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关键词： 华蟾素   胃癌   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接研究华蟾素治疗胃癌的作用机制。方法通过药物靶点预测网站获得华蟾素成分靶点,疾病数据库获取胃癌疾病基因,将两者共同靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路分析,Cytoscape软件构建蛋白互作(PPI)网络和药物-靶点-疾病相互作用网络。通过Kaplan-Meier分析关键靶点与胃癌预后的相关性,分子对接分析华蟾素成分与关键靶点的结合情况,最后筛选出核心靶点,并通过TCGA、GEO数据库进行单因素、多因素Cox回归分析以验证其与胃癌预后的关系。结果华蟾素治疗胃癌涉及70个靶点、1399个生物学过程、75个分子功能、145条信号通路,通过药物-靶点-疾病相互作用网络筛选出关键化合物5个、关键靶点10个,其中与胃癌预后相关的有7个。华蟾素主要成分与胃癌关键靶点间有较好的结合活性,核心靶点为EGFR、MAPK3、ALB,与胃癌预后密切相关。结论华蟾素治疗胃癌的关键成分为华蟾毒它灵、蟾毒它灵、华蟾酥毒基、蟾蜍色胺C、蟾毒灵,它们可能通过多靶点、多途径来发挥作用。

关键词： 药理学   用药指导   实训  

摘要： 目的:针对药理学实训以实验为主,传统教学模式单一,不能很好地与将来的工作岗位衔接等特点,进行“用药指导”为导向的部分药理学实训,提高学生的学习兴趣和实践能力。方法:基于比赛形式,以案例、问题作引导,让学生在情景模拟中进行角色体验,能够对常见的以及重要药物进行用药指导。结果:学生的积极性和实践能力明显提高。结论:以“用药指导”为导向的药理学实训,教学效果明显,适用于实训改革。

关键词： 网络药理学   石菖蒲挥发油   阿尔兹海默症   气相色谱-质谱   分子对接  

摘要： 目的:通过气相色谱-质谱(GC-MS)技术分析石菖蒲挥发油的化学成分并结合网络药理学研究石菖蒲挥发油抗阿尔兹海默症(AD)的作用机制。方法:采用GC-MS技术对石菖蒲挥发油成分进行精准鉴定,运用TCMSP、Swiss Target Prediction数据库对石菖蒲挥发油成分的作用靶点进行预测。利用Genecards、OMIM数据库获得AD疾病靶点。绘制韦恩图并提取交集靶点,随后对其进行PPI网络构建和拓扑分析、GO富集分析和KEGG通路富集分析,建立“成分-靶点-疾病-通路”网络图;并采用分子对接技术进行验证。结果:经GC-MS分析共得到74个挥发油成分。获得成分疾病交集靶点138个,经PPI网络拓扑分析发现ALB、ACTB、TNF和IL-6 4个核心靶点。GO结果显示,石菖蒲挥发油可能通过激素的反应、对外源性物质刺激的反应和激素水平调节等来发挥抗AD的作用。KEGG结果表明,石菖蒲挥发油可作用于PI3K-Akt、cGMP-PKG、NF-κB和cAMP等信号通路对AD进行干预。分子对接结果表明,石菖蒲挥发油中有效成分与核心靶点具有较好的结合活性。结论:石菖蒲挥发油可通过多靶点和多通路抑制神经炎症和减少氧化应激发挥其抗AD的作用。

关键词： 黄连   溃疡性结肠炎   网络药理学   分子对接   分子动力学   作用机制   槲皮素   小檗碱   (R)-氢化小檗碱   木兰花碱  

摘要： 目的通过网络药理学、分子对接和分子动力学模拟(MD)探讨黄连治疗溃疡性结肠炎的作用机制。方法利用TCMSP和UniProt数据库获取黄连活性成分及其对应靶点,经GeneCards、OMIM、Drugbank、TTD、DisGeNET数据库筛选溃疡性结肠炎相关靶点,利用Venny 2.1.0获取黄连和溃疡性结肠炎的交集靶点,并上传String 11.0数据库绘制蛋白相互作用(PPI)网络图。通过Cytoscape3.9.0的Cyto Hubb插件和“药物活性成分–靶点–通路网络图”筛选核心靶点。借助Metascape数据库对交集靶点进行基因本体功能注释(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过Autodock Tools 1.5.6软件将活性成分与核心靶点进行分子对接。用分子动力学模拟法验证最佳结合模型的稳定性。结果共筛选出黄连7个活性成分及其137个靶点,溃疡性结肠炎1258个相关靶点和81个交集靶点。核心靶点包括蛋白激酶B1(Akt1)、B淋巴细胞2(BCL2)、有丝分裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)等。生物过程包括无机物的反应、细胞因子受体结合等。KEGG通路富集主要包括MAPK信号通路等。分子对接结果显示,黄连的核心活性成分能够很好地与关键靶点结合。MD进一步验证了能量结合最好的小檗碱与白细胞介素(IL)-1β的结合能为-36.19 kJ/mol。结论黄连可能通过多成分、多靶点及多通路参与溃疡性结肠炎的治疗。

关键词： 银屑病   青蒿油   网络药理学   活性成分  

摘要： 基于网络药理学探讨青蒿油干预银屑病的主要活性成分并分析其作用靶点。方法:检索与银屑病相关的基因,并筛选青蒿油中具有药靶基因的活性成分。结合银屑病基因表达芯片筛选出青蒿油-银屑病交集靶点,并进行GO分析、KEGG通路分析,对银屑病相关重要信号通路进行分析;寻找与主要活性物质相关的潜在靶点,构建主要活性成分-靶点-通路可视化网络图。结果:银屑病相关差异基因与青蒿油的药靶基因交集共有23个。GO分析显示核心靶点参与血管发育、缺氧反应、血液循环、外来生物刺激反应等多项进程,KEGG通路分析显示相关基因主要在趋化因子信号通路、IL-17信号通路、Th17细胞分化、T细胞受体信号通路等显著富集。青蒿油中作用于银屑病相关靶点和通路的活性成分有D-柠檬烯、桉叶油素、聚伞花素,主要通过血管发育、趋化因子信号通路、IL-17信号通路、Th17细胞分化、T细胞受体信号通路等多个信号通路干预银屑病。结论:青蒿油可通过多成分、多靶点、多通路改善银屑病。

关键词： 灌木亚菊   炎症   气质联用技术   网络药理学   cis-橙花叔醇   τ-依兰油醇   τ-毕橙茄醇   α-红没药醇   富集分析   拓扑分析  

摘要： 目的 采用GC-MS和网络药理学法研究西藏灌木亚菊Ajania fruticulosa(Ledeb.)Poljak.挥发油抗炎的有效成分和作用机制。方法 通过GC-MS技术和中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选灌木亚菊挥发油的活性成分及相关靶点;利用GeneCards、DisGeNET数据库检索炎症相关靶点,利用韦恩图获取共有靶点,并将信息导入Cytoscape 3.9.1软件和STRING在线分子平台,通过网络拓扑学分析,构建挥发油有效成分-炎症-交集靶点;基于关键靶点利用DAVID数据库进行KEGG通路富集分析。结果 结合气质分析和数据库筛选,得到灌木亚菊挥发油的关键成分9个,药物靶点165个,疾病靶点2759个,交集靶点105个。经蛋白互作网络拓扑分析,获取核心靶点10个,分别为EGFR、MAPK8、JAK1、RXRA、JAK2、JAK3、CASR、MAPK14、ESR1、PRKCD等;挥发油有效成分4个,包括cis-橙花叔醇、τ-依兰油醇、τ-毕橙茄醇、α-红没药醇等。KEGG富集基因通路29条,TRP通路、神经活性配体-受体相互作用通路及PPAR信号通路可能是灌木亚菊挥发油发挥抗炎作用的主要通路。结论 初步探讨了西藏灌木亚菊挥发油治疗炎症的有效成分和作用机制,表明灌木亚菊挥发性成分具多成分、多靶点抗炎的特点,提示灌木亚菊有作为天然抗炎剂的潜力。

关键词： 桂枝茯苓丸   肝硬化   网络药理学   分子对接  

摘要： 探究桂枝茯苓丸治疗肝硬化潜在的作用机制。利用TCMSP、ETCM和HERB数据库获得桂枝茯苓丸的化学成分及作用靶点,Genecards、OMIM和TTD数据库收集肝硬化相关靶点,并运用Venn图获取药物和疾病交集靶点。通过STRING在线数据库对交集靶点蛋白构建蛋白相互作用网络(PPI),采用Cytoscape 3.9.1软件对结果进行可视化分析。使用Metascape数据平台进行GO功能分析和KEGG通路富集分析,AutoDock Tools 1.5.7和Discovery Studio 2021软件进行分子对接验证。共获得桂枝茯苓丸的有效成分56个,PPI包含靶点蛋白121个,关键蛋白包括TNF、AKT1和TP53等。GO功能分析,得到桂枝茯苓丸治疗肝硬化主要通过对活性氧的反应、对脂多糖的反应和对细菌来源的分子反应等发挥作用。KEGG通路富集分析结果显示,桂枝茯苓丸治疗肝硬化的机制可能与AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路和IL-17信号通路等有关。分子对接发现药物核心活性成分与靶点基因之间的结合活性良好。本文初步揭示了桂枝茯苓丸治疗肝硬化的多成分、多靶点和多通路的作用机制,为桂枝茯苓丸的进一步研究提供了理论基础。

关键词： 胃癌   新加疏调汤   网络药理学   机制研究  

摘要： 胃癌属于恶性肿瘤的一种,在中国地区发病率较高,并且临床上预后多数较差,为了提高胃癌患者的生活质量,证明新加疏调汤在临床上对胃癌患者的有效性,故于此进行作用分析。新加疏调汤是国医大师张震根据人体气机的基本理论,加之临床实践得出的疏调气机汤加减而来,去山药,易枳实为枳壳,更加符合治疗胃癌的性质,经过实践证明了其有效性,故而通过药理学理论说明其作用机制。本研究使用中医药整合药理学研究平台(TCMIP)V2.0获取新加疏调汤的化学成分及其对应靶点,通过GeneCards数据库获得胃癌的靶点信息,创建药物与疾病的核心靶点网络。使用Hiplot网站进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,通过TCGA数据库获得部分核心靶点所对应基因在患者和正常人中的表达情况,对主要成分进行吸收、分布、代谢、排泄和毒性(Absorption,Distribution,Metabolism,Excretion,Toxicity,ADMET)水平分析、类药性定量评估(Quantitative Estimate of Drug-likeness,QED),随后得到新加疏调汤287个化学成分,对应靶点1127个、胃癌潜在靶点16778个。通过与药物和疾病靶点互相作用的蛋白,获得173个节点作为核心靶点。核心靶点GO分析结果显示其主要作用于羧酸生物合成过程、核受体活性、类固醇结合等,KEGG通路分析显示其主要富集于苯丙胺成瘾信号通路、环磷酸腺苷(cyclic Adenosine Monophosphate,cAMP)信号通路、多巴胺能突触信号通路等。多维网络、QED显示,主要作用靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、JUN原癌基因(Jun Proto-Oncogene,JUN)和热休克蛋白90α家族A类成员1(Heat Shock Protein 90 Alpha Family Class A Member1,HSP90AA1)等靶点,参与的主要成分有华良姜素、黄芪甲苷Ⅷ、二甲氧基异黄酮H和橙皮素等。

关键词： 胃癌   中药   数据挖掘   网络药理学  

摘要： 目的:本研究拟通过数据挖掘探究中药治疗胃癌的基本规律,并利用网络药理学方法分析高频药对治疗胃癌的作用机制。方法:检索中文数据库中国知网中有关于中药治疗胃癌的文献,通过频数统计、关联规则分析、聚类分析探究中药治疗胃癌的基本规律。通过网络公开数据库筛选出中药的有效成分和潜在靶点及胃癌的相关基因,用R 4.2.2得到二者的交集基因,并利用Cytoscape 3.8.0完成有效成分-靶点-胃癌的可视化分析。在STRING数据库中构建蛋白质-蛋白质相互作用(Protein-protein Interaction,PPI)网络图,并用Cytoscape 3.8.0进行拓扑分析,得到核心靶点,使用R 4.2.2进行基因本体论(GO)生物富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后运用AutoDock 1.5.7(vina)完成药物成分和靶点的分子对接。结果:数据挖掘认为白术-党参是中药治疗胃癌的高频药对,通过网络药理学筛选出白术-党参与胃癌相关的交集基因有94个,涉及21种有效成分,其中木犀草素为主要有效成分,通过拓扑分析得出雌激素受体(Estrogen Receptor,ESR)1、热休克蛋白90α家族A类成员1(Heat Shock Protein 90 Alpha Family Class A Member 1,HSP90AA1)、丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)14、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Akt Serine/Threonine Kinase,AKT)1、MAPK1、视网膜母细胞瘤基因(Retinoblastomal,RB1)和肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)可能是治疗胃癌的关键靶点。GO生物富集分析共产生2011个条目,包括生物过程1796项、细胞组成78项和分子功能137项,通过KEGG通路富集分析筛选出163条通路。分子对接结果表明核心靶点均与木犀草素具有较强的结合活性。结论:本研究初步揭示了白术-党参通过多成分、多靶点、多通路治疗胃癌的作用机制,及其药物成分和靶点有较强的结合力。

关键词： 温经止痛合剂   网络药理学   指纹图谱   含量测定   薄层色谱法   质量标准  

摘要： 目的基于网络药理学和指纹图谱,筛选温经止痛合剂质量指标成分,建立薄层鉴别和含量测定方法,为评价温经止痛合剂的质量提供依据。方法构建“温经止痛合剂饮片-主要活性成分-靶点”图,筛选用于质量控制的主要饮片和成分;采用TLC法对其进行定性分析;用HPLC法建立温经止痛合剂的指纹图谱,标定共有峰并进行相似度评价,并对确认的成分进行含量测定。结果通过温经止痛合剂“饮片-主要活性成分-靶点”图,筛选出甘草、蒲黄、吴茱萸、乌药、延胡索、赤芍为主要活性成分饮片。赤芍、吴茱萸、延胡索的TCL鉴别结果分离度好、专属性强;指纹图谱指认了5个共有峰,并以去甲异波尔定、芍药苷、甘草酸铵建立了温经止痛合剂含量测定的质量标准。结论基于网络药理学和指纹图谱,建立了TLC定性分析和HPLC含量测定方法,该法准确可靠,重复性好,可用于温经止痛合剂的质量控制。