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关键词： 补血益母丸   中药   产后腹痛   网络药理学   靶点  

摘要： 本研究通过网络药理学和实验验证,探讨补血益母丸治疗产后腹痛的分子机制。通过TCMSP、SymMap、BATMAN-TCM和《中华人民共和国药典》筛选出补血益母丸的主要活性成分;采用GeneGards数据库获得产后腹痛相关疾病靶点;采用Cytoscape3.9.1软件和String数据库构建蛋白相互作用网络;通过DAVID6.8数据库对GO和KEGG信号通路进行分析;对分析结果构建“化合物-靶点”网络,采用动物实验验证网络核心靶点,采用免疫组化检测不完全流产模型大鼠相关蛋白的表达水平。网络学分析结果表明,补血益母丸中的40种潜在活性成分可能影响ESR1、PGR、MMP2等40个相关靶点,并调节HIF-1、TNF、雌激素等信号通路。免疫组化结果显示,模型大鼠ERα、PR、MMP2蛋白表达水平均显著升高(P<0.01)。给予补血益母丸后,PR表达水平升高(P<0.01),ERα和MMP2表达水平显著降低(P<0.05或P<0.01)。补血益母丸可通过多成分、多靶点、多途径治疗产后腹痛,可通过调节雌孕激素受体,改善胶原代谢,从而促进产后子宫恢复。

关键词： 苎麻根   糖尿病出血   网络药理学   靶点  

摘要： 目的:通过网络药理学预测苎麻根治疗糖尿病出血潜在靶点的作用机制。方法:通过中药系统药理数据库和分析平台、GeneCards、TTD、OMIM等数据库获取苎麻根有效成分和已报道与糖尿病出血有关的靶标蛋白;利用Uniport数据库筛选获得相关基因靶点;将药物与疾病的靶点基因通过Venny软件获取映射基因;通过Metascape数据库进行GO和KEGG富集分析;最后利用Cytoscape 3.10.1软件将其可视化,构建“苎麻根有效成分-核心靶点蛋白-代谢通路”网络图,并分析互作关系。结果:通过筛选,获取苎麻根有效成分27个,相关潜在靶点177个,其中与调控糖尿病出血相关的靶点共23个;通过PPI网络并筛选的得到5个关键靶点,这些靶点主要涉及Pathway in cancer、Nitrogen metabolism等63条生物学通路。结论:苎麻根治疗糖尿病出血存在多成分、多靶点、多通路协同作用,为苎麻根进一步治疗糖尿病出血的研究提供理论基础和新思路。

关键词： 鼻渊   过敏性鼻炎   慢性鼻窦炎   鼻灵散   网络药理学   中成药疗法  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接的方法探究鼻灵散治疗慢性鼻炎(CRS)的药理作用机制。方法借助TCMSP数据库筛选得到鼻灵散方中的活性成分及其对应靶点,通过Genecards、OMIM、DRUGBANK数据库筛选获取鼻炎治疗靶点。结果鼻灵散治疗鼻炎的核心活性成分包括槲皮素、山奈酚、木犀草素、豆甾醇等,相关核心靶点有PTGS2、NOS2、GABRA2等,分子对接验证亦显示大部分活性成分与核心靶点的结合活性较好。KEGG富集分析显示涉及的生物学通路主要是IL-17和TNF信号通路。结论鼻灵散以各种成分通过调控靶点PTGS2、NOS2、GABRA2,有可能是作用于IL-17和TNF信号通路,收缩鼻腔,减轻炎症反应,从而起到治疗鼻炎的作用。

关键词： 培补清利方   网络药理学   多囊卵巢综合征   作用机制  

摘要： 目的 通过网络药理学方法探讨培补清利方治疗多囊卵巢综合征(polycystic ovarian syndrome, PCOS)的作用机制。方法 利用TCMSP挖掘培补清利方相关信息。在GeneCards、OMIM数据库收集疾病靶基因。通过STRING数据库构建共同基因的PPI网络。通过ClueGO插件进行GO富集及KEGG通路分析。利用分子对接验证关键靶点。通过动物实验观察大鼠卵巢形态学及血清大鼠肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素-6(IL-6)浓度。结果 通过网络数据库共筛选出102个药物靶点蛋白及3532个疾病基因,获得68个共同靶基因。GO功能富集获得444条生物学功能条目。KEGG得到115条富集显著的通路。分子对接结果示AKT1、MAPK3与各个成分具有较强的亲和力。动物实验表明与模型组比较,治疗组大鼠卵巢功能得到改善,TNF-a、IL-6浓度降低(P<0.05)。结论 培补清利方治疗PCOS具有多成分、多靶点、多通路的特点。培补清利方治疗PCOS过程涉及与炎症相关等潜在的多个信号通路,为后续的进一步作用机制研究提供重要参考。

关键词： 数据挖掘   关联规则   网络药理学   眩晕  

摘要： 目的:基于数据挖掘技术探讨中药处方治疗眩晕用药规律,并挖掘出其常用药对,最后借助网络药理学技术探讨常用药对治疗眩晕的作用机制。方法:以“中国知网”为数据源,以“眩晕”为主题词,搜索2010年1月―2021年2月治疗眩晕的所有相关中药处方,将其录入Excel 2010,并建立中药处方治疗眩晕的数据库,使用IBM SPSS Modeler 18.0中Apriori算法构建药物相关的关联模型,进一步挖掘涉及的配伍规律,并利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、STRING、Metascape数据库及Cytoscape 3.8.0软件分析常用药对与疾病之间的作用关系以及通路。结果:搜索出符合要求的文献1 843篇,共涉及521味中药,其中白术-茯苓为支持度最高的药对,共有22个目标化合物,去重后共得到32个靶基因,检索出的眩晕靶点基因去重后为1 278个,二者相关靶基因映射结果为16,通过Cytoscape 3.8.0软件得出春藤皂苷元、前列腺素内过氧化物合酶2(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase 2,PTGS2)等在白术-茯苓治疗眩晕中的重要意义;富集分析结果显示白术-茯苓治疗眩晕的机制与血压调节、化学性突触传递、膜电位的调节、膜筏、突触膜、淀粉样蛋白-β结合、神经递质受体活性等生物功能密切相关,通过对神经活性配体-受体相互作用、钙信号传导通路、雌激素信号相关通路等多条通路的调控来治疗眩晕。结论:分析得出白术-茯苓相配伍治疗眩晕的重要性及其作用机制,为眩晕的中医药治疗开拓了思路。

关键词： 心肌梗死   网络药理   丹灯通脑胶囊  

摘要： 目的:基于网络药理学的方法,分析丹灯通脑胶囊对于治疗心肌梗死的作用机制。方法:借助TCMSP、Pubchem、Swiss Target Prediction等数据库及参考文献获取丹灯通脑胶囊的有效成分及靶标。通过TTD、OMIM、GenCards数据库检索心肌梗死疾病相关的靶标,并借助STRING数据库构建靶蛋白相互作用网络(PPI),获得关键靶标。使用Cytoscape 3.9.1软件对“药物-有效成分-靶点-疾病”网络图进行可视化分析,使用DAVID数据库对关键靶点进行GO和KEGG通路富集分析。结果:从丹灯通脑软胶囊中共筛选出90个有效成分,1283个与心肌梗死相关的作用靶点,其中有效成分与疾病的交集靶点204个,其中包含非受体酪氨酸激酶(SRC)、信号转导和转录激活因子3(STAT3)、促分裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(PIK3CA)、蛋白激酶(AKT1)等。经GO和KEGG通路富集分析得出涉及的信号通路主要有P13-Akt信号通路、AGE-RAGE信号通路、Rap1信号通路、钙信号通路等。结论:通过建立靶点网络图,分析得到丹灯通脑软胶囊可通过调节SRC、STAT3、MAPK1、PIK3CA、AKT1等关键靶点治疗心肌梗死,其过程可能与PI3-Akt、AGE-RAGE等信号通路等有关,可进一步为深入研究丹灯通脑软胶囊治疗心肌梗死相关疾病机制提供理论依据。

关键词： 凉膈散   急性胰腺炎   肺损伤   网络药理学   分子对接   PTGS2   HO-1   P53   caspase-3  

摘要： 目的基于网络药理学探究凉膈散对急性胰腺炎肺损伤(AP-ALI)大鼠的保护作用。方法利用TCMSP、TCMID、GeneCards、DisGeNET及STRING数据库建立药物与疾病的靶点网络,使用Cytoscape筛选靶点,借助GO和KEGG富集分析阐释生物学机制,使用Autodock Vina 1.1.2和PyMOL计算并可视化成分和靶标的结合情况。大鼠随机分为对照组、模型组和凉膈散组,除对照组外,其余组大鼠经胰胆管逆行注射5%牛磺胆酸钠(50 mg/kg)制备AP-ALI模型,凉膈散组于造模后2、12 h灌胃给予10 g/kg凉膈散。造模后24 h收集血浆、血清和胰腺、肺组织,测定肺组织湿/干重比,血浆PaO_(2)和PaCO_(2)值,血清淀粉酶活性和炎症因子TNF-α、IL-6水平,肺组织MDA、GSH水平和MPO活性,HE染色观察胰腺和肺组织病理损伤,TUNEL染色检测肺组织细胞凋亡情况,Western blot法检测肺组织PTGS2、cleaved caspase-3、HO-1、P53蛋白表达。结果网络药理学分析筛得凉膈散活性成分155个,靶点网络确定了41个关键靶点(TNF、IL6、MMP9、HO-1、PTGS2、P53、STAT3、MAPK8、CASP3、FOS等),涉及TNF、MAPK、HIF-1、TLRs和癌症等信号通路。动物实验表明,与对照组比较,模型组大鼠肺组织湿/干重比、血浆PaCO_(2)值、血清淀粉酶活性和TNF-α、IL-6水平、肺组织MDA水平和MPO活性、肺组织细胞凋亡率及PTGS2、cleaved caspase-3、HO-1、P53蛋白表达均升高(P<0.05,P<0.01),血浆PaO_(2)值、血清GSH水平均降低(P<0.01),胰腺、肺组织出现严重病理损伤,病理评分升高(P<0.01);与模型组比较,凉膈散组上述指标均有改善(P<0.05,P<0.01)。结论凉膈散可能通过促进HO-1通路活化缓解AP-ALI的氧化应激损伤,并调控P53/caspase-3通路发挥抗凋亡作用。

关键词： 西洋参   黄芪   2型糖尿病   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:探究西洋参-黄芪治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制。方法:筛选西洋参-黄芪的有效化学成分与作用靶点、T2DM相关靶点,利用Cytoscape 3.7.2构建中药化学成分-靶点相互作用网络图,筛选出西洋参-黄芪作用T2DM的关键成分和核心靶点。通过DAVID数据库分析核心靶点基因功能及信号通路,构建关键化学成分-核心靶点-信号通路网络,并利用Auto Dock4进行分子对接。结果:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及文献检索筛选西洋参-黄芪有效化学成分26种,西洋参9种,黄芪17种,预测靶点184个,与T2DM的靶基因取交集得到靶点162个。中药化学成分-作用靶点相互作用网络共有187个节点,378条连线,筛选出关键成分13种。黄芪关键成分是槲皮素、西洋参关键成分是β-谷甾醇,核心靶点21个与T2DM相关的靶点有PTGS1、PTGS2、NOS2、AR、ERS1、ERS2。核心靶点进行基因本体(GO)富集分析发现西洋参-黄芪主要参与RNA信号转录、唾液分泌、类固醇激素调节等生物过程,京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析结果显示西洋参-黄芪药对与脂肪细胞内脂肪分解调节、cGMP-PKG信号通路、甲状腺激素信号通路关系密切。分子对接结果显示,β-谷甾醇、槲皮素与核心靶点度值前5位的靶点蛋白(PTGS2、NCOA2、PTGS1、PRSS1、RXRA)有较好的结合性。结论:西洋参-黄芪治疗T2DM的作用机制具有多成分、多靶点、多通路的特点。

关键词： 黄芩   糖尿病脑病   阿尔茨海默病   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的采用网络药理学和分子对接技术研究黄芩治疗糖尿病脑病的作用机制。方法通过TCMSP数据库检索黄芩主要活性成分和作用靶点,通过OMIM、GeneCards、TTD及DrugBank等数据库筛选糖尿病和阿尔茨海默病的主要靶点,构建活性成分-靶点网络;利用STRING 11.0进行蛋白质互作分析,构建PPI网络以筛选重要靶点;运用Metascape库对关键交集靶点进行GO和KEGG富集分析;利用Cytoscape 3.7.2将分析得到的重要靶点和通路构建药物成分-疾病靶点-通路网络;进一步对关键活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果筛选出黄芩重要活性成分有汉黄芩素、黄芩素、金合欢素、降穿心莲黄酮等,PPI网络中关键交集靶点61个,核心靶点有AKT1、IL-6、MAPK14、TNF、PRKCA、VEGFA等。GO富集分析得到细胞组成101条,分子功能76条,生物过程1413条;KEGG通路富集分析得到258条,主要涉及AGE-RAGE信号介导的糖尿病并发症通路、IL-17、MAPK、TNF、PI3K-Akt信号通路、胰岛素抵抗通路等。分子对接结果可知,汉黄芩素、金合欢素、黄芩素、红花素、二氢奥洛昔林、黄芩黄酮Ⅱ、5,7,2,5-四羟基-8,6-二甲氧基黄酮、降穿心莲黄酮等活性成分与核心靶点VEGFA、AKT1、TNF、MAPK14、IL-6结合较好。结论黄芩可以通过多成分、多靶点、多通路改善糖尿病脑病。

关键词： 桂枝茯苓丸   子宫内膜异位症   中医药   网络药理学   分子对接  

摘要： 子宫内膜异位症是妇科常见疾病,严重影响患者的心身健康,桂枝茯苓丸是中药复方,对子宫内膜异位症具有积极作用,但桂枝茯苓丸的作用机制尚不清楚。本研究旨在通过网络药理学和分子对接技术揭示桂枝茯苓丸治疗子宫内膜异位症的可能分子机制。首先,在TCMSP平台筛选出桂枝茯苓丸活性成分,利用GeneCards、OMIM、PharmGkb、Disgenet、drugbank、TTD数据库筛选出子宫内膜异位症Endometriosis(EMT)的相关靶点基因,将两者通过R语言、Cytoscapes和STRING进行汇总分析,筛选出中药靶基因与疾病相关基因并构建中药调控网络和PPI网络图,通过R语言进行GO和KEGG富集分析。最后,以核心基因的蛋白受体和所对应的小分子配体进行分子对接。共筛选出桂枝茯苓丸49个成分和189个(去重复后)预测靶点,EMT靶点1115个(去重复后);通过比对桂枝茯苓丸和EMT共同靶点,筛选出80个潜在基因。桂枝茯苓丸与疾病的交集基因的PPI网络包涵1218条边和80个节点,其核心基因有AKT1、TP53、TNF、IL6等。分子对接结果显示桂枝茯苓丸的核心基因与成分有较好的结合能。