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关键词： 稿件署名   授权书   journal   通讯作者   单位公章   投稿   温馨提示   版权  

摘要： 结合本刊的稿约及平时常见的问题,编辑部温馨提示:1.在线(https://***)投稿成功后,请尽快在线上传“版权专有使用授权书”,编辑部收到全部材料后方开始稿件的处理工作。2.“版权专有使用授权书”可在本刊网站的“投稿指南”下载;签名作者的顺序一定要与稿件署名顺序一致;不方便签字者,可由第一作者或通讯作者代签;加盖单位公章。

关键词： 虫草-川芎-黄芪-三七   特发性肺纤维化   网络药理学   分子对接   信号通路  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术探讨虫草-川芎-黄芪-三七配伍使用治疗特发性肺纤维化的潜在分子机制。方法借助网站Swiss Target Prediction、PubChem查询主要化学成分靶点,利用Home-OMIM、UniProt、DisGeNET、GeneCards数据库获取特发性肺纤维化靶点,基于STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI),利用Cytoscape3.7.0软件构建“活性成分-疾病-靶点”的相互作用网络调控图,同时,利用R语言进行基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)基因富集分析。最后,根据拓扑学参数筛选核心成分及核心靶点,并利用软件AutoDock 1.5.7进行分子对接。结果虫草-川芎-黄芪-三七共含有38种活性成分,药物靶点与疾病靶点的交集有88个,主要涉及磷脂酰肌醇-3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)、缺氧诱导因子(HIF)-1等信号通路。分子对接结果显示虫草-川芎-黄芪-三七中核心成分可较好地与用于治疗特发性肺纤维化的核心靶点接合。结论虫草-川芎-黄芪-三七联合用药可通过黄芪紫檀烷苷、槲皮素、异微凸剑叶莎醇、山柰酚等主要化学成分作用于PI3K-Akt、HIF-1等信号通路,以达到治疗特发性肺纤维化的目的,为进一步研究虫草、川芎、黄芪、三七联合用药治疗特发性肺纤维化的临床研究提供参考和依据。

关键词： 淫羊藿苷   前列腺癌   Notch1通路   网络药理学  

摘要： 目的结合网络药理学和动物实验研究淫羊藿苷对前列腺癌的干预作用及其机制。方法通过SwissTargetPrediction数据库预测淫羊藿苷作用靶点;通过String数据库构建蛋白互作网络,并运用Cytoscape 3.9.1筛选核心靶点;通过Metascape数据库对核心靶点进行基因本体(GO)生物过程富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析以预测作用机制。构建前列腺癌PC-3荷瘤小鼠模型,观察淫羊藿苷单用和联用紫杉醇对肿瘤的抑制作用。结果网络药理学预测淫羊藿苷具有治疗前列腺癌的作用,核心靶点可能是丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、B淋巴细胞瘤-2基因(BCL2)、表皮生长因子受体(EGFR)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、热休克蛋白90α家族B类成员(HSP90AB1)、细胞核因子κB亚基1(NF-κB1)、肿瘤蛋白p53等。动物实验发现,与模型对照组比较,淫羊藿苷组、紫杉醇组小鼠肿瘤生长得到显著抑制,并且血清中肿瘤坏死因子含量明显降低,但睾酮无明显变化;2组均可明显下调Notch1、Jagged1和Hes1的mRNA表达(P<0.05),而联合用药组的抑制作用更为显著。结论网络药理学和动物实验结果均证实淫羊藿苷对前列腺癌有明显的抑制作用,对肿瘤激活的Notch信号通路的抑制作用更显著,这可能是淫羊藿苷发挥抗肿瘤作用的机制之一。

关键词： 化疗   肌无力   归脾汤   炎症   TNF家族受体   趋化因子受体  

摘要： 目的应用网络药理学技术及生物信息学分析归脾汤对化疗肌无力的改善作用,并阐明其可能的相关机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索归脾汤潜在作用靶点,通过基因表达综合数据库(GEO)检索“肌无力”的相关靶点,用Venn软件获得归脾汤-肌无力的共同靶点,Cytoscape软件筛选获取归脾汤活性成分-作用靶点-相关疾病的网络图,利用MCODE插件筛选获取归脾汤改善肌无力的关键靶点。使用单样本基因集富集分析(ssGSEA)探索归脾汤改善肌无力可能涉及的核心免疫细胞,经基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)进行功能和通路富集分析,构建“归脾汤-关键靶点-主要通路-肌无力”的网络图。结果共得到394个药物靶向基因,914个肌无力相关靶点,构建MCODE网络获得归脾汤改善肌无力的35个keycluster基因,ssGSEA显示趋化因子受体及TNF家族成员受体与keycluster基因相关性最高。根据GO富集分析获得归脾汤改善肌无力的生物学过程主要涉及基因表达、细胞生物合成过程、及大分子代谢过程等的调控,KEGG富集分析显示主要涉及冠状病毒病、恰加斯氏病、IL-17信号通路、癌症、Toll样受体信号通路和TNF信号通路等。结论综上,归脾汤可能通过多靶点、多通路抑制肌肉内炎症水平,诱导HIF-1α的激活以对抗炎症所致的氧化应激,从而达到缓解化疗肌无力的作用。

关键词： 人参   甘草   网络药理学   抗衰老   作用机制  

摘要： 目的 本研究旨在基于网络药理学研究人参-甘草药对(Ginseng-Glycyrrhiza couplet,简称:GGC)对机体抗衰老作用的机制。方法 本研究采用TCMSP数据库获取GGC的活性成分和作用靶点;Gene Cards数据库和DisGeNET数据库检索相关文献获取衰老疾病靶点,将交集靶点上传至STRING数据库,构建蛋白互作PPI网络;使用DAVID数据库进行GO和KEGG富集分析;利用Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-成分-疾病-靶点”网络。结果 GGC含有活性成分115个,具有抗衰老作用靶点85个,可由槲皮素、山柰酚、芒柄花素和柚皮素等活性成分作用与TNF、IL1B、AK1T和IL6等靶点来调控PI3K-Akt、细胞衰老、TNF、JAK/STAT和NF-κB等信号通路达到抗衰老目的。结论 人参-甘草药对采用调节多成分、多靶点和多通路的方式达到抗衰老作用。

关键词： 黄蜀葵   非药用部位   多糖   慢传输型便秘   网络药理学  

摘要： 目的首先分析黄蜀葵根多糖的单糖组成,并进行治疗慢传输型便秘的作用评价,最后通过网络药理学、分子对接技术探讨黄蜀葵根多糖中改善慢传输型便秘的药效物质和分子机制。方法水提醇沉法制备黄蜀葵根多糖,通过离子色谱法测定黄蜀葵根多糖的单糖组成;采用盐酸洛哌丁胺(10 mg·kg^(-1))诱导的慢传输型便秘模型,以粪便含水率和小肠推进率两个指标评价其治疗便秘的治疗作用;通过苏木素-伊红(HE)染色法和免疫组化法检测结肠组织病理变化以及闭锁小带蛋白-1(ZO-l)蛋白和紧密连接蛋白claudin-1表达;利用RT-qPCR法检测各组结肠组织AQP3、AQP4、TNF-α、IL-1β和IL-6 mRNA表达水平,最后通过网络药理学和分子对接探究黄蜀葵根多糖治疗STC的潜在核心靶点及相关信号通路,探索其分子机制。结果黄蜀葵根多糖能增加小鼠粪便含水率及小肠推进率(P<0.01),抑制AQP3、AQP4、TNF-α、IL-1β和IL-6mRNA的表达(P<0.01,P<0.001)。同时,黄蜀葵根多糖高剂量组可保护结肠屏障的完整性并显著上调便秘小鼠结肠组织ZO-1和claudin-1蛋白表达。此外,网络药理学结果显示,鼠李糖、岩藻糖和葡萄糖醛酸主要作用于STAT3、JUN、CASP3、HSP90AA1、VEGFA和IL-1β等关键靶点,通过调节TRP通道的炎症介质调节、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性和糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路改善便秘。Western blot结果显示黄蜀葵根多糖干预可显著降低便秘小鼠结肠组织的CASP3、VEGFA和IL-1β3蛋白表达量。结论黄蜀葵根多糖可通过多成分、多靶点、多途径治疗慢传输型便秘,为后续的临床应用和药物开发提供科学依据(国家专利已授权ZL202310894613.3),有望促进黄蜀葵非药用部位的资源高效利用。

关键词： 天麻   原发性高血压   降血压   网络药理学  

摘要： 目的通过网络药理学探究天麻在降血压方面的潜在机制。方法从Disgenet和GeneCards数据库获取原发性高血压的靶点,天麻成分的靶点来自BATMAN-TCM数据库;通过筛选疾病靶点和药物成分靶点的交集,确定候选“药物-疾病”靶点;利用ExpressAnalyst网站进行基因本体富集分析,并采用WebGestalt进行京都基因与基因组百科全书富集分析,筛选前10位信号通路。使用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络,并通过Cytohubba筛选前10个关键靶点。借助Cytoscape软件构建“药物-成分-靶点-疾病”和“成分-靶点-通路”网络图。结果共筛选出原发性高血压的疾病靶点207个,筛选出天麻的活性成分14种,其中8种成分能调控原发性高血压的27个疾病靶点。这些靶点主要富集在昼夜节律、血管收缩、细胞钙离子稳态、节律性等生物进程中;涉及的分子功能包括核受体活性、细胞因子活性和激素活性等;靶点分布的细胞组分主要为胞质外区域。信号通路包括长寿信号通路、恰加斯病信号通路、神经活性配体-受体互作信号通路、白细胞介素-17炎性信号通路等。天麻的主要活性成分,如4-羟基苄胺、北豆根碱、蔗糖、间羟基苯甲酸、γ-谷甾醇通过调控TNF、PPARG、INS、ADIPOQ、NFKB1、MMP9、SERPINE1、IFNG 8个关键靶点,影响前10个关键信号通路,从而调控原发性高血压。结论天麻作为一种传统中药降压机制,涉及了多成分、多靶点和多通路的网络调控。

关键词： 消化系统肿瘤   靶向治疗   治疗学   结肠癌   胰腺癌   医疗体系   食管癌   癌症  

摘要： 癌症是实现健康中国战略的拦路虎。消化系统肿瘤,包括食管癌、胃癌、结肠癌、肝癌、胰腺癌等,在所有癌症中的比例超过50%。这类疾病不仅对患者造成了极大的身心负担,也对社会医疗体系提出了严峻的挑战。靶向治疗通过提升治疗的特异性和有效性,已经成为消化系统肿瘤治疗的关键环节。然而,肿瘤的可塑性和异质性使得消化系统肿瘤靶向治疗面临耐药和复发等挑战。

关键词： 心绞痛   网络药理学   佛手   香橼  

摘要： 目的:利用网络药理学方法探讨“佛手–香橼”药对在心绞痛患者中的临床价值。方法:本研究拟以“佛手–香橼”为研究对象,采用Cytoscape 3.7.2构建“活性成分–靶点”网络图谱。通过GeneCards数据库收集心绞痛的相关靶点,将药物的有效靶点与疾病相关靶点进行关联,选取交集靶基因上传STRING 11.0数据库建立蛋白质相互作用网络,并导入Cytoscape 3.7.2对其进行处理。利用Metascape平台对其进行GO富集分析与KEGG Pathway富集分析。结果:共获得佛手和香橼活性成分12个,对应靶点278个,心绞痛相关靶点4478个。药物–疾病作用核心靶点98个,其中包括AKT1、PPARG、PTGS2、SRC、BCL2、MAPK3、EGFR等。结论:通过上述研究,初步阐明“佛手–香橼”对心绞痛“多途径,多靶点”的作用机理,为“佛手–香橼”在冠心病心绞痛防治中的应用提供新的研究思路和理论依据。Objective: To investigate the clinical value of the “bergamot-citron” drug pair in angina pectoris patients using a network pharmacology approach. Methods: In this study, we used “bergamot-citron” as the research object, and Cytoscape 3.7.2 was used to construct an “active ingredient-target” network map. The GeneCards database was used to collect angina pectoris-related targets, correlate the effective targets of the drugs with the disease-related targets, select the intersecting target genes and upload them to the STRING 11.0 database to establish a protein interaction network, which was then imported into Cytoscape 3.7.2 for processing. The Metascape platform was used for GO enrichment analysis and KEGG Pathway enrichment analysis. Results: A total of 12 active components of bergamot and citron were obtained, corresponding to 278 targets, and 4478 angina-related targets. There were 98 drug-disease action core targets, including AKT1, PPARG, PTGS2, SRC, BCL2, MAPK3 and EGFR, etc. Conclusion: Through the above study, the mechanism of “multi-pathway, multi-target” of “bergamot-citron” on angina pectoris was initially elucidated, providing new research ideas and new applications of “Bergamot-citron” in the prevention and treatment of angina pectoris in coronary heart disease.

关键词： 参苓白术散   网络药理学   儿童肥胖   炎症   代谢紊乱   实验验证  

摘要： 目的借助网络药理学和分子对接方法,挖掘参苓白术散改善儿童肥胖脂肪组织炎症的有效成分及可能的作用靶点和机制,并通过动物实验进行初步验证。方法利用TCMSP数据库筛选参苓白术散活性成分和靶点,利用GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库获取疾病靶点,药物与疾病的靶点取交集后构建活性成分-靶点网络,构建蛋白相互作用网络并获取核心靶点,进行GO和KEGG通路富集分析,对关键成分与核心靶点进行分子对接。构建高脂饮食诱导的幼龄肥胖大鼠模型,予参苓白术散灌胃,检测大鼠血清三酰甘油、总胆固醇及附睾脂肪组织肿瘤坏死因子-α、白细胞介素-1β、γ干扰素、Fas mRNA表达。结果参苓白术散改善儿童肥胖微炎症的关键成分为荜茇明宁碱、金合欢素、木犀草素、海风藤酮、亚麻油酸乙酯、高丽槐素等,药物-疾病共同靶点515个,核心靶点为TP53、SRC、PIK3R1、HSP90AA1、PIK3CA。GO富集分析结果涉及炎症反应、MAPK级联正向调控、膜筏、丝氨酸/苏氨酸/酪氨酸蛋白激酶活性等,KEGG通路富集分析结果包含代谢、免疫、内分泌及癌症和相关肝病等信号通路。分子对接结果表明,关键成分与核心靶点具有良好的结合活性。动物实验结果表明,参苓白术散具有改善模型大鼠炎症指标及代谢指标的作用。结论参苓白术散能够通过多种活性成分调控多个靶点,影响多条信号通路,通过特定的生物学过程及相关通路调节炎性反应、调节免疫过程、改善胰岛素抵抗、调节糖脂代谢等,共同发挥改善儿童肥胖脂肪组织炎症的作用。