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关键词： 阿尔兹海默症   文冠果壳苷   网络药理学   差异表达基因  

摘要： 利用GEO数据挖掘技术、网络药理学和分子对接技术,深入探究文冠果壳苷在治疗阿尔兹海默症中的作用机制。方法 通过Pharmmaper、SEA数据平台获取文冠果壳苷的生物功能作用靶点;通过R软件limma包对GEO平台阿尔兹海默症数据集GSE138260进行差异基因筛选;构建文冠果壳苷作用靶点与疾病相关靶点韦恩图,筛选文冠果壳苷治疗阿尔兹海默症的潜在作用靶点;利用Cytoscape软件及STRING数据库构建“关键靶点-通路”网络图、蛋白相互作用(PPI)网络图;借助R语言对潜在靶点进行GO和KEGG富集分析;利用PyMOL软件对文冠果壳苷与核心靶点间进行分子对接。结果 共获得文冠果壳苷作用靶点228个,阿尔兹海默症基因芯片的差异基因4836个;通过韦恩图得到文冠果壳苷治疗阿尔兹海默症的潜在靶点50个;根据Dgree值大于中位数筛选出10个核心靶点;GO富集分析涉及57个生物过程、17个细胞组分、28个分子功能;KEGG富集分析得到33条相关信号通路;分子对接显示文冠果壳苷与9个核心靶点具有稳定的结合能力。结论 文冠果壳苷主要通过多靶点、多通路对阿尔兹海默症产生治疗效果。

关键词： Seminar教学法   学生授课   药理学进展   双语课程  

摘要： 介绍了创新教学模式“Seminar”教学法和“学生授课”模式的国内外研究现状,明确了2种教学模式能够有效培养学生创新意识和创新能力,激发课堂教学效能的作用;探讨了双语教学对培养具有国际视野和国际竞争力的创新复合型高级人才具有重要意义;通过课堂教学案例,总结了“Seminar”教学法和“学生授课”模式在药学专业硕士研究生双语课程《药理学进展》中的优点。最后提出“Seminar”教学法和“学生授课”模式能有效提升学生综合素质和社会竞争力的观点,为今后药学相关研究生课程的教学模式改革提供了一个很好的借鉴。

关键词： 临床药理学   混合式教学   雨课堂   教学改革  

摘要： 随着互联网技术在高校教学中应用的不断普及,越来越多的高校采用线上线下混合式教学。主要介绍教师结合长江雨课堂智慧教学软件,通过将传统线下课堂教学方式与线上教学方式相结合,对“临床药理学”课程线上线下混合式教学的学生考试成绩和教学满意度与传统线下课堂教学进行比较,从而为新形势下“临床药理学”的教学改革提出全新的思路,达到提高教学质量的目的。

关键词： 栀子豉汤   心肌梗死   网络药理学   分子对接技术   PI3K/Akt信号通路  

摘要： 目的基于网络药理学、分子对接技术及体外细胞实验探究栀子豉汤干预心肌梗死(MI)的潜在分子机制。方法根据TCMSP、SwissTargetPrediction和GeneCards等数据库以及相关文献,筛选栀子豉汤主要成分靶点和心肌梗死相关靶点。利用STRING 11.5数据库和Cytoscape 3.7.2软件构建蛋白互作网络,拓扑分析筛选核心靶点,对其进行GO和KEGG富集分析并构建“药物-成分-靶点-通路”网络。运用AutoDock Vina进行关键成分与核心靶点的分子对接。通过MTT法、DAPI染色法、罗丹明123染色法和蛋白免疫印迹法验证栀子豉汤对H9c2细胞的作用。结果筛选得到栀子豉汤中槲皮素、藏花酸、藏红花素等51种活性成分调控IL10、Akt1、TNF、HIF1A等29个核心靶点,作用机制涉及信号转导过程、刺激反应和蛋白结合等基因功能以及肿瘤坏死因子、AGE-RAGE和PI3K-Akt等信号通路。分子对接显示,栀子豉汤中重要的活性成分槲皮素、青蒿素、黄豆苷和染料木素与Akt1靶点紧密结合。细胞实验证实,栀子豉汤能够恢复H8/R12诱导的H9c2细胞活力,升高线粒体膜电位,改善细胞氧化应激水平,以及调控p-PI3K/PI3K、p-Akt/Akt、Bcl-2和caspase-3蛋白表达。结论通过网络药理学与体外细胞实验验证了栀子豉汤可能通过调控PI3K/Akt信号通路,发挥保护心肌损伤的作用。

关键词： 抽动障碍   网络药理学   钩藤-菊花   炎症  

摘要： 目的:通过网络药理学方法和分子对接技术探讨“钩藤-菊花”药对治疗儿童抽动障碍的潜在作用机制。方法:在TCMSP数据库中检索“钩藤-菊花”药对的有效成分并筛选靶点,利用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-有效成分-靶点网络;从GeneCards、OMIM及DrugBank数据库检索与抽动障碍相关的疾病靶点;使用Venny 2.1.0软件绘制药物-疾病靶点韦恩图,应用STRING平台构建PPI网络;在Metascape网站对关键靶点进行GO功能分析和KEGG通路富集分析;最后通过AutoDock Vina软件进行分子对接。结果:筛选出“钩藤-菊花”药对活性成分50个,作用靶点243个,槲皮素、山奈酚、木犀草素、β-谷甾醇等是药对的关键成分。疾病相关靶点1951个,“钩藤-菊花”药对与抽动障碍交集靶点101个,Akt1、TNF、IL6、IL1B、VEGFA等为“钩藤-菊花”药对治疗抽动障碍的关键靶点。“钩藤-菊花”药对治疗抽动障碍主要参与细胞对氮化合物的反应、氧化应激反应、细胞迁移的活化等生物过程,主要富集在神经活性配体-受体相互作用、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路、IL-17信号通路等。分子对接结果显示度值(degree)较高的5个核心成分与5个核心靶点的结合能均小于-5.0 kcal/mol,说明“钩藤-菊花”药对活性成分与核心靶点具有较好的结合性。结论:“钩藤-菊花”药对治疗抽动障碍具有多成分、多靶点、多通路的作用特点,涉及抑制炎症、抗氧化应激等多方面,为治疗抽动障碍的分子机制研究提供了新的方向。

关键词： 乙型肝炎   护肝宁片   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:通过网络药理学研究护肝宁片治疗乙型肝炎的作用机制。方法:利用TCMSP数据库收集护肝宁片活性成分,构建化合物—靶点图。通过GeneCards和OMIM数据库获取乙型肝炎相关靶点,将护肝宁片活性成分靶点与乙型肝炎疾病靶点取交集,得到关键靶点。通过对共有核心靶点进行蛋白质相互作用分析,分析蛋白相互作用(PPI)中度中心度(DC)、中间性中心性(BC)、紧密性中心性(CC)筛选核心靶基因。选取的护肝宁片主要活性成分与关键靶点进行分子对接。结果:筛选到护肝宁片中木樨草素、槲皮苷、隐丹参酮、丹参酮等81种主要化学成分和198个相关靶点,其中关键靶点有TP53、AKT1、VEGFA、STAT3等。护肝宁片中的活性成分可能通过线粒体、膜筏等细胞组分参与DNA生物合成、细胞凋亡、星形胶质细胞的激活等多种生物学过程,作用通路为乙型肝炎、PI3K-AKT等。分子对接结果显示主要化学成分与核心靶点的结合力均较强,蛋白结晶复合物构象稳定。结论:研究初步表明了护肝宁片通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗乙型肝炎的作用机制。

关键词： 肺癌   国家专利   中药复方   用药规律   网络药理  

摘要： 目的基于数据挖掘、网络药理学和分子对接技术,探索国家专利中治疗肺癌的中药复方的用药规律,及其潜在的物质基础和可能的作用机制。方法在国家知识产权局-专利检索及分析平台检索治疗肺癌的中药复方专利。在纳排处理和数据规范化后,应用古今医案云平台对中药复方进行中药的频次、性味、归经、功效等统计分析,以及聚类分析、关联分析、复杂网络分析等深度挖掘,归纳核心中药。从TCMSP、ETCM下载核心中药的成分和靶点并通过UniProt对靶点进行标准化,从OMIM、GeneCards和Pharmgkb下载肺癌的靶点,在微生信平台取交集靶点后,应用Metascape进行GO、KEGG富集分析,应用STRING和Cytoscape构建PPI网络和中药-成分-靶点-通路-疾病网络并筛选核心成分和核心靶点。应用PDB、PyMOL、AutoDockTools、AutoDock Vina将核心成分与核心靶点分别进行分子对接。结果共纳入485项复方专利,含中药1105味,累计频次7344次,性味主要为苦寒,归经主要为肺;综合数据挖掘的结果,归纳核心中药为黄芪、白花蛇舌草、半枝莲、白术、麦冬、甘草。6味中药共获得177个成分和388个靶点,肺癌获得2788个靶点,交集靶点219个。6味中药治疗肺癌的11个核心成分为腺苷、槲皮素、木犀草素、山奈酚、汉黄芩素、7-O-甲基异微凸剑叶莎醇、柚皮素、黄芩素、芒柄花黄素、异鼠李素,10个核心靶点为MAPK3、MAPK1、AKT1、MAPK14、STAT3、PIK3CA、RELA、TP53、RXRA、MYC、RB1,主要涉及的通路有恶性肿瘤通路、脂质与动脉硬化通路、乙型肝炎通路、PI3K-Akt信号通路、人类巨细胞病毒感染通路、卡波西肉瘤相关的疱疹病毒感染通路、MAPK信号通路等。结论国家中药复方专利治疗肺癌的用药规律与以“益气除痰”为核心的“益气化痰,活血解毒”主要治法基本相符,黄芪、白花蛇舌草、半枝莲、白术、麦冬、甘草可通过多成分、多靶点、多通路发挥对肺癌的治疗作用。

关键词： 补骨脂   肺腺癌   网络药理学   分子对接   β-肾上腺素能受体  

摘要： 目的:运用网络药理学、分子对接、实验验证等手段探讨补骨脂抗肺腺癌的作用和机制。方法:在症状映射数据库(SymMap)、中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMANTCM)、中草药数据库(TCMID)和基因表达谱互动分析平台(GEPIA)中检索补骨脂活性成分、对应靶点及肺腺癌有关的潜在靶点;利用韦恩图获取补骨脂活性成分作用于肺腺癌的靶点,Cystoscape 3.7.2软件构建补骨脂活性成分作用于肺腺癌靶点网络图。采用STRING数据库进行蛋白质-蛋白质相互作用分析;采用注释、可视化和综合发现数据库(DAVID)进行富集分析,Origin 2021软件构建补骨脂“活性成分-靶点-通路”网络关系图。采用AutoDockTools 1.5.6和PyMOL进行分子对接。结果:①筛选获得补骨脂治疗肺腺癌的交集靶点55个,涉及β1-肾上腺素能受体(ADRB1)、β2-肾上腺素能受体(ADRB2)等核心靶点,以及环磷酸鸟苷酸(cGMP)-蛋白激酶G(PKG)和细胞缺氧诱导因子-1(HIF-1)等信号通路。②分子对接结果提示,补骨脂酚与肺腺癌核心治疗靶点ADRB1、ADRB2均有较低的结合能。③实验验证结果证实,补骨脂酚能够抑制肿瘤细胞增殖及肾上腺素能受体亚型ADRB1、ADRB2、α1A-肾上腺素受体(ADRA1A)等基因的表达水平,与网络药理学分析结果相符。结论:补骨脂及其活性成分补骨脂酚可通过干预β-肾上腺素能受体及其信号通路,从而发挥抗肺腺癌的作用。

关键词： 白芍   UPLC-Q-TOF-MS   原发性痛经   分子对接   网络药理学   质量标志物  

摘要： 目的借助UPLC-Q-TOF-MS技术和网络药理学探究白芍治疗原发性痛经的机制,辨识其质量标志物。方法利用UPLC-Q-TOF-MS技术对白芍进行成分分析,借助网络药理学方法收集白芍活性成分和原发性痛经靶点,归纳两者交集靶点,借助DAVID平台对靶点进行GO与KEGG通路富集分析;并将核心成分与核心靶点进行分子对接,依据五原则结合文献预测白芍治疗原发性痛经的质量标志物。结果白芍提取物中鉴定出63个化合物,经筛选得到4个关键活性成分,包括芍药内酯苷、牡丹皮苷I、柚皮素和芍药内酯C,作用于6个核心靶点BCL2L1、HSP90AA1、MMP9、PPARG、VEGFA、STAT3,涉及IL-17、TNF、PI3K/Akt等信号通路。分子对接显示发现这6个核心靶点与4个活性成分有良好的亲和力,基于五原则预测出白芍治疗原发性痛经的候选质量标志物为2个。结论预测出芍药内酯苷和芍药内酯C可作为白芍治疗原发性痛经的候选质量标志物,为进一步提升白芍质量控制奠定依据。

关键词： 白术   挥发油   指纹图谱   网络药理学   质量标志物  

摘要： 建立白术挥发油指纹图谱,并结合网络药理学对白术挥发油质量标志物(Q-Marker)进行初步预测分析。采用气相色谱-质谱联用技术(GC-MS)对白术挥发油进行成分分析,对11批白术饮片挥发性成分进行相似度评价、主成分分析(PCA)和聚类分析(HCA),筛选挥发油中的Q-Marker候选成分;对筛选的Q-Marker候选成分进行靶点搜集和网络药理学分析,构建“成分-靶点-通路”网络,并预测白术挥发油的Q-Marker。结果显示11批白术饮片挥发油的指纹图谱相似度均大于0.990,提示不同产地和批次的白术饮片挥发油成分整体组成上具有一致性;PCA分析显示浙江产区白术分布更集中,HCA分析显示当分类距离为15时,浙江产区的4批白术被聚为一类,这表明道地产区的白术挥发油质量更稳定;根据GC-MS共有成分得到白术挥发油中10个Q-Marker候选成分,网络药理学分析提示这些成分涉及19个关键靶点和66条通路。本研究初步预测棕榈酸、β-桉叶醇、γ-榄香烯、榄香醇和苍术酮是白术挥发油的Q-Marker,为白术的质量控制提供了理论依据,也为其他类似中药材的质量标志物研究提供了理论参考。