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关键词： 三七   网络药理学   分子对接   膜性肾病   有效成分   作用机制   名医经验  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接技术,探讨曹恩泽教授应用三七治疗膜性肾病的作用机制。方法:使用TCMSP数据库获取中药三七所含有效成分及相应靶点信息,使用GeneCards数据库获取膜性肾病的疾病靶点基因,取二者交集靶点并绘制韦恩图;利用STRING数据库获取蛋白互作关系,并通过Cytoscape3.9.1软件构建PPI网络图,筛选出三七治疗膜性肾病的核心靶点;利用David数据库进行GO功能和KEGG通路富集分析,得到三七治疗膜性肾病的潜在作用通路,最后利用Autodock软件进行药物主要活性成分与核心靶点的分子对接验证。结果:共检索得到槲皮素、人参皂苷Rh2、扁桃醇、豆甾醇等7个有效成分,筛选出127个三七治疗膜性肾病的潜在作用靶点;经PPI网络拓扑分析筛选出JUN、TP53、RELA、AKT1、MAPK1等23个核心靶点,GO功能富集分析得到703个生物过程、55个细胞组分及121个分子功能;KEGG信号通路富集分析获得171条信号通路,分子对接结果显示主要核心靶点与药物主要成分具有较强结合能力。结论:药物三七可能通过多个靶点、多条通路治疗膜性肾病,为后续研究提供了理论依据。

关键词： 盐酸雷洛昔芬   绝经后骨质疏松症   网络药理学   关键靶点   信号通路  

摘要： 目的:运用网络药理学研究盐酸雷洛昔芬治疗绝经后骨质疏松症潜在的作用靶点和作用机制。方法:通过GeneCards数据库收集盐酸雷洛昔芬与绝经后骨质疏松症的靶点,共同靶点的交集通过Venny 2.1工具获得,采用STRING数据库构建共同靶点的PPI(Protein-Protein Interation,PPI),使用可视化软件Cytoscape 3.9.1的McCreight算法(MCC)对PPI进行分析,筛选出排名前10的中枢基因(Hub genes),通过DAVID生物信息学资源数据库进行GO生物功能、KEGG通路富集分析。结果:筛选出药物与疾病有168个共同靶点;关键靶点涉及STAT3、SRC、MAPK1、ESR1、JUN、PIK3R1、FOS、SP1、MAPK14和MYC等。盐酸雷洛昔芬可能通过调节STAT3、SRC、MAPK1、ESR1和JUN等关键基因,内分泌抵抗通路、糖尿病并发症晚期糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、脂质与动脉粥样硬化通路、与磷脂酰肌醇相关的PI3K-Akt信号通路等治疗绝经后骨质疏松症。结论:本文预测了盐酸雷洛昔芬治疗绝经后骨质疏松症的作用靶点和信号通路,可为下一步实验研究和研究方向奠定基础。

关键词： 郭诚杰   乳腺增生   数据挖掘   核心药对   网络药理   分子对接  

摘要： 目的基于数据挖掘及网络药理学研究手段,总结国医大师郭诚杰治疗乳腺增生病(Mammary gland hyperplasia,MGH)的用药规律特点,并对核心药对进行药理机制分析。方法整理国医大师郭诚杰在陕西中医药大学附属医院2011年3月—2017年3月诊治的MGH医案,运用SPSS molder、SPSS Statistics系统对其临床处方用药规律进行研究,网络药理学分析最高支持度药组治疗MGH的成分、靶点、作用通路等。用Autodock系统进行分子对接。结果共纳入689首处方,处方中多使用补虚药、理气药、活血化瘀药,药性寒、温居多,苦、甘、辛药味为主,注重肝、脾两经的药物配伍使用;香附-当归是郭诚杰教授治疗MGH的核心药对;香附-当归对药的重要活性成分有槲皮素、山奈酚、木犀草素、豆甾醇、β-谷甾醇等;药对参与疾病共有靶点154个;主要信号通路有IL-18信号通路、AGE-RAGE信号通路等。分子对接验证显示,活性槲皮素与关键靶点成分TP53的对接得分最高,亲和力最好。结论郭诚杰教授治疗MGH主张以肝为本,在这一原理的指导下,以疏肝理气、活血化瘀为治则,核心药对香附-当归可能通过IL-18信号通路、AGE-RAGE信号通路起到治疗MGH的作用。

关键词： 三七   视网膜静脉阻塞   网络药理学   分子对接   分子机制  

摘要： 目的:探讨三七治疗视网膜静脉阻塞(RVO)的分子作用机制。方法:采用TCMSP数据库及文献补充获得三七的有效成分,并在Swiss Target Prediction收集其作用靶点;使用GeneCards等5个数据库检索RVO疾病靶点,并将三七成分靶点与RVO疾病靶点进行映射;利用STRING、Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白-蛋白相互作用网络图,筛选出核心靶基因,对其进行GO和KEGG富集分析。最后,利用Sybyl-x 2.0软件进行分子对接验证。结果:筛选出三七有效成分10种,涉及354种蛋白。RVO的疾病靶点有181个,其中9个是三七治疗RVO的潜在靶点。“药物-活性成分-疾病-靶蛋白”相互作用网络中,核心作用靶点包括VEGFA、EGFR等;通过GO及KEGG富集分析,筛选出参与RVO主要生物学过程28种,相关信号通路18条。三七治疗RVO潜在的分子机制与纤溶等生物学过程密切相关。关键信号通路包括HIF-1信号通路、PI3K-Akt信号通路等。分子对接结果提示,三七主要活性成分DFV、Panaxydol等与VEGFA、EGFR等关键靶点有着较好的结合活性。结论:三七的多成分通过纤溶等多种生物学过程及HIF-1等多条生物学信号通路,多靶点、多通路、多效应作用于视网膜,进一步发挥治疗作用,而VEGFA、EGFR等可能是潜在作用靶点。

关键词： 网络药理学   紫檀芪   阿尔茨海默病   靶点   信号通路  

摘要： 目的:基于网络药理学研究紫檀芪抗阿尔茨海默病(Alzheimer’s disease,AD)的潜在靶点和信号通路。方法:利用Swiss Target Prediction数据库筛选获得紫檀芪相关靶点;通过Gene Cards数据库检索获得AD相关靶点;使用Venny 2.1网站获取药物-疾病靶基因的交集;采用STRING数据库获取共同基因的蛋白质间相互作用关系,构建蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络;利用Cytoscape 3.7.2软件进行紫檀芪-靶点网络的可视化及分析;使用DAVID数据库对共同基因进行基因本体(gene ontology,GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)信号通路富集分析;使用在线工具进行绘制GO及KEGG通路富集分析图。结果:通过数据库筛选获得紫檀芪相关靶点100个,AD相关靶点14472个,其中有88个为紫檀芪作用于AD的潜在靶点。通过对图中心介值分析发现ESR1、EGFR、MAPT、PTGS2及Bcl-2等为核心靶点。富集分析发现,内分泌抵抗、神经营养信号通路及催乳素信号通路等参与程度非常高。结论:紫檀芪可能通过ESR1、EGFR、MAPT、PTGS2及Bcl-2等核心靶点,调节内分泌抵抗及神经营养信号通路等发挥改善AD的作用。

关键词： 岗课赛证融通   教学改革   药理学   中等职业学校  

摘要： 目的基于岗课赛证融通探讨中职药理学教学改革策略。方法选取2021年1月—2022年12月山东医药技师学院制药工程学院40名学生纳入本研究,2021年1—12月,实施常规教学(视为对照组);2022年1—12月,实施基于岗课赛证融通的教学模式(视为观察组),每组20名。对比两组职业能力考核评分恒和教学满意度。结果和对照组相比,观察组的职业能力考核评分更高,差异有统计学意义(P<0.05)。观察组教学满意度高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。结论基于岗课赛证融通用于中职药理学教学的改革中,能够显著提高教学满意度和教学效果。

关键词： 文旦柚皮   精油   网络药理学   分子对接   主要功效  

摘要： 利用网络药理学和分子对接探究文旦柚皮精油的主要功效。首先,通过文献和数据库进行活性成分的收集与筛选、靶点的预测,构建成分-靶点数据集,导入Cytoscape 3.7.2软件构建网络,获取靶点信息;然后,筛选出主要靶点,利用Metascape系统进行富集和通路分析,利用Sybyl-x 2.0软件进行分子对接试验。最后,筛选得到文旦柚皮精油有效活性成分28个,共621个靶点,主要涉及化学致癌、雌激素信号、癌症和神经退行性等生物学过程中的多条信号通路。初步揭示了文旦柚皮精油的主要药理学机制和功效,为其进一步开发提供了理论参考。

关键词： 肝纤维化   五灵胶囊   网络药理学   分子对接   动物实验   PI3K-Akt信号通路  

摘要： 采用网络药理学、分子对接及动物实验探究五灵胶囊抗肝纤维化的潜在作用机制。首先通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中医药综合数据库(Traditional Chinese Medicines Integrated Database,TCMID)和GeneCards等数据库,以及文献检索获取五灵胶囊抗肝纤维化的化学成分与作用靶点,采用STRING数据库和Cytoscape 3.9.1软件对交集靶点进行蛋白-蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析,筛选出核心靶点,并对核心靶点进行基因本体(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,进一步构建“药物-核心成分-靶点-通路-疾病”网络,随后利用AutoDock Vina软件对核心成分与核心靶点进行分子对接,预测其抗肝纤维化的潜在作用机制。最后构建四氯化碳(CCl_(4))诱导的肝纤维化大鼠模型,观察大鼠一般体征和肝组织形态,采用苏木精-伊红(HE)及Masson染色对肝组织切片进行分析,并通过ELISA、实时荧光PCR等研究五灵胶囊对炎症因子、羟脯氨酸(HYP)水平及核心靶点的作用。筛选得到五灵胶囊化学成分445个,其对应潜在靶点3882个,与1240个肝纤维化疾病靶点相交,筛选得到TNF、IL6、INS、PIK3CA等47个核心靶点。GO功能和KEGG通路富集分析得知,核心靶点主要影响细胞刺激反应过程、代谢调节过程,涉及癌症、PI3K-Akt、MAPK等信号通路。分子对接结果显示,五灵胶囊的核心成分赤芝酸K、灵芝酸B、赤芝酸N、柴胡皂苷Q2、新隐丹参酮等与核心靶点TNF、IL6、PIK3CA均有较高的亲和力。动物实验结果显示,五灵胶囊可以减少大鼠肝脏中脂肪空泡、炎症浸润以及胶原沉积,降低炎症因子肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-6(IL-6)及HYP水平,下调PI3K、Akt mRNA的表达量。结果表明,五灵胶囊可能通过调控PI3K-Akt信号通路,降低TNF-α、IL-6炎症因子水平,抑制胶原过度沉积,达到抗肝纤维化的作用。

关键词： 双石通淋胶囊   良性前列腺增生   蛋白激酶   血管内皮因子   表皮生长因子受体  

摘要： 目的:基于网络药理学及动物实验探讨双石通淋胶囊治疗良性前列腺增生(BPH)的作用机制。方法:通过TCMSP、SymMap和ETCM数据库筛选双石通淋胶囊的化学成分及靶点;利用GeneCards、DisGeNET和DrugBank数据库检索BPH疾病靶点;用STRING数据库构建蛋白互作网络;对关键靶点进行GO和KEGG富集分析;利用Cytoscape 3.7.2软件构建“双石通淋胶囊-活性成分-靶点-通路”图。分子对接预测核心成分与靶点的结合能力。采用去势联合皮下注射丙酸睾酮建立大鼠前列腺增生模型,造模同时进行灌胃干预,连续28 d,末次给药24 h后,比较各组大鼠体质量、前列腺湿质量及指数;HE染色和Masson染色观察前列腺组织病理变化和胶原沉积情况;Western blot法检测大鼠前列腺组织中EGFR、VEGFA、p-P38、p-AKT蛋白的表达。结果:双石通淋胶囊筛选出193种活性成分,包括槲皮素、木犀草素、汉黄芩素、黄芩素、薯蓣皂素、等核心成分,对应靶点422个,与994个疾病靶点取交集后得到100个共同靶点,核心靶点包括AKT1、STAT3、EGFR、CASP3、VEGFA、等;GO富集分析发现生物途径主要包括酶结合、转录因子结合、蛋白激酶结合、等;细胞组分主要包括大分子络合物、转录因子复合物、核染质、等;分子功能包括酶结合、序列特异性DNA结合、转录因子结合、等;KEGG富集分析发现MAPK信号通路、PI3K/AKT信号通路等可能在双石通淋胶囊治疗良性前列腺增生中起关键作用。分子对接结果显示,汉黄芩素与VEGFA结合能力最强。HE和Masson染色显示,与假手术对照组相比,模型对照组大鼠前列腺组织增生及胶原沉积明显;与模型对照组相比,双石通淋胶囊2.5 g/kg组大鼠前列腺湿质量和指数明显降低(P<0.05);给药各组大鼠前列腺中EGFR、VEGFA、p-AKT、p-P38蛋白表达明显下调(P<0.05或P<0.01),给药各组的前列腺增生程度及胶原沉积明显减轻。结论:双石通淋胶囊通过多靶点、多通路治疗BPH,其作用机制可能与调控EGFR、VEGFA、p-P38、p-AKT的表达有关。

关键词： 脑出血   大黄   三七   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:运用网络药理学和分子对接探讨大黄-三七配伍治疗脑出血的作用机制。方法:运用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)以及文献查找获取大黄和三七的活性成分,以口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18为阈值进行筛选,通过Swiss Target Prediction预测活性成分靶点;从人类基因综合数据库(GeneCard)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、治疗靶点数据库(TTD)获取脑出血疾病基因,并筛选出与药物靶标的交集基因;运用STRING对交集基因进行蛋白-蛋白互作(PPI)分析,运用Cytoscape 3.7.1软件绘制“疾病-中药-化合物-交集基因”网络图、PPI网络图,运用Metascape数据分析平台进行基因本体(GO)富集以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用分子对接技术对关键靶点和化合物的相互作用进行验证,并通过动物实验验证大黄-三七药对对磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)/蛋白激酶B(AKT)通路以及Bcl-2家族促凋亡蛋白(Bax)、Bcl-2家族抗凋亡蛋白(Bcl xL)的影响。结果:最终筛选获得大黄-三七药对有效成分31个,潜在靶点486个,与脑出血交集靶点130个,PPI获得关键靶点信号转导激活转录因子3(STAT3)、酪氨酸激酶(SRC)、丝裂原激活的蛋白激酶1(MAPK1)、肿瘤蛋白p53(TP53)、磷脂酰肌醇3激酶α亚单位(PIK3CA)、Harvey肉瘤病毒癌基因同源物(HRAS)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)。GO和KEGG富集分析后共获得符合筛选标准的条目2137条和188条,主要涉及磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K-AKT)信号通路、Ras相关蛋白1(Rap1)信号通路、晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路、丝裂原激活的蛋白激酶(MAPK)信号通路等。分子对接结果显示,筛选的化合物与潜在靶点大部分有良好的结合能力。动物实验显示,三七-大黄药对可改善脑出血大鼠脑组织病理损伤,减少细胞凋亡率,显著升高脑出血大鼠脑组织PI3K、磷酸化的AKT(p-AKT)、Bcl xL表达,降低Bax表达。结论:本研究初步揭示了大黄-三七配伍多成分、多靶点、多通路治疗脑出血的机制,验证了大黄-三七药对通过激活PI3K/AKT通路,降低神经元凋亡,保护脑组织,为今后临床上使用大黄-三七配伍治疗脑出血提供了一定依据。