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关键词： 高血压   蔓荆子   网络药理学   分子对接   作用机制   信号通路  

摘要： 目的:通过网络药理学和分子对接探讨蔓荆子降压作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)数据库筛选蔓荆子有效成分和作用靶点,利用UniProt数据库将蛋白质名称转换为GeneSymbol;检索基因名片数据库(GeneCards)数据库获取高血压疾病靶点,将蔓荆子和高血压靶点基因取交集后导入STRING平台,得到交集靶点网络数据,借助Cytoscape软件绘制PPI网络图并提取核心网络和关键靶点;运用Metascape对交集靶点进行基因本体(GO)功能分析、京都基因和基因组百科全书(KEGG)富集分析,借助微生信平台绘制气泡图和条形图,运用Cytoscape软件构建“疾病-通路-靶点-成分-药物”网络并进行拓扑分析,最后通过AutoDock进行分子对接验证。结果:蔓荆子降压的潜在核心成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素等,关键靶点包含白细胞介素-6(IL6)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-10(IL10)、小窝蛋白-1(CAV1)、蛋白激酶-1(AKT1)等,KEGG富集分析主要集中在流体剪切应力与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)信号通路、脂质与动脉粥样硬化等通路。分子对接结果显示,蔓荆子主要活性成分与关键靶点具有较好的结合活性。结论:蔓荆子通过多成分、多靶点、多通路干预高血压,推测其作用机制主要是保护血管内皮、舒张血管、抑制炎症反应、抗动脉粥样硬化、调控肾素-血管紧张素-醛固酮系统等。

关键词： 人参-五味子   肝细胞癌   网络药理学   药效物质   作用机制  

摘要： 目的基于“人参-五味子”药对入血成分,运用网络药理学和分子对接技术探讨“人参-五味子”药对治疗肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的潜在药效物质及其作用机制。方法采用液质联用技术分析“人参-五味子”药对入血成分,利用网络药理学和分子对接筛选“人参-五味子”药对治疗HCC的潜在作用靶点、作用通路和潜在活性成分。结果从大鼠血浆中共鉴定了32个“人参-五味子”药对入血成分,网络药理学结果表明五味子丙素、戈米辛S、当归酰基戈米辛H、越南人参皂苷R1、人参皂苷Rf等成分可作用于EGFR、VEGFA、AKT1、STAT3、SRC等核心靶点,调节PI3K-AKT、VEGF等信号通路来治疗HCC。分子对接结果显示这5个成分与核心蛋白有良好的结合性能,可能是潜在药效物质。结论通过构建“成分-靶点-通路”多层次网络整合分析探讨了“人参-五味子”药对治疗HCC的药效物质及作用机制,为其临床应用提供参考。

关键词： 金露梅水提物   斑马鱼   心肌缺血   网络药理学   分子机制  

摘要： 心肌缺血是因为冠状动脉疾病中心肌耗氧量和氧输送间的不协调引起的,由于其高发病率和死亡率,中国死于缺血性心脏病患者的数量逐年递增。为了验证金露梅有效成分具有抗心肌缺血功效,通过前期试验确定最大耐受浓度(maximum tolerance concentration,MTC)为15.63μg/mL,并依据MTC划分高中低剂量组分别为7.81μg/mL(1/2 MTC)、2.60μg/mL(1/6 MTC)、0.868μg/mL(1/18 MTC),阳性药物组为N-乙酰半胱氨酸(125μg/mL)。借助网络药理学及分子对接技术的方法研究金露梅有效成分抑制心肌细胞凋亡,减缓心肌缺血的可能作用机制。结果表明:借助斑马鱼心脏荧光强度表型图发现金露梅水提物与阳性药物组对比具有明显的防治心肌缺血功效,而且其作用机制与Rap1信号通路、癌症通路、癌症中的蛋白巨糖、PI3K-Akt信号通路、脂质和动脉粥样硬化5条通路有关。可见探究金露梅有效成分的抗心肌缺血机制对防治心肌缺血有一定的理论意义。

关键词： 黄柏骨伤散   指纹图谱   网络药理学   跌打损伤   风湿痹痛  

摘要： 目的为黄柏骨伤散的全面质控提供依据,探索黄柏骨伤散的药效成分及作用机制;也为其他中药复方预测Q-Marker提供新的思路。方法采用高效液相色谱(HPLC)法,建立黄柏骨伤散的标准指纹图谱,同时采用网络药理学方法构建黄柏骨伤散中4个关键成分的“成分-靶标-疾病”网络,预测其分子作用机制。结果建立了黄柏骨伤散的指纹图谱,并指认了菊苣酸、小檗碱、黄柏碱和槲皮苷等4个共有峰。网络药理学结果表明黄柏骨伤散中菊苣酸、小檗碱、黄柏碱和槲皮苷等有效成分主要调控TNF、PTGS2、SRC等信号通路发挥跌打损伤、骨折、风湿痹痛、腰肌劳损、腰椎颈椎增生的作用。结论通过指纹图谱结合网络药理学,阐明了黄柏骨伤散治疗跌打损伤、骨折、风湿痹痛、腰肌劳损中10个潜在药效成分和作用机制,为黄柏骨伤散的质量控制提供了潜在的质量标志物以及有效的评价手段。

关键词： 酸枣仁汤   指纹图谱   网络药理学   分子对接   含量测定   质量评价  

摘要： 目的:基于UPLC指纹图谱、网络药理学和定量分析相结合的研究策略,准确评价酸枣仁汤的质量。方法:建立酸枣仁汤指纹图谱,对10批酸枣仁汤进行相似度评价和共有峰鉴定;利用网络药理学方法预测酸枣仁汤药效成分,并采用分子对接进行验证;基于获得的药效物质建立酸枣仁汤的含量测定方法,用于评价酸枣仁汤的质量。结果:通过指纹图谱分析,共得到酸枣仁汤32个共有峰,其中22种化学成分得到鉴定;通过网络药理学构建了“中药-活性成分-靶点-疾病”网络图,基于成分可测性和对照品的可获得性,选择贡献度较高的11种化合物作为药效关联物质,分子对接验证表明其与靶点具有较好的结合能力;对此11种化合物进行含量测定,方法学验证结果表明11种被测化合物在检测范围内均具有良好的线性关系(r^(2)>0.9940),精密度、准确度和稳定性均良好。结论:该研究所建立的方法简单、快速、准确可靠,能够用于酸枣仁汤的药效物质筛选和质量评价,同时也为中药的活性成分筛选和质量评价研究提供了思路。

关键词： 莪术   慢性胰腺炎   胰腺星状细胞   网络药理学   分子对接   单细胞测序分析  

摘要： 目的采用网络药理学和生物信息学结合的方法探索莪术有效成分以及治疗慢性胰腺炎(CP)的潜在价值。方法网络药理学方法筛选出莪术的有效活性成分及CP潜在治疗靶点,结合公开数据库中CP组织测序和单细胞测序数据,进一步分析这些靶点在CP中的表达丰度以及在细胞亚群中的分布情况。分子对接分析莪术的活性成分与CP相关靶点的结合情况。最后,通过单细胞测序分析这些核心靶点在PSC激活及相关通路的作用,评估莪术有效成分在CP治疗中抗炎、抗纤维化的潜力。结果通过网络药理学分析识别出莪术中最有效化合物成分三萜皂苷,并确定了其与CP相关的两个治疗靶点基因:LYZ和Rxra。分子对接结果显示三萜皂苷与CP的核心靶点Rxra蛋白有着极强的结合能力(结合能达到-7.392 kcal·mol^(-1))。单细胞测序分析进一步表明,核心靶点Rxra基因与胰腺星状细胞(PSC)的激活密切相关,并且在PTN和TGF-β信号通路中发挥着重要作用,而这两条通路的激活在慢性炎症和纤维化进展中扮演着至关重要的角色。结论莪术可能可以通过抑制PSC活化治疗CP,为CP的临床治疗提供新思路。

关键词： 杜仲   先兆流产   网络药理学   分子对接   β-胡萝卜素   绿刺桐灵   山柰酚   丁香黄素   槲皮素  

摘要： 目的采用网络药理学和分子对接技术探讨杜仲治疗先兆流产的潜在作用靶点及其分子机制。方法基于前期的研究成果,结合中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和文献报道补充筛选杜仲的活性成分,从GeneCards、OMIM和DisGeNET数据库中筛选先兆流产疾病靶点,利用韦恩图绘制平台获取共有靶点后,导入Cytoscope3.9.0软件和STRING在线分析平台,进行网络拓扑学分析。通过DAVID数据库对核心靶点进行基因本体(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析;最后采用AutoDockTools 1.5.6软件进行分子对接验证,并将对接结果可视化。结果共筛选得到包括β-胡萝卜素、绿刺桐灵、山柰酚、丁香黄素、槲皮素等16个杜仲潜在活性成分,通过预测得到的成分靶点387个,疾病靶点5287个,并得到共同靶点247个;经蛋白质相互作用(PPI)分析及网络拓扑分析后,获取核心靶点10个,包括丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(Akt1)、酪氨酸蛋白激酶转化蛋白(SRC)、半胱氨酸蛋白酶3(CASP3)、表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体(ESR1)、缺氧诱导因子-1α(HIF-1A)、前列腺素G/H合酶2(PTGS2)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、热休克蛋白HSP90-β(HSP90AB1)、糖原合成酶激酶-3β(GSK3B)。GO富集到基因功能120个,KEGG富集到信号通路53条,分析结果表明,KEGG富集分析关键靶点主要富集在癌症通路、癌症中的蛋白聚糖、雌激素信号通路等信号通路中;分子对接结果显示核心成分与核心靶点具有较好的构象。结论揭示了杜仲在预防先兆流产中的多成分、多靶点、多通路的作用机制。

关键词： 中医扶正治疗   肺癌   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接方法探究中医扶正治疗肺癌的机制。方法通过TCMSP数据库筛选有效成分和相关作用靶点,并利用GeneCards、OMIM、PharmGKb、TTD、DrugBank数据库获得肺癌的相关靶点,两者取交集得到药物-肺癌的潜在作用靶点;运用Cytoscapea软件分析药物-肺癌潜在靶点的蛋白互作(PPI)关系图,筛选关键靶点;再对关键靶点进行GO分析和KEGG分析,最后进行分子对接验证。结果五个关键成分槲皮素、木犀草素、山柰酚、7-甲氧基-2-甲基异黄酮、7-O-甲基异微凸剑叶莎醇有良好的结合活性,可能作用于MAPK1、AKT1、HSP90AA1、FOS、MYC、CASP3、ESR1、CDK4、CDKN1A、BCL2、TP53、STAT3、MAPK3共13个关键靶点,发挥治疗肺癌的作用。结论中医扶正治疗肺癌可能以13个关键靶点通过多种信号通路达到治疗效果。

关键词： 编排规范   高校自然科学学报   中国国家标准   医学期刊编辑   医药院校   学术研究  

摘要： 1本须知刊登在本刊每卷卷首,主要参照国际医学期刊编辑委员会制订的《学术研究实施与报告和医学期刊编辑与发展的推荐规范》[Uniform Require-ments for Manuscripts Submitted to Biomedical Journal:Writing and Editing for Biomedical Publication(Updated April 2010)]、中国国家标准(GB/T 3179-2009)《期刊编排格式》和(GB/T 7714-2015)《信息与文献参考文献著录规则》、原国家教委科技司1997年发布《中国高校自然科学学报编排规范》、中国医药院校学报编辑学会1991年制订的《医(药)学院校学报编排规范》。

关键词： 复制粘贴   Word文档   典型病变   图片   TIF格式   自明性   美学原则   规范化  

摘要： 1.图片总要求:科学性、自明性、规范化、美学原则。2.图片分辨率300 dpi以上、RGB颜色模式和TIF格式保存,并以“插入”方式插入Word文档,不要使用复制粘贴。3.病理照片(HE染色、免疫组化、免疫荧光等)上必须加标尺(scale bar),以箭头指示典型病变位置,并保证清晰度和对比度。