归-白术-梅花-茯苓”是治疗月经后期的核心药物组合;经筛选后获得“当归-白术-梅花-茯苓”的关键活性成分5个,包括β-谷甾醇、(-)-β-花柏烯、豆甾醇、常春藤皂苷元和苍术酮;经拓扑分析得到其治疗月经后期的7个关键靶点,包括肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、β2-肾上腺素受体(β2-drenergic receptor,ADRB2)、去甲肾上腺素转运体(norepinephrine transporter,SLC6A2)、90 kDa热休克蛋白AA1(heat shock protein 90 kDa alpha1,HSP90AA1)、毒蕈碱型胆碱能受体1(cholinergic receptor muscarinic 1,CHRM1)、多巴胺D2受体(dopamine D2 receptor,DRD2)和钾电压阀门通道亚家族H成员2(potassium voltage-gated channel subfamily H member 2,KCNH2)。京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析结果主要涉及磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositol 3-kinase-protein kinase B,PI3K-Akt)信号通路、环磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP)信号通路、环磷酸鸟苷-蛋白激酶G(cyclic guanosine monophosphate-protein kinases G,cGMP-PKG)信号通路等多种信号通路。[结论]何教授临床诊治月经后期时,在补肾的基础上更重视疏肝健脾、养血调经,以促进女性气血调和,月经按时来潮。其核心药物组合“当归-白术-梅花-茯苓”治疗月经后期的潜在靶点主要参与调节激素水平、生成血管壁、促进卵泡生长发育、降低炎症反应等生物学过程。本研究为中医药治疗月经后期提供了参考依据,并为进一步挖掘其作用机制提供了方向。

关键词： 芪蓝方   网络药理学   前列腺癌   人前列腺癌细胞株   凋亡   氧化应激  

摘要： 目的:采用网络药理学研究芪蓝方治疗前列腺癌的生物学物质基础与药效机制。方法:借助TCMSP、GeneCards等数据库及相关文献构建芪蓝方治疗前列腺癌的“药物-疾病-靶点”网络,利用STRING及Cytoscape插件构建上述药物治疗前列腺癌的蛋白-蛋白相互作用网络,同时对关键靶点进行GO功能富集分析以及KEGG信号通路富集分析,并以细胞实验进一步验证网络药理学所得结论。结果:芪蓝方治疗前列腺癌的“药物-疾病-靶点”网络共涉及423个生物活性成分,筛选后获得227个靶基因,783个前列腺癌靶点,二者共同靶点89个;芪蓝方中核心活性分子为槲皮素、木犀草素、山柰酚、薯蓣皂苷素、刺芒柄花素、异黄杞苷素。关键靶点为PTGS2、PGR、AR、PPARG、ESR1、RELA;共同靶点的PPI网络中节点度排名前五位的为TP53、ESR1、MYC、AKT1、CCND1。GO富集分析提示芪蓝方治疗前列腺癌的生物学过程及功能集中在细胞增殖、对氧化应激的反应、对活性氧的反应、对类固醇激素的反应、凋亡信号通路的调控、等。KEGG通路富集分析提示芪蓝方治疗前列腺癌主要涉及PI3K-AKT信号通路、细胞凋亡、前列腺癌相关信号通路、内分泌抵抗、lL-17信号通路、化学致癌受体激活、等通路。细胞实验结果显示,与空白对照组相比,35 g/kg芪蓝方含药血清组PC-3凋亡率明显升高,细胞内H2O2、MDA水平升高,BAX、CASP9、P53蛋白明显上调(P<0.05),同时PC-3增殖、侵袭、迁移能力明显降低,细胞内SOD水平、总抗氧化能力明显降低,Ar、Psa mRNA表达下调,BCL-2、p-PI3Kp85、p-AKT、CCND1蛋白明显下调(P<0.05)。结论:芪蓝方治疗前列腺癌的作用靶点和药效机制,可能与其调控细胞增殖凋亡、氧化应激和类固醇反应的生物学过程及PI3K/AKT信号通路相关。

关键词： 新型冠状病毒感染   寒湿疫   小青龙汤   达原饮   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的分析加味小青龙汤合达原饮治疗新型冠状病毒感染(COVID-19)的临床效果,探讨其活性成分、潜在靶点和作用机制。方法比较常规治疗和加味小青龙汤合达原饮治疗COVID-19的中医证候疗效、炎症指标及不良反应,评价加味小青龙汤合达原饮治疗COVID-19的临床效果。应用TCMSP数据库收集加味小青龙汤合达原饮中活性成分,使用SwissTargetPrediction工具预测其潜在靶点;利用Pubchem,Immport等数据库获取COVID-19相关的疾病靶点,取药物-疾病交集靶点;对交集靶点进行蛋白相互作用(PPI)分析与网络构建;对交集靶点进行GO和KEGG分析;利用Autodock vina软件对其重要成分及关键靶点进行分子对接。结果经加味小青龙汤合达原饮治疗后,COVID-19患者的临床症状和炎症指标改善均优于对照组。加味小青龙汤合达原饮治疗COVID-19的相关靶点共34个,其中核心靶点有EGFR、RELA、RELA、ICAM-1、MMP9等。主要通路涉及PI3K-Akt信号通路、Ras信号通路、MAPK信号通路等。结论加味小青龙汤合达原饮可通过多成分-多靶点治疗新型冠状病毒引起的“寒湿疫”。

关键词： 定量药理学   新生儿   模型预测  

摘要： 新生儿超说明书用药的比例高达80%~97%,但关于影响新生儿药物吸收、分布、代谢和排泄过程的研究十分有限。随着近年模型技术的发展,多种定量药理学模型已经应用于新生儿临床研究和治疗中,弥补了以往缺乏直观数据的缺陷,也加深了医生对新生儿药代动力学病理生理影响因素的认识,有助于更加科学地制定新生儿临床药物治疗方案。本文就定量药理学在新生儿群体中的研究进展进行综述。

关键词： 三芪丹   2型糖尿病   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的采用网络药理学探讨三芪丹对2型糖尿病(T2DM)治疗的潜在作用机制。方法在中药系统药理学技术平台(TCMSP)以口服生物利用度(OB)和类药性(DL)为限定条件筛选出三芪丹的活性成分、作用靶点;在GeneCards数据库TTD数据库中寻找2型糖尿病相关靶点,将三芪丹作用靶点与T2DM相关靶点进行映射分析,筛选出三芪丹治疗T2DM的活性成分和作用靶点。借助Cytoscape3.7.2软件,构建三芪丹活性成分-作用靶点网络;通过String平台构建靶蛋白相互作用网络;对靶点基因GO富集分析和KEGG代谢通路进行分析,并构建“成分-靶点-通路”网络图。结果三芪丹筛选得到97个化合物,相应作用靶点371个,与2型糖尿病的共同靶点18个,涉及关键靶点有PPARG、TGFB1、PTEN、SIRT1等,通路主要涉及癌症通路、骨质疏松分化、foxo信号通路、PPAR信号通路、胰岛素抵抗等。结论初步研究了三芪丹治疗T2DM的作用机制,三芪丹具有多个活性成分,能通过多个靶点、多个通路来发挥治疗T2DM的作用。

关键词： 多囊卵巢综合征   健脾益肾化浊方   作用机制   网络药理学  

摘要： 目的:基于网络药理学方法探讨健脾益肾化浊方治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovary syndrome, PCOS)的有效成分及可能作用机制。方法:通过TCMSP数据库检索健脾益肾化浊方组成药物的活性成分,筛选有明确作用靶点的活性成分和作用靶点;通过Uniport数据库检索靶点信息,将各中药活性成分作用靶点转化成相对应的基因名称,并通过Cytoscape3.9.0软件构建活性成分网络图、中药-活性成分-基因靶点网络图;检索Gene Cards疾病数据库中PCOS相关靶点;制作健脾益肾化浊方活性成分靶基因和PCOS相关靶点韦恩图,筛选交集基因,通过String数据库构建蛋白相互作用网络(PPI);最后利用Meta scape数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,用微生信作图。结果:筛选出健脾益肾化浊方活性成分94种,对应靶基因254个,PCOS疾病靶点1297个,两者交集靶点116个;其中MAPK1、MAPK3、AKT1、TP53、TNF、MAPK14、IL6、ESR1、EGRF、RB1可能是健脾益肾化浊方治疗PCOS的主要靶点。结论:健脾益肾化浊方的活性成分、关键靶点、信号通路可能以“多成分-多靶点-多通路”调节糖脂代谢紊乱、胰岛素抵抗、卵泡发育等方面发挥治疗PCOS的作用。

关键词： 黄芩-厚朴   龋齿   网络药理学   作用机理   实验验证  

摘要： 通过网络药理学和实验验证,探讨黄芩-厚朴治疗龋病的作用机制.从TCMSP中对黄芩-厚朴的药物成分及对应靶点进行研究,并通过Uniprot统一基因名称.使用Gene Cards、OMIM、Dis Genet获取龋病靶点,使用venny 2.1获取交叉靶点.使用STRING进行PPI分析,使用Cytoscape构建网络图.metscape用于GO和KEGG分析.使用Cytoscape软件构建“成分-靶点-通路”网络图.建立大鼠龋模型,用黄芩-厚朴汤局部治疗.检测核心靶蛋白在大鼠血清中的表达.结果发现黄芩-厚朴中32种有效成分可通过多种途径直接作用于31个疾病靶点,其中黄芩素、β-谷甾醇、豆甾醇、金合花、木质素、桉叶油素是核心成分,IL-6、AKT1、TNF、MMP9、VEGFA是最重要的靶点.基因功能注释分析结果显示,与重叠基因最可能相关的生物过程主要是炎症、细胞对生物刺激的反应,如细胞对脂多糖的反应,细胞组分主要涉及膜筏、进入管腔微区、细胞质膜等,分子功能主要涉及蛋白质二聚化、细胞因子活性、DNA结合转录因子和细胞因子受体等.通路富集分析结果提示黄芩-厚朴主要参与AGE-RAGE、TNF、IL-17、MAPK、JAK-STAT、HIF-1、VEGF、PI3K/AKT、凋亡等信号通路.黄芩-厚朴治疗后大鼠血清中IL6、AKT1、TNF、MMP9、VEGFA含量均升高.综上所述,黄芩-厚朴主要调控AGE-RAGE、TNF、IL-17、MAPK、JAK-STAT、HIF-1、VEGF、PI3K/AKT、凋亡等信号通路中的IL6、AKT1、TNF、MMP9、VEGFA等疾病靶点,干预酶活性、炎症反应等生物过程从而治疗龋病.

关键词： 网络药理学   中药有效成分   缺血性脑卒中   治疗靶点   出血性脑卒中   中药成分   中药防治   不良反应  

摘要： 脑卒中又称中风,分为缺血性脑卒中和出血性脑卒中,在临床上绝大部分的脑卒中属于缺血性脑卒中。近年来缺血性脑卒中在我国的发病率呈逐年上升趋势[1],且发病群体逐渐趋于年轻化,当代年轻人的生活压力是该疾病的主要诱发因素之一。研究发现,中药能够防治缺血性脑卒中,具有疗效好、不良反应少等优势[2],但因中药成分繁多、作用机制复杂,故很难准确定位其有效成分和治疗靶点,而网络药理学可以预测中药有效成分对疾病靶点及通路的影响,因此可用来辅助筛选防治缺血性脑卒中的中药及其有效成分,定位疾病关键治疗靶点。