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关键词： 蠲痹强骨方   网络药理学   类风湿关节炎   血管翳   FGFR1  

摘要： 基于网络药理学和细胞功能实验研究国医大师经验方蠲痹强骨方(JBQGF)治疗类风湿关节炎(RA)的潜在分子作用机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药百科全书数据库(ETCM)等获取JBQGF的主要活性成分和作用靶点,对核心靶点进行功能富集分析以及信号通路分析,采用Cytoscape 3.6.0构建JBQGF的“活性成分-靶点-信号通路”的可视化网络。通过筛选获得JBQGF潜在作用通路9条,主要包括G蛋白偶联受体信号通路、酪氨酸激酶受体的信号传导通路等。结合课题组前期通过单细胞测序发现FGFR1信号通路在RA活动期滑膜成纤维细胞(fibroblast-like synoviocytes,FLS)中高度活化,通过细胞及动物实验证实抑制成纤维细胞生长因子受体1(fibroblast growth factor receptor 1,FGFR1)信号通路可以明显减轻CIA大鼠关节炎症及关节破坏。随后聚焦于酪氨酸激酶受体信号传导通路,对其进一步靶基因分析发现FGFR1可能是JBQGF治疗RA的潜在靶点。通过Western blot实验、Transwell侵袭实验以及血管翳骨片侵蚀实验初步验证了JBQGF抑制FGFR1的磷酸化而发挥生物学效应,进而抑制基质金属蛋白酶2(matrix metalloproteinase 2,MMP2)和NF-κB配体受体激活因子(receptor activator of nuclear factor-κB ligand,RANKL)从而抑制RA成纤维细胞的侵袭,抑制血管翳的骨片侵蚀效应,为进一步通过网络药理学方法寻找治疗RA潜在的靶点和中医药治疗药物提供了思路。

关键词： 网络药理学   口腔鳞状细胞癌   黄芪   蛋白质-蛋白质相互作用网络   分子对接  

摘要： 目的:通过网络药理学理论及分子对接探究黄芪治疗口腔鳞状细胞癌(Oral Squamous Cell Carcinoma,OSCC)的可能机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)下载黄芪的有效成分及对应靶点,并通过癌症基因组图谱获取OSCC的差异表达基因集,筛选出的共同靶点即为黄芪治疗OSCC的潜在靶点。利用STRING数据库获取潜在靶点的相互作用关系,用Cytoscape软件构建黄芪治疗OSCC的潜在靶点相互作用网络图,并获得关键靶点。通过注释可视化和集成发现数据库(DAVID)和KOBAS数据库分别对潜在靶点进行基因本体论功能和京都基因与基因组百科全书通路富集分析并构建“靶点-信号通路”网络图。借助Schrodinger软件对关键靶点及相应的黄芪有效成分进行分子对接。结果:黄芪可通过66个潜在靶点治疗OSCC,包括周期蛋白依赖激酶1(Cyclin Dependent Kinase 1,CDK1)、信号转导和转录活化因子1(Signal Transducer and Activator of Transcription 1,STAT1)、雄激素受体蛋白(Androgen Receptor,AR)、表皮生长因子受体(Epidermal Growth Factor Receptor,EGFR)和微囊蛋白1(Caveolin-1,CAV1)。黄芪治疗OSCC的潜在靶点富集最显著的是肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)信号通路、细胞衰老和p53信号通路。关键靶点AR和黄芪相关有效成分均有良好的结合活性。结论:研究证明了黄芪治疗OSCC的多组分、多靶点和多通路特征,并为黄芪治疗OSCC的深入验证及黄芪在临床的合理应用提供科学依据。

关键词： 复杂疾病   关键病理生理学过程   网络药理学分析   新思路   阿尔兹海默病  

摘要： 近年来网络药理学(NP)领域发展迅猛,但存在缺陷的、套路化的工作流程严重影响了NP分析结果的科学性与可靠性。对于由环境与遗传因素共同导致的复杂疾病,对症治疗或靶向单一病理生理学过程的药物并不能阻止或者延缓病情的进展,因而药物研发失败或退出市场。因此,迫切需要发展结合多个病理生理学过程的NP分析新思路。关键病理生理学过程是疾病的发生发展和转归过程中重要的、成套的病理变化,代表了目前对疾病本质全面的、深刻的认识。为提高NP研究质量、促进NP领域健康发展,该文提出了基于关键病理生理学过程的NP分析的新思路。该方法基于长期中医临床实践与疾病的关键病理生理学过程,从关键病理生理学过程的角度全面解析中药复方药理学机制及活性成分,增加了分析结果的科学性、可靠性与可重复性。本文以阿尔兹海默病(AD)为例阐述了该方法的必要性、可行性、主要工作流程与优缺点等,有望筛选阻止或逆转疾病病程的疾病修饰药物、促进研究成果的临床转化等。

关键词： 特发性肺纤维化   生物信息学   网络药理学   miRNA预测   麦门冬汤  

摘要： 目的:通过生物信息学与网络药理学方法探求麦门冬汤治疗特发性肺纤维化(idiopathic pulmonary fibrosis,IPF)的微小RNA和相关作用机制。方法:通过在线数据库查检麦门冬汤的有效活性成分及其相关靶基因与IPF的疾病靶点,GEO数据库下载GSE53845基因芯片,筛选GSE53845与疾病共同表达的基因。取药物和疾病交集靶点上传至miRNA在线数据库预测关键基因靶点相关微小RNA,运用DAVID数据库对关键靶基因进行GO和KEGG分析,采用iGEMDOCK进行分子对接分析,结合相关文献分析麦门冬汤防治IPF的作用机制。结果:麦门冬汤共含有502个活性化合物及1039个预测靶点;43个共同表达的IPF疾病基因靶点;关键靶点MMP3与化合物β-胡萝卜素结合性能最佳。结论:麦门冬汤主要通过miR-29家族、let-7家族、miR-26a-5p等微小RNA调节靶基因,干预IPF进程;主要作用于胶原分解过程、细胞外基质组织、细胞外基质分解等生物学过程;参与NF-κB信号通路、ECM-受体相互作用、TNF信号通路等关键信号通路。

关键词： 荔枝核提取物   非酒精性脂肪性肝病   网络药理学   DIO   小鼠  

摘要： 目的:运用网络药理学的方法,研究荔枝核提取物(Lychee kernel extract,LKE)干预非酒精性脂肪性肝病(Nonalcoholic fatty liver disease,NAFLD)的作用及分析潜在机制。方法:通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取荔枝核的成分和作用靶点,通过疾病靶点数据Genecard获取NAFLD的疾病靶点,然后取交集,通过Cytoscape获取通路-靶点互作网络图,利用微生信网站进行GO生物过程分析和KEGG通路富集分析。建立饮食诱导的肥胖(diet-induced obsisity,DIO)小鼠NAFLD动物模型并用LKE灌胃给药。HE染色观察肝脏脂质变化;试剂盒检测TG、TC、ALT、AST含量。结果:获得荔枝核潜在活性成分18个,与NAFLD疾病交集靶点52个,关键靶点为INS、TNF、HSP90AA1,通过KEGG通路富集筛选得到信号通路20条,主要为癌症通路(pathways in cancer)、动脉粥样硬化通路(Fluid shear stress and atherosclerosis)、糖尿病并发症的信号通路(AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications);模型组小鼠肝脏病变严重,给药组小鼠肝脏病变相对于模型组明显减轻,给药组小鼠血清转氨酶也明显降低,接近正常组,给药组血脂代谢也趋于正常组,且差异均具有显著性(P<0.05)。结论:荔枝核可能通过作用于INS、TNF、HSP90AA1等靶点,调节脂质和动脉粥样硬化通路等起到治疗NAFLD的作用。

关键词： 巴蜀颗粒   新型冠状病毒肺炎   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的研究巴蜀颗粒抑制新型冠状病毒肺炎的潜在活性成分及作用机制。方法通过TCMSP和GeneCard等数据库对巴蜀颗粒中药材成分和靶点,新冠肺炎治疗相关靶点进行搜集;采用Cytoscape软件和String数据库对成分和靶点进行构建互作网络;对得到的核心靶点进行富集分析;用分子对接技术对3个核心成分与ACE2、3Clpro和PLpro进行分子对接;用巨噬细胞炎症模型实验对网络药理学分析结果进行验证。结果巴蜀颗粒-成分-靶点-疾病网络中包含101个成分,66个靶点;其中核心成分3个,核心靶点14个。GO富集分析得出2140个生理途径,其中2041个在生物过程上。KEGG富集得到148条相关信号通路。分子对接发现槲皮素、山奈酚、木犀草素等成分与3CLpro,ACE2,PLpro的结合能均低于-7.0 kcal/mol。验证实验结果表明,巴蜀颗粒可以降低LPS刺激所引起的iNOS蛋白增多和p65蛋白的磷酸化,且p-p65蛋白呈剂量依赖性降低。结论巴蜀颗粒主要通过槲皮素、山奈酚和木犀草素等黄酮类成分与ACE2、3Clpro和PLpro蛋白酶结合,抑制肺部炎症,发挥对新冠病毒肺炎起到防治作用。

关键词： 青蒿   脓毒症   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:应用网络药理学方法预测青蒿抗脓毒症的活性成分和作用机制。方法:首先利用TCMSP数据库获取青蒿的活性成分;基于PubChem数据库及SwissTargetPrediction数据库预测活性成分靶点;利用GeneCards数据库获取脓毒症基因,将基因映射到活性成分靶点,得到青蒿抗脓毒症的靶点;使用String数据库构建蛋白互作关系网络(PPI);使用Cytoscape软件构建“青蒿–活性成分–交集靶点”网络图;DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;通过分子对接检验核心成分与核心靶点的结合活性。结果:青蒿治疗脓毒症的主要活性成分主要有双氢青蒿素、槲皮素、木樨草素等,获得88个交集靶点,包括SRC、MAPK3、AKT1、MAPK1、EGFR、HSP90AA1、RHOA、MMP9、MAPK14、APP、F2、ADRBK1,这12个靶向基因可能在疾病治疗中起关键作用。获得GO富集条目共544个和KEGG富集通路146条,主要与脂质与动脉粥样硬化、内分泌阻力、肺结核、弓形体病、癌症的途径、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性等通路有关。分子对接结果表明青蒿的主要活性成分对核心靶点具备良好的亲和力,在治疗脓毒症中发挥核心作用。结论:初步研究了青蒿治疗脓毒症的作用机制,青蒿具有多成分、多靶点的特点,可以通过多个靶点、多条通路来发挥治疗脓毒症的作用。

关键词： 药理学   课程思政   教育教学  

摘要： 药理学是医学生的必学课程,现阶段,仅仅传授给学生书本上的知识是不够的,教师在开展教学实践活动时还应充分融合思政教育的内容,坚持“三全育人”的思想。本文基于药理学课程实施课程思政的必要性,分析药理学教学中课程思政元素的提炼与有机融入,包括爱国情怀、社会责任、法治观念、科学素养以及团队合作,最后确定药理学教学中开展思政教育的具体方法,例如结合在线教育并引入评价机制、提高职业道德修养、构建课程思政教学大纲的顶层设计与思政教育与课程教学的全面融合等,从而为药理学课程思政的实施提供借鉴与参考。

关键词： 民国时期   中药药理学   研究历程   优势与不足  

摘要： 文章回顾了民国时期中药药理学的形成与发展过程,分析了其特点、优势、不足和启示。将民国时期中药药理学的研究历程分为三个阶段:第一阶段为1924~1932年(借鉴起步期),以协和医学院为代表,对麻黄、延胡索等中药进行了药理学的探索;第二阶段为1933~1937年(成长壮大期),以国立北平研究院为代表,对防己、贝母、党参等数十种中药进行了系统研究,更加注重与传统中药功效的结合;第三阶段为1938~1949年(艰难挣扎期),受战乱影响,研究成果大幅下降,但仍有常山、仙鹤草等抗疟、止血药物的突出研究成果。民国时期中药药理学已经形成了较为规范的研究方法模式,并培养了一批优秀的科技人才,虽然也存在不足之处,但也为建国后该学科的建设打下了良好基础。

关键词： 麻杏止哮颗粒   哮喘   UPLC-Q-TOF-MS/MS   网络药理学   槲皮素   异鼠李素   汉黄芩素   柚皮素   儿茶素  

摘要： 目的基于UPLC-Q-TOF-MS/MS技术和网络药理学探讨麻杏止哮颗粒治疗哮喘的有效成分和作用机制。方法通过UPLC-Q-TOF-MS/MS技术及中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选麻杏止哮颗粒的活性成分和相关靶点;利用Disgenet、Genecards数据库检索哮喘疾病靶点,利用韦恩图绘制平台获取共有靶点,并将信息导入Cytoscope3.9.1软件和STRING在线分析平台,进行网络拓扑学分析,构建药物关键活性成分-关键靶点网络和药物-有效成分-核心靶点网络;基于核心靶点通过DAVID数据库进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。结果结合质谱分析与数据库筛选得到药物活性成分24个,药物靶点147个,疾病靶点1483个,共同靶点106个,关键活性成分23个;经蛋白质相互作用分析及网络拓扑分析后,获取核心靶点10个,分别是肿瘤坏死因子、白细胞介素-6、细胞肿瘤抗原p53、白细胞介素-1β、血管内皮生长因子A、表皮生长因子受体、分裂原活化蛋白激酶3、半胱氨酸蛋白酶3、基质金属蛋白酶9、纤连蛋白1,药物有效成分5个,包括槲皮素、异鼠李素、汉黄芩素、柚皮素、儿茶素;GO富集到基因功能69个,KEGG富集到基因通路70条,分析结果表明,麻杏止哮颗粒治疗哮喘的作用机制是通过调节晚期糖基化终末化产物-晚期糖基化终末产物受体信号通路在糖尿病并发症中的作用、分裂原活化蛋白激酶信号通路、白细胞介素-17信号通路、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B信号通路、人类巨细胞病毒感染通路等来发挥治疗哮喘的作用。结论初步揭示了麻杏止哮颗粒治疗哮喘的有效成分和作用机制,为麻杏止哮颗粒药效物质基础研究奠定基础,为质量控制提供参考依据。