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关键词： 网络药理学   软坚清脉颗粒   动脉硬化闭塞症   ApoE^(-/-)小鼠   胆固醇代谢   脂质代谢   机制  

摘要： 目的:运用网络药理学探索软坚清脉颗粒(RJQM)治疗动脉硬化闭塞症(ASO)的潜在治疗靶点及机制,并利用载脂蛋白E基因缺陷(ApoE^(-/-))小鼠验证。方法:利用数据库分析RJQM作用于ASO的交集靶点,进行GO、KEGG信号通路分析。30只ApoE^(-/-)小鼠高脂饮食,随机分为模型组,RJQM低、中、高剂量组及阳性药组,每组6只。以同周龄C57BL/6J小鼠作为空白对照组。连续灌胃18周。测定血清中总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平,HE染色检测肝脏、主动脉弓形态学变化,油红O染色观察主动脉弓根部的病变程度,并结合qRT-PCR检测肝脏中ABCA1、ABCG5、ABCG8mRNA表达情况。结果:KEGG通路富集分析发现RJQM可能通过调节脂质代谢信号通路发挥治疗作用。与模型组比较,RJQM高剂量组TG水平显著降低(P<0.05);RJQM各剂量组肝脏细胞肿胀与脂肪空泡样得到改善,主动脉弓中粥样斑块面积显著减小(P<0.01),油红着色脂滴面积显著减小(P<0.05);RJQM高剂量组肝脏中ABCA1、ABCG5 mRNA表达显著上调(P<0.01);RJQM各剂量组ABCG8 mRNA表达显著下调(P<0.01)。结论:RJQM能够调控脂质和动脉硬化信号通路,通过影响脂质代谢途径发挥干预ASO的作用。

关键词： 百合   抑郁症   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的利用网络药理学及分子对接技术探讨百合治疗抑郁症的活性成分和作用机制。方法从TCMSP、ETCM、BATMAN-TCM和SymMap数据库筛选百合活性成分及药物靶点,用Genecards数据库预测抑郁症的疾病靶点,取药物靶点和疾病靶点交集,并在STRING数据库获得潜在靶点蛋白质-蛋白质互作网络,导入Cytoscape软件获得关键靶点和活性成分,利用DAVID数据库对关键靶点进行KEGG和GO富集分析,最后进行关键靶点与活性成分分子对接验证。结果4个数据库共发现百合治疗抑郁症的6种活性成分和52个关键靶点,分子对接验证了豆甾醇、β-谷甾醇、百合皂苷、26-O-β-D-吡喃葡萄糖基-3β,26-二羟基-Δ5-胆甾-16,22-二氧基-3-O-α-L-鼠李糖基-(1→2)-β-D-吡喃葡萄糖苷等活性成分与ESR1、CYP1A1、JUN、CYP3A4等关键靶点通过氢键、静电作用力和范德华力等形成稳定的构象。GO富集分析表明,关键靶点参与的功能主要与靶向膜的SRP依赖性共翻译蛋白、胞浆核糖体小亚单位、肿瘤坏死因子(tumornecrosisfactor,TNF)介导的信号通路调控等有关;KEGG富集分析表明,百合活性成分和关键靶点主要通过参与调节细胞凋亡、NOD样受体信号通路、RIG-I样受体信号通路、脂肪细胞因子信号通路和NF-κB信号通路而发挥治疗抑郁症的作用。结论百合治疗抑郁症是通过多成分、多靶点、多通路的调控机制而发挥作用,可为进一步开展百合抗抑郁作用机制的实验研究提供理论基础。

关键词： 夏麻化浊颗粒   缺血性中风   网络药理学   作用机制   分子对接  

摘要： 目的:基于痰湿瘀滞型中风病机理,应用网络药理学技术探究夏麻化浊颗粒治疗缺血性脑中风的有效成分及潜在的分子机制。方法:通过TCMSP平台、HERB数据库和Swiss Target Prediction数据库预测药物有关作用靶点,从GeneCards、OMIM和DrugBank数据库取交集获取缺血性脑中风(ischemic stroke,IS)的相关基因。利用Venn2.1.0平台将药物的成分靶点与IS相关的靶基因取交集,利用Cytoscape3.10.0进行“药物-成分-靶点”网络图的构建,并利用STRING平台构建蛋白互作(PPI)网络图,将获得的数据信息导入至Cytoscape3.10.0筛选获得关键靶点,并对该网络进行拓扑学分析。然后利用DAVID平台进行KEGG通路富集分析与GO功能富集分析,通过Cytoscape3.10.0构建“药物-成分-靶点-通路-疾病”网络图。最后进行分子对接,验证其紧密联系程度。结果:共筛选出夏麻化浊颗粒作用靶点928个,获得IS作用靶点1294个,两者取交集共得到273个。网络分析显示,药物作用于IS的主要有效成分为苏齐内酯(suchilactone)、棕榈酸(hexadecanoic acid)、香茅醛(citronellal)、β-谷甾醇(beta-sitosterol)、咖啡酸二甲醚(caffeic acid dimethyl ether)、4-ethoxymethylphenyl-4-hydroxybenzyl ether。PPI网络筛选出TP53、PTGS2、ALB、IL-6、ADORA2A、AKT16个关键核心靶点。GO功能富集分析(P<0.05)共获得1074个条目,KEGG通路富集分析(P<0.05)共获得180个条目,其中在AGE-RAGE信号通路、PI3K-Akt信号通路、cAMP信号通路等富集较多。分子对接结果表明,夏麻化浊颗粒主要有效成分与核心靶点有较好的结合性。结论:药物中的主要活性成分可作用于TP53、PTGS2、ALB、IL-6等多个靶点,并通过多条通路抑制细胞凋亡及炎症反应,提高抗氧化活性,发挥其治疗IS的作用。

关键词： 教学   药学   药理学   临床药理学   整合   优化  

摘要： 随着医药科技的快速发展和药品种类日益增多、药理知识不断更新,合理用药已成为临床上一个重要的课题,教育教学面临着新的挑战和机遇。为了适应时代和社会的发展、提高教育教学质量、提升学生就业满意度、提高学生药学服务的能力,医学教育必须不断创新和发展。整合教学资源是国内医学教育发展的必然趋势,以此减少知识重复,丰富学习内容,优化教育教学质量。本文通过对“药理学”和“临床药理学”的理论教学整合和优化,确保了知识的完整性和系统性,注重临床应用与基础理论的紧密结合。在教学设计、教学目标、教学内容、教学资源、教学模式、教学团队和教学评价方面实施整合优化,以此推进职业教育又好又快地发展,打造出“适用、实用”的专业药学人才。

关键词： 网络药理学   细菌性肠胃炎   分子对接   大黄   决明子  

摘要： 背景:已有基于大黄、决明子、枳实、三七治疗细菌性肠炎的临床给药策略,但其靶向机制不明确,作用具体位点不清晰。目的:阐明大黄、决明子、枳实、三七联合用药的作用机理和靶向机制。方法:采用TCMSP等药理学数据库获得潜在靶点,构建PPI和“中药–活性成分–靶点”网络图,筛选核心成分靶点并进行分子对接。结果:四种药物的活性成分包括大黄素、泽兰黄醇、豆甾醇等。该药物治疗交集靶点49个,KEGG筛选出富集得到的14条相关信号通路,分子对接结果表明,关键活性成分与核心靶点都有较好的亲和力。结论:大黄、决明子、枳实、三七中的大黄素、裘皮素、木犀草素、β-谷甾醇等主要通过AKT1、SRC等通路调控疾病进展。Background: Clinical drug delivery strategies based on Rhubarb, Cassia, Citrus aurantium and Panax ginseng for the treatment of bacterial enteritis have been developed, but the targeting mechanism is unclear and the specific site of action is not clear. Objective: To elucidate the mechanism of action and targeting mechanism of the combination of Rhubarb, Cassia, Citrus aurantium and Panax ginseng. Methods: TCMSP and other pharmacological databases were used to obtain potential targets, construct PPI and “TCM-active ingredient-target” network diagrams, and screen the core component targets and perform molecular docking. Results: The active ingredients of the four drugs included rhodopsin, zeylanol and stigmasterol. The drug therapy intersected 49 targets, and KEGG screened 14 relevant signaling pathways obtained from the enrichment, and the molecular docking results showed that the key active ingredients had good affinity with the core targets. Conclusion: Rhubarb, Cassia, Citrus aurantium and Panax ginseng in rhubarb, cucurbitacin, lignocerosin, and β-sitosterol mainly regulate the disease progression through the pathways of AKT1, SRC, and so on.

关键词： 网络药理学   分子对接   保苓汤   2型糖尿病   肺部感染  

摘要： 目的基于网络药理学及分子对接技术探讨保苓汤治疗2型糖尿病合并肺部感染的作用机制。方法通过TCMSP数据库筛选保苓汤的活性成分及作用靶点;利用GeneCards等数据库筛选2型糖尿病合并肺部感染的疾病靶点;利用VennDiagram.R软件包对药物和疾病作用靶点取交集并绘制Venn图;利用Cytoscape等软件对“药物活性成分-靶点-疾病”进行网络可视化构建;利用STRING数据库构建蛋白互作网络,根据拓扑学参数筛选核心靶点,并利用Autodock_vina等软件将核心靶点与相对应药物活性成分进行分子对接。利用R软件对药物-疾病共同靶点基因进行GO功能富集和KEGG通路分析。结果筛选出保苓汤药物有效活性成分219个,2型糖尿病合并肺部感染疾病相关基因靶点4222个,药物-疾病共同作用靶点基因47个,其中STAT3、TP53、CCND1等靶点可能与2型糖尿病合并肺部感染密切相关,保苓汤治疗2型糖尿病合并肺部感染主要涉及脂质和动脉粥样硬化通路、PI3K-Akt信号通路、细胞因子介导的信号通路等。结论保苓汤可能通过多成分、多靶点、多通路治疗2型糖尿病合并肺部感染,调节机体脂质和动脉粥样硬化通路、PI3K-Akt信号通路等,以达到调节机体糖、脂质代谢紊乱,减轻机体炎症反应的作用。

关键词： 唐草片   艾滋病   网络药理   分子对接  

摘要： 目的 通过网络药理学与分子对接技术解析唐草片对艾滋病的治疗机制。方法 通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)收集唐草片活性成分,通过SwissTargetPrediction数据库预测其成分靶点,利用GeneCards、OMIM数据库检索疾病靶点。利用STRING平台绘制PPI网络图,并通过CytoScape 3.9.1软件构建中药-成分-靶点网络,利用DAVID数据库进行GO分析与KEGG分析,借助AutoDockTools1.5.7软件进行分子对接验证。结果 唐草片治疗艾滋病的核心活性成分为槲皮素、木犀草素、山柰酚、黄芩素、异鼠李素等,核心靶点为AKT1、IL-6、TNF、STAT3、EGFR等。GO分析主要涉及磷酸化、RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正调控、信号转导等生物过程,KEGG分析主要涉及PI3K-Akt、MAPK、Ras等信号通路。分子对接显示,关键成分与核心靶点结合活性良好。结论 唐草片可能通过槲皮素、木犀草素、山柰酚、黄芩素、异鼠李素等成分,作用于AKT1、IL-6、TNF、STAT3、EGFR等靶点,调节PI3K-Akt、MAPK、Ras等信号通路治疗艾滋病。

关键词： 网络药理学   分子对接计算   通窍耳聋丸   眩晕  

摘要： 目的采用网络药理学及分子对接技术,研究通窍耳聋丸治疗眩晕的作用机制。方法利用TCMSP和其他网络数据得到通窍耳聋丸中有效成分及其治疗眩晕的靶点,构建靶点-靶点及药物-靶点间相互作用网络,然后对靶点进行GO功能和KEGG信号通路富集分析及分子对接研究。结果通窍耳聋丸中共有108种成分与眩晕相关的132个潜在靶点存在相互作用。这些靶点主要分布于钙离子信号、神经活性配体-受体相互作用、多巴胺能突触、多种神经退行性疾病、血清素突触、人类巨细胞病毒感染、瞬时受体电位(TRP)通道的炎症介质调节、血脂和动脉粥样硬化等8条通路。分子对接计算表明通窍耳聋丸中部分有效成分对丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、血管紧张素转化酶(ACE)、血管紧张素Ⅱ受体1(AGTR1)和钙调蛋白1(CALM1)具有较强的亲和力。结论通窍耳聋丸可通过降血压、降血脂、抗炎、抗病毒、神经保护等途径发挥治疗眩晕的作用,可作为抗眩晕药物进行进一步开发和研究。

关键词： 灵芝蜂胶胶囊   肝细胞癌   网络药理学   单细胞转录组   分子对接  

摘要： 目的采用网络药理学和单细胞转录组分析方法研究灵芝蜂胶胶囊抗肝细胞癌的潜在机制。方法利用TCMSP、本草组鉴(HERB)和SwissTargetPrediction数据平台,获得灵芝和蜂胶的活性成分及靶点。基于TCGA数据库获取肝癌RNAseq数据,运用R软件包DESeq2进行差异分析,将差异基因与药物靶点的交集基因作为灵芝蜂胶胶囊抗肝细胞癌的潜在靶点基因。采用R软件包clusterProfilter进行GO和KEGG富集分析。利用Cox和KM方法对交集靶点进行筛选,再使用GEO数据库中的GSE14520进行生存分析再次筛选得到核心基因。利用分子对接进行核心靶点基因和对应成分的模拟结合。采用GSE149614数据对核心基因进行单细胞分析,并对关键基因在多种癌症中的生存预后进行分析。采用qPCR验证灵芝蜂胶对HepG2和Huh7细胞的干预作用。结果基于网络药理学成功鉴定出肝细胞癌差异基因706个,灵芝蜂胶潜在作用靶点603个,二者交集靶点29个。富集分析结果主要涉及神经活性配体-受体相互作用和细胞周期等。满足生存分析筛选的关键靶点为AURKB、CCNA2、CCNB1、CCR3、CDK1、PLK1、TOP2A和TTK。分子对接结果表明这些关键基因与对应成分均具有良好的结合能力。qPCR结果显示灵芝蜂胶可显著抑制HepG2和Huh7细胞中AURKB基因的表达。结论灵芝蜂胶可能通过过氧麦角甾醇等成分作用于AURKB等基因参与细胞周期等过程发挥抗肝细胞癌的作用,为进一步研究提供思路和参考。

关键词： 网络药理学   固本止崩汤   崩漏   排卵障碍性异常子宫出血   作用机制  

摘要： 通过运用网络药理学的多个数据库筛选固本止崩汤治疗崩漏的有效成分,探讨其作用机制。方法 通过多个数据库联用检索和文献挖掘,筛选固本止崩汤的主要活性成分及其靶点,运用STRING平台对交集靶点进行蛋白-蛋白相互作用网络分析,利用Cytoscape3.10.3 软件构建固本止崩汤成分-靶点-通路网络,通过交互靶点GO功能分析和KEGG通路富集分析研究固本止崩汤和崩漏的相关生物学过程和信号通路。结果 得到固本止崩汤中58种药物有效活性成分,736个潜在药物治疗靶点,958个疾病靶点,其中疾病靶点与药物靶点交集共有108个。通过GO功能分析和KEGG通路富集分析发现,靶基因主要富集在癌症通路、癌症中的蛋白聚糖、钙信号通路等信号通路上以发挥治疗作用。结论 固本止崩汤具有多成分、多靶点、多通路的特点,可通过调节不同靶点来调控不同的信号通路达到治疗崩漏的作用,可为进一步深入的临床研究提供科学依据。