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关键词： DGD-4   急性肝损伤   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学及分子对接方法,分析蒙药地格达-4(DGD-4)治疗急性肝损伤(ALI)的作用机制。方法前期实验获得DGD-4主要活性成分,进一步搜索TCMSP、Swiss Target Prediction和ETCM数据库以及文献,结合两者获取DGD-4主要活性成分和靶点;采用GeneCards、DisGeNET和OMIM数据库获取ALI的靶点,利用InteractiVenn数据库获得DGD-4对ALI的作用靶点;应用STRING数据库和Cytoscape 3.9.1软件构建蛋白质-蛋白质互相作用(PPI)网络图并筛选核心靶点;运用Metascape数据库进行KEGG通路和GO富集分析,再使用CB-DOCK数据库进行分子对接验证。结果实验数据及文献检索得到DGD-4与ALI相关的主要活性成分胡黄连苷I、胡黄连苷Ⅱ、木犀草素、4-甲基伞形酮、海藻糖、大车前苷、异牡荆黄素、甜菜碱、京尼平-龙胆双糖苷、栀子苷共10种,相关的靶点314个,ALI的靶点4577个,交集靶点223个,其中TP53、GAPDH、JUN、AKT1、BCL2、EGFR、SRC、IL-6、HSP90AA1和ESR1可能是DGD-4治疗ALI的核心靶点;KEGG分析结果显示,该靶点主要富集PI3K-Akt信号通路等。进一步分子对接结果显示,结合能均<-5kcal/mol,证明有较好的结合亲和力,与网络药理学预测结果相符。结论该研究为DGD-4治疗ALI提供新的思路和方法。

关键词： 网络药理学   芍甘散   镇痛   经验方  

摘要： 目的基于网络药理学研究方法探讨经验方芍甘散镇痛的作用机制。方法通过TCMSP数据库搜索芍甘散有效成分及潜在靶点;通过GeneCards数据库收集疼痛的疾病靶点,并获取药物与疾病的交集靶点;采用Cytoscape3.9.1构建药物-成分-交集靶点网络图,筛选出核心成分;采用String数据库,绘制构建蛋白质相互作用网络图,筛选出核心靶点;使用David数据库进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析。结果芍甘散有效成分167个,其潜在靶点与疼痛靶点的交集有224个,“药物-成分-靶点-疾病”网络提示芍甘散的核心化合物为槲皮素、山柰酚、7-甲氧基-2-甲基异黄酮、β-谷甾醇、柚皮素、异鼠李素、芒柄花黄素、美迪紫檀素、甘草查尔酮A、豆甾醇;“药物-成分-靶点-疾病”网络结合蛋白质相互作用网络提示雌激素受体、COX2、热休克蛋白90、钙调蛋白受体、蛋白激酶、白细胞介素-6、抑癌蛋白、白介素-1β可能是关键靶点。KEGG通路富集分析显示核心通路主要包括癌症的信号通路、脂质与动脉粥样硬化的信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、流体剪切应力与动脉粥样硬化信号通路等。结论芍甘散可能通过多靶点、多信号途径的相互作用起到镇痛作用,可为下一步实验研究提供依据。

关键词： 青钱柳叶总黄酮   肾纤维化   PI3K-Akt信号通路   分子对接   网络药理学  

摘要： 目的:运用网络药理学和分子对接技术探讨青钱柳叶总黄酮治疗肾纤维化的物质基础及作用机制。方法:综合前期研究基础分类汇总青钱柳叶总黄酮主要活性成分,利用Swisstarget预测潜在靶点;通过GeneCards和OMIM数据库获取疾病靶点,应用STRING网站构建PPI和“药物-成分-靶点-通路”网络;最后将青钱柳叶总黄酮主要活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果:收集并筛选出21种黄酮类成分,9种为黄酮,11种为黄酮苷类,潜在靶点391个;关键靶点为AKT1、TP53、TNF、EGFR、ALB、SRC、BCL2、CASP3、HSP90AA1和ESR1;关键通路为PI3K-Akt信号通路;分子对接结果表明,青钱柳叶总黄酮的21种活性成分与多数关键靶点有较好的结合能力。结论:阿福豆苷、金丝桃苷、异槲皮苷、山奈酚-3-O-芸香糖苷、槲皮苷、牡荆素为青钱柳叶总黄酮治疗肾纤维化的核心成分,可能通过AKT1、EGFR、BCL2、CASP3和HSP90AA1等靶点调控PI3K-Akt信号的表达和磷酸化传导发挥作用。

关键词： 消炎抗菌片   网络药理学   靶点   抗菌   抗炎   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学阐释中药制剂消炎抗菌片抗菌活性成分及作用机制。方法采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库和SwissTargetPrediction数据库收集与筛选消炎抗菌片活性成分并挖掘其对应的靶标;采用GeneCards数据库和在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)筛选抗菌靶点并通过Venny 2.1取交集获得消炎抗菌片的抗菌靶点,然后利用Cytoscape 3.8.0软件构建“药物-活性成分-抗菌靶标”网络图;将获得的消炎抗菌片的抗菌靶点导入STRING平台构建靶蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,Cytoscape软件网络拓扑计算筛选抗菌关键靶点;通过Metascape数据库对抗菌靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析;利用基因表达综合数据库(GEO)下载GSE19315芯片进行差异基因分析;最后,通过利用AutoDock Tools进行活性成分与核心靶点的分子对接验证。结果检索获得消炎抗菌片的潜在活性成分52种,相对应的潜在基因靶标485个;抗菌相关潜在靶点2296个,通过Venny 2.1取交集,得到消炎抗菌片抗菌靶点138个,其中关键靶点为蛋白激酶B(AKT1)、肿瘤蛋白P53(TP53)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、磷酸甘油醛脱氢酶(GAPDH)、血管生长因子A(VEGFA)、白细胞介素-1β(IL-1β)、原癌基因(MYC)、酪氨酸激酶(SRC)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)、表皮生长因子受体(EGFR)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、雌激素受体1(ESR1)、白细胞介素-10(IL-10)、缺氧诱导因子1A(HIF1A)、趋化因子配体2(CCL2)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、过氧化物酶体增殖物激活受体-γ(PPARG)、细胞周期蛋白D1(CCND1);并通过GEO数据库获得的差异基因与活性成分潜在基因靶标取交集,获得消炎抗菌片治疗菌痢和出血性结肠炎可能的抗炎靶点;分子对接结果显示,潜在活性成分与核心靶点具有良好的结合潜能;消炎抗菌片可能通过参与癌症途径、脂质和动脉粥样硬化、化学致癌-活性氧、内分泌耐药、核因子κB信号通路、铂耐药、松弛素信号通路、炎症性肠病、催乳激素信号通路、病毒致癌作用等信号通路发挥抗菌作用。结论研究阐明了消炎抗菌片具有多成分、多靶点、多通路的抗菌作用机制,为进一步深入探索中药制剂消炎抗菌片抗菌机制提供理论参考,并为其功效的开发提供新的思路和线索。

关键词： 独活寄生汤   腰椎间盘突出症   网络药理学   分子对接   活性成分   作用机制  

摘要： 目的运用网络药理学方法和分子对接技术探讨独活寄生汤治疗腰椎间盘突出症(LDH)的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索筛选获得独活寄生汤中药活性成分,借助TCMSP、SwissTargetPrediction及TargetNet等数据库预测中药活性成分的靶点。通过GeneCards、OMIM和DisGeNET等数据库检索LDH相关疾病靶点。利用在线工具VENNY得到中药活性成分靶点与疾病靶点交集,通过Cytoscape3.9.0软件构建“中药-活性成分-作用靶点”网络,通过STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI),利用Cytoscape软件筛选网络中核心靶点蛋白,通过Metascape数据库对潜在靶点进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)和基因本体(GO)通路富集分析。最后,利用AutoDockTools及PyMOL软件对关键活性成分和核心靶点蛋白进行分子对接验证。结果从相关数据库中筛选得到215种中药活性成分及560个作用靶点,1859个LDH相关疾病靶点,独活寄生汤治疗LDH的潜在作用靶点156个。独活寄生汤中的槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇、豆甾醇、汉黄芩素、β-胡萝卜素等活性成分通过AGE-RAGE、MAPK、IL-17、TNF等信号通路作用于STAT3、AKT1、TP53、MAPK3、TNF等靶点蛋白。最终通过其抗炎、抗氧化、免疫调节以及神经保护等多种作用机制实现治疗LDH。分子对接结果显示关键活性成分与核心靶点蛋白分子有较强的结合能力。结论通过网络药理学及分子对接技术初步探讨了独活寄生汤治疗LDH的作用机制,为后续基础性研究及独活寄生汤的临床应用提供了参考。

关键词： 药理学   教学改革   课程思政   教学模式  

摘要： 在新医科背景下,药理学的核心任务是培养能够理解常见疾病药物作用机制并解决实际用药问题的高素质应用型药学人才,这些人才将致力于药物研究、生产、检验和使用等关键领域。为了克服传统教学方法中学生在知识调取、知识串联和知识迁移方面的不足,以及在运用药理学理论分析和解决实际用药问题上的能力缺失等问题,在“以学生发展为主体”的教育理念指引下,教学团队重塑了课程教学内容体系,利用整合的动态教学资源库,创设了线上、线下自然融入式多维化教学环境,旨在培养“新医科”背景下的创新型医药人才。

关键词： 心肌缺血再灌注损伤   麝香通心滴丸   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:利用网络药理学和动物实验验证的方法探索麝香通心滴丸治疗心肌缺血再灌注损伤的分子机制。方法:通过检索中药系统药理学分析平台(TCMSP)和在线生物信息学分析工具(BATMAN TCM)数据库,获取麝香通心滴丸的活性成分并筛选出相关靶点,同时收集心肌缺血再灌注损伤相关靶点,将两者取交集。构建蛋白质相互作用网络,并进行基因本体论(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,进一步构建活性化合物-靶点网络和中药-靶点-通路网络图。最后,进行动物实验验证潜在机制。结果:麝香通心滴丸含有122种化学成分,485个相关靶点,其中165个与心肌缺血再灌注损伤相关。蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析表明蛋白激酶B1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、TP53、信号转导与转录激活因子3(STAT3)、JUN、白细胞介素(IL)6、IL1B等靶点为关键靶点。KEGG富集分析显示麝香通心滴丸通过多条信号通路发挥作用。动物实验结果与网药预测相符,基因组测序和蛋白质检测结果显示麝香通心滴丸可能通过调节缺氧诱导因子-1α(HIF-1α)和血管内皮生长因子(VEGF)来治疗心肌缺血再灌注损伤。结论:本研究全面展示了麝香通心滴丸治疗心肌缺血再灌注损伤的有效成分、分子机制和潜在靶点。

关键词： 五加丹   绝经综合征   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学及分子对接技术分析五加丹治疗绝经综合征的作用机制。方法对五加丹的核心药物进行有效成分及作用靶点的筛选,对绝经综合征进行疾病靶点筛选,并将有效成分作用靶点与绝经综合征的疾病靶点进行交集分析,得出治疗疾病的有效靶点;进行PPI蛋白互作网络的构建、KEGG分析及GO分析;进行分子对接验证。结果共筛选出五加丹核心药物有效成分51种,得出关键靶点204个,在PPI蛋白互作网络中,TP53、AKT1等被认为是五加丹核心药物治疗绝经综合征的最关键蛋白。在GO分析中,BP中“对外源性刺激的反应”等,CC中细胞外空间等,MF中“酶结合”等生物学意义较强。在KEGG分析中,“AGERAGE信号通路”等通路较为明显。在分子对接中,有效成分与关键靶点的结合力较强。结论五加丹可能通过槲皮素、黄芩素、豆甾醇、谷甾醇、苯甲酰芍药苷、刺槐素等活性成分作用于TNF、AKT1、JUN、TP53、SRC等关键靶点,实现治疗绝经综合征。

关键词： 金课标准   药理学   挑战度   教学质量   学生综合能力  

摘要： 本研究旨在探讨如何基于“金课”标准深化药理学课程挑战度的建设,并评估其在提升课程质量和学生综合能力方面的应用效果。通过整合前沿技术与学科知识,设计多学科融合的教学内容,推动课程内容的创新;采用三阶梯式互动模式与案例分析相结合的教学方法,激发学生课堂参与度;研究结合虚拟仿真实验与创新实验的实践方式,进一步强化理论与实践的深度结合,帮助学生更好地将知识应用于实际场景;全面评估教学效果,科学地衡量学生的学习成效和能力提升。本研究通过优化教学设计、深化技能训练、丰富实践形式以及平衡评价机制,不仅有效提升了课程质量和学生能力,还为高等教育发展提供了具有参考价值的实践经验。

关键词： 肝硬化   消化道出血   大黄   白及   三七   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:利用网络药理学和分子对接方法,探索大黄-白及-三七在治疗肝硬化伴消化道出血中的主要活性成分、关键作用靶点及机制。方法:通过TCMSP、Pubchem和SwissTargetPrediction数据库获取大黄、白及、三七的活性成分及靶点,同时从GeneCards和DisGeNET数据库中搜集与肝硬化伴消化道出血相关的靶点。利用Venn图找出药物-疾病交集靶点,利用STRING建立蛋白质-蛋白质相互作用网络,并使用Cytoscape 3.10.1进行可视化分析。通过Metascape数据平台完成基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,分子对接验证则采用AutoDock Tools 1.5.6和PyMoL 2.4.0软件。结果:共获得大黄-白及-三七的有效成分32个,预测到523个潜在靶点,获得1011个肝硬化伴消化道出血靶点,得到中药-疾病交集基因149个。中药的主要活性成分有2,3,4,7-四甲氧基菲、泽兰黄醇、槲皮素、3-(对羟基苄基)-4-甲氧基-9,10-二氢菲、甘草素等,主要通过非受体酪氨酸激酶、信号转导及转录激活因子3、丝氨酸/苏氨酸激酶1、磷酸肌醇3-激酶调节亚基1、磷脂酰肌醇4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α等关键靶点和磷脂酰肌醇-3-激酶/丝苏氨酸蛋白激酶、缺氧诱导因子1、Ras相关蛋白1、血管内皮生长因子等信号通路发挥治疗肝硬化伴消化道出血的作用。分子对接发现活性成分2,3,4,7-四甲氧基菲、槲皮素与靶点SRC结合活性高且稳定。结论:大黄-白及-三七可能通过槲皮素、甘草素等成分,SRC等靶点和PI3K-Akt等通路协同治疗肝硬化伴消化道出血。