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摘要： 1本须知刊登在本刊每卷卷首,主要参照国际医学期刊编辑委员会制订的《学术研究实施与报告和医学期刊编辑与发展的推荐规范》[Uniform Require-ments for Manuscripts Submitted to Biomedical Jour-nal:Writing and Editing for Biomedical Publication(Updated April 2010)]、中国国家标准(GB/T 3179-2009)《期刊编排格式》和(GB/T 7714-2015)《信息与文献参考文献著录规则》、原国家教委科技司1997年发布《中国高校自然科学学报编排规范》、中国医药院校学报编辑学会1991年制订的《医(药)学院校学报编排规范》.

关键词： 桂枝   非小细胞肺癌   网络药理学   表皮生长因子受体-酪氨酸激酶抑制剂   Src  

摘要： 目的研究中药桂枝对非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)耐药细胞株H1650增殖、转移、凋亡的影响,揭示桂枝改善H1650吉非替尼耐药性的功能及潜在分子机制。方法在H1650中,使用桂枝、吉非替尼单药以及桂枝与吉非替尼联合用药,利用MTT法、细胞划痕法、流式细胞术分别检测H1650细胞的增殖、迁移、凋亡情况。随后,利用网络药理学预测桂枝的有效活性成分及其影响NSCLC细胞功能的可能分子靶点,构建“桂枝-活性成分-靶点-疾病”的关系网络,并对桂枝潜在作用分子靶点进行GO功能分析和KEGG信号通路富集分析,预测与桂枝活性成分密切相关的核心分子及信号通路。最后,利用Western blotting检测预测得到的核心分子蛋白质表达及蛋白质磷酸化修饰水平在桂枝、吉非替尼作用后的变化情况。结果桂枝单药可抑制H1650细胞增殖、迁移,促进细胞凋亡;与吉非替尼单药组相比,桂枝联合吉非替尼可降低吉非替尼抑制H1650细胞增殖的IC_(50)。网络药理学预测得到7个桂枝活性成分、252个NSCLC疾病相关分子靶点及多条与肿瘤发生发展密切相关的信号通路。其中,Src、PI3K、MAPK1及其相关信号通路可能是桂枝影响NCSLC细胞功能及耐药性的核心分子靶点。分子水平上,桂枝降低了H1650细胞Src蛋白质表达水平以及Src信号通路下游分子——Akt和mTOR的磷酸化水平。结论桂枝可通过抑制Src/Akt/mTOR信号通路,改善H1650细胞对吉非替尼的耐药现象。

关键词： 七味白术散   2型糖尿病   糖代谢紊乱   胰岛素抵抗   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的 基于网络药理学和动物实验探讨七味白术散治疗2型糖尿病糖代谢紊乱的作用机制。方法 在中药系统药理学技术平台检索七味白术散活性成分及靶点,从GeneCard、OMIM、DisGeNET数据库获得“2型糖尿病糖代谢紊乱”相关靶点;运用STRING和CytoScape进行PPI网络分析并筛选关键靶点;通过DAVID平台,获得关键靶点的GO和KEGG富集分析结果;利用分子对接方法验证活性成分与关键靶点结合性。制造2型糖尿病大鼠模型,检测空腹血糖和胰岛素水平,进行苏木精-伊红(H-E)染色和油红O染色,Western blot检测肝组织中磷酸化蛋白激酶B1(p-AKT1)、缺氧诱导因子1α(HIF1α)、白细胞介素(IL)-6、IL-1β表达水平。结果 获得96个七味白术散改善2型糖尿病糖代谢紊乱的潜在靶点,通过PPI网络分析筛选出前21个关键靶点。GO富集分析得到72个GO条目,KEGG富集分析得到86条信号通路。分子对接结果显示:槲皮素、山柰酚、柚皮素、β-谷甾醇等活性成分与关键靶点的结合能更低,结构更稳定。动物实验结果显示,七味白术散显著降低血糖,改善胰岛素抵抗,减轻胰腺组织损伤、肝内脂滴积聚,显著降低p-AKT1、HIF1α、IL-6、IL-1β表达水平(P<0.001)。结论 七味白术散改善2型糖尿病糖代谢紊乱具有多成分、多靶点、多通路的特点,可降低2型糖尿病大鼠血糖及p-AKT1、HIF1α、IL-6、IL-1β表达水平,改善胰岛素抵抗,可能与IL-17通路、HIF1α通路等主要通路有关。

关键词： 玉竹   抑郁症   网络药理学   GEO   数据库   作用机制  

摘要： 目的:基于生物信息学和网络药理学方法筛选玉竹治疗抑郁症的潜在药物靶点和信号通路,并通过PC12细胞实验初步证实其抗抑郁药效。方法:下载GSE98793表达矩阵和GPL570平台信息进行差异表达基因筛选;通过检索TCMSP数据库进行成分筛选,利用Cytoscape3.7.1软件,构建玉竹“药物-成分-靶点”相互作用网络图和PPI网络图;利用DAVID数据库,进行GO和KEGG富集分析;使用SYBYL-X 2.0软件对主要活性成分及靶点进行分子对接验证;采用谷氨酸(Glu)诱导PC12细胞模型后,将玉竹醇提物按低、中、高剂量进行分组给药,考查其对PC12细胞损伤的保护作用。结果:筛选得到玉竹抗抑郁活性成分23个,活性靶点34个;“药物-成分-靶点”网络图显示棕榈酸、月桂酸、(+)-雪松醇等为玉竹抗抑郁的主要活性成分;PPI网络图显示PTGS2、PTGS1、SLC6A2、GABRA1、TNF等为关键靶点;通过GO富集分析得到GO条目共209个,其中包括生物过程(BP)149个,细胞组分(CC)23个,分子功能(MF)37个;主要涉及Chemical carcinogenesis-receptor activation、Small cell lung cancer和Adipocytokine signaling pathway等信号通路;分子对接结果显示,玉竹主要活性成分与抑郁症主要靶点对接结果具有良好稳定性;体外细胞实验结果表明,600μg/mL的玉竹醇提物对Glu诱导的PC12细胞损伤具有明显恢复作用。结论:玉竹可能通过炎症反应、氧化应激和前列腺素合成等途径发挥抗抑郁作用。

关键词： 网络药理学   分子对接   茵陈蒿汤   ICP   不良妊娠结局  

摘要： 基于网络药理学、分子对接研究茵陈蒿汤治疗ICP的潜在机制,并通过实验验证。方法 利用TCMSP、Batman-TCM等数据库获得茵陈、栀子、大黄有效成分及作用靶点;GeneCards、OMIM数据库获得ICP疾病靶点;STRING数据库构建PPI网络;对最终靶点进行GO、KEGG通路富集分析;Cytoscape 3.9.1软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络,筛选关键靶点进行分子对接。通过动物实验建立ICP大鼠模型,流式细胞术检测茵陈蒿汤对大鼠胎盘各期细胞凋亡率的影响,Western Blot检测胎盘组织中AKT、p-AKT、PI3Kp85以及PI3K p-p85的表达水平。结果 剔除重复靶点,获得44个化学成分和167个潜在作用靶点。GO富集分析,得到了75个细胞成分(Cellular Compounds)条目、130个分子功能(Molecular Function)条目、668个生物学过程条目。KEGG富集分析得到136条信号通路,排名前五的为PI3K-Akt、MAPK、Rap1、TNF、Apoptosis等信号通路。分子对接结果显示,异鼠李素、儿茶素、大黄素、茵陈色原酮、异山奈素、山奈酚、4-甲基茵陈色原酮、β-谷甾醇、槲皮素、异茵陈黄酮等可能是茵陈蒿汤治疗ICP的关键成分。实验表明,茵陈蒿汤能改善ICP大鼠血清胆汁酸水平,降低ICP大鼠胎盘早期、晚期以及总细胞凋亡率以及p-AKT和PI3K p-p85表达水平。结论 茵陈蒿汤可能其有效成分通过PI3K/AKT信号轴减少ICP大鼠胎盘滋养细胞凋亡,改善ICP造成的不良妊娠结局。

关键词： 双夏汤   失眠   对氯苯丙氨酸   网络药理学   5-HT信号通路  

摘要： 目的基于网络药理学及实验验证揭示双夏汤治疗失眠的作用机制,为临床用药提供数据支撑。方法利用ETCM数据库筛选出双夏汤有效活性成分及靶点,通过CTD数据库筛选出与失眠相关靶点,Venn图获取双夏汤-失眠的交集靶点;STRING数据库构建PPI后导入Cytoscape 3.9.1获取核心靶点,并进行可视化分析;DAVID数据库进行GO富集分析和KEGG通路富集分析,初步预测双夏汤治疗失眠的作用机制。再以对氯苯丙氨酸(4-chlorophenylacetic acid,PCPA)失眠模型小鼠为研究对象,进行高架十字迷宫行为学试验,采用LC-MS检测5-羟色胺(5-hydroxy tryptamine,5-HT)、5-羟吲哚乙酸(5-hydroxyindole acetic acid,5-HIAA)和5-羟基色氨酸(5-hydroxytryptophan,5-HTP)的含量变化,以qRT-PCR检测白介素1β(interleukin-1β,IL-1β)、白介素6(interleukin-6,IL-6)、肿瘤坏死因子α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、5-羟色胺1A受体(5-hydroxytryptamine 1A receptor,5-HT1AR)、5-羟色胺2A受体(5-hydroxytryptamine 2A receptor,5-HT2AR)、5-羟色胺转运蛋白(5-hydroxytryptamine transporter,5-HTT)和色氨酸羟化酶2(tryptophan hydroxylase 2,TPH2)的基因表达,尼氏染色观察脑组织神经元细胞形态,免疫组化检测5-HT1AR、5-HT2AR、5-HTT和TPH2的蛋白表达。结果网络药理学分析得到双夏汤治疗失眠的化学活性成分49种,主要作用成分11种,药物疾病交集靶点107个,核心靶点17个,推测双夏汤的主要活性成分可能是通过抗炎、保护神经元等作用达到镇静安眠效果,其关键靶点主要作用于5-羟色胺能突触、苯丙胺酸代谢、cAMP及神经活性配体-受体相互作用等信号通路。动物实验结果显示,与正常组相比,模型组小鼠在高架十字迷宫开臂中的活动距离、停留时间以及进入次数显著降低(P<0.05或P<0.01),脑组织IL-1β、IL-6、TNF-α基因表达明显升高(P<0.01),尼氏染色显示神经元细胞水肿,空泡变性,尼氏小体染色浅且数目较少,分布不均,前额叶皮质(prefrontal cortex,PFC)5-HT、5-HTP和5-HIAA含量明显降低(P<0.01),5-HT2AR的基因、蛋白表达明显升高(P<0.01或P<0.05),5-HT1AR、5-HTT的基因、蛋白表达均明显下降(P<0.01);中缝背核(dorsal raphe nucleus,DRN)中TPH2的基因、蛋白表达明显下降(P<0.01)。与模型组相比,双夏汤组小鼠在高架十字迷宫开臂中的距离、停留时间以及进入次数明显升高(P<0.05或P<0.01);各给药组小鼠IL-1β、IL-6、TNF-α基因表达明显降低(P<0.01),脑组织神经元细胞损伤有不同程度好转,结构相对清晰,尼氏小体相对规则,阳性组、双夏汤组小鼠PFC中5-HT、5-HTP和5-HIAA含量及DRN中TPH2的基因、蛋白表达明显升高(P<0.05或P<0.01)。阳性组小鼠PFC中5-HTT基因及5-HT1AR蛋白表达明显上升,5-HT2AR基因表达明显下降(P<0.05);双夏汤组小鼠PFC中5-HT1AR、5-HTT的基因、蛋白表达明显上升(P<0.05或P<0.01),5-HT2AR的基因、蛋白表达明显下降(P<0.01)。与模型组相比,半夏组、夏枯草组小鼠5-HT2AR蛋白表达明显降低(P<0.05或P<0.01),TPH2蛋白表达明显升高(P<0.05)。结论双夏汤对PCPA失眠小鼠的治疗作用可能是通过抗炎、保护神经元并且增加5-HTP含量,促进5-HT的合成、重摄取及代谢实现的。

关键词： 葛根芩连汤   新型冠状病毒感染   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:运用网络药理学和分子对接技术分析葛根芩连汤治疗新型冠状病毒感染(Corona Virus Disease 2019,COVID–19)的药物活性成分、关键靶点和作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Gene Cards、OMIM、TTD、Drug Bank数据库收集药物活性成分和疾病靶点。通过Venny软件获取药物活性成分靶点与疾病靶点的交集,借助STRING数据库构建蛋白质–蛋白质相互作用网络,通过网络拓扑分析得到关键靶点。通过Metascape数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用Cytoscape软件构建药物活性成分–靶点网络以及靶点–通路网络。使用Auto Dock Vina对核心药物活性成分与关键靶点进行分子对接验证。结果:通过检索相关数据库获得药物活性成分共130种、靶点209个,疾病靶点1936个,药物活性成分与疾病的交集靶点有55个。通过Cytoscape软件可视化筛选得到核心药物活性成分为槲皮素、山柰酚,核心靶点为丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(Akt Serine/Threonine Kinase 1,AKT1)、白细胞介素(Interleukin,IL)–6、肿瘤坏死因子(TumorNecrosisFactor,TNF)。通过GO富集分析得到43个生物功能条目,通过KEGG富集分析得到15条信号通路,与COVID–19有关的核心信号通路为癌症通路、IL–17、炎症性肠病以及肿瘤蛋白p53(Tumor Protein p53,TP53)信号通路。分子对接结果显示药物核心成分与核心靶点具有较强的结合活性。结论:葛根芩连汤能改善COVID–19患者的炎症反应和免疫防御,减轻气道堵塞及胃肠道并发症,从而治疗COVID–19。

关键词： 中文核心期刊   荷兰医学文摘   中国临床药理学   核心版   中国药理学会   皖南医学院   弋矶山医院   乌利希期刊指南  

摘要： 《中国临床药理学与治疗学》是由中国科学技术协会主管、中国药理学会主办、皖南医学院弋矶山医院承办的国家级学术性月刊(ISSN 1009-2501,CN 34-1026/R),创刊于1996年6月,创刊人是全国著名定量药理学家孙瑞元教授,现任主编为国家杰出青年基金获得者复旦大学特聘教授黄志力。本刊于2001年获得中国科学技术协会专项基金资助,2003年入选“中国科技论文统计源期刊(中国科技核心期刊)”,2011年被中国科学引文数据库核心版(CSCD)收录,现为北大中文核心期刊、中国科学引文数据库(CSCD)核心库期刊、中国科技论文统计源期刊,并被荷兰医学文摘(Embase)、美国《化学文摘》(CA)、日本科学技术振兴机构数据库(JST)、波兰《哥白尼索引》(IC)、西太平洋地区医学索引(WPRIM)、美国《乌利希期刊指南》(Ulrichsweb)等国际数据库收录。

关键词： 麝香   脑出血   中医   网络药理学   作用机制   作用靶点   信号通路   关联网络  

摘要： 目的基于网络药理学探讨麝香治疗脑出血(ICH)的分子机制,为进一步实验研究提供依据。方法首先检索BATMAN-TCM数据库得到麝香的有效成分及靶基因;再检索GeneCards、数据库OMIM数据库以及DisGeNET数据库等疾病数据库,从而获得疾病的基因,同时利用韦恩图将药物基因与疾病基因取交集;然后将韦恩图所得靶点导入STRING数据库构建基因功能关联网络,采用Cytoscape软件绘制图形;最后采用R软件进行GO富集分析和KEGG富集分析。结果共获得有效成分59种,其中30个化合物有对应的靶点,累计靶点1082个,疾病靶点3686个;上述靶点的韦恩图共得到481个核心基因,将其导入STRING数据库构建基因功能关联网络,并将网络参数导入Cytoscape软件进行拓扑分析;使用R软件Bioconductor包进行富集分析,其中GO富集分析共涉及297个条目,最终得到具有显著意义的条目,包括生物过程中对有毒物质的反应、细胞组分中的染色质以及分子功能中的近端启动子序列特异性DNA结合。通路富集分析涉及184个条目,通过文献的阅读发现KEGG富集结果中磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路、Janus激酶(JAK)-信号转导因子和转录激活因子(STAT)信号通路、cAMP信号通路、核苷酸结合寡聚结构域样受体(NLR)信号通路、Toll样受体(TLR)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路等通路与ICH关系密切。结论麝香可通过多靶点、多维度发挥对ICH的治疗作用,其通过PI3K-Akt信号通路发挥作用的可能性最大。

关键词： 网络药理学   分子对接   鱼腥草   慢性阻塞性肺疾病  

摘要： 目的:基于网络药理学以及分子对接探讨鱼腥草治疗慢性阻塞性肺疾病(Chronic Obstructive Pulmonary Disease,COPD)的活性成分和潜在作用机制。方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Universal Protein(UniProt)数据库筛选鱼腥草活性成分及靶点。通过DisGeNet数据库、Drugbank、Therapeutic Target Database(TTD)、GeneCards数据库获取COPD的疾病相关靶点。利用Venny 2.1.0在线分析工具得到鱼腥草治疗COPD的潜在靶点,应用DAVID网站进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)分析,结果用R语言中的ggplot包进行可视化。在String数据库构建PPI网络,通过Cytoscape 3.10.1构建“药物-成分-靶点-疾病”网络图,CytoNCA插件筛选关键靶点。利用AutoDock Tools Version 1.5.7软件对鱼腥草4种成分和鱼腥草治疗COPD的关键靶点进行分子对接。结果:获得鱼腥草有效活性成分4个:槲皮素、山奈酚、异拉马酮、黄夹次甙丙,治疗COPD的潜在靶点105个,关键靶点4个:肿瘤蛋白p53(TP53)、丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白介素6(IL-6),主要涉及炎症反应等过程,调控磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路等通路。分子对接结果显示鱼腥草的主要活性成分大部分与COPD的受体具有较好的结合力。结论:鱼腥草可能通过槲皮素、山奈酚、异拉马酮、黄夹次甙丙等活性成分,作用于TP53、AKT1、TNF、IL-6等关键靶点,调节PI3K/Akt等通路,发挥抗炎、抗氧化应激、延缓肺气肿进展,改善肺功能等作用,为鱼腥草治疗COPD提供了理论依据。