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关键词： 高尿酸血症   网络药理学   分子对接技术   核桃(Juglans regia L.)   鞣花酸   作用机制  

摘要： 基于网络药理学方法及分子对接技术分析核桃(Juglans regia L.)治疗高尿酸血症(Hyperuricemia,HUA)的作用机制,利用中药系统药理数据库和分析平台(Traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)预测核桃活性成分的作用靶点,运用OMIM、GeneCards和DrugBank数据库检索HUA疾病靶点。使用Cytoscape 3.7.2软件进行作用靶点-活性成分-疾病网络绘制,利用Metascape平台进行富集分析。使用AutoDockTools 1.5.6软件进行分子对接,对活性成分及重要靶点的结合度进行验证。结果表明,共筛选出核桃活性成分5种,与HUA有交集靶点16个;富集程度较高的信号通路包括癌症信号通路、化学致癌-受体激活信号通路、糖尿病并发症中的晚期糖基化产物-晚期糖基化终末产物受体信号通路和卡波西肉瘤相关疱疹病毒信号通路;通过分子对接验证试验可知,核桃中主要活性成分与重要靶点结合紧密。

关键词： 丹葛解酲汤   网络药理学   酒精性肝病   动物实验  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨丹葛解酲汤治疗酒精性肝病(ALD)的可能作用机制,并进行实验验证。方法:采用中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选出丹葛解酲汤的有效成分与靶点。利用GeneCards、OMIM、PharmGkb、TTD、DrugBank五个数据库检索ALD的相关基因。取药物靶点与疾病基因交集,筛选丹葛解酲汤治疗ALD的潜在治疗靶点。利用Cytoscape 3.8.0软件构建“成分-靶点-疾病”网络图,用R软件4.1.1进行GO和KEGG富集分析。通过动物实验对核心治疗靶点进行验证。采用白酒灌胃法建立ALD大鼠模型,经丹葛解酲汤干预4周后,HE染色观察大鼠肝脏组织形态学变化,蛋白印迹法(Western Blot)检测各组大鼠肝脏组织中AKT、p-AKT1、PI3K、p-PI3K、HIF1A蛋白表达量。结果:预测丹葛解酲汤靶点276个,ALD相关基因2682个,丹葛解酲汤治疗ALD的靶点170个,筛选得到CCND1、FOS、AKT1、CREB1、TP53、MAPK3、MAPK14、JUN、MYC、BELA、NFKBIA为核心蛋白靶点。GO功能富集主要涉及氧化应激反应、活性氧代谢过程、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶复合物等。KEGG通路主要富集在AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路、IL-17信号通路、TNF信号通路等。HE染色结果显示ALD模型组大鼠部分肝细胞出现脂肪变性,排列紊乱,出现肝细胞坏死,有炎性细胞浸润并伴有大量的脂滴空泡;与ALD模型组相比,各治疗组大鼠肝组织病变均有不同程度的改善。与空白对照组相比,ALD模型组大鼠肝组织p-AKT1、p-PI3K、HIF1A蛋白表达水平显著降低(P<0.01);与ALD模型组相比,各治疗组大鼠肝组织p-AKT1、p-PI3K、HIF1A蛋白表达水平显著升高(P<0.05,P<0.01)。结论:丹葛解酲汤通过多成分、多靶点、多信号通路治疗ALD,该方可能通过上调p-AKT1、p-P13K、HIF1A的表达,进而起到治疗ALD的作用。

关键词： 艾司氯胺酮   右旋氯胺酮   术后镇痛   临床应用   药理学  

摘要： 术后疼痛是影响手术患者恢复的重要因素,随着舒适化医疗的发展,术后有效镇痛的研究日益增加。艾司氯胺酮是一种新型的非阿片类镇痛药,与其他镇痛药相比,它对循环、呼吸的抑制更轻,镇静、镇痛作用更强,已在麻醉诱导、麻醉维持中表现重要优势,但当前关于其术后镇痛的研究较少,临床尚缺乏一致的观点。本文对近年来艾司氯胺酮术后镇痛的相关研究进行综述,旨在为临床有效术后镇痛提供理论依据。

关键词： 急性肺损伤   党参   网络药理学   靶点  

摘要： 本研究以网络药理学和相关分子生物学试验相结合共同探究党参对小鼠急性肺损伤(acute lung injury,ALI)的保护作用机制。通过网络药理学相关数据库对党参的主要化学成分及主成分相关靶点进行挖掘。通过疾病相关数据库获取急性肺损伤的相关靶点。构建蛋白相互作用(PPI)网络,并对挖掘的数据进行GO分析和KEGG通路富集分析。结果表明,党参中的主要成分有8种化合物可作用于303个靶点;急性肺损伤相关靶点有1522个,党参与急性肺损伤相交靶点为119个,PPI网络包括MAPK,NF-κB和TLR4等总共103个核心靶点;GO功能富集分析显示,分子功能133条,生物学过程79条,细胞组分523条;KEGG富集分析显示相关通路132条。通过Western blot、ELISA和免疫荧光方法进行验证。试验结果表明,党参多糖(Codonopsis pilosula polysaccharide,CPPS)预处理可显著下调大肠杆菌诱导的巨噬细胞中MAPK和NF-κB炎症信号通路的激活,并可显著下调炎性细胞因子TNFα和IL-1β的分泌水平;此外小鼠体内试验表明党参多糖可显著下调小鼠肺中TNFα和IL-1β的产生,并可下调损伤相关因子HMGB1的表达从而降低大肠杆菌诱导的肺损伤。综上所述,党参可对急性肺损伤的疾病相关靶点通过多个通路及生物过程进行调控从而发挥对肺保护作用。

关键词： 健脾益肾方   慢性肾脏病   网络药理学   超氧化物歧化酶1(SOD1)   超氧化物歧化酶2(SOD2)   过氧化氢酶(CAT)   大鼠  

摘要： 【目的】基于网络药理学技术和体内实验探讨健脾益肾方治疗慢性肾脏病的作用机制。【方法】以网络药理学技术筛选健脾益肾方治疗慢性肾脏病的关键靶标和核心信号通路。体内实验:将实验大鼠随机分为正常组、模型组、健脾益肾方组等3组,每组6只。模型组、健脾益肾方组大鼠给予腺嘌呤饲料喂养4周,建立慢性肾脏病模型。健脾益肾方组从建模第3周开始给予健脾益肾方10.89 g·kg^(-1)·d^(-1)灌胃,持续4周。给药结束后,检测血清肌酐(SCr)、尿素氮(BUN)评估肾功能;采用高碘酸-雪夫(PAS)、苏木素-伊红(HE)、马松(Masson)染色法分别观察肾脏病理;采用蛋白免疫印迹法检测相关靶标水平。【结果】筛选出关键靶标30个,主要有AKT1、IL6、TNF、VEGFA、CAT等,核心信号通路5条。体内实验结果显示:与正常组比较,模型组血清SCr、BUN水平升高,肾组织可见肾小球硬化、胶原纤维沉积、肾小管损伤等病理损害,肾组织超氧化物歧化酶1(SOD1)、超氧化物歧化酶2(SOD2)和过氧化氢酶(CAT)水平下调;与模型组比较,健脾益肾方组血清SCr、BUN水平降低,肾组织病理损害明显得到改善,肾组织SOD1、SOD2和CAT水平上调。【结论】健脾益肾方可有效保护慢性肾脏病大鼠肾功能、改善肾脏病理损害,其机制与上调SOD1、SOD2和CAT表达,起到抗氧化应激作用有关。

关键词： 独活寄生汤   椎间盘退变   作用机制   网络药理学   靶点   信号通路  

摘要： 目的:运用网络药理学分析独活寄生汤治疗椎间盘退变(intervertebral disc degeneration,IDD)的可能作用机制。方法:在TCMSP平台内检索独活寄生汤的生物活性成分并根据研究需要进行筛选,同时在GeneCards和OMIM数据库中检索椎间盘退变的靶点。运用Cytoscape软件构建“药物成分—靶点—疾病”复杂网络关系图。同时构建韦恩图,得到独活寄生汤治疗IDD的作用靶点。构建蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,使用NetworkAnalyzer进行网络特征分析,并进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释和东京基因组百科全书(kyoto gene and genome encyclopedia,KEGG)通路富集分析。结果:共探索出独活寄生汤中的有效活性成分240种,潜在靶点257个,椎间盘退变疾病靶点2 713个,得到共同靶点75个。GO富集分析得到20个条目,KEGG通路富集分析得到20条。结论:独活寄生汤可能是通过调节MAPK3、FOS、RELA、TP53、IL-6、MAPK1、TNF等靶点,调控高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路及PI3K-Akt信号通路等来抑制炎症反应、调控细胞凋亡来治疗椎间盘退变。

关键词： 痛泻要方加味   溃疡性结肠炎   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学,结合分子对接技术,来探讨痛泻要方加味对溃疡性结肠炎(UC)产生治疗作用的物质基础及分子机制。方法:通过TCMSP数据库搜索痛泻要方加味所包含的全部化学成分及作用靶点,利用Genecards、OMIM、TTD及DrugBank 4个数据库获取UC的受体靶点,制作Venny图寻找药物和疾病的共有靶点;结合Cytoscape软件对中药复方调控网络进行可视化展示;在STRING数据库中寻找靶点蛋白图并构建网络核心;分析GO生物学过程和KEGG富集通路;并对核心蛋白进行3D结构的重建,实现Vina分子对接。结果:在TCMSP中获得痛泻要方加味的有效活性成分共98个,成分靶点231个,疾病基因4 635个,二者共有基因161个;GO生物学过程主要涉及对脂多糖、抗生素、细菌来源分子、营养水平、氧化应激、活性氧、类固醇激素等反应,与细胞周期蛋白依赖性蛋白激酶等全酶复合物、转录因子等的活性、RNA聚合酶II特异性及磷酸酶等酶的结合有关;KEGG富集分析:与类固醇激素、精氨酸生物的合成,色氨酸、精氨酸、谷胱甘肽和脯氨酸代谢密切相关;黄芩甙元、山奈酚等成分可与AKT1蛋白受体进行高效对接,构象稳定。结论:痛泻要方加味成分复杂,对UC的治疗作用具有靶点多样、通路复杂、层次分明的特点;AKT1等重点因子可作为治疗UC疗效的重要观测指标,为下一步临床验证奠定基础。

关键词： 类风湿关节炎   益肾蠲痹丸   中医药疗法   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的采用网络药理学方法探讨益肾蠲痹丸治疗类风湿关节炎(RA)的分子作用机制。方法采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药整合药理学研究平台(TCMIP)、本草组鉴(HERB)和中医药百科全书数据库(ETCM)获取益肾蠲痹丸的有效成分,并借助SwissTargetPrediction数据库对有效成分的作用靶点进行预测;在人类基因综合数据库(GeneCards)、人类疾病相关基因与突变位点信息数据库(DisGeNET)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、药物靶标数据库(TTD)中搜索RA相关基因。将益肾蠲痹丸的作用靶点和与RA相关靶点进行映射交集,获得二者的交集靶点,借助STRING数据库构建蛋白互作(PPI)网络;采用Cytoscape 3.7.2软件筛选出核心靶点,采用Cytoscape 3.9软件进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析。结果共获得益肾蠲痹丸治疗RA的有效成分185个,其中关键成分为山柰酚、木犀草素、槲皮素和黄藤素,核心作用靶点为肿瘤坏死因子(TNF)、白介素-6(IL-6)、白介素-1β(IL-1β)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、信号转导及转录激活蛋白3(STAT3)基因等。KEGG信号通路主要涉及TNF、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、白介素-17(IL-17)、VEGF、核因子-κB(NF-κB)信号通路及RA疾病信号通路等。结论益肾蠲痹丸治疗RA具有多成分、多靶点、多通路协同作用优势,可通过调控相关信号通路调节机体免疫功能、影响细胞凋亡、抑制炎症反应。

关键词： 网络药理学   西北燥证   分子对接   桑麻止咳汤   慢性支气管炎  

摘要： [目的]运用网络药理学探讨桑麻止咳汤治疗西北燥证兼慢性支气管炎的作用机制。[方法]利用多个数据库获取药物有效成分、疾病靶点,取两者交集基因。通过STRING和DAVID数据库构建蛋白相互作用网络和富集分析,运用Cytoscape建立中药-成分-疾病靶点网络。运用Autodock Vina软件进行分子对接验证。[结果]筛选得到桑麻止咳汤活性成分287个,药物靶点1147个,疾病靶点213个。基因本体(GO)富集分析得到93个条目,京都基目与基因组百科(KEGG)通路富集分析确立了49条相关通路。分子对接结果显示药物主要活性成分与核心靶点结合活性良好。[结论]研究发现,桑麻止咳汤可能通过白细胞介素-17(IL-17)和晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)等信号通路影响肿瘤坏死因子(TNF)、基质金属蛋白酶(MMP9)、白蛋白(ALB)和MMP1等靶蛋白的表达,槲皮素、棕榈酸、山奈酚和芹菜素可能是其发挥多靶点和多途径治疗西北燥证兼慢性支气管炎的主要成分。

关键词： 网络药理学   犀黄丸   胃癌   细胞增殖   细胞凋亡  

摘要： 阐明犀黄丸浸提液对胃癌增殖的影响及其分子生物学机制,为祖国医药治疗胃癌提供治疗线索。方法 在线数据库筛选犀黄丸作用于胃癌的交集靶基因。Metascap分析交集靶基因的细胞增殖和凋亡的生物过程及其分子机制。STRING构建蛋白质相互作用网络(PPI)。Cytoscape 3.9软件的MCODEApp筛选核心基因,并构建核心基因对胃癌患者影响的Kaplan-Meier生长曲线。结果 犀黄丸的49个活性成分对应452个靶点作用于胃癌的MED1、RNASE1、RBP1、PRKDC、GRIN2B等52个交集靶基因。其中,IL2、PTGS2基因涉及72个细胞增殖过程,并调控ErbB、Ras、MAPK、PI3K-Akt等19个与细胞增殖相关的KEGG信号通路;IL2、TOP2A与15个细胞凋亡过程和TNF、FoxO、PI3K-Akt等19个细胞凋亡KEGG信号通路相关。52个交集靶基因编码57个蛋白,核心蛋白包括TP53、IRS1、CD36、INSR、TOP1等12个。TP53蛋白高表达的胃癌患者生存时间显著延长(P<0.05)。结论 犀黄丸能够通过IL2、PTGS2、TOP2A等基因调控PI3K-Akt、MAPK、FoxO等信号通路,影响胃癌增殖和凋亡过程;基于高表达的TP53蛋白对延长胃癌患者生存时间有重要意义。