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关键词： 药理学教学   麻醉学专业   情景模拟教学法   虚拟病人  

摘要： 为了探究基于虚拟病人的情景模拟教学法在麻醉学专业本科药理学教学中应用的有效性,文章分别以南方医科大学2018级(62人,对照组)和2019级(62人,实验组)麻醉学专业本科生作为研究对象,比较分析两组学生的教学满意度评分(教学内容、学习氛围、学习兴趣、解决问题能力及教学效果)和期末理论考核成绩,结果显示,实验组学生的教学满意度评分与期末理论考核成绩均显著高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。

关键词： 肉苁蓉总苷   网络药理学   炎症   炎症性肠病  

摘要： 目的:通过网络药理学及动物实验研究,探讨肉苁蓉总苷对炎症性肠病(IBD)的潜在作用机制。方法:应用Pubchem数据库及文献收集肉苁蓉总苷中7种主要活性成分的三维结构。通过PharmMapper,UniProt,GeneCards等数据库获取活性成分相关靶点与IBD相关的基因靶点信息。再将肉苁蓉活性成分靶点和IBD的靶点绘制韦恩图,得到交集靶点,并将交集靶点上传到String数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)筛选分析。使用DAVID数据库将肉苁蓉总苷活性成分对IBD发挥保护作用的靶点进行基因本体(GO)功能富集、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,采用Cytoscape 3.8.0软件构建“活性成分-靶点-通路网络”,预测肉苁蓉总苷治疗IBD的作用靶点与途径,并构建IBD小鼠模型进一步验证。结果:肉苁蓉总苷活性成分对IBD具有防护作用的靶点有254个,PPI分析筛选出核心靶点30个。GO功能富集和KEGG通路富集发现肉苁蓉总苷可能主要通过调控癌症通路、mTOR通路、TGF-β通路、JAK-STAT通路、AMPK通路等,进而影响细胞信号传导、增殖、分化、凋亡来发挥作用。动物实验结果表明,肉苁蓉总苷能有效缓解IBD小鼠体质量减轻及粪便出血,降低疾病活动指数,同时有效抑制脾脏中mTOR、TGF-β两个靶点蛋白的表达。通过对小鼠粪便的16S rDNA扩增子测序进行PICRUSt2基因功能注释,分析发现肉苁蓉总苷调控IBD疾病与小鼠体内细胞壁/细胞膜/包膜生物生成,脂代谢、糖代谢过程及相关防御信号转导机制有着密切关系,与网络药理学结果相符。结论:肉苁蓉总苷可以通过多成分、多靶点、多途径协同有效防止IBD,这为阐明肉苁蓉治疗IBD的临床应用提供了新方法和新思路。其具体机制及物质基础还需更深入的试验研究加以验证。

关键词： 鼻炎   苍耳子散   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探究苍耳子散(CRZS)治疗异质性鼻炎的作用机制以及“多成分-多靶点-多通路”的整体药理作用特征。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索CRZS的活性成分及靶点;从GeneCards、DisGeNET、Phenopedia、TTD和PharmGKB数据库获取相关鼻炎的基因。通过STRING数据库与Cytoscape软件构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用STRING数据库对核心基因进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过Cytoscape软件构建“中药成分-靶点-信号通路”网络并筛选核心靶点;采用AutoDock软件对筛选得到的关键通路靶点进行分子对接。结果CRZS有131个核心基因,鼻炎相关靶点756个,交集靶点41个。GO生物富集条目2005条,KEGG通路富集条目151条,HIF-1、Lipid and atherosclerosis、Fluid shear stress and atherosclerosis等通路最具连接可能。分子对接显示,CEZS靶点的有效成分与3个核心基因连接紧密。结论CEZS可通过多成分、多靶点,多信号通路发挥治疗鼻炎的作用,其中最有可能通过HIF-1、lipid and atherosclerosis、Fluid shear stress and atherosclerosis等3条通路进行调控。

关键词： 胃癌   荜茇   胡椒碱   网络药理学   分子对接   MTT法   流式细胞术   蛋白免疫印迹法  

摘要： 目的采用网络药理学及分子对接技术探究荜茇治疗胃癌的作用机制。方法在中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索荜茇成分及活性成分;利用GeneCards数据库检索与胃癌相关靶点及共同基因;绘制PPI网络图,分别进行GO和KEGG富集分析;利用AutoDock Tools1.5.6软件对核心成分及靶点进行分子对接。MTT、流式细胞术检测不同浓度胡椒碱对SGC-7901细胞抑制及细胞凋亡的影响;蛋白免疫印迹法检测相关蛋白表达水平。结果检索到荜茇活性成分15个;荜茇-胃癌共同靶点15个;GO功能富集分析关联到基因生物过程19条,细胞组成12条,分子功能4条,KEGG通路富集分析主要涉及TNF信号通路等;分子对接结果显示胡椒碱、芝麻素等与核心靶点分子对接结果良好。MTT法及流式细胞术结果显示,与对照组相比,胡椒碱组SGC-7901细胞抑制率增加(P<0.01),细胞凋亡率增加(P<0.01);Western blotting结果显示,与对照组相比,胡椒碱组SGC-7901细胞中TNF-α、Caspase-3、Caspase-8蛋白表达量增加(P<0.05)。结论荜茇及活性成分胡椒碱对胃癌的治疗呈多靶点、多通路的特征,可为后续实验研究和临床应用提供参考。

关键词： 花生红衣   多酚   动脉粥样硬化   网络药理学   分子对接  

摘要： 为研究花生红衣多酚抗动脉粥样硬化的作用机制,该研究利用网络药理学和分子对接技术进行了活性成分、靶点及通路预测。通过TCMSP平台和文献搜索获得花生红衣多酚的活性成分,利用相关数据库获得花生红衣多酚活性成分和动脉粥样硬化的相关靶点;采用DAVID平台进行GO和KEGG富集分析,并通过Cytoscape软件,构建“花生红衣酚类活性成分-作用靶点-通路”网络图;最后,采用AutoDockTools软件对活性成分与核心靶点进行分子对接。筛选得到山奈酚、表儿茶素、漆黄素、儿茶素、木犀草素、槲皮素、原花青素B1、表没食子儿茶素没食子酸酯等13个花生红衣多酚活性成分和丝氨酸/苏氨酸激酶1、磷脂酰肌醇-3-激酶调节亚基1、丝裂原活化蛋白激酶1、表皮生长因子受体(epithelial growth factor receptor,EGFR)、肿瘤蛋白p53等65个核心靶点。花生红衣多酚发挥抗动脉粥样硬化作用主要涉及磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B信号通路信号、脂质与动脉粥样硬化、流体剪切应力和动脉粥样硬化、白细胞介素-17信号通路和EGFR酪氨酸激酶抑制剂通路。分子对接结果表明,花生红衣多酚的主要活性成分与关键靶点均能稳定结合。花生红衣多酚通过多成分、多靶点、多通路干预脂质代谢、炎症、细胞增殖和凋亡等多个生理过程而发挥抗动脉粥样硬化作用,从而为花生红衣抗动脉粥样硬化功能健康食品的开发利用提供理论依据。

关键词： 三阴性乳腺癌   加权基因共表达网络分析   小柴胡汤   网络药理学   分子对接技术  

摘要： 目的 通过生物信息学分析和整合药物代谢动力学数据进行多重药物靶点预测,探究小柴胡汤治疗三阴性乳腺癌(triple negative breast cancer, TNBC)的作用机制。方法 基于药理学数据库获取小柴胡汤的活性成分与对应靶点;采用加权基因共表达网络分析方法识别乳腺癌高通量测序数据中肿瘤发生发展的关键基因;采用GO功能与KEGG通路富集分析进行生物功能与通路注释;通过Cytoscape软件进行核心基因鉴定;利用分子对接方法模拟关键生物标志物与小柴胡汤核心活性成分的对接模式。结果 在对小柴胡汤进行数据挖掘后获得242个有效成分和265个对应靶点,通过加权分析方法得到乳腺癌密切相关的563个疾病关键靶点,小柴胡汤与TNBC共有13个交集靶点。小柴胡汤成分靶点网络构建得到槲皮素、山柰酚、异鼠李亭素、木犀草素、豆甾醇、β-豆甾醇、牵牛花色素等主要成分。PPI网络构建后通过筛选得到3个核心靶点(CCNA2、CCNB1、CHEK1)与2个关键化学成分(槲皮素、山柰酚)。GO富集获得15个生物过程、45个细胞组分、16个分子功能,其中主要与细胞器裂变和细胞核分裂等细胞增殖过程,浓缩染色体和中心区核染色体,单链DNA结合ATP依赖活性等相关。KEGG通路富集得到了37条通路,主要富集在精氨酸等代谢通路上。分子对接模拟显示核心蛋白靶点与重要活性成分具有良好的结合活性。结论 小柴胡汤主要通过CCNA2、CCNB1、CHEK1等靶点,槲皮素、山柰酚等主要活性成分及细胞凋亡、成纤维细胞形成和肿瘤细胞增殖及炎症进程达到干预TNBC的作用。

关键词： 黄精   网络药理学   肺结核  

摘要： 目的基于网络药理学分析黄精防治肺结核的作用及其机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选黄精的有效化合物及其作用靶点,通过OMIM、GeneCards、DrugBank、pharmgkb数据库收集肺结核疾病的相关潜在靶点。利用R 4.2.1软件、string网站对获取的靶点及蛋白质进行网络构建及可视化,利用相关的R程序包进行基因本体论功能(GO)富集分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,最后利用discovery studio 2019软件对重要有效成分与相关重要靶点进行分子对接研究。结果本研究筛选出黄精有效化合物12个,作用靶点81个;肺结核疾病靶点2137个,共同靶点41个。黄精防治肺结核生物学过程包含miRNA转录正向调控、化学应激的细胞反应,细胞组分涉及转录调节复合物、RNA聚合酶Ⅱ转录调节复合物等,分子作用包括转录辅助调控因子结合等。同时有多条信号通路参与其过程,主要涉及脂质和动脉粥样硬化、MAPK信号通路等相关通路。Molecular Docking结果显示:关键活性成分黄芩素、薯蓣皂苷元、β-谷甾醇与核心靶点JUN、VEGFA、HIF1-1α对接良好,LibDockScore显示分别为99.22、104.83、97.03与128.76、108.73、103.26。结论黄精中的多种化合物可能通过调节JUN、VEGFA、HIF1-1α靶点以调控氧化应激、miRNA转录正向调控、活性氧、化学应激等生物学过程,以及脂质和动脉粥样硬化、神经退化-多种疾病的通路、MAPK信号通路等多个通路,从而发挥改善肺结核的作用。

关键词： 网络药理学   蛋白组学   地龙   抗血栓   作用机制  

摘要： 基于网络药理学和蛋白组学技术探究地龙抗血栓的物质基础及作用机制。首先通过网络药理学方法对地龙小分子活性成分进行研究,基于文献检索收集地龙化学成分101个,包括核苷酸、有机酸、氨基酸及寡肽、脂类及其他,构建成分数据库,预测成分作用靶标共798个;以课题组前期已验证的地龙抗血栓靶点(纤维蛋白原、纤维蛋白、纤溶酶原)为基础,通过BioGRID数据库挖掘与其具直接作用的靶点1046个,为潜在抗血栓靶点库,二者共有靶点81个;根据核心靶点蛋白互作网络及成分-靶点-通路网络分析,发现脂类、氨基酸和寡肽类成分为主要抗血栓成分,纤连蛋白、纤溶酶原、促分裂原活化蛋白激酶-14、基质金属蛋白酶-9、表皮生长因子受体、凝血酶原、纤维蛋白原等为地龙抗血栓核心靶点,通过调控黏着斑、白细胞跨内膜转移、补体与凝血、细胞周期及坏死性凋亡等发挥作用。继而采用TMT同位素标记法进行定量蛋白组学研究,以斑马鱼为模式生物,以课题组前期分离纯化地龙抗血栓活性蛋白DPf3为研究对象,预测地龙大分子活性成分抗血栓的作用机制,其潜在调控通路包括结氨基酸代谢、紧密连接、坏死性凋亡、吞噬、甘油磷酸代谢等。反映了地龙多成分、多靶点、多功效的特性,为其临床使用提供依据,为其抗血栓机制的进一步验证提供方向,并为采用现代药理学技术研究中药动物药提供参考。

关键词： 女贞子   黄芪   转移性去势抵抗性前列腺癌   网络药理学   作用机制   信号通路  

摘要： 本研究利用数据挖掘和网络药理学探讨女贞子(Ligustrum lucidum)-黄芪(Astragalus membranaceus)治疗转移性去势抵抗性前列腺癌(Metastatic Castration-Resistant Prostate Cancer,mCRPC)的作用机制。利用中药系统药理学(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)数据库与分析平台检索女贞子-黄芪的有效成分和作用靶点;利用R语言对芯片数据集GSE77930进行分析,筛选差异表达的基因;利用Cytoscape 3.8.0软件构建有效成分-靶点网络及蛋白互作网络;利用R语言对核心靶点进行GO富集分析和KEGG分析;采用Cytoscape 3.8.0软件构建女贞子-黄芪活性成分-靶点通路关系网络。结果表明女贞子-黄芪的关键活性成分共33个,包括槲皮素(Quercetin)、山奈酚(Kaempferol)、木犀草素(Luteolin)、异鼠李素(Isorhamnetin)、芒柄花黄素(Formononetin)等;核心作用靶点18个,其中AR、VCAM1、PCNA、NTRK1、TP53、EGFR和FBXO6等靶点可能是女贞子-黄芪治疗mCRPC的重要靶点。KEGG分析发现,女贞子-黄芪主要通过乙型肝炎(Hepatitis B)、前列腺癌(Prostate Cancer,PCa)、细胞周期(Cell cycle)、Vascular Endothelial Growth Factor(VEGF)信号通路(VEGF signaling pathway)和细胞衰老(Cellular senescence)等通路发挥抗mCRPC的作用。本研究结果可为mCRPC的临床治疗提供参考。

关键词： 槟榔多酚   高原   运动性疲劳   跑台   氧化应激   网络药理学  

摘要： 目的探究槟榔多酚对大鼠高原运动性疲劳的保护作用,并选择主要的靶点开展网络药理学研究,初步探究其保护机制。方法将Wistar大鼠随机分为对照组、高原运动性疲劳模型组、槟榔多酚低、中、高(400、800、1200 mg·kg^(-1))剂量组,共5组。槟榔多酚给药组在兰州预防给药3 d后,急进高原实地实验室进行跑台训练。跑台运动结束后取大鼠肺组织、心肌组织、脑组织。通过HE染色观察大鼠肺组织病理切片,生化法测定丙二醛(MDA)、谷胱甘肽(GSH)、超氧化物歧化酶(SOD)水平评价抗疲劳活性。利用网络药理学方法构建“成分-靶点-通路”网络图,展开核心靶点和作用通路分析。结果HE染色结果显示,槟榔多酚对模型组大鼠肺组织具有保护作用;氧化应激指标表明,槟榔多酚能增加模型组大鼠心组织和脑组织SOD和GSH水平,降低MDA含量。网络药理学,共得到槟榔多酚对高原运动性疲劳保护作用的潜在靶点79个,靶点主要涉及PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、IL-17信号通路、松弛素信号通路等。结论槟榔多酚能通过维持肺组织正常的生理结构、增强抗氧化应激能力的发生等多重机制预防高原运动性疲劳。