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关键词： 网络药理学   雾水葛   Ⅱ型糖尿病   物质基础   作用机制  

摘要： 通过网络药理学探讨雾水葛防治Ⅱ型糖尿病的物质基础及作用机制.首先通过文献调研获取雾水葛的活性成分,Pubchem等数据库分析雾水葛主要成分核心靶点,运用GeneCards获取Ⅱ型糖尿病靶点,通过微生信软件筛选雾水葛-Ⅱ型糖尿病的靶点交集,进一步构建“活性成分-靶点-疾病”网络和蛋白质相互作用(PPI)网络,并进行KEGG和GO分析.研究发现雾水葛中含有丰富的熊果酸、东莨菪素、槲皮素及芹菜素等,这些活性成分通过调控INSR、ERBB2、AKT1及TEK等重要靶点,进一步影响PI3K/Akt通路、HIF-1通路及5-羟色胺能突触等信号通路发挥防治Ⅱ型糖尿病的作用.

关键词： 参芪苓蛇汤   网络药理学   结直肠癌   作用机制  

摘要： 运用网络药理学方法探究名医经验方“参芪苓蛇汤”治疗结直肠癌的潜在效应机制。方法 采用网络药理学方法,利用TCMSP、PubChem数据库检索“参芪苓蛇汤”主要组方人参、黄芪、女贞子、枸杞、蛇舌草、藤梨根、猫人参、猪苓、茯苓、苍术的活性成分及潜在靶点,通过 Genecards、OMIM、DrugBank数据库检索结直肠癌的治疗靶点。利用Venny2.1软件构建药物与疾病交集靶点,STRING数据库建立靶点蛋白相互作用关系,Cytoscape3.7.1软件构建“中药-化合物-靶点-疾病”网络。基于DAVID数据库对核心靶点进行GO功能分析和KEGG 通路富集分析。结果 参芪苓蛇汤方筛选获得有效活性成分92种、 “药物-疾病”交集靶点159个,其中槲皮素、木犀草素、山奈酚、汉黄芩素、芒柄花黄素、异鼠李素、β-甾谷醇等27个成分为核心成分,AKT1、TP53、VEGFA、TNF、JUN等22个基因为核心基因。GO功能分析得到 134条生物学过程、13个细胞组分、26个分子功能,KEGG富集分析得到癌症通路、MAPK信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路、PI3K-Akt等 91条信号通路。结论 参芪苓蛇汤方治疗CRC有多成分、多靶点、多通路的作用机制,为本方的开拓应用奠定基础,为结直肠癌的治疗研究和临床应用提供了理论依据。

关键词： 网络药理学   分子对接   保和丸   非酒精性脂肪肝   功能性消化不良  

摘要： 目的探讨保和丸“异病同治”非酒精性脂肪肝(non-alcoholic fatty liver disease,NAFLD)和功能性消化不良(functional dyspepsia,FD)的潜在分子机制。方法基于TCMSP平台搜集保和丸的化学成分和对应靶点;基于GeneCards等数据库搜集NAFLD和FD疾病靶点;将化学成分对应靶点与疾病靶点取交集获得保和丸治疗NAFLD和FD的交集靶点。“药物-成分-靶点”网络基于Cytoscape 3.8.0软件建立;交集靶点的蛋白互作网络基于String平台建立。GO功能和KEGG通路富集分析基于R语言进行;分子对接验证基于AutoDock Vina软件进行。结果共获得保和丸治疗NAFLD和FD的交集靶点112个。筛选出木犀草素等6种核心成分,肿瘤蛋白p53(tumor protein p53,TP53)等8个核心靶点。GO功能共富集2456个条目,主要涉及营养、甾体激素等因素;KEGG共富集162条通路,包括白介素(interleukin,IL)-17、缺氧诱导因子(hypoxia-inducible factor,HIF)-1等。分子对接初步验证了以上网络药理学结果。结论保和丸核心成分木犀草素等可作用于TP53等核心靶点,通过调控IL-17、HIF-1等信号通路,发挥“异病同治”NAFLD和FD的作用。

关键词： 早发性卵巢功能不全   大补元煎   网络药理学   信号通路   分子对接  

摘要： 目的通过网络药理学和分子对接的方法初步探讨大补元煎治疗早发性卵巢功能不全(POI)的作用机制。方法在TCMSP数据库中检索大补元煎8味中药名得出其活性成分及靶点的相关信息,检索GeneCards和OMIM数据库,得到POI疾病靶点的相关信息,筛选出大补元煎与POI的共同基因靶点信息,利用Cytoscape软件构建大补元煎治疗POI的活性成分-靶点网络图。利用STRING数据库进行共同基因靶点信息的蛋白质互作(PPI)网络构建;利用Metascape数据库对共同基因靶点进行生物信息学分析,包括基因本体(GO)功能富集和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集相关分析。应用AutoDock和Py Mol软件进行活性成分及关键靶点之间的分子对接验证。结果将获得的8味中药共176个活性成分和282个靶点与POI的1284个疾病靶点取交集,得到71个交集靶点。进行PPI分析得到核心靶点基因:蛋白激酶B(Akt)1、白细胞介素-6、血管内皮生长因子A、肿瘤蛋白53、雌激素受体1等,通过GO功能和KEGG通路富集分析显示,核心靶点基因的GO分析主要参与生物过程,主要富集在癌症、磷脂酰肌醇-3-激酶/Akt、促分裂原活化的蛋白激酶、Janus激酶-信号转导及转录活化因子、叉头框转录因子O、卵巢类固醇激素生成等信号通路。分子对接结果显示,肿瘤坏死因子(TNF)-豆甾醇、TNF-山柰酚、TNF-刺芒柄花素、TNF-槲皮素、TNF-β-谷甾醇、Akt1-刺芒柄花素等均具有较高的结合性。结论大补元煎可能通过多种有效成分作用于共同核心靶点影响卵巢功能、炎性衰老、葡萄糖代谢等,发挥治疗POI的作用。

关键词： 阿司匹林   胃黏膜损伤   黏膜修复   网络药理学   增殖细胞核抗原  

摘要： 目的基于网络药理学和免疫组织化学染色方法,阐明阿司匹林相关胃黏膜损伤后修复的分子机制。方法利用SwissTargetPrediction数据库和DrugBank数据库预测阿司匹林作用的靶点基因,通过GeneCards数据库获取参与胃黏膜修复的相关基因,对二者进行交集靶点的筛选,通过STRING数据库构建交集靶点蛋白的PPI网络图,利用DAVID数据库对交集核心靶点进行GO、KEGG通路的富集分析。应用免疫组织化学染色验证阿司匹林相关人胃黏膜病变中核心基因的表达。结果阿司匹林相关胃黏膜损伤后修复的交集靶点共56个,其中包括核心靶点增殖细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)。PPI网络图显示PCNA主要与细胞周期蛋白A2(cyclin A2,CCNA2)、组蛋白去乙酰化酶1(histone deacetylase1,HDAC1)等相互作用。KEGG通路分析发现PCNA参与的相关信号通路主要包括细胞周期、DNA复制等。GO富集显示交集核心靶点蛋白主要定位于细胞核,PCNA主要的分子功能包括与受损的DNA结合、与组蛋白乙酰转移酶结合等,参与的生物学过程包括RNA聚合酶Ⅱ启动子转录负调控、细胞对过氧化氢的反应和DNA复制等。免疫组织化学染色结果验证,阿司匹林相关人胃黏膜病变组织中PCNA表达上调(Z=3.974,P<0.001),且PCNA在阿司匹林相关浅表活动性胃炎和溃疡性病变中的表达高于急性糜烂出血性胃炎组(H=13.935,P=0.001)。结论阿司匹林相关胃黏膜损伤后的修复过程需要多靶点、多信号通路参与,其中核心靶点蛋白PCNA与CCNA2、HDAC1等相互作用参与阿司匹林相关胃黏膜损伤后的修复,且这种修复机制在阿司匹林相关浅表活动性胃炎和胃溃疡病变中更为明显。

关键词： 冠心病   网络药理学   数据挖掘   分子对接   中医药   作用机制  

摘要： 目的运用数据挖掘、网络药理学与分子对接来研究李军教授中医药治疗冠心病的规律与作用机制。方法通过Microsoft excel、SPSS Modeler 18.0对李军教授2017—2021年门诊病例进行数据挖掘与核心方筛选;TCMSP、SymMap、ETCM、GeneCards、Uniprot网站搜集核心处方药对及冠心病相应基因,通过Hiplot网站得到核心处方与疾病靶点的交点靶点;应用String及CytoscapeV 3.7.2构建靶基因PPI蛋白互作网络及疾病-药物-成分-靶点网络图;并结合GO和KEGG通路富集分析,运用CytoscapeV 3.7.2构建药物-成分靶点-通路-生物过程网络图,最后通过分子对接技术对获得的主要成分和靶点进行验证分析。结果共有95例患者纳入研究,收集到处方145首,共用中药219味,通过关联、聚类和网络分析最终得出黄芪、瓜蒌、薤白、法半夏为核心药对,通过网络药理学获得关键成分、靶点、交集靶点49种、305、127个。药物-成分靶点-通路-生物过程网络图分析显示,过程可能与蛋白质特异性结合、蛋白质同源二聚化活性、氧化还原酶活性以及受体复合物、蛋白质磷酸化的正向调节、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶信号通路等关系重大;分子对接较好的为AKT1、VEGFA、IL1B。结论李军教授临床上治疗冠心病以辨病、辨证及辨症相结合的思路为指导,以“扶阳活血,通阳散结”为治疗原则,核心药对包括黄芪、瓜蒌、薤白、法半夏,主要通过蛋白质活性、心肌能量代谢、炎症反应、神经调节等方面的多靶点调节发挥作用,对中医药治疗冠心病及机制研究具有一定的参考价值。

关键词： 关节炎,类风湿   芍甘附子汤   入血成分   超高效液相色谱-高分辨串联质谱   网络药理学   分子对接模拟  

摘要： 目的采用超高效液相色谱-高分辨串联质谱(UPLC-HRMS/MS)技术结合网络药理学、分子对接方法,探讨芍甘附子汤入血成分治疗类风湿关节炎可能的药效物质基础和作用机制。方法利用UPLC-HRMS/MS技术分析芍甘附子汤的入血成分;通过PubChem数据库和SwissTargetPrediction数据库预测芍甘附子汤入血成分的作用靶点;通过DrugBank数据库、Therapeutic Target Database(TTD)数据库和GeneCards数据库筛选类风湿关节炎相关靶点,通过韦恩图获得共同靶点;通过STRING数据库构建PPI网络,筛选得到关键靶点和关键成分;通过DAVID 6.8数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析;通过Cytoscape 3.2.1软件构建“入血成分-靶点-通路”网络;利用AutoDock软件将网络中预测到的关键成分与关键靶点进行分子对接验证。结果得到芍甘附子汤入血成分26个及相关作用靶点526个,类风湿关节炎相关靶点478个,共同靶点111个;筛选出桔皮素、山柰酚、甘草次酸、甘草素、皂皮酸、光果甘草内酯等关键成分,作用于TNF、IL6、VEGFA、PTGS2、JUN、PPARG等关键靶点,主要参与炎症反应、类固醇代谢过程、细胞外区域、细胞质、RNA聚合酶Ⅱ转录因子活性、类固醇结合等生物过程,主要调控类固醇激素生物合成、PI3K-Akt信号通路、细胞凋亡、IL-17信号通路、类风湿关节炎等信号通路。分子对接结果显示,关键成分与关键靶点均有较好的结合活性。结论芍甘附子汤可通过桔皮素、山柰酚、甘草次酸等成分作用于TNF、IL6、VEGFA、PTGS2、JUN、PPARG等靶点,调节PI3K-Akt等信号通路,抑制细胞增殖并促进其凋亡,减轻炎症反应,从而治疗类风湿关节炎。

关键词： 失眠   植物饮品早早睡   药理学  

摘要： 目的:研究补益为主植物饮品早早睡的药理学活性成分,了解其作用机制。方法:将植物饮品早早睡委托给有多个国内外权威机构资质认证的深圳市计量质量检测研究院,按相关国家标准法及《保健食品检验与评价技术规范》(2003年版)进行实验检测。结果:植物饮品早早睡含有多种氨基酸、钙、维生素B6、黄酮、总皂甙等。结论:基于失眠多虚理论,以补益气血、健脾滋肝肾、养心安神组方的植物饮品早早睡安神作用可能的神经药理学机制之一,是通过其所含的生物活性物质维护神经元的正常代谢、调节中枢神经及相关神经递质、镇静催眠、神经保护等神经系统作用而达到的。

关键词： 蜂毒肽   药理学   纳米运载系统   抗肿瘤   抗炎  

摘要： 蜂毒肽(MEL)是蜂毒的主要成分,对癌症等疾病的治疗有独特的优势,然而由于MEL具有较强的毒副作用,其药物研发及临床应用一直受到阻碍。近年来药理学研究表明,MEL除具有较强的细胞膜表面活性和溶血活性外,还具有较好的生物活性和药理作用,包括抗菌、抗病毒、抗炎、抗肿瘤、抗纤维化等作用。此外,在MEL的给药系统方面也采取了多种策略,如改进MEL及其共轭物、采用纳米运载工具等。兹就MEL的药理学及纳米运载系统的研究进展进行综述,以期为今后MEL的研究提供参考。