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关键词： 胃复春   胃低级别上皮内瘤变   生物信息学   作用机制   GEO芯片   药效团模型   分子对接  

摘要： 目的基于胃低级别上皮内瘤变(LGIN)患者GEO芯片及网络药理学,探究胃复春治疗胃LGIN的作用机制。方法从GEO数据库下载LGIN芯片,以logFoldChange=1、adjust P=0.05为标准筛选差异表达基因作为疾病靶点,检索文献收集胃复春入血成分并预测得到药物靶点,疾病靶点与药物靶点交集得到潜在作用靶点,采用蛋白互作网络及构建“入血成分-疾病”筛选核心靶点及化合物。通过ClusterProfiler包对交集靶点进行GO富集分析、KEGG通路富集分析并构建核心通路-靶点关系。核心靶点及核心通路共有靶点整合得到药效靶点,构建药效团模型预测核心化合物对药效靶点作用,采用分子对接进一步验证。结果基于数据集GSE130823/GSE55696筛选得到差异表达基因2871个,文献整理分析得到入血成分75个,对应靶点663个,潜在作用靶点131个,蛋白互作网络分析显示,白细胞介素6、表皮生长因子受体、JUN、细胞色素P4503A4酶、肝细胞核因子4α、肾上腺素受体等为核心靶点,药材-入血成分-靶点网络分析显示,槲皮素、香茶菜素O、线纹香茶菜酸、异橙黄酮、桔皮素、蓝萼甲素、蓝萼乙素为核心化合物。网络药理学分析结果显示,神经活性配体-受体相互作用、化学致癌作用、Rap1信号通路、类固醇激素生物合成、HIF-1、FoxO信号通路等为胃复春治疗慢性胃炎进展性LGIN病变的核心通路,药效团及分子对接显示核心化合物可调节药效靶点表达,发挥抗炎、调节能量代谢及癌症形成、调节黏膜血流量及黏膜损伤修复等作用。结论胃复春通过作用于神经活性受体-配体互作、钙离子、化学致癌、胆碱能、Rap1、药物代谢酶、HIF-1、FoxO等信号通路干预胃LGIN进程。

关键词： 膝骨关节炎   青风藤   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:应用网络药理学与分子对接技术探讨青风藤治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制。方法:从TCMSP数据库中提取青风藤的化学成分,获得药物靶点及疾病相关基因,筛选交集靶点,获得青风藤治疗KOA的作用靶点。对交集靶点及相关信号通路利用数据库进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过分子对接平台进行分子对接。结果:获得青风藤化合物主要化学成分6种、疾病基因643个、药物与疾病交集靶点11个。网络分析结果显示,青风藤通过调控肿瘤信号通路、糖尿病并发症中的糖基化终末产及其受体信号通路(AGE-RAGE)、细胞凋亡信号通路、肿瘤抑制蛋白p53信号通路(p53)、血清素突触信号通路等作用于前列腺素G/H合酶1(PTGS1)、前列腺素-内过氧化物酶合酶2(PTGS2)、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPARG)、B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)、转化生长因子β-1前蛋白(TGFB1)、胱天蛋白酶3(CASP3)等关键靶点,通过干预细胞凋亡、抑制炎症等发挥治疗KOA的作用。分子对接结果显示,青风藤核心成分β-谷甾醇(beta-sitosterol)、青藤碱(Sinomenine)与核心靶点结合高度稳定。结论:青风藤治疗KOA是多通路、多靶点共同作用的结果,其作用机制与细胞凋亡、炎症关系最为密切。

关键词： 药剂学   药理学   网络   表观遗传学   创新   实践  

摘要： 《兽医药剂学》是研究畜禽专用药物制剂的基本理论、处方设计、制备工艺、质量控制和合理应用等内容的一门综合性技术科学,是动物医学和动物药学专业培养方案中的核心课程。基于我院特色专业建设与创新型人才培养的新要求,我们尝试将本学院的优势科研学科网络药理学和表观遗传药理学与兽医药剂学相结合,旨在实现《兽医药剂学》教学的高阶创新,提升该课程的创新性和挑战度,培养学生的创新精神,提高学生的综合素质,对于新型兽药制剂的研发和指导临床合理用药等方面亦具有重要意义。

关键词： 免疫抑制小鼠模型   健胃消食口服液   免疫调节   T淋巴细胞亚群   三羧酸循环  

摘要： 目的:通过小鼠免疫功能抑制模型探讨健胃消食口服液的免疫调节作用,同时整合网络药理学方法探讨健胃消食口服发挥液健胃消食作用的机制。方法:按体质量随机分为对照组,模型组,阳性药及健胃消食口服液低、中、高剂量(0.62、1.24、2.48 g·kg^(-1))组,腹腔注射环磷酰胺制备小鼠免疫功能抑制模型。观察小鼠表观状态、体质量、脾指数和胸腺指数变化;运用淋巴细胞转化实验和B细胞抗体生成实验检测小鼠细胞免疫和体液免疫能力;结合流式细胞术检测淋巴细胞中辅助性T细胞(CD4^(+)T)和细胞毒性T细胞(CD8^(+)T)细胞比例,观察T淋巴细胞亚群的变化;应用中医药整合药理学研究平台(TCMIP)V2.0预测健胃消食口服液的潜在活性成分与靶点;根据主治病症临床表现,以“Gastritis”“Anorexia”为关键词在GeneCards等数据库获取疾病靶点;利用Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,筛选健胃消食口服液核心作用靶点;使用欧易云平台对核心靶点进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;应用液相色谱-质谱法检测脾脏中三羧酸循环代谢产物以初步了解代谢与免疫之间的关系。结果:体外实验证明,与对照组比较,模型组小鼠体质量持续下降。与模型组比较,给药组小鼠体质量从给药后第4天开始相继出现不同程度恢复,饮食、反应状态、蜷缩弓背情况也有不同程度的改善;给药组小鼠脾脏体比、胸腺脏体比及小鼠脾淋巴细胞转化能力和B细胞抗体生成能力显著提高。通过筛选得到健胃消食口服液中95个成分、650个成分靶点及1490个疾病靶点。结合CytoNCA插件筛选到56个核心靶点。富集分析发现,健胃消食口服液健胃消食的相关机制与C型凝集素受体信号通路和辅助性T细胞17(Th17)细胞分化等免疫通路有关。三羧酸循环中琥珀酸、二磷酸腺苷、乌头酸、柠檬酸、丙酮酸的代谢产物含量均呈现上升趋势,但是无剂量相关性。结论:初步揭示了健胃消食口服液的免疫相关作用机制,为健胃消食口服液的临床应用提供依据。

关键词： 专业核心能力   药理学   教学改革  

摘要： 中西医结合人才培养对坚持中西医并重,实现中医药创造性转化、创新性发展意义深远。明确药理学教学在中西医结合专业核心能力培养目标中的定位,立足学情创新教学设计,培养自主探究学习;延伸课堂边界,提高课程内涵建设;以执业医师考试为抓手,强调临床思维和实践能力;构建形成性分层次评价考核体系。围绕中西医结合的内涵和外延,实现以就业为导向的教学模式转变。维护健康,弘扬文化,传承融合,创新发展,为建设健康中国培养更多知识、能力、素质协调发展的应用型高级中西医结合人才。

关键词： 药理学   以学生为中心   改革  

摘要： 目的药理学知识点多、内容抽象,传统的教学模式难以达到教学目标,亟需改革以提高教学效果。方法教学团队通过调研、学习、商讨,分析药理学的学科特点及学生学情,确定教学改革策略、实施途径及目标。结果教学团队确立了“以学生为中心”的教学改革策略、目标,将教学实施过程分为课前、课中、课后,并依据教学过程特点建立了教学资源库、习题库、优化教学课件、应用多种教学平台及教学方法、融入社会主义核心价值观教育、培养学生的创新能力等。结论通过以上教学改革措施,调动了学生学习积极性和主动性,提高了药理学教学效果。

关键词： 金钱草   网络药理学   水肿   信号通路  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨金钱草治疗水肿的分子机制。方法:基于中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Swiss Target Prediction数据库及Uniprot数据库筛选出金钱草的有效成分,GeneCards数据库、DrugBank数据库及OMIM数据库筛选出水肿的靶点基因,Cytoscape 3.9.1构建中药活性成分-靶点-水肿疾病网络图,STRING数据库绘制蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein Interaction,PPI)网络图。用Metascape进行关键靶基因基因本体论(GO)富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:获得中药金钱草活性成分10个,涉及靶点129个。网络分析显示靶点主要涉及对激素的反应、对类固醇激素的反应、氧化还原酶活性、蛋白激酶结合、核受体活性等生物过程;富集分析显示,相关基因主要通过调节磷脂酰肌醇3激酶(Phosphatidylinositol 3-kinase,PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、花生四烯酸代谢、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)信号通路等信号通路发挥治疗作用。结论:金钱草作用机制涉及PI3K-Akt信号通路、花生四烯酸代谢、MAPK信号通路等,初步揭示了金钱草治疗水肿的关键靶点及信号通路,其作用是多靶点、多通路的,为从分子层面以金钱草治疗水肿提供了一定的参考依据。

关键词： 小承气汤   急性胰腺炎   网络药理学   分子对接   机制  

摘要： 目的应用网络药理学与分子对接技术探讨小承气汤治疗急性胰腺炎(AP)的作用机制.方法于中药药理学分析平台(TCMSP)数据库筛选大黄、枳实、厚朴的活性成分,应用瑞士目标预测(STP)数据库预测相关靶点.通过药物银行(DrugBank)数据库、基因卡片(GeneCards)数据库、人类孟德尔遗传在线(OMIM)数据库、治疗靶点数据库(TTD)及药物基因组学知识库(PharmGKB)数据库中筛选出AP的相关靶点.运用String数据库构建靶点蛋白互作网络,采用Cytoscape绘制网络并进行拓扑学分析,使用R3.6.2软件对相关靶点进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释分析,通过Autodock 4.2.6软件以及Vina软件进行分子对接.结果共筛选出小承气汤与AP直接相关的交集靶点124个,通过网络拓扑分析发现11个靶点,包括视网膜母细胞瘤1(RB1)基因、蛋白激酶B(PKB)基因、细胞周期蛋白D1(CCND1)基因、禽髓细胞瘤病毒癌基因同源物(MYC)基因、雌激素受体1(ESR1)基因、网状内皮细胞过多症病毒癌基因同源物A(RELA)基因、激活蛋白1(AP-1)基因、p53基因、丝裂素活化蛋白激酶(MAPK1、3、14)基因为核心靶点.GO富集分析及KEGG通路富集分析显示,小承气汤可通过干预细胞凋亡、调节胰腺细胞增殖分化、抑制氧化应激等方面治疗AP,其中磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路是最重要的通路.选取小承气汤关键活性成分与核心基因靶点进行分子对接,结果表明,柚皮素分别与PKB、MAPK1、MAPK3;川陈皮素分别与AP-1、p53基因;木犀草素分别与CCND1、RB1 RELA;木犀草素四甲醚与MAPK14;芦荟大黄素与MYC;儿茶素与ESR1等11对成分-靶点对接的自由能较小,显示出良好的对接活性.结论通过网络药理及分子对接的方法证实小承气汤治疗AP具有多途径、多靶点作用的特点,并揭示了相关物质基础和作用机制,这为经典名方在临床的广泛应用提供了参考,也为后期的基础研究提供了理论依据.

关键词： 健脾祛湿解毒通络方   幽门螺杆菌感染   网络药理学   分子对接   槲皮素   信号通路   姚乃礼  

摘要： [目的]基于网络药理学和分子对接方法,挖掘姚乃礼教授健脾祛湿解毒通络方治疗幽门螺杆菌(Helicobacter pylori,Hp)感染的作用机制。[方法]应用中药系统药理学分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP),检索并获取健脾祛湿解毒通络方药物的活性成分及靶点,通过人类孟德尔遗传在线(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)、人类基因综合数据库(Human Gene Comprehensive Database,GeneCards)和DrugBank数据库获取Hp感染相关靶点,对药物靶点与疾病靶点取交集,作为健脾祛湿解毒通络方治疗Hp感染的潜在作用靶点。采用Cytoscape 3.7.0软件构建药物-成分-共有靶点网络,通过STRING网站构建蛋白互作(protein protein interaction,PPI)网络,通过Metascape平台进行基因本体(gene ontology,GO)分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。利用AutoDock软件,对核心靶点和度值前5位的主要活性成分进行分子对接。[结果]健脾祛湿解毒通络方治疗Hp感染有126个靶点,涉及118个活性成分,Cytoscape 3.7.0软件筛选出槲皮素、β-谷甾醇、金合欢素、山柰酚、豆甾醇等主要活性成分,PPI网络分析后得到肿瘤蛋白P53(tumor protein p53,TP53)、信号转导和转录激活因子3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、转录因子p65(transcription factor p65,RELA)、丝裂原活化蛋白激酶3(mitogen-activated protein kinase 3,MAPK3)、酪氨酸蛋白激酶B1(threonine protein kinase B1,AKT1)、MAPK1、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)等核心靶点,参与对脂多糖的反应、对外来刺激的反应等生物过程,涉及癌症相关通路、叉头框转录因子O(forkhead box protein O,FOXO)、缺氧诱导因子-1(hypoxia induced factor-1,HIF-1)、核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)信号通路等多条通路。分子对接结果表明,健脾祛湿解毒通络方主要活性成分与核心靶点结合能力较强,验证了上述预测结果。[结论]健脾祛湿解毒通络方中多种成分可作用于Hp感染相关靶点,通过多条通路发挥作用,为深入研究健脾祛湿解毒通络方治疗Hp感染提供了参考。

关键词： 甲状腺结节   浙贝母-夏枯草药对   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨浙贝母-夏枯草治疗甲状腺结节(thyroid nodules)的作用机制。方法:在中药系统药理数据库和分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform, TCMSP)检索浙贝母、夏枯草的化学成分,利用PharmMapper数据库获取化学成分靶点,并采用Cytoscape 3.7.1软件构建“药物-活性成分-靶点”网络。基于Genecards数据库、在线人类孟德尔遗传数据库、治疗靶点数据库获得甲状腺结节相关靶点。将有效成分相关靶点与疾病靶点导入韦恩图网站进行在线分析,获得交集靶点,并利用STRING数据库构建蛋白互作网络(protein-protein interaction networks, PPI)模型,利用Cytoscape 3.7.1软件构建PPI网络并筛选核心靶点。将药物及其活性成分、交集靶点及疾病导入Cytoscape 3.7.1软件绘制成“药物-活性成分-交集靶点-疾病”网络图。利用Metascape数据库对交集靶点进行基因本体(gene ontology, GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG)信号通路富集分析。采用AutoDock软件对关键靶点与活性成分进行分子对接。结果:浙贝母-夏枯草药对共15个活性成分,171个相关靶点。甲状腺结节疾病靶点1 563个。经韦恩图网站在线分析后得到浙贝母-夏枯草治疗甲状腺结节相关的靶点108个。交集靶点PPI网络分析得到AKT1、肿瘤蛋白P53(tumor protein P53,TP53)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)为核心靶点。GO富集分析得到生物过程1 705条、分子功能136条、细胞组分115条。KEGG富集分析获得202个信号通路。分子对接结果表明,浙贝母-夏枯草主要有效活性成分与靶点受体蛋白可以较好的结合。结论:浙贝母-夏枯草药对可通过多成分、多靶点、多通路治疗甲状腺结节。