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关键词： 连理汤   溃疡性结肠炎   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的 基于网络药理学及分子对接技术探讨连理汤治疗溃疡性结肠炎(UC)的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台检索连理汤6味中药的活性化学成分及其作用靶点;通过OMIM?、DrugBank、TTD、DISEASES、GeneCards^(?)等数据库获取UC的相关靶点;对连理汤活性化学成分的作用靶点和UC的相关靶点取交集;使用Cytoscape 3.8.2软件构建连理汤治疗UC的“中药-活性成分-靶点”网络以筛选主要活性化学成分。通过STRING数据库及Cytoscape 3.8.2软件构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点。应用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。使用AutoDock软件对主要活性化学成分和核心靶点进行分子对接。结果 共获得连理汤活性化学成分110个,作用靶点229个,UC相关靶点1 538个,取交集后获得134个连理汤治疗UC的相关靶点。通过构建“中药-活性成分-靶点”获得槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、异鼠李素、芒柄花黄素等11个主要活性化学成分,通过构建PPI网络筛选出丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素(IL)-6、肿瘤抑癌蛋白p53(TP53)、IL-1B、原癌基因C-Jun(JUN)等10个核心靶点。GO功能富集分析结果显示,交集靶点涉及的生物过程主要与凋亡过程、炎症反应、信号转导等有关,涉及的细胞组分与细胞核、胞质溶胶、蛋白质复合物、核质等有关;涉及的分子功能与酶结合、转录因子结合、蛋白质结合、细胞因子活性等有关。KEGG通路富集分析结果显示,交集靶点主要富集在TNF信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶/AKT信号通路、缺氧信号因子1信号通路、Toll样受体信号通路等。分子对接结果表明,槲皮素、山柰酚、异鼠李素、芒柄花黄素、β-谷甾醇等与核心靶点AKT1、TNF、IL-6、TP53、IL-1B、JUN等表现出较强的亲和力。结论 连理汤治疗UC具有多成分、多靶点、多通路协同作用的特点,连理汤的多个主要活性化学成分可能通过AKT1、TNF、IL-6、TP53、IL-1B、JUN等多个靶点作用于多个信号通路来发挥抗炎、免疫调节、维持肠黏膜免疫屏障、调节肠道菌群等作用,从而达到治疗UC的目的。

关键词： 药桑总黄酮   肝癌   网络药理学   分子对接技术  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探讨药桑总黄酮治疗肝癌的作用机制。方法通过中国知网、万方数据知识服务平台、维普中文期刊服务平台、PubMed以及SwissADME等数据库预测并筛选药桑总黄酮活性成分及靶点信息。通过在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)和GeneCards数据库获取肝癌疾病靶点及药桑有效黄酮类成分与肝癌的交集基因,将交集基因导入STRING数据库后构建蛋白质相互作用(PPI)网络,通过Cytoscape 3.9.1软件预测核心蛋白并构建“药物-药效成分-靶点”网络图。通过Metascape数据库和微生信对作用靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。运用AutoDockTools软件将核心成分与关键靶点进行分子对接。结果药桑有效黄酮类成分共21种,基于主要活性成分筛选获得293个靶点,肝癌疾病靶点8949个,取交集获得270个靶点,其中关键靶点为非受体酪氨酸激酶SRC、磷脂酰肌醇-3激酶调节亚基1(PIK3R1)、磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶催化亚基α(PIK3CA)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、蛋白激酶B(AKT)、淋巴细胞特异性蛋白酪氨酸激酶(LCK)、表皮生长因子受体(EGFR)、Janus激酶2(JAK2)、细胞周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、蛋白酪氨酸激酶2(PTK2)。飞燕草色素、木犀草素、山奈酚可能是药桑总黄酮治疗肝癌的关键成分。GO功能富集分析显示,交集基因主要参与蛋白质磷酸化、细胞对各物质的反应、酶活性、酶结合、蛋白质结合等。KEGG通路富集分析显示,磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)/AKT、Ras、erb-b2受体酪氨酸激酶(ERBB)、细胞衰老等信号通路可能是药桑总黄酮治疗肝癌的重要信号通路。结论药桑总黄酮治疗肝癌的核心靶点是SRC、PIK3R1、PIK3CA、HSP90AA1、AKT等,药桑总黄酮可能通过多靶点、多成分、多途径治疗肝癌。

关键词： 多花黄精   炎性疲劳   LC-MS   网络药理学   RAW264.7  

摘要： 目的基于LC-MS分析与网络药理学评估多花黄精缓解炎性疲劳(Inflammatory fatigue)的有效成分与活性机制。方法通过LC-MS获得多花黄精成分信息,收集成分作用靶点信息;对比炎性疲劳的基因靶点后获取共有靶点作为多花黄精作用靶点;进行共有基因靶点GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,最后采用促炎细胞模型验证多花黄精抗炎活性。结果LC-MS共检测到62个多花黄精化学成分,发现成分与疾病的共有靶点208个。网络药理学分析提示:N-顺阿魏酰酪胺、β-谷甾醇、11 E-十八碳二烯酸、β-D-葡萄糖醛酸和甘草素为多花黄精抗炎性疲劳重要起效成分,STAT3、MAPK3、AKT1、JUN、TP53、EGFR、CASP3、IL6可能为其关键作用靶点,而5-羟色胺能突触、钙信号通路、JAK-STAT信号和NF-κB通路是其主要的生物途径。细胞实验研究表明多花黄精具有显著的抑制LPS诱导的巨噬细胞分泌炎症因子作用,表明多花黄精具有一定的抗炎活性。结论多花黄精中较多的小分子成分可通过多种生物途径,作用于多个生物靶点改善机体炎性相关疲劳。

关键词： 马齿苋   变应性接触性皮炎   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的马齿苋具有抗变应性接触性皮炎的作用,但其作用机制尚不明确,本文基于网络药理学和分子对接探讨马齿苋抗变应性接触性皮炎的作用机制。方法通过TCMSP数据库,筛选出马齿苋的活性成分及靶点,在GeneCards数据库中获取疾病相关靶点,通过Venny 2.1在线平台获得马齿苋与疾病的交集靶点,再利用Cytoscape软件构建药物-活性化合物-靶点-疾病网络,通过String数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络,利用Metascape数据库对交集靶点进行富集分析,最后选取关键靶点对关键成分进行分子对接验证。结果研究得到马齿苋活性成分10个,交集基因共有110个,PPI分析得到核心作用靶点有RELA、JUN、TNF等,GO分析富集显示相关生物过程涉及对脂多糖的反应,对细菌起源分子反应等,KEGG富集结果显示马齿苋抗变应性接触性皮炎的主要通路涉及癌症通路、脂质与动脉粥样硬化、TNF等。结论马齿苋抗变应性接触性皮炎具有多成分、多靶点、多通路协同调节的特点,为其后期作用机制研究奠定了基础。

关键词： “五育”融合   药理学   课证融通   乡村医师  

摘要： 乡村医师作为基层老百姓生命健康的守护员,不仅需要获得学历证书,还需要获取国家执业助理(全科)医师资格证书。但乡村医师目前存在工作任务重、人手短缺导致的继续教育到课率低的问题。文章作者从乡村医师的工作岗位特点入手,通过优化重组药理学课程内容,开发药理学课程教学资源、搭建精品课程在线教学平台等实践策略设计“五育”融合的育人活动,提升乡村医师的药理知识水平与用药指导实践技能,积极探索学历证书与执业证书融通的方式,达到课证融通的育人目标,培养出更多符合基层医疗卫生服务岗位需求的医学专业人员。

关键词： 远志   石菖蒲   抑郁症   阿尔茨海默病   网络药理学   异病同治  

摘要： 目的运用网络药理学技术,从分子水平探讨远志-石菖蒲药对异病同治抑郁症和AD的作用机制。方法检索TCMSP、TCMID、ETCM数据库并结合文献分析,获得远志-石菖蒲药对的有效成分;检索GeneCards、TTD、CTD数据库获得抑郁症和AD疾病靶点,通过SwissTargetPrediction平台预测药对有效成分的作用靶点,获得药对与疾病的交集靶点;采用Cytoscape 3.6.1构建远志-石菖蒲药对"成分-共有靶点-疾病"相互作用网络,借助Metascape平台进行GO功能与KEGG通路富集分析,并进行分子对接验证。结果通过检索数据库与文献分析,获得远志-石菖蒲药对78个有效成分,对应41个异病同治靶点,GO功能主要富集于对脂多糖的反应、细胞对氮化合物的反应,KEGG通路主要富集于脂质与动脉粥样硬化、钙信号通路、5-羟色胺能突触和胰岛素抵抗等,核心靶点为PTGS2、ESR2等。分子对接显示,大部分核心成分与核心靶点可形成稳定构象。结论远志-石菖蒲药对异病同治具有多成分、多靶点、多途径的特点,可通过远志皂苷元、1-carbobutoxy-β-carboline、6-hydroxy-1,2,3,7-tetramethoxyxanthone、山柰酚等核心成分,作用于PTGS2等靶点,调控脂质与动脉粥样硬化、钙信号通路、5-羟色胺能突触和胰岛素抵抗通路,发挥异病同治抑郁症和AD的作用。

关键词： 翻转课堂   PDCA循环   药理学   课程中   应用探索  

摘要： 目的探索翻转课堂联合PDCA循环在药理学课程中的应用。方法选取甘肃中医药大学的2019级和2020级药学专业学生作为本次研究对象,并将其分为观察组与对照组,每组42名。对2019级对照组学生采取传统课程教学模式,对2020级观察组学生采取翻转课堂联合PDCA循环课程教学模式。对比两组学生的成绩考核及教学效果。结果课程结束后可见,观察组学生的随堂检测、理论考核成绩及操作考核成绩高于对照组(P<0.05);观察组对教学效果的评价率均显著高于对照组(P<0.05);观察组满意度显著高于对照组(P<0.05)结论翻转课堂联合PDCA循环在药理学课程中的应用效果显著,能明显提高学生的综合成绩及教学效果。

关键词： 类风湿性关节炎   脑卒中   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:以三藤汤的临床疗效为切入点,运用网络药理学和分子对接技术探讨三藤汤降低类风湿性关节炎(RA)并发脑卒中(CVA)发生率的机制。方法:运用TCMSP数据库检索三藤汤中黄芪、淫羊藿、青风藤、鸡血藤、络石藤的活性成分及其靶点,通过GeneCards数据库获取RA和CVA的主要靶点,并将两者靶点基因取交集,得到RA&CVA交集靶点。将药物靶点与疾病交集靶点取交集,得到三藤汤降低RA并发CVA发生率的靶点,利用STRING数据库分析蛋白质-蛋白质相互作用(PPI),构建PPI网络图,运用David数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,使用Cytoscape 3.9.1软件绘制三藤汤药物成分-RA&CVA交集靶点-通路网络图。结果:三藤汤主要活性成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素、黄芪异黄烷苷、芒柄花黄素等,主要靶点为核受体辅激活蛋白2(NCOA2)/原癌基因蛋白质c-akt(AKT1)、环氧化酶2(PTGS2)/环氧化酶1(PTGS1)/AP-1转录因子(JUN)、丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)、诱导型一氧化氮合酶(NOS2)、丝氨酸蛋白酶1(PRSS1)、转录激活蛋白3(STAT3)等,主要涉及癌症的途径、脂质与动脉粥样硬化、流体剪切应力和动脉粥样硬化及糖尿病并发症中的糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)等信号通路。分子对接结果显示,主要靶点NCOA2/AKT1与山柰酚、PTGS2/PTGS1/AR与槲皮素、MAPK14与芒柄花黄素、NOS2与毛蕊异黄酮、PRSS1与木犀草素、STAT3与甘草查尔酮A形成稳定的对接模型。结论:三藤汤中存在槲皮素、山柰酚、木犀草素、黄芪异黄烷苷、芒柄花黄素等活性成分,可能作用于PTGS2、NCOA2、MAPK14、NOS2、PRSS1、STAT3等靶点对RA并发CVA进行干预,其主要机制可能涉及癌症的途径、脂质与动脉粥样硬化、流体剪切应力和动脉粥样硬化、AGE-RAGE等多条信号通路。

关键词： 白薇   丁香   真菌性角膜炎   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:应用网络药理学方法研究白薇(Cynanchum atratum Bge, CA)和丁香(Syzygium aromaticum, SA)对治疗真菌性角膜炎(Fungal keratitis)的有效成分及其治疗机制。方法:通过中医药系统药理与分析平台(TCMSP)和BATMAN-TEM数据库收集CA/SA的主要有效成分和潜在靶点,应用GEO、OMIM、CTD、GenCLiP 3、DisGeNET、Malacards和Genecards数据库检索FK的治疗靶点。通过String和Cytoscape 3.7.2构建蛋白质–蛋白质相互作用(protein-protein interaction)网络,从而研究CA/SA潜在靶点与FK靶点之间的相互作用。此外,使用R软件、David和WebGestalt分析了基因本体论(Gene Ontology)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of Genes and Genomes)丰富信号通路。结果:共搜索到71个已分离鉴定的白薇化学成分及434个丁香化学成分,角膜炎相关靶点2031个,白薇和丁香治疗真菌性角膜炎的潜在靶点135个,包含20个直接作用靶点。构建出“成分–靶点–疾病”网络后发现白薇和丁香对治疗真菌性角膜炎与32个靶基因密切相关,GO功能富集分析与KEGG通路富集分析结果显示白薇和丁香对治疗真菌性角膜炎可能涉及的GO功能134个,信号通路主要包括肿瘤坏死因子信号通路、IL-17通路、Toll受体信号通路、Th17细胞分化通路、HIF-1信号通路等,绘制“CA/SA关键靶点–主要通路–FK”可视化网络图,显示出白薇、丁香和真菌性角膜炎与77个共同关键靶点、20条关键靶点作用的通路密切相关。结论:本研究预测了白薇和丁香的活性成分及潜在靶点,对于白薇和丁香对真菌性角膜炎的潜在作用及机制进行了初步探索,为阐明白薇和丁香对真菌性角膜炎的机制提供了科学依据和参考。

关键词： 淤胆型肝炎   赤茵合剂   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:根据网络药理学及分子对接技术探讨赤茵合剂治疗淤胆型肝炎的作用机制。方法:通过TCMSP平台获得赤茵合剂有效成分及对应靶点,利用GeneCards及OMIM数据库获得淤胆型肝炎的疾病靶点,根据STRING数据库及Cytospace 3.0.1软件构建有效成分-疾病交集靶点蛋白质相互作用网络,DAVID数据库进行GO功能及KEGG通路富集分析,运用TCMSP、PubChem、UniProt、PDB平台及Chem 3D软件获得受体、配体3D结构,利用AutoDock Vina及PyMoL软件对其进行分子对接及可视化分析。结果:赤茵合剂靶点365个,淤胆型肝炎靶点255个,两者交集靶点18个。GO功能分析发现其作用机制可能与外源性刺激反应、基因表达正调控、相同蛋白结合等31种生物过程,细胞外空间、质膜、质膜的组成部分等17种细胞组分,蛋白结合、相同蛋白结合、酶结合等38种分子功能密切相关。KEGG通路富集分析发现其与NF-κB信号通路、Toll样受体信号通路、PI3K/Akt信号通路联系紧密。分子对接显示RAF1可能是赤茵合剂治疗淤胆型肝炎的重要靶点。结论:中药复方具有多成分、多靶点、多途径的治疗作用,赤茵合剂可能通过抗炎、抗氧化等机制治疗淤胆型肝炎。