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关键词： 网络药理学   聚精丸   精索静脉曲张   男性不育   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接技术探讨聚精丸治疗精索静脉曲张性男性不育的潜在作用机制。方法:通过TCMSP数据库及BATMAN数据库检索聚精丸中药成分并获取成分对应的靶点;在“GeneCards”“DISGENET”“OMIM”“HPO”数据库检索“varicocele”、“male infertility”,获得精索静脉曲张性男性不育的潜在靶点;利用jvenn工具绘制韦恩图,获得中药靶点与疾病靶点的交集靶点;筛选出与交集靶点相对应的成分及中药,在Cytoscape3.8.2构建中药-活性成分-靶点网络图;应用STRING平台构建病药交集靶点的蛋白-蛋白相互作用网络(PPI);将病药交集靶点导入DAVID数据库进行GO富集分析并进行基于KEGG的通路富集分析;再将病药交集靶点上传至KEGG数据库,选择与本课题最为相关的通路,使用mapper工具构建KEGG通路图;进一步使用FDR值排名前15的通路与其相关靶点、成分绘制核心成分-靶点-通路图;最后,利用AutoDock及PyMol软件对核心基因的蛋白受体和小分子配体进行分子对接验证及结果的可视化分析。结果:共筛选出聚精丸207种成分和1 103个预测靶点;精索静脉曲张性男性不育疾病靶点285个;韦恩图获得共同靶点86个;GO结果分析显示生物过程(BP)显著富集于基因表达的正向调控、转录正调控、凋亡过程的正、负调控、缺氧反应、对雌二醇的反应、一氧化氮生物合成过程的正调控等;细胞组分(CC)显著富集于大分子、细胞质、核、磷脂酰肌醇3-激酶复合物等;分子功能(MF)显著富集于酶绑定、相同蛋白结合、转录共激活因子结合等;KEGG分析结果显示通路富集于癌症通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、HIF-1信号通路、FoxO信号通路等;分子对接结果显示核心成分与关键靶点有较好的结合能。结论:聚精丸的有效活性成分通过多靶点、多通路治疗精索静脉曲张性男性不育,为进一步的细胞实验及动物实验奠定了理论基础。

关键词： 当归挥发油   血管性痴呆   网络药理学   分子对接   E-藁本内酯   洋川芎内酯H   多巴胺受体D2   单胺氧化酶A   小鼠  

摘要： 目的基于网络药理学、分子对接及实验验证探讨当归挥发油(Volatile oil of Angelica Sinensis Radix,VOASR)改善血管性痴呆(Vascular dementia,VaD)的作用机制。方法(1)采用气相色谱-质谱联用(GC-MS)法对VOASR的主要化学成分进行分析鉴定,确定百分含量排前5位的化合物。通过Swiss Target Prediction数据库筛选出VOASR 5个主要化学成分的作用靶点,通过OMIM、GeneCards、Drugbank数据库收集VaD疾病相关靶点。对VOASR主要化学成分的作用靶点与VaD疾病相关靶点取交集,得到二者共同靶点即为VOASR干预VaD的潜在作用靶点。运用STRING数据库对交集靶点构建蛋白相互作用(PPI)网络,并分析判断关键靶点。使用R语言的Bioconductor软件包对共同靶点进行GO功能富集分析及KEGG通路富集分析,并使用Cytoscape 3.7.2软件构建VOASR干预VaD的“药物-成分-疾病-靶点-通路”网络。采用AutoDock Vina软件进行分子对接,分析5个主要化学成分与关键靶点蛋白的结合能力,进一步筛选出VOASR治疗VaD的核心靶点。(2)体内实验:将C57BL/6小鼠随机分为假手术组、模型组、VOASR组(105 mg·kg^(-1)),每组6只。采用单侧颈总动脉结扎术(UCCAO)构建VaD小鼠模型;术后灌胃给药(10 mL·kg^(-1)),每日1次,持续3周。采用Morris水迷宫实验评估VaD小鼠的认知功能;采用免疫组织化学法及Western Blot法检测小鼠海马组织中多巴胺受体D2(DRD2)、单胺氧化酶A(MAOA)蛋白表达情况。结果(1)VOASR中相对百分含量排前5位的核心化学成分分别为(E)-Ligustilide(E-藁本内酯)、Z-Butylidenephthalide(Z-正丁烯基苯酞)、Senkyunolide H(洋川芎内酯H)、Spathulenol(桉油烯醇)、3-Butylphthalide[3-丁基-1(3H)-异苯并呋喃酮],占总含量的97.32%。共筛选得到VOASR中5个主要化学成分的作用靶点92个,VaD疾病相关靶点1181个,得到共同靶点(交集靶点)31个。分析得到VOASR治疗VaD的关键靶点包括VEGFA、PTGS2、ICAM1、VCAM1、F2、FGF2、CCR5、PIK3R1、MAPK14、MPO、SELE、DRD2、MAOA、ADRA1A、ELANE。VOASR治疗VaD的潜在作用靶点与脂多糖的反应、神经递质水平的调节、突触传递、多巴胺能等生物学过程有关,主要涉及多巴胺能突触、钙离子信号通路、神经活性配体-受体相互作用、MAPK信号通路、NF-κB信号通路等。分子对接结果显示,E-藁本内酯-DRD2、洋川芎内酯H-MAOA的结合能力最优。(2)与假手术组比较,模型组小鼠的逃避潜伏期明显延长(P<0.05,P<0.01),穿越平台次数显著减少(P<0.001);小鼠海马区中的MAOA、DRD2阳性表达显著上调(P<0.01,P<0.001),MAOA、DRD2蛋白表达水平明显上升(P<0.05)。与模型组比较,VOASR组小鼠的逃避潜伏期明显缩短(P<0.05,P<0.01),穿越平台次数显著增加(P<0.001);小鼠海马区中的MAOA、DRD2阳性表达明显下调(P<0.05,P<0.01),MAOA、DRD2蛋白表达水平明显下降(P<0.05,P<0.01)。结论VOASR可以有效改善VaD小鼠的认知功能,可能是通过E-藁本内酯、洋川芎内酯H等核心化学成分,作用于DRD2、MAOA等关键靶点,通过多巴胺能突触、钙离子信号通路、MAPK信号通路等多条信号通路来实现的,具有多成分、多靶点、多通路的特点。

关键词： 缺血性中风   龙加通络胶囊   网络药理学   益气活血   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接探讨龙加通络胶囊治疗缺血性中风物质基础及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药综合数据库(TCMID)以及查阅文献获得穿山龙、刺五加的主要活性成分;使用PharmMapper数据库预测活性成分靶点,利用人类基因综合数据库(GeneCards)和在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)得到疾病相关靶点,对活性成分靶点与疾病靶点取交集后采用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。最后通过AutoDock Vina软件对关键靶点和化合物进行分子对接批量处理。结果:筛选出穿山龙、刺五加针对缺血性中风的14个活性成分和179个作用靶点。蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络拓扑分析发现白蛋白(ALB)、蛋白激酶B1(AKT1)、胱天蛋白酶3(CASP3)、表皮生长因子受体(EGFR)、酪氨酸激酶(SRC)是穿山龙、刺五加治疗缺血性中风的关键靶点。GO功能分析发现龙加通络胶囊生物过程主要集中在中性粒细胞脱粒、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录过程的正调控、凋亡过程的负调控等多个方面;KEGG信号富集分析主要涉及磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/AKT)、有丝分裂原激活蛋白激酶(MAPK)、Ras相关蛋白1(Rap1)等信号通路。分子对接结果显示活性物质与靶点蛋白之间存在较强的结合力,其中薯蓣皂苷与AKT1的结合力最强。结论:穿山龙、刺五加治疗缺血性中风具有多组分、多靶点相互协同的特点,为今后龙加通络胶囊的临床应用提供了理论基础和参考。

关键词： 金课   药理学   线上线下混合教学  

摘要： 随着教育部关于“金课”建设的提出,利用线上线下混合教学模式实现教育界的新变革成为当今研究热点。本研究以本校药学本科核心课程——药理学为例,从药学本科药理学“金课”的建设方法、线上线下混合教学模式的构建方法、教学效果的评价方式、“金课”建设的成效、推进“金课”建设的几点思考等方面进行阐述,总结线上线下混合式“金课”建设的经验。

关键词： 糖尿病   网络药理学   小柴胡汤   分子对接   作用机制  

摘要： 目的 运用网络药理学和分子对接技术预测小柴胡汤防治糖尿病(Diabetes Mellitus, DM)的作用靶点和信号通路,分析可能的作用机制。方法 通过中药系统网络药理学分析平台(TCMSP)采集小柴胡汤的活性成分及作用靶标;从DisGeNET和GeneCards数据库中搜索DM的靶标,取交集绘制韦恩图;利用String数据库进行基因转换和网络互作分析;用Cytoscape 3.6.0构建网络图;运用分子对接技术对预测的结果进行佐证;通过Metascape数据库进行GO和KEGG分析。结果 共筛选出小柴胡汤197种活性成分,DM相关靶点1010个,核心靶点63个。活性成分和核心靶点有良好的结合能。GO分析得出47个功能条目,KEGG分析得出20条通路。结论 小柴胡汤通过多成分、多靶点,影响流体剪切应力与动脉粥样硬化、DM并发症中的AGE-RAGE、PI3K-Akt等信号通路,减轻炎性反应、氧化损伤,减少细胞凋亡,改善细胞代谢,调节葡萄糖代谢。

关键词： 网络视域   药理学教学   教学改革  

摘要： 随着互联网技术的不断发展,大专院校“药理学”教学需要与时俱进,适应网络时代的教学需求。探讨在网络视域下大专院校“药理学”教学改革的必要性和可行性,针对大专院校“药理学”教学面临的挑战与问题,提出了在网络视域下进行教学改革的思路和具体实施方法,包括利用在线教学平台进行知识传授、组织线上讨论等。教学改革策略能够丰富教学资源、提高教学效率及学生的学习积极性和创造力,这种模式为高校“药理学”教学改革提供了有益的启示和借鉴。

关键词： 血管性痴呆   参麻益智方   人参   鬼箭羽   川芎   天麻   配伍   网络药理学  

摘要： 目的:基于网络药理学方法分析阐释参麻益智方的配伍规律及其治疗血管性痴呆(VaD)的合理性。方法:对参麻益智方中4味中药人参、鬼箭羽、天麻、川芎、全方及不同配伍的预测靶点进行京都基因和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析,构建“成分-靶点”网络等,发现每味中药及全方可能参与的信号通路。通过STRING网站构建参麻益智方靶点和VaD发病共同靶点的蛋白-蛋白互作(PPI)网络,并进行KEGG信号通路富集分析,发现参麻益智方治疗VaD的关键干预靶点及可能的作用机制。结果:参麻益智方的预测靶点共291个。KEGG信号通路富集分析发现每味中药及全方都参与代谢及血管功能调节。人参及天麻的共同作用靶点93个,人参及川芎的共同作用靶点91个,天麻和川芎可协助君药人参改善机体血管功能。参麻益智方靶点和VaD发病的共同靶点主要包括白细胞介素6、肿瘤坏死因子、载脂蛋白E、半胱氨酸蛋白酶3及脑源性神经营养因子等。KEGG信号通路富集分析显示参麻益智方治疗VaD的主要调控部位在血管,与改善脑内血管炎症有关。结论:参麻益智方配伍严谨、合理,其治疗VaD可能与改善脑血管内皮细胞炎症有关。

关键词： 石榴花   脂质沉积   HepG2细胞   代谢组学   网络药理学  

摘要： 目的:探讨石榴花改善脂质沉积(lipid deposition,LD)的作用机制。方法:CCK-8法测定石榴花提取物(pomegranate flower extract,PFE)及棕榈酸(palmitic acid,PA)对细胞活力的影响,采用PA诱导HepG2细胞LD模型,实验分为PFE组、空白组(NC组)和模型组(PA组),油红O染色法测定细胞内脂质含量,GPO-PAP法测定细胞内总胆固醇(total cholesterol,TC)和甘油三酯(triglyceride,TG)含量。UPLC-LTQ-Orbitrap-MS技术鉴定差异代谢物并进行代谢通路富集。采用网络药理学方法筛选关键成分与核心靶点,并进行GO和KEGG富集分析。利用Autodock软件对关键成分与核心靶点进行分子对接,采用q-PCR检测PIK3CA、AKT1、MAPK、STAT3 mRNA的表达。结果:与NC组比较,PA组细胞内脂质、TC、TG含量显著升高(P<0.01),33种代谢物有显著差异(P<0.05);与PA组比较,PFE组细胞内脂质、TC、TG含量显著降低(P<0.05),10种代谢物显著回调(P<0.05)。33种差异代谢物富集到与LD关联性强的甘油磷脂代谢通路。网络药理学得到PF的关键成分为白桦脂酸、木犀草素等,核心靶点为MAPK1、PIK3CA、AKT1、STAT3等。交集靶点主要通过调控PI3K-AKT、HIF-1等信号通路发挥治疗作用。关键成分与核心靶点均有较好的结合能力。q-PCR实验表明PFE可抑制HepG2细胞中MAPK、PIK3CA、AKT1 mRNA表达,促进STAT3的mRNA表达。结论:石榴花可改善HepG2细胞LD,代谢组学和网络药理学发现其作用机制可能与调节甘油磷脂代谢、MAPK、STAT3基因表达及PI3K-AKT等信号通路有关。

关键词： 白头翁汤   结直肠腺瘤   网络药理学   IL-17信号通路   p53信号通路   ESR1   CASP8  

摘要： 目的:基于网络药理学分析及实验验证探讨白头翁汤抗结直肠腺瘤的作用机制。方法:利用Cytoscape 3.9.0软件、中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、GeneCards数据库等构建“疾病-药物化学成分-靶点”网络,推测白头翁汤治疗结直肠腺瘤的有效化学成分,并进行基因本体(GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,构建“信号通路-靶点”网络,推测核心靶点。最后通过小鼠结直肠腺瘤模型对预测出的核心靶点进行验证。结果:①通过网络药理学分析筛选获得白头翁汤活性成分治疗结直肠腺瘤的潜在靶点129个,其中10种活性成分对应40个关键潜在效应靶点。白头翁汤可能通过调节白介素-17(IL-17)信号通路、p53信号通路来影响DNA结合转录因子的结合、DNA聚合酶Ⅱ型特异性DNA结合转录因子的结合、核因子受体活性等生物学过程,对结直肠腺瘤起到治疗作用。②对12个超过度值均值的靶点进行实验验证,结果显示白头翁汤干预后雌激素受体1(ESR1)与半胱天冬酶8(CASP8)基因表达较模型组显著降低(P<0.05),推测其为白头翁汤治疗结直肠腺瘤的关键靶点。结论:白头翁汤可能通过多成分、多靶点、多途径的方式发挥抗结直肠腺瘤的作用。