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关键词： 复制粘贴   化学结构式   典型病变   电泳图   病理照片   图表   箭头   标尺  

摘要： 1.论文中的病理照片、电泳图及化学结构式图等要求以“插入”→“图片”方式插入word文档,不要使用复制粘贴。病理照片必须加标尺,并以箭头指示典型病变位置。除照片外,其他图尽量不用彩色。

关键词： 艾叶   黄酮   类风湿性关节炎   网络药理学   靶点   通路  

摘要： 基于网络药理学探究艾叶黄酮治疗类风湿性关节炎(RA)的作用机制.通过TCMSP数据库和STP数据库并结合文献筛选艾叶活性黄酮成分及其相应靶点,通过GeneCards、DRUGBANK、OMIM、TTD数据库预测RA相关靶点,得到艾叶黄酮治疗RA的交集靶点;采用DAVID数据库对交集靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析;并导入STRING数据库进行蛋白相互作用(PPI)分析,筛选出关键靶点;使用Cytoscape3.7.2软件构建“成分-靶点-通路”网络,分析并筛选出核心活性成分.筛选获得38个艾叶活性黄酮成分,主要作用于129个RA相关靶点;主要通过药物反应、凋亡过程的负调控和炎症应答等生物过程,涉及包括肿瘤坏死因子信号通路、Toll样受体信号通路、破骨细胞分化等15条相关的信号通路,关键靶点有TNF、JUN、RELA、AKT1、TP53、IL-6、MAPK1、MAPK14;核心成分为槲皮素、芹菜素、山柰酚、木犀草素、柚皮素、异鼠李素、异泽兰黄素.表明艾叶黄酮通过多成分、多靶点、多通路协同治疗RA,为其进一步实验研究和临床应用提供依据.

关键词： 栀子   肝胆胰腺肿瘤   药理学   综述  

摘要： 栀子,始载于《神农本草经》,属于茜草科栀子属植物栀子的干燥成熟果实,主产于我国中南、西南及江苏、安徽等地[1]。栀子味苦性寒,具有凉血、解毒、泻火、除烦、清热利湿的功效,用于湿热黄疸、火毒疮疡、热病心烦、血热吐衄和扭挫等外伤伤痛[2]。药理研究表明,栀子具有抗氧化、保肝、利胆、促进胰腺分泌、抗肿瘤等活性[3],广泛应用于肝胆胰疾病。

关键词： 痹证   膝骨关节炎   网络药理学   国医大师   周仲瑛   骨痹方  

摘要： 目的利用网络药理学技术,探究骨痹方治疗膝骨关节炎(KOA)的作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)等数据库获取骨痹方潜在活性成分及对应靶点,通过Drugbank、GeneCards、OMIM、TTD和DigSee数据库得到KOA疾病靶点。使用String数据库构建PPI网络,采用Cytoscape 3.8.0软件筛选核心靶点和关键成分;通过Metascape数据平台对核心靶点进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果筛选出骨痹方的关键成分10个,作用于白蛋白(ALB)、白细胞介素-6(IL-6)等核心靶点,通过调控晚期糖基化终产物及其受体(AGE-RAGE)等信号通路发挥作用。结论骨痹方通过多成分、多靶点、多通路发挥治疗KOA的作用。

关键词： 连花清咳片   COVID-19   网络药理学   分子对接   靶点   通路   作用机制  

摘要： 目的基于网络药理学及分子对接预测连花清咳片治疗新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)可能作用的靶点及信号通路。方法通过TCMSP,UniProt Knowledgebase及SwissTargetPrediction数据库获取连花清咳片的活性成分及相关靶点;通过GeneCards和OMIM获取COVID-19相关靶点;使用Cytoscape 3.9.0软件构建“连花清咳片-COVID-19”靶点调控网络,结合STRING数据库绘制蛋白相互作用网络(Protein-protein interaction networks,PPI);使用Metascape数据库对交集基因进行GO功能和KEGG通路富集分析。通过AutoDockTools1.5.6软件将关键作用靶点与主要活性成分进行分子对接验证。结果以口服生物利用度(oral bioavailability,OB)和类药性(drug-like properties,DL)作为筛选条件,获得连花清咳片中药物活性成分287个,药物疾病交集基因86个,核心靶点58个。KEGG富集分析预测连花清咳片治疗COVID-19主要涉及p53信号通路(p53 signaling pathway)、补体途径(complement and coagulation cascades)、细胞因子-细胞因子受体相互作用(cytokine-cytokine receptor interaction)等信号通路等。分子对接结果证实连花清咳片中主要活性成分与核心靶点具有较为稳定的结合活性。结论连花清咳片可能通过多成分、多靶点及多通路参与COVID-19的治疗。

关键词： 网络药理学   灵芝酸   肝细胞癌   靶点   通路   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学探讨灵芝酸治疗肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)的分子作用机制。方法:通过Pubchem数据库获取灵芝酸成分的SDF结构,导入Swiss Target Prediction数据库对其作用靶点进行预测;与OMIM、Drugbank、Genecards数据库获得HCC疾病作用靶点相映射,得到灵芝酸与HCC的共同靶点;通过Cytoscape软件构建“灵芝酸类-HCC-共同靶点”网络和蛋白质相互作用网络,并进行核心成分以及核心靶点的分析,使用R3.6.0软件以P<0.05,q<0.05对关键靶基因进行GO与KEGG功能富集分析。通过CCK-8和WB法研究灵芝酸对HCC细胞HepG2的抑制作用。结果:获得灵芝酸-HCC共同靶点66个;Ganoderic acid A、C2、DM、F、D这五种灵芝酸是治疗HCC的主要活性成分;拓扑分析提示灵芝酸最可能作用于AKT1、SRC、ALB、MAPK3、MAPK1、STAT3、CASP3、JUN等靶点,参与多个生物学过程、细胞组分及分子功能,通过抑制增殖以及诱导凋亡、抑制相关病毒基因表达以及激活TNF信号通路等发挥治疗HCC的作用。分子对接表明Ganoderic acid C2可以与AKT结合。实验证明灵芝酸通过降低AKT1蛋白的表达抑制HCC细胞的增殖。结论:灵芝酸具有多通路、多靶点抗HCC的作用,可以为治疗HCC提供新方向。

关键词： 精品资源共享课   机能学实验室   本科课程   机能实验学   精品课   药理学   生理学   线上线下混合式  

摘要： 大连医科大学机能学实验室于1998年组建,将传统的生理学、药理学、病理生理学实验合并成为一门独立的机能实验学课程。机能实验学课程于2009年获评辽宁省精品课,2015年获评辽宁省精品资源共享课,2020年获评辽宁省线上线下混合式一流课程,2020年获评首届双万计划国家医学虚拟仿真一流课程,2023年获评第二批国家级一流本科课程。

关键词： 糖尿病溃疡   生肌玉红膏   网络药理学   基因本体功能注释   京都基因与基因组百科全书通路富集分析  

摘要： 目的基于网络药理学研究生肌玉红膏治疗糖尿病溃疡的作用机制。方法以口服生物利用度(OB)≥30%和类药性(DL)≥0.18为标准通过中药系统药理学数据库与分析平台检索生肌玉红膏的活性化学成分及作用靶点,使用Uniprot蛋白质数据库进行标准化处理获得靶点基因简写;检索GeneCards等数据库中糖尿病溃疡发病机制的相关基因靶点,使用Venny在线工具对生肌玉红膏作用靶点和糖尿病溃疡发病机制相关基因靶点进行交集处理,获得生肌玉红膏治疗糖尿病溃疡的潜在作用靶点;使用STRING数据库构建生肌玉红膏治疗糖尿病溃疡潜在作用靶点靶标蛋白质⁃蛋白质相互作用(PPI)网络,并用Cytoscape软件构建生肌玉红膏治疗糖尿病溃疡药物有效成分⁃作用靶点网络;使用Bioconductor生物信息软件包对生肌玉红膏治疗糖尿病溃疡核心作用靶点进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并对结果进行可视化处理。结果共获得生肌玉红膏作用靶点基因1842个、糖尿病溃疡发病机制相关基因靶点857个,分析处理后获得交集靶点(生肌玉红膏治疗糖尿病溃疡潜在作用靶点)108个;生肌玉红膏治疗糖尿病溃疡潜在作用靶点PPI网络结果显示,关键作用靶点共包含白细胞介素(IL)⁃6、RAC⁃α丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶⁃1(AKT⁃1)等28个;生肌玉红膏治疗糖尿病溃疡药物有效成分⁃作用靶点网络结果显示,关键化学成分包含槲皮素、7⁃甲氧基⁃2⁃甲基异黄酮等10个;GO功能注释结果显示,共涉及生物过程(BP)条目2403个、细胞组成(CC)条目64个、分子功能(MF)条目155个;KEGG通路富集分析结果显示,共涉及通路170条。结论生肌玉红膏中的槲皮素、7⁃甲氧基⁃2⁃甲基异黄酮、毛蕊异黄酮等多种活性化学成分可能通过作用于IL⁃6、AKT⁃1等多靶点调节晚期糖基化终末产物(AGE)⁃晚期糖基化终末产物受体(RAGE)、IL⁃1β/IL⁃23⁃IL⁃17A等多条信号通路发挥促进糖尿病溃疡创面愈合的作用。

关键词： 二至丸   阿尔茨海默病   代谢组学   网络药理学   槲皮素   组织蛋白酶D  

摘要： 本研究采用高通量血清代谢组学及网络药理学技术探究二至丸对阿尔茨海默病的药效机制。将60只雄性SD大鼠按体重随机分6组,每组10只,即为假手术组、模型组、阳性药组、低剂量组、中剂量组和高剂量组。模型组和各给药组大鼠给与D-半乳糖腹腔注射和双侧脑室注射β淀粉样蛋白25-35(Aβ25-35)建立阿尔茨海默病大鼠模型,模型制备第6周后,给药组每天给与相应药物进行干预,其他组给与相同体积生理盐水(4周),采用Morris水迷宫实验观测各组大鼠空间学习记忆能力,采用Western blotting检测大鼠海马tau蛋白表达。利用高通量血清代谢组学技术结合模式识别方法寻找内源性差异代谢物及相关代谢通路;采用网络药理学技术探究二至丸的潜在活性成分、关键靶点,进一步将代谢组学与网络药理学技术整合聚焦关键靶标及成分,最终采用分子生物学技术靶向验证。通过水迷宫实验及大鼠海马tau蛋白程度,证明模型制备成功。代谢组学结果显示模型组与假手术组代谢轮廓发生明显分离,给药组处于假手术组和模型组间,证明模型组大鼠的整体代谢发生显著变化,给与二至丸后呈现回调趋势。代谢组学结果发现16个生物标记物,主要涉及10个代谢通路。网络药理学结果显示二至丸内主要有β-谷甾醇、山柰酚、紫杉醇等13个潜在有效成分、与阿尔茨海默病相关的直接作用靶标有毒蕈碱型乙酰胆碱受体M1等11个蛋白成分。基于以上可知,二至丸对阿尔茨海默病大鼠有很好的干预作用,其可能通过槲皮素对组织蛋白酶D直接调控作用达到干预疾病的目的。

关键词： 丁苯酞   溶栓药物   联合给药   潜在靶点  

摘要： 目的丁苯酞是芹菜籽中提取的左旋芹菜甲素为基础人工合成的药物,临床试验已证实其联合阿替普酶的有效性与安全性,但其作用机制仍不明确。运用网络药理学探究丁苯酞联合阿替普酶抗急性脑缺血的作用机制。方法通过Pub⁃Chem及SwissTargetPrediction数据库寻找丁苯酞作用靶点;利用GeneCards、OMIM、TTD、Dis⁃GeNET数据库获取脑缺血相关靶点;使用生物分子功能注释系统STRING对丁苯酞抗脑缺血靶点集合进行GO富集、KEGG通路富集分析和PPI网络分析,构建丁苯酞抗脑缺血的“药物-靶点-通路”网络。根据|log FC|>1且P值<0.05筛选条件分析GSE21136基因芯片获取阿替普酶作用靶点,最终得到丁苯酞联合阿替普酶治疗急性脑缺血的作用靶点。结果丁苯酞可通过106个关键靶点作用于AGE-RAGE、HIF1等关键通路抗脑缺血;丁苯酞联合阿替普酶通过NLRP3、IL1B、VEGF等10个关键靶点作用于NLRP3-MMP9等通路治疗急性脑缺血。结论网络药理学能够揭示丁苯酞联合阿替普酶治疗急性脑缺血的作用机制,为进一步的机制研究提供借鉴。