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关键词： 防己茯苓汤   肾病综合征   网络药理学   信号通路  

摘要： 为了探究防己茯苓汤(FJFL)治疗肾病综合征(NS)的作用机制,结合网络药理学和分子对接的方法,通过TCMSP数据库和SwissTargetPrediction在线靶点平台获取FJFL的活性成分及其潜在作用靶点;从GEO数据库和DisGenet数据库获取NS的疾病靶点;采用STRING数据库对“复方-疾病”的共同靶点进行蛋白互作分析,并在Cytoscape软件上构建核心靶点网络;在DAVID数据库上对核心靶点进行基因本体论(GO)分析和京都基因和基因组数据库(KEGG)分析,获取FJFL治疗NS的核心通路机制。最后,利用Autodock Vina对核心化合物和核心靶点进行分子对接。结果表明FJFL包含106个主要活性成分以及309个药物靶点,与1835个NS疾病靶点相交联后得到72个共同靶点;经MCODE分析得到一个包含30个靶点的核心网络。KEGG分析表明靶点涉及21条相关信号通路网络,包括VEGF信号通路、NF-κB信号通路、HIF-1信号通路等,分子对接显示核心化合物与靶点网络具备良好的对接可能性,其中最优对接结果为NOS3_quercetin。进一步研究表明Kaempferol和Cortisol一样能够与糖皮质受体(GR)较好的结合,有潜力成为GR的天然调节剂。同时,对核心化合物Quercetin和Kaempferol基于网络的测量表明在化学特性、生物学功能和临床特征方面两者具有相关性,有成为药物对使用的潜力。本研究探究了FJFL治疗NS的活性成分及其作用机制,为进一步深入阐明该复方治疗NS的物质基础和作用机制提供参考。

关键词： 葛根芩连汤   2型糖尿病   网络药理学   动物实验   TNF-α   炎症反应  

摘要： 目的基于网络药理学和动物实验探讨葛根芩连汤治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制。方法利用中药系统药理学技术平台(TCMSP)对葛根芩连汤有效成分进行筛选及靶点预测,GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank数据库获得T2DM相关疾病靶标基因,Cytoscape技术整合药物与疾病的交集靶点基因,建立蛋白质相互作用(PPI)网络,R语言进行GO功能、KEGG通路富集分析。通过动物实验验证葛根芩连汤治疗T2DM的作用机制。结果获得活性化合物140个,有效靶点212个。葛根芩连汤治疗T2DM涉及靶点204个,涉及炎症TNF信号通路等119条信号通路。与模型组比较,葛根芩连汤可降低T2DM小鼠体质量、空腹血糖、空腹胰岛素、HOMA-IR、TNF-α及IL-17水平(P<0.05),改善肝细胞形态,减少脂质空泡数目,减轻淋巴细胞浸润及脂质沉积,降低肝组织TNF-α、NF-κB蛋白表达(P<0.05)。结论葛根芩连汤治疗T2DM具有多成分、多靶点特性,可能通过TNF-α信号通路抑制炎症反应来发挥降糖疗效。

关键词： 股骨干骨折   骨折愈合   桃红四物汤   网络药理学   靶点   大鼠  

摘要： 目的:采用网络药理学方法预测桃红四物汤促进股骨干骨折愈合的药效物质基础及作用靶点,并建立右侧股骨干骨折大鼠模型对关键靶点进行验证。方法:通过TCMSP数据库筛选桃红四物汤的化合物及其作用靶点;使用GeneCards数据库获得股骨干骨折的疾病靶点;采用Cytoscape 3.6.0软件构建“药物-成分-基因-疾病”网络;通过STRING数据库建立靶蛋白交互作用(PPI)网络并分析核心靶点。使用多个剂量桃红四物汤干预右侧股骨干骨折大鼠对核心靶点进行初步验证,通过HE染色法观察桃红四物汤对骨折愈合的影响,利用Western blotting技术检测骨折早期骨痂内核心靶点蛋白的表达情况。结果:筛选后获得14个活性成分,共对应28个靶点。PPI网络分析发现VEGF节点度值最大,为潜在的核心靶点;通过分子对接技术分析可知黄芩苷、β-胡萝卜素可能为靶向VEGF的关键活性化合物。动物实验验证发现,桃红四物汤早期干预后,大鼠股骨干骨折端骨痂成骨进程加快,软骨细胞大量凋亡,成骨细胞不断增加,骨基质分泌增多且钙化加强,并以桃红四物汤高剂量组为佳。VEGF蛋白表达结果表明,与模型组比较,桃红四物汤中、高剂量组大鼠早期骨痂内VEGF蛋白相对表达量均明显升高(P<0.05),其中高剂量桃红四物汤作用最为显著;桃红四物汤低剂量组大鼠早期骨痂内VEGF蛋白相对表达量与模型组比较,差异无统计学意义(P>0.05)。结论:VEGF为桃红四物汤促进股骨干骨折愈合的核心靶点,黄芩苷和β-胡萝卜素可能靶向VEGF为桃红四物汤促进股骨干骨折愈合的关键活性成分。

关键词： 肝炎   角茴香   异喹啉生物碱   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:利用网络药理学和分子对接技术研究角茴香治疗肝炎的核心成分和相关靶点以及作用机制。方法:本研究通过文献和HERB、Swiss Target Prediction和UniProt平台筛选角茴香的活性成分和作用靶点,利用GeneCards、OMIM和DisGeNET数据库搜集肝炎相关靶点,取交集获取角茴香防治肝炎的潜在作用靶点,进行KEGG通路和GO功能富集分析。采用Cytoscape 3.9.1软件构建蛋白相互作用(PPI)图,利用AutoDock Vina软件对核心成分和靶点进行分子对接验证。结果:角茴香10个有效成分的候选作用靶点有313个,肝炎相关靶点2853个。其中直立角茴香碱、别隐品碱和原阿片碱等是角茴香治疗肝炎的核心成分,核心作用靶点包括GAPDH、SRC和CASP3等,分子对接结果显示核心靶点与关键成分结合良好。结论:角茴香核心活性成分通过调控核心靶点,参与细胞凋亡和抑制炎症反应等过程,结合PI3K-Akt、ErbB和FoxO等信号通路来发挥治疗肝炎的作用。

关键词： 雨课堂   翻转课堂模式   药理学  

摘要： 在疫情防控常态化背景下,传统单一的线下教学模式已不能满足现代教学的需求。如今的网络教学模式诸多,然而教学效果参差不齐,这就需要教学改革来实现教学效果的提升。从现阶段“药理学”教学中存在的问题出发,从课前、课中、课后进行翻转课堂设计并提出合理建议,旨在为医学院校“药理学”教学改革提供参考。

关键词： 黄芪   当归   高血压病   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接探讨黄芪-当归药对治疗高血压的作用机制。方法采用TCMSP数据库筛选黄芪、当归活性成分,SwissTargetPrediction数据库获取对应靶点,通过GeneCards、DrugBank及DisGeNET数据库获取高血压病相关靶点,并与黄芪-当归作用靶点取交集,得到其治疗高血压病潜在靶点。将交集靶点利用STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,通过DAVID6.8数据库对靶点进行GO及KEGG富集分析。使用AutoDock4.2.6软件将主要活性成分与核心靶点进行分子对接验证。结果得到黄芪-当归药对活性成分29个,活性成分与高血压病交集靶点189个,GO富集分析得到生物过程285个、细胞组分36个、分子功能65个,KEGG富集分析得到100条通路。分子对接结果显示,11个主要活性成分与5个核心靶点(VEGFA、MAPK1、PIK3CA、SRC、AKT1)均具有较好的亲和力。结论黄芪-当归主要活性成分熊竹素、山柰酚、槲皮素、异鼠李素、阿魏酸等可能通过HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路、黏着斑、cAMP等信号通路,作用于VEGFA、MAPK1、PIK3CA、SRC、AKT1等靶点治疗高血压。

关键词： 高良姜素   白癜风   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的应用网络药理学与动物实验研究高良姜素(GA)乳膏抗白癜风的作用机制。方法通过Swiss Target Prediction、中药系统药理学数据库与分析平台筛选GA的活性成分和靶点,在TTD、OMIM、Drug Bank数据库中筛查白癜风相关靶点;将药物和疾病靶点导入String平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并筛选核心靶点;应用Cytoscape 3.7.1软件构建中药-活性成分-核心靶标-关键通路网络图,进行富集分析,并通过Autodock Vina 1.2进行GA与核心靶点蛋白的分子对接。选取4周龄SPF级的雄性C57BL/6小鼠60只,体重(21±3)g,其中10只设为正常对照组,其余50只于背部均匀涂抹10%H2O2构建白癜风模型,造模成功后按照随机数字表法将其分为模型组、阳性药组(8-甲氧补骨脂素,4.25 mg/kg)及GA乳膏高(4%GA,1 g/次)、中(2%GA,1g/次)、低(1%GA,1g/次)剂量组,每组10只。连续给药30 d后,采用苏木精-伊红染色观察小鼠皮肤组织变化;采用酶联免疫吸附试验检测小鼠血清中的白细胞介素-18(IL-18)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)及内皮素-1(ET-1)含量;采用Western blot检测小鼠皮肤组织中TNF-α、ET-1蛋白表达水平;采用实时荧光定量PCR检测小鼠皮肤组织中ET-1、IL-18及TNF-α的m RNA表达情况。结果共得到GA靶点17个,白癜风靶点459个,药物-疾病靶点10个。PPI网络显示,酪氨酸酶、TNF、IL-1β、IL-18等为GA治疗白癜风的核心靶点。富集分析显示,GA可能通过核因子κB信号传导途径、NOD样受体信息通路及HIF-1通路等发挥抗白癜风作用。分子对接结果显示,GA与ET-1、TNF-α、IL-18结合能力较好。苏木精-伊红染色显示,正常对照组皮肤无明显异常;模型组皮肤表皮棘层皱襞变厚,毛囊破损及角质层明显增生;GA乳膏各剂量组表皮轻微棘层皱襞,情况轻于模型组。模型组血清ET-1、IL-18、TNF-α水平高于正常对照组,皮肤组织中ET-1、TNF-α蛋白表达高于正常对照组,皮肤组织中ET-1、IL-18、TNF-αm RNA表达高于正常对照组(P<0.05)。GA乳膏低、中、高剂量组血清ET-1、IL-18、TNF-α水平低于模型组,GA乳膏高剂量组皮肤组织ET-1蛋白表达低于模型组,GA乳膏中、高剂量组皮肤组织TNF-α蛋白及IL-18 m RNA表达低于模型组,GA乳膏低、中、高剂量组皮肤组织ET-1、TNF-αm RNA表达低于模型组(P<0.05)。GA乳膏中、高剂量组皮肤组织TNF-α蛋白及IL-18 m RNA表达低于GA乳膏低剂量组,GA乳膏高剂量组皮肤组织ET-1蛋白表达低于GA乳膏低剂量组(P<0.05)。结论GA乳膏可能通过调节多种通路及抑制ET-1、IL-18和TNF-α发挥抗白癜风作用。

关键词： 糖尿病   降糖消渴颗粒   网络药理学   分子对接模拟   药理作用分子作用机制(中药)  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接技术预测降糖消渴颗粒治疗糖尿病的作用靶点和信号通路,分析可能的作用机制。方法通过ETCM数据库筛选降糖消渴颗粒的活性成分及作用靶点;检索DisGeNET、GeneCards数据库获得糖尿病靶点,绘制韦恩图取交集靶点;利用STRING数据库进行基因转换和网络相互作用分析;采用Cytoscape 3.6.0构建PPI网络;运用分子对接技术进行验证;通过Metascape数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析。结果共筛选出降糖消渴颗粒128个活性成分,对应靶点607个。糖尿病相关靶点1240个,核心靶点53个。分子对接提示,活性成分和核心靶点有良好的结合能力。GO功能分析得出46个功能条目,KEGG分析得出15条通路。结论降糖消渴颗粒通过多成分、多靶点参与多种生物过程,包括影响脂质代谢和动脉粥样硬化、AD、AMPK信号通路、Apelin信号通路、胰高血糖素信号通路,调节葡萄糖稳态。

关键词： 功能失调性子宫出血   青春期   数据挖掘   用药规律   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:探讨中医药治疗青春期功能失调性子宫出血(DUB)的组方用药规律及作用机制。方法:收集运用中药方剂治疗青春期DUB的文献,对文献所含方剂中涉及的中药进行频数、性味、归经及关联规则分析,并挖掘出潜在新方。通过检索TCMSP、GeneCards、OMIM数据库,收集新方中药物有效成分的靶点与疾病靶点并取交集,利用CytoscapeV3.9.0构建“青春期DUB-药物-化合物-靶点”网络,采用STRING平台、David数据库对关键靶点进行PPI网络分析及KEGG通路分析,并运用PubChem、Uniport、PDB数据库,AutoDockVina、PyMol软件对药物有效活性成分与关键靶标作分子对接。结果:共筛选出154个中药复方,包含药物143味,其中药性以温、平为主,药味以甘、苦为主,归经以肝经、肾经、脾经为主;常用药对有黄芪-白术、女贞子-墨旱莲、熟地黄-山茱萸等;挖掘出潜在4个新方组合。新方2(党参+升麻+黄芪+女贞子+墨旱莲)治疗青春期DUB的关键成分有槲皮素和木犀草素等,关键靶点为Akt激酶1(AKT1)、血管内皮生长因子(VEGFA)等,主要通路为癌症通路(Pathways in cancer)、磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)信号通路等。结论:中医主要从肝肾论治青春期DUB,网络药理学与分子对接结果表明新方药物治疗青春期DUB的机制可能与其止血、抗炎及子宫内膜修复有关。

关键词： γ-倒捻子素   肝癌   网络药理学  

摘要： [目的]基于网络药理学预测γ-倒捻子素(Mangosin)治疗肝癌(LC)的潜在靶点和作用机制。[方法]采用SwissADME数据库进行γ-Mangosin的筛选、鉴定,STP数据库(SwissTargetPrediction)对作用靶标预测,Uniprot数据库完成相关Gene Symbol的匹配;GeneCards数据库对LC相关疾病的靶点进行检索,并完成药物和疾病交集靶点的筛选;使用String数据库、Cytoscape 3.8.0软件完成LC靶点的蛋白互作网络(PPI)、“药物-共活性物质-核心靶点基因”互作网络的绘制;借助Metascape数据库完成对基因本体论(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集通路分析,用AutoDock软件对γ-Mangosin和核心靶点开展分子对接(MD)验证。[结果]筛选出与肝癌相对应的作用靶点共66个,PPI网络分析显示关键靶点有MTOR、MAPK3、AKT1、HSP90AA1、TNF。GO富集分析显示通路主要有蛋白激酶活性、转移酶活性的正调控等,KEGG富集通路集中于癌症通路,MD显示多数核心靶点和γ-Mangosin存在较强的结合性能。[结论]预测出γ-倒捻子素治疗肝癌的关键靶点为MAPK3、MTOR、TNF等,主要作用通路为癌症通路,可为进一步开展γ-倒捻子素治疗LC的基础研究提供思路。