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关键词： 升麻葛根汤   猴痘   网络药理学   分子对接   分子机制  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接探讨升麻葛根汤治疗猴痘的作用机制。方法从TCMSP、Swiss Target Prediction、SuperPred数据库以及中药药理学相关文献筛选升麻葛根汤有效成分和作用靶点。从GeneCards、DrugBank和OMIM数据库获取猴痘相关基因。通过Cytoscape软件构建“药物⁃化合物⁃靶点”网络,筛选升麻葛根汤治疗猴痘核心成分,进行GO、KEGG富集分析,通过分子对接验证核心成分与靶点的结合活性。结果经筛选获得127个活性成分,671个药物靶点,105个猴痘相关靶点,通过Cytoscape软件筛选获得槲皮素、山柰酚等4个核心成分,CYP3A4、STAT1、ERBB2等6个作用靶点,GO、KEGG分析发现升麻葛根汤可能通过细胞对外源刺激反应等生物过程,作用细胞质核周区等位置,实现氧化还原酶活性等生物学功能。药物作用涉及AGE⁃RAGE、IL⁃17、HIF⁃1等多条信号通路。分子对接结果显示核心活性成分与核心靶点均有较强结合能力。结论升麻葛根汤以多成分作用多靶点治疗猴痘,AGE⁃RAGE、IL⁃17、HIF⁃1信号通路是治疗猴痘的重要通路。

关键词： 药理学   “一线两面”   思维导图  

摘要： 在药理学“一线两面”思维导图教学法的基础上,为帮助学生理解药物临床适应证、不良反应等机制,从启发性问题设计、发散性问题设计、联想性问题设计、反向提示性问题设计等几方面探索了问题设计。研究表明,有效的问题设计,既能提升教师把控教学内容和教学进程的能力,又能使学生在活泼的气氛下拓展思维,领悟药物临床适应证的药理基础和不良反应、用药禁忌、药物相互作用的机理,收到事半功倍的教学效果。

关键词： 虎杖   非酒精性脂肪性肝炎   网络药理学  

摘要： 目的:运用网络药理学探究虎杖治疗非酒精性脂肪性肝炎(Non-alcoholic steatohepatitis,NASH)的主要活性成分及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)获得虎杖主要活性成分,于Pubmed compound数据库下载其结构式并导入Pharmmapper数据库获得成分作用靶点;借助Genecards、OMIM、Disgenet等数据库获得非酒精性脂肪性肝炎的疾病靶点;绘制药物-疾病交集靶点韦恩图,Cytoscape 3.9.1软件构建成分-靶点网络;String数据库获得PPI网络并通过拓扑分析得核心靶点网络,于Metascape数据库对潜在靶点进行GO、KEGG富集分析,微生信在线制图平台绘制气泡图及条形图等。结果:经筛选获得虎杖主要活性成分10个,主要活性成分作用靶点436个,疾病靶点3944个;去重结合得疾病靶点。虎杖抗NASH潜在作用靶点81个,6,8-Dihydroxy-7-methoxyxanthone、luteolin、Physovenine等可能为虎杖作用NASH的主要活性成分;PPI网络拓扑分析得到SRC、RXRA、GRB2、AKT1、RXRB、ESR1、STAT1、JAK2、IGF1、IGF1R等10个核心靶点;GO富集分析主要包含生物过程(Biological process,BP)条目1092个、细胞组分(Cellular component,CC)条目49个、分子功能(Molecular function,MF)条目98个,KEGG分析结果130条,涉及调节细胞对脂质的反应(Cellular response to lipid)、细胞内受体信号通路(Intracellular receptor signaling pathway)等生物过程,通过PI3K/Akt等信号通路发挥作用。结论:虎杖可通过多成分、多靶点、多通路对非酒精性脂肪性肝炎发挥治疗作用,其可能涉及抗炎、抗氧化、抗凋亡、调节代谢、抑制细胞增殖等生物活性。虎杖中的多种活性成分如6,8-Dihydroxy-7-methoxyxanthone、luteolin、Physovenine等可能通过SRC、RXRA、GRB2、AKT1等靶点对信号通路进行调控,涉及多种生物过程,从而发挥抗NASH的作用。

关键词： 双虎肿痛宁酊剂   UPLC-Q-TOF-MS/MS   化学成分   网络药理学   镇痛   靶点   通路  

摘要： 目的联用UPLC-Q-TOF-MS/MS技术和网络药理学研究双虎肿痛宁酊剂的化学成分和镇痛的分子机制。方法通过对比双虎肿痛宁酊剂色谱图、空白色谱图,并结合PubChem、HMDB、MassBank数据库谱图及对照品裂解信息,分析鉴定双虎肿痛宁酊剂的化学成分。通过STRING数据库构建蛋白相互作用网络,筛选出双虎肿痛宁酊剂镇痛的潜在靶点,并对靶点进行GO和KEGG富集分析,解析镇痛相关的核心通路。采用Cytoscape软件构建“化学成分-疾病-靶点”网络,解析镇痛相关的关键化合物。结果初步鉴定出新绿原酸、绿原酸、橙皮苷、新橙皮苷、阿魏酸、小檗碱、熊果酸、去氧乌头碱、新乌头碱、次乌头碱、苯甲酰新乌头碱、苯甲酰次乌头碱、咖啡酸、槲皮素、齐墩果酸、4-羟基肉桂酸、甲芬那酸17个核心原型成分;STAT3、MAPK3、MAPK13个核心靶点;IL-17、TNF、PI3K-Akt、花生四烯酸代谢4个关键通路。结论本研究初步阐明双虎肿痛宁酊剂的化学成分及镇痛潜在的作用机制,为双虎肿痛宁药效物质基础和作用机制研究提供了科学的理论依据。

关键词： 定喘颗粒   网络药理学   RSV肺炎   信号通路   靶点  

摘要： 目的基于网络药理学和动物实验验证探讨定喘颗粒干预呼吸道合胞病毒肺炎的作用机制。方法通过TCMSP、TCMID等数据库获取定喘颗粒中各个中药的潜在活性成分及作用靶点,根据ADME药动学参数筛选定喘颗粒中药物的活性成分;通过Genecards、OMIM、DisGeNet数据库获取呼吸道合胞病毒肺炎潜在的疾病靶点;利用String平台构建蛋白互作网络对交集靶点进行可视化处理;采用David数据库对关键核心靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;随后利用Cytoscape软件(3.9.1)构建定喘颗粒干预呼吸道合胞病毒肺炎的相关网络。选取呼吸道合胞病毒(RSV)致呼吸道合胞病毒肺炎幼龄大鼠模型进行实验验证。结果网络药理学结果显示定喘颗粒共177个潜在活性成分,作用于144个靶点,呼吸道合胞病毒肺炎共1075个相关靶点,得到“药物-疾病”交集靶点55个,其中核心靶点25个为ALB、IL6、CASP3、EGFR、VEGFA等;GO功能富集分析结果显示涉及的生物过程主要包括对转录的正调控、对RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、对基因表达的正调控、对细胞凋亡过程的负调控等;KEGG通路富集主要涉及PI3KAkt信号通路、癌症通路、肿瘤坏死因子信号通路、IL-17信号通路等。动物实验初步表明:定喘颗粒可通过调控PI3K-Akt信号通路,从而参与炎症、免疫反应发挥作用。与正常组相比,模型组幼龄大鼠肺组织中p-PI3K/PI3K、p-Akt/Akt的比值显著升高(P<0.05),病毒载量显著升高(P<0.05),肺组织损伤病理评分显著增高(P<0.05),肺泡灌洗液(BALF)中炎症因子IL-6、TNF-α含量明显增高(Ρ<0.05)。与模型组相比,定喘颗粒各剂量组和阳性对照组幼龄大鼠肺组织中p-PI3K/PI3K、p-Akt/Akt蛋白表达降低(Ρ<0.05),病毒载量显著降低(P<0.05),肺组织损伤病理评分明显降低(P<0.05),BALF中炎症因子IL-6、TNF-α含量明显降低(Ρ<0.05)。结论研究揭示了定喘颗粒治疗呼吸道合胞病毒肺炎的多组分、多靶点、多通路的协同作用机制。经动物实验验证,RSV感染幼龄大鼠时很有可能激活了PI3K-Akt信号通路,引起炎症因子IL-6、TNF-α释放,定喘颗粒能够有效下调PI3K-Akt信号通路,抑制炎症因子IL-6、TNF-α释放从而达到达到抗炎的作用。

关键词： 动脉粥样硬化   黄芪   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的探讨基于网络药理学和分子对接方法分析黄芪治疗动脉粥样硬化(As)的作用机制。方法通过TCMSP数据库得到有效成分及对应的靶点基因,利用GeneCards和OMIM数据库获取AS的疾病靶点,构建药物有效成分与疾病靶点的交集Venny图,利用Cytoscape 3.9.1软件与STRING数据库建立有效成分——作用靶点网络和蛋白质互作网络图。通过Metascape平台进行GO功能和KEGG通路富集分析,并采用Autodock软件进行分子对接。结果筛选获得药物有效成分16种,主要的核心成分为槲皮素、山奈酚;药-病交集靶点109个,PPI分析得到蛋白激酶B1(AKT1)、白细胞介素-6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、JUN原癌基因(JUN)、白细胞介素1β(IL-1β)5个核心靶点,可能是治疗As的核心靶点。GO生物功能富集分析,获得GO条目共1663个。KEGG通路186条,主要为癌症通路、脂质和As、流体剪切力和As、IL-17等信号通路。分子对接结果显示,黄芪的主要活性成分均能与核心靶点自发结合,其结合能均≤-5.0 kJ/mol。结论黄芪可通过多成分、多靶点、多通路发挥作用而起到抗As的作用,其活性成分具有良好的类药性。为临床应用提供了一定的理论依据。

关键词： 网络药理学   脓毒症   升降散   分子对接   免疫抑制   炎症因子  

摘要： 目的验证升降散在脓毒症中的作用并探讨其分子机制。方法通过TCMSP、Disgenet等数据库搜索药物活性成分作用靶点与疾病相关靶点,并将二者取交集。采用DAVID数据库对交集靶点进行GO、KEGG通路富集分析,将药物活性成分与关键通路的核心基因进行分子对接。采用盲肠结扎穿刺(cecal ligation puncture,CLP)构建脓毒症小鼠模型,收集小鼠脾脏组织与血清,采用流式细胞术检测脾脏中不同T细胞亚群百分比,采用ELISA检测血清中IL-6、IL-10水平。结果网络药理学分析搜索获得升降散活性成分25个,活性成分作用靶点238个,疾病相关靶点2797个,活性成分与疾病相关靶点交集基因有90个,潜在靶标为AKT、JUN、EGFR、MMP9等;GO功能富集分析,得到条目数1021条,其中生物过程942条,细胞组成23条,分子功能55条。KEGG通路分析发现交集基因主要富集在PD-1/PD-L1信号通路、HIF-1信号通路、TNF信号通路、炎症介质信号通路等,表明其治疗效果可能和这些通路有关。分子对接结果显示,槲皮素、山奈酚、大黄素等核心化合物与关键基因都能较好的结合。流式细胞术结果显示,CLP 7 d后小鼠脾脏CD4^(+)T细胞比例减少,CD4^(+)PD-1^(+)T细胞比例增加,IL-6释放减少,IL-10含量增加,小鼠呈免疫抑制状态。给予升降散灌胃治疗后小鼠脾脏CD4^(+)T细胞百分比增加,CD4^(+)PD-1^(+)T细胞数量减少,IL-6释放增强,IL-10含量降低,小鼠免疫抑制得以改善。结论升降散能增加脓毒症晚期促炎症细胞因子IL-6释放,提高CD4^(+)T/CD8^(+)T细胞比值,降低抗炎性细胞因子IL-10表达,以改善脓毒症晚期免疫抑制,提高小鼠生存率。

关键词： 雨花茶   不同产地   HPLC   网络药理学   抗肿瘤机制  

摘要： 利用高效液相色谱(HPLC)对不同产地雨花茶中儿茶素组分进行分析与评价,并基于中药网络药理学探讨雨花茶抗肿瘤的潜在作用机制。采用HPLC法建立12批雨花茶的指纹图谱并对其进行含量测定。基于TCMSP、Swiss Target Prediction、PubChem和UNIPROT数据库获取雨花茶中7个成分的靶点信息并导入Cytoscape软件构建成分-靶点网络,借助蛋白互作网络得到核心靶点,对核心靶点进行GO生物过程富集、KEGG通路富集,构建雨花茶抗肿瘤的主要成分-核心靶点-主要通路的网络。结果表明,不同产地雨花茶中儿茶素组分具有一定差异,表没食子儿茶素没食子酸酯为含量最高成分。网络药理学结果显示雨花茶中7个成分主要作用于134个靶点、165条通路发挥抗肿瘤作用,包括转录与凋亡相关的JUN、STAT3、MAPK3、TP53、MAPK1、FOS、ESR1、SP1及血管生成相关的HIF1A和炎症相关的RELA。本研究建立了不同产地雨花茶HPLC指纹图谱和多成分含量测定方法,可为雨花茶等的质量评价提供参考。雨花茶中多成分主要通过促凋亡、抗炎、抗氧化、抗缺氧等多种机制,产生抗肿瘤效应。

关键词： 新冠肺炎   五指毛桃汤   网络药理学   分子对接  

摘要： 运用网络药理学和分子对接的思路和方法,研究五指毛桃汤预防新冠肺炎(Coronavirus disease 2019,COVID-19)的作用机制。从ETCM、TCMSP、SwissADME、SwissTargetPrediction等数据库和文献中获取五指毛桃汤各味中药的主要有效成分和作用靶点,导入Cytoscape 3.8.0软件绘制药物有效成分-靶点网络图。通过TTD、GeneCards、OMIM、DrugBank、pharmgkb等数据库筛选疾病基因,将疾病基因与靶点基因取交集,通过STRING平台构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)关系图,筛选得到核心基因。利用R语言软件编辑脚本文件进行GO功能和KEGG通路分析。最后,利用AutoDock4及Pymol 2.2.0平台进行分子对接分析,预测活性化合物与关键靶点的亲和力。五指毛桃汤PPI关系图涉及7味中药、155个活性成分和749个靶基因。五指毛桃汤作用于COVID-19的核心靶点基因为信号转导和转录激活因子1(STAT1)、原癌基因酪氨酸蛋白激酶Src(SRC)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)、AKT丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)和丝裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)。GO功能分析富集到5023条生物过程、462条细胞组成、738条分子过程;KEGG通路分析富集到173条信号通路。分子对接验证显示,活性成分槲皮素、山奈酚、环桑色烯与SRC、MAPK1、MAPK3、AKT1、STAT1等靶点基因显示出良好的结合力;环桑色烯与SARS-CoV-23Clike蛋白具有良好的结合力。五指毛桃汤关键活性成分槲皮素、山奈酚、异鼠李素等可能通过作用SRC、MAPK1、STAT3、MAPK3、AKT1、STAT1等核心靶点及SARS-CoV-23Clike蛋白,调控T细胞受体信号通路和IL-17信号通路等免疫途径,抑制病毒感染,发挥预防COVID-19的作用。

关键词： 网络药理学   Akt信号通路   黑枸杞   MTT实验   结直肠癌   PI3K   TP53   抗癌活性  

摘要： 目的:利用网络药理学预测和体外实验验证,探讨枸杞子提取物的抗癌活性及作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取枸杞子的活性成分以及对应的靶点;通过TTD数据库、Gene Card数据库和DisGeNET数据库筛选结直肠癌的治疗靶点;采用Venny2.1在线工具获取枸杞子与结直肠癌的共同靶点,并用STRING数据库进行PPI (Protein-Protein Interaction)网络分析;借助Metascape网站实现基因本体(GO)富集分析和KEGG通路富集分析;采用溶剂法提取,并采用真空冷冻法进行浓缩干燥;利用MTT实验检测枸杞子的抗癌活性。结果:获取枸杞子活性成分35个;潜在的抗癌靶点121个,其中基于PPI分析度值,最有潜力的5个靶点分别是TP53、HSP90AA1、AKT1、MAPK1、RELA;KEGG富集显示枸杞子活性成分主要通过PI3K-Akt信号通路、HIF-1信号通路、松弛素信号通路等发挥作用;MTT实验表明黑枸杞和红枸杞粗提物均具有抗结直肠癌的活性。结论:初步筛选并明确了枸杞子的活性成分及其抗癌活性,为枸杞子的抗癌作用机制研究提供一定的参考。