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关键词： “水蛭-三七”药对   IgA肾病   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学方法及分子对接技术探究“水蛭-三七”药对干预IgA肾病(IgAN)的分子机制。方法使用TCSMP、TCMID、SymMap、FAF-Drugs4、Pharmmapper数据库并在中国知网、PubMed检索相关文献获得水蛭、三七活性成分并预测相关靶点。检索GeneCadrs、DisGeNET、CooLGeN数据库获取IgAN的作用靶点,两者取交集后运用Cytoscape软件构建相关网络图。再使用STRING数据库作蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络图并筛选核心靶点。基于DAVID数据库对交集靶点进行GO与KEGG富集分析。最后使用Autodock Vina软件进行分子对接。结果得到“水蛭-三七”药对的31种活性成分、217个预测靶点、438个IgAN相关靶点及17个交集靶点。富集分析发现交集靶点主要通过参与凋亡过程的负向调控、脂多糖应答、细胞迁移正向调节等生物学过程及TNF信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、脂质和动脉粥样硬化等相关信号通路来干预IgAN。分子对接结果表明,低分子肝素、水蛭素、人参皂苷rh2、β-谷甾醇与ALB、CASP3、EGFR、HGF、NOS3、REN具有较强烈的结合活性。结论“水蛭-三七”药对可能是通过水蛭素、肝素及人参皂苷rh2、β-谷甾醇4个关键成分调控ALB、CASP3、EGFR、HGF、NOS3、REN共6个关键靶点以实现调节凝血功能,对抗氧化应激、炎症及肾纤维化等作用从而干预IgAN。

关键词： 平胃散   肥胖2型糖尿病   网络药理学   分子对接   苍术酮   厚朴酚  

摘要： 目的:利用网络药理学和分子对接技术研究复方平胃散治疗肥胖2型糖尿病的活性成分及作用机制。方法:通过TCMSP、ETCM、SwissTargetPrediction数据库及文献检索收集平胃散化学成分和靶点信息;通过GeneCards及DisGeNET数据库检索肥胖2型糖尿病靶点;通过STRING和David的数据库,对共有靶点进行PPI网络分析及GO和KEGG富集分析;使用Cytoscape软件构建“中药-成分-靶点-通路”网络图,筛选核心靶点及关键成分,使用Autodock软件进行分子对接验证。结果:共整理得到平胃散的70个化学成分及其对应的414个靶点,肥胖2型糖尿病靶点475个,共有靶点56个;PPI网络显示,AKT1、ESR1、NFKB1、PIK3CA等靶点可能是平胃散治疗肥胖2型糖尿病的关键靶点;KEGG富集分析发现共有靶点主要参与脂肪分解调节、TNF信号传导、胰岛素抵抗、胆汁分泌和cAMP信号传导等多种疾病通路;构建“成分-靶点-通路-疾病”网络发现苍术酮、茅苍术醇、β-桉叶醇、光甘草定、厚朴酚、异甘草素等成分是平胃散治疗肥胖2型糖尿病的主要活性成分;分子对接显示,7个关键成分与10个核心蛋白靶点均有较好的结合活性。结论:预测平胃散中治疗肥胖2型糖尿病的活性成分为苍术酮、茅苍术醇、β-桉叶醇、厚朴酚、光甘草定和异甘草素,这些成分可能是通过AKT1、ESR1、NFKB1、PIK3CA等靶点和胰岛素抵抗、cAMP信号传导、TNF信号传导等通路发挥治疗肥胖2型糖尿病的作用。

关键词： 西洛他唑   动静脉内瘘   内膜增生   网络药理学  

摘要： 目的基于网络药理学探究西洛他唑抑制血管内膜增生(IH)治疗动静脉内瘘成熟障碍及狭窄的作用机制。方法通过Chemical Book平台、Swiss Target Prediction服务器获取西洛他唑的基本信息和作用靶点;使用Genecards和CTD数据库筛选IH相关靶点。相关平台及数据库的数据更新至2023年1月。构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络。对共同靶点进行基因本体(GO)富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。结果共获得西洛他唑作用靶点100个,IH相关靶点1794个,交集靶点57个。PPI网络核心靶点14个。GO富集分析共得到887个富集结果,其中生物过程主要涉及蛋白质磷酸化、肽基丝氨酸磷酸化、肽基苏氨酸磷酸化等;细胞组分主要涉及细胞质的核周围区域、顶端质膜、膜微域等;分子功能主要涉及蛋白激酶活性、激酶活性、激酶结合等;KEGG信号通路富集分析共得到144条信号通路,主要涉及癌症中的通路、PI3K-Akt信号通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂抵抗。结论该研究初步验证西洛他唑可能通过多靶点与多通路抑制血管内膜增生治疗动静脉内瘘成熟障碍及狭窄,为西洛他唑的进一步研究提供理论依据。

关键词： 慢性肾小球肾炎   王孟庸   数据挖掘   网络药理学   分子对接   用药规律  

摘要： 目的:基于中医传承辅助平台及网络药理学方法探讨国家级名老中医王孟庸教授治疗慢性肾小球肾炎的用药规律和作用机制,为慢性肾小球肾炎的防治提供中医方案。方法:收集2013年1月1日至2021年8月30日王孟庸治疗慢性肾小球肾炎的门诊病历,运用关联规则、复杂系统熵聚类等方法对其用药规律进行分析,运用网络药理学及分子对接方法阐述核心用药的作用机制。结果:筛选出治疗慢性肾小球肾炎处方369份,分析得出王孟庸教授治疗慢性肾小球肾炎常用药物有黄芪、女贞子、当归、茯苓等61种,黄芪、女贞子、墨旱莲、熟地黄、当归、黄精、白芍、白术、茯苓、陈皮、牡丹皮11味中药为王孟庸教授核心处方用药。槲皮素、木犀草素、山奈酚、谷甾醇等成分是核心处方药物治疗慢性肾小球肾炎的主要成分,涉及苏丝氨酸特异性蛋白激酶1(AKT1)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素6(IL6)等核心靶点。结论:王孟庸教授治疗慢性肾小球肾炎寒温并用,善用墨旱莲、女贞子组合护肾阴,以及五皮饮利水渗湿。核心药物治疗慢性肾小球肾炎机制可能与其抗氧化、抗炎、减少肾缺血再灌注期间的肾小管凋亡和炎症反应有关。

关键词： 药理学   实验教学   教学质量   教学改革   评价体系  

摘要： 药理学实验教学是药理学教学工作的重要组成部分,是学生进一步理解理论知识,提升操作能力和创新能力的有效途径。结合徐州医科大学药理学实验教学实际情况,对药理学实验教学现状包括各专业实验课程内容设置、实验课教学模式、实验课课堂组建和实验课评价体系进行分析,总结经验并提出改革思考,以优化药理学实验教学各环节,提高药理学科整体的实验教学质量,亦为培养应用型医药人才为目标的教学改革提供参考。

关键词： 温胆汤   枳实   指纹图谱   网络药理学   质量标志物  

摘要： 目的基于指纹图谱和网络药理学预测经典名方温胆汤(Wendandecoction,WDD)中药材枳实的质量标志物(Q-Marker)。方法建立枳实药材和WDD基准样品的指纹图谱,使用中药色谱指纹图谱相似度评价软件(2012年A版)进行相似度分析和共有成分指认;采用网络药理学筛选共有成分的相关靶点和关键通路,并建立成分-靶点-通路网络,预测枳实发挥祛痰止呕,清胆和胃功效潜在的Q-Marker,并测定其含量。结果建立了15批枳实药材和15批WDD基准样品的指纹图谱,15批枳实药材和WDD基准样品指纹图谱相似度>0.9,指认出5个化学成分,分别为柚皮苷、橙皮苷、新橙皮苷、川陈皮素、桔皮素;网络药理学筛选分析得到5个化合物的TP53、MAPK8、EGFR、JUN、MMP9等32个核心靶点和癌症通路、内分泌抵抗通路等10条关键通路,构建了“成分-靶点-通路”网络图,预测柚皮苷、橙皮苷、新橙皮苷、川陈皮素、桔皮素为WDD中枳实的Q-Marker。WDD中柚皮苷、橙皮苷、新橙皮苷、川陈皮素、桔皮素的含量≥0.0117%,0.0253%,0.0257%,0.0104%,0.0107%。结论WDD中枳实的Q-Marker预测分析为建立完整的WDD质量评价体系提供参考,也为阐明其药效物质基础的作用机制奠定了基础。

关键词： 散偏汤   偏头痛   网络药理学   靶点   信号通路   分子对接  

摘要： [目的]运用网络药理学方法与分子对接技术预测散偏汤治疗偏头痛(migraine)的作用机制。[方法]利用TCMSP数据库对散偏汤进行活性成分筛选。通过STRING 11.5数据库构建蛋白互作网络,并得到药物靶向基因;通过OMIM、GeneCards数据库筛选偏头痛的疾病靶点基因;利用Rx644.1.1软件构建韦恩图,得到散偏汤治疗偏头痛的潜在靶点,进行GO及KEGG富集分析并制作气泡图,相关结果用Cytoscape 3.7.1构建“药物-成分-疾病-通路”网络,并进行可视化研究。利用PyMOL和AutoDock Vina等软件对散偏汤活性成分与核心靶蛋白进行分子对接。[结果]散偏汤治疗偏头痛的核心活性成分为槲皮素、木犀草素、山奈酚等,潜在治疗靶点主要包括PTGS2、MAPK1、MAPK3、GSK3β、AKT1、HSP90AA1、ESR1等,主要涉及脂质和动脉硬化、AGE-RAGE、PI3K-Akt、IL-17、TNF、MAPK等信号通路。分子对接结果显示,槲皮素、木犀草素和山奈酚与关键核心靶点PTGS2、MAPK1、MAPK3有较好的结合力。[结论]通过网络药理学研究,初步预测了散偏汤治疗偏头痛的作用机制可能主要与调节炎症因子,改善神经源性炎症相关,也能够起到调节免疫功能与激素水平、维持血管稳态等作用,体现了中药方剂“多成分-多靶点-多通路”的药效作用特点,为后续临床应用与研究提供理论参考。

关键词： 栀豉温胆汤   网络药理学   分子对接   失眠  

摘要： 目的基于网络药理学方法探究栀豉温胆汤治疗失眠的作用机制。方法通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)分别收集栀豉温胆汤中各味中药的主要活性成分和作用靶点;通过GeneCard、OMIM、DrugbankDis、GeNET数据库获取疾病相关靶点,合并4个数据库获得并集靶点,并收集药物-疾病交集靶点,构建蛋白相互作用网络,采用Cytoscape软件作图分析。借助R语言进行GO分析和KEGG分析。应用AutoDock Tools-1.5.6软件进行分子对接。结果共筛选出活性成分153个,成分作用靶点614个,与失眠相关共同靶点120个,关键靶点包括IL-6、INS、COMT、TNF、PTGS2等。结合GO分析及KEGG通路相关条目,主要通路包括神经活性配体-受体相互作用、5-羟色胺能突触、cGMP-PKG信号通路、色氨酸代谢、神经退行性变的途径-多种疾病、cAMP信号通路、多巴胺能突触、阿尔茨海默病等信号通路等发挥治疗失眠的作用。分子对接结果显示关键成分与关键靶点具有较好的结合能力。结论栀豉温胆汤作用靶点涉及神经退行性疾病、炎症等多种疾病,与神经类疾病尤为相关。

关键词： 当归芍药散   原发性痛经   入血成分   网络药理学   有效性  

摘要： 目的以当归芍药散入血成分为研究对象,基于网络药理学和动物实验探究当归芍药散治疗原发性痛经的有效性及作用机制。方法运用Gene Cards、OMIM数据库筛选与当归芍药散入血成分对接的原发性痛经靶点,利用R语言获得关键靶标,进行蛋白互作网络构建,针对筛选出的靶点进行GO和KEGG通路富集;利用AutoDock Vina 1.2.3版软件进行分子对接;通过当归芍药散给药干预原发性痛经模型大鼠,从行为学和组织病理学角度验证当归芍药散的有效性。结果共筛选出当归芍药散入血成分12个,作用于肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、白细胞介素(IL)-6、VEGFA、PTGS2等核心靶点,主要参与IL-17、TNF、花生四烯酸代谢等信号通路。分子对接显示Z-丁烯基酞内酯、洋川芎内酯I、芍药内酯苷3个活性成分与靶标蛋白结合能力较强。动物实验表明,原发性痛经模型大鼠扭体反应明显增加(P<0.05),子宫内膜剥脱及水肿严重;当归芍药散能有效减少大鼠扭体次数(P<0.05),减轻子宫内膜剥脱及水肿。结论当归芍药散主要通过中枢镇痛、调控激素效应、抑制子宫炎症反应等药理作用发挥治疗原发性痛经的效果,为后续研究提供参考。

关键词： 中药复方CB001   低剂量辐射   防护   网络药理学   PI3K/AKT信号通路   小鼠  

摘要： 目的基于网络药理学预测中药复方CB001对低剂量辐射(LDR)防护的潜在机制,并通过动物实验进行验证。方法基于网络药理学预测得到中药复方CB001防护LDR的可能作用靶点和通路。小鼠随机分为对照组,模型组,中药复方CB001低(1 g·kg^(-1))、中(2 g·kg^(-1))、高(4 g·kg^(-1))给药组,对小鼠进行连续5 d的LDR,结束后处死小鼠,测定小鼠外周血白细胞、淋巴细胞总数,检测脾脏细胞凋亡,苏木素-伊红(HE)法观察各组小鼠脾脏组织形态学变化,蛋白免疫印迹法(WB)检测脾脏组织中蛋白激酶B(AKT)、磷酸化的蛋白激酶B(p-AKT)、B细胞淋巴相关X蛋白(Bax)、白细胞介素-6(IL-6)蛋白的表达。结果最终获得中药复方CB001潜在活性成分42个,79个靶点,可影响细胞周期、炎症反应调节、活性氧代谢过程,KEGG富集分析结果显示,中药复方CB001对LDR的防护主要涉及PI3K/AKT信号通路等。动物实验显示,中药复方CB001可升高小鼠外周血白细胞、淋巴细胞总数,减轻小鼠脾脏细胞凋亡,改善小鼠脾脏病理变化,促进小鼠脾脏中p-AKT蛋白表达,抑制Bax、IL-6蛋白表达。结论中药复方CB001通过减轻LDR诱导的PI3K/AKT抑制,抑制细胞凋亡,改善炎症反应,进而对LDR起到防护作用。