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关键词： 丹红注射液   支气管哮喘   网络药理学   作用机制   富集分析  

摘要： 目的探讨丹红注射液(DHI)治疗支气管哮喘(BA)的有效活性成分,潜在作用靶点和作用机制。方法运用TCMSP和UniProt平台获取DHI的有效活性成分及对应靶基因;从GeneCards数据库收集BA相关靶标;通过Venny 2.1网站对DHI有效活性成分对应靶标和BA疾病靶标取交集;利用Cytoscape(V3.7.2)构建药物-成分-靶标-疾病网络图。运用STRING数据库对交集靶标进行蛋白质互作分析以及安装Cytoscape的cytoHubba插件确定中枢靶点。最后,利用Metascape数据库对交集靶标进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共得到DHI有效活性成分73个和对应的靶基因247个,BA相关靶点1616个,交集靶点149个。DHI治疗BA的有效活性成分有槲皮素、木犀草素、黄芩苷等,主要治疗靶点有信号传导及转录激活因子3(STAT3)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、白细胞介素6等,涉及的主要通路包括癌症通路、晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)信号通路、白细胞介素17信号通路、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶(PI3K-AKT)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等。结论DHI是通过多活性成分、多治疗靶点、多信号通路起治疗BA的作用。

关键词： 清肺排毒汤   急性呼吸窘迫综合征   网络药理学   肺动脉血气   丝裂原活化蛋白激酶信号通路  

摘要： 目的:基于网络药理学的方法研究清肺排毒汤对油酸(OA)+脂多糖(LPS)诱导的急性呼吸窘迫综合征(Acute respiratory distress syndrome,ARDS)的作用机制,并通过动物实验进行验证。方法:通过TCMSP、TCMID数据库筛选出清肺排毒汤活性成分及靶点;利用GEO和CTD数据库筛选出ARDS相关潜在靶点;根据韦恩图获取清肺排毒汤与ARDS的交集靶点;利用String数据库构建交集靶点的蛋白互作网络(PPI);通过David数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)分析和基因组百科全书通路(KEGG)富集分析;采用Cytoscape软件构建药物-成分-靶点-通路网络图,选择一条关键通路进行动物实验验证。结果:筛选出清肺排毒汤治疗ARDS的化学成分442个,关键蛋白105个。GO分析得到2790个条目,发现潜在靶点可以作用于活性氧代谢过程的调节、细胞对化学的应激反应、蛋白质丝氨酸/苏氨酸激酶活性的调节等生物过程;KEGG通路分析共富集到182条通路,其中包括丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、PI3K-AKT信号通路、Kaposi肉瘤相关疱疹病毒感染、脂质和动脉粥样硬化等。动物实验结果显示,清肺排毒汤对ARDS大鼠模型动脉血气指标有明显改善,肺系数、肺通透指数、肺病理评分显著降低,ARDS大鼠肺组织中p-ERK及p-P38MAPK蛋白的表达下调(P<0.05或P<0.01)。结论:清肺排毒汤对ARDS大鼠模型具有很好的保护作用,可通过抑制MAPK信号通路活化缓解大鼠ARDS。

关键词： 养心消痹汤   稳定型心绞痛   冠心病   网络药理学   作用机制   槲皮素   山奈酚   木犀草素   β-谷甾醇   丹参酮ⅡA  

摘要： 目的运用网络药理学方法探讨养心消痹汤治疗冠心病稳定型心绞痛的作用机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索养心消痹汤组方各味中药成分及其靶点信息,利用DrugBank和Therapeutic Target Database(TTD)数据库收集冠心病稳定型心绞痛疾病靶点;使用STRING数据库构建上述靶点信息蛋白质-蛋白质互作网络并导入Cytoscape软件进行分析与可视化图形构建。结果获得养心消痹汤治疗冠心病稳定型心绞痛靶点信息共计126个,相互作用关系2305种,度值排名靠前的化合物有槲皮素、山奈酚、木犀草素、β-谷甾醇和丹参酮ⅡA等;GO与KEGG分析结果显示养心消痹汤可能通过影响细胞组分运动、脂质定位、氧化应激、DNA转录、凝血过程、三磷腺苷代谢、免疫与炎症反调控、钙离子转运等生物过程发挥治疗冠心病稳定型心绞痛作用,缺氧诱导因子-1、Toll样受体、C-型凝集素受体、流体剪切和动脉粥样硬化、辅助性T细胞17/白细胞介素-17、T细胞受体、肿瘤坏死因子、松弛素和晚期搪基化终产物及其受体信号通路可能参与该过程。结论养心消痹汤治疗冠心病稳定型心绞痛的物质基础与机制可能与上述化学成分及相关生物学过程与信号通路有关。

关键词： 结肠息肉   人参   茯苓   白术   网络药理学  

摘要： 目的:采用网络药理学方法研究人参-茯苓-白术防治结肠息肉复发的作用机制。方法:通过TCMSP等数据库获取人参、茯苓、白术药物有效成分并预测靶点,结合PharmGKb、GeneCard等数据库获取疾病靶点,利用Venny2.1找到交集靶点。通过STRING、CytoNCA和R语言构建蛋白互作网络并识别核心靶点。采用Metascape进行KEGG和GO富集分析,Cytoscape构建“药物-成分-靶点-通路”网络图,AutoDockTools和PyMOL进行分子对接分析。结果:人参、茯苓、白术共有9个核心成分,包括山柰酚、常春藤皂苷元等,以及27个核心靶点,如AKT1、ESR1等。GO富集分析显示主要富集过程涉及对激素的反应、对脂质的细胞反应、对无机物质的反应、细胞迁移的正调控、炎症反应的调控等,KEGG分析显示人参、茯苓、白术防治结肠息肉主要要与NF-κB信号通路、促性腺激素释放激素信号通路、TGF-β信号通路和内分泌抵抗等信号通路有关。分子对接结果显示,这些成分与核心靶点有良好的结合能力。结论:人参、茯苓、白术的多种有效成分通过多种作用靶点以及多种信号通路协同防治结肠息肉。

关键词： OBE理念   药理学   教学改革  

摘要： 分析了“药理学”教学现状及存在问题,通过修订教学大纲、优化教学内容、建设线上课程资源平台、打造“金课”、改革考评体系等方式,积极探索并实施了基于OBE理念的混合式教学改革,确保学生的中心地位,培养学生综合能力,提高综合素质,以适应职业岗位需求。

关键词： 网络药理学   瓜蒌   低氧   大鼠   平滑肌   细胞   增殖   迁移  

摘要： 目的运用网络药理学和体外实验方法探究瓜蒌对低氧诱导的大鼠肺动脉平滑肌细胞增殖、迁移的影响。方法利用TCMSP、Pubchen、Swiss Target Prediction、GeneCards、OMIM、DisGeNET、STRING、PDB等数据库预测瓜蒌作用于低氧性肺动脉高压的潜在靶点基因,筛选出核心靶点基因后进行富集分析,采用分子对接技术验证网络药理学预测结果,通过体外实验观测瓜蒌提取物对低氧诱导的大鼠肺动脉平滑肌细胞增殖、迁移的影响。结果通过综合多个数据库得到210个瓜蒌抗低氧性肺动脉高压潜在靶点基因,进一步筛选得到IL6、ESR1、AKT1、BCL2等43个核心靶点基因。GO、KEGG富集分析结果表明,瓜蒌通过影响PI3K/AKT和FoxO、Ras等信号通路发挥抗低氧性肺动脉高压作用。在分子对接实验中,瓜蒌中的多种成分与多种靶点基因有着良好的结合能力。通过体外实验发现,瓜蒌提取物可以抑制低氧诱导的大鼠肺动脉平滑肌细胞的增殖、迁移。结论瓜蒌提取物可以通过多成分、多靶点、多通路抑制低氧诱导的大鼠肺动脉平滑肌细胞的增殖、迁移,进而对低氧性肺动脉高压发挥保护作用。

关键词： 加味真武汤   慢性肺心病心力衰竭   网络药理学   提壶揭盖法   ERK/AP-1信号通路  

摘要： 目的通过网络药理学及动物实验探讨基于“提壶揭盖法”的加味真武汤治疗慢性肺心病(Chronic pulmonary heart disease,CPHD)心力衰竭的主要信号通路及潜在作用靶点。方法通过中药系统药理学分析平台(Traditional chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)获取加味真武汤的活性成分和对应靶蛋白,Uniprot数据库获取对应靶基因;GeneCards数据库获取CPHD心力衰竭靶基因;Venny在线软件构建韦恩图,获取交集靶基因;采用STRING数据库构建蛋白互作(Protein protein interaction,PPI)网络,获得加味真武汤治疗CPHD心力衰竭的潜在核心靶基因,Cytoscape软件对结果进行可视化;Metascape数据库对潜在核心靶基因进行基因本体论(Gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析,获取加味真武汤治疗CPHD心力衰竭的主要信号通路,微生信在线软件将结果进行可视化。采用腹腔注射野百合碱溶液方法构建右心力衰竭大鼠模型,留取大鼠外周血及心脏标本。采用ELISA检测右心力衰竭大鼠外周血中TNF-a、MMP9、MMP2的含量,Western Blot、免疫组化检测右心力衰竭大鼠右心组织中ERK、p-ERK、c-Fos、c-Jun、p-c-Jun蛋白的表达水平;采用HE染色行病理检查观察右心力衰竭大鼠右心组织结构改变。采用IBM SPSS 26.0软件进行统计分析。结果通过网络药理学筛选获得加味真武汤药物有效活性成分53个,其中潜在核心有效活性成分29个;药物靶基因238个,疾病靶基因7412个,药物、疾病共有靶基因227个,其中潜在核心靶基因51个。GO分析获得1381条生物进程(Biological process,BP)、36条细胞组分(Cellular com⁃ponent,CC)、211条分子功能(Molecular function,MF);KEGG通路富集分析获得PI3K/AKT、MAPK、IL-17、TNF等共262条信号通路。动物实验结果显示加味真武汤可调控ERK/AP-1信号通路活性,抑制模型大鼠外周血中MMP-2、MMP-9、TNF-α的表达,下调右心组织中ERK、P-ERK、c-fos、c-jun、p-c-jun蛋白表达水平,减轻右心力衰竭大鼠心肌组织的病理改变。结论基于“提壶揭盖法”的加味真武汤在CPHD心力衰竭中具有多成分、多靶点、多通路共同作用的特点;加味真武汤可显著抑制ERK/AP-1信号通路活性,通过下调ERK、P-ERK、c-fos、c-jun、p-c-jun、MMP-2、MMP-9、TNF-α蛋白表达来发挥CPHD心力衰竭的治疗作用。

关键词： 网络药理学   分子对接   黄芪   莪术   中枢神经炎症  

摘要： 目的:基于网络药理学结合分子对接探究黄芪-莪术改善中枢神经炎症的潜在靶点和信号通路。方法:通过中药系统药理学数据库,BATMAN-TCM数据库检索“黄芪-莪术”药对的主要活性成分和作用靶标,GeneCards数据库筛选出中枢神经炎症疾病靶点,利用Cytoscape3.7.1建立“药物-成分-作用靶点”网络图,venny2.1.0做韦恩图交集图,获取黄芪-莪术-中枢神经炎症交集基因。利用String数据库获取蛋白质互作关系图,利用在线分析平台DAIVID对靶点进行基因本体(gene ontology,GO)功能富集和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,筛选出靶标蛋白的功能及其相关机制通路,利用Auto Dock软件对药物主要成分与核心靶点进行分子对接分析。结果:黄芪-莪术中共含有包括槲皮素、山奈酚、莪术醇、大豆苷元等129种重要活性成分,作用于包括AKT1、STAT3、IL-6、IL-1β、TNF、BCL-2、IFNG、JUN在内的543个疾病药物治疗的潜在靶点。GO和KEGG富集分析发现这些靶点广泛富集于HIF-1、TNF、和IL-17等一系列信号通路中,核心活性成分也与核心靶点紧密结合。结论:黄芪-莪术可能通过AKT1、STAT3、IL-6、IL-1β、TNF、BCL-2、IFNG、JUN等核心靶点,调节HIF-1、TNF、和IL-17等通路发挥改善中枢神经炎症的作用,进而为中医药治疗中枢神经炎症提供了科学依据和参考。

关键词： 黄连   慢性牙周炎   药物-成分-靶点   网络药理学  

摘要： 目的:基于中药网络药理学探讨黄连治疗慢性牙周炎的分子作用机制。方法:利用中药系统药理学综合数据库(TCMSP)筛选黄连有效活性成分及作用靶点,利用Genecards数据库筛选慢性牙周炎的靶点基因并取交集基因。利用Cytoscape构建“药物-成分-靶点”网络及利用String数据库构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络、关键子网络和关键基因,并基于Webgestalt数据库对关键子网络进行京都基因与基因组百科全书功能(KEGG)富集分析。结果:研究筛选出14个黄连有效成分和92个交集基因,并构建2个关键子网络,确定Top 5关键靶点:白细胞介素6(IL-6)、白细胞介素-1α(IL-1α)、C-C基序趋化因子2(CCL2)、白细胞介素-1β(IL-1β)、白细胞介素-10(IL-10)。KEGG结果显示,主要富集通路包括通过乳铁蛋白(LTF)危险信号、光动力疗法诱导核因子κB(NF-κB)、细胞因子和炎症应答、脂肪细胞因子、小细胞肺癌相关、过氧化物酶体增殖物活化受体(PPAR)信号通路等。结论:黄连可通过作用于IL-6、IL-1α、CCL2、IL-1β、IL-10等靶点,调控LTF危险信号、光动力疗法诱导NF-κB、细胞因子和炎症应答、脂肪细胞因子、小细胞肺癌相关、PPAR等信号通路参与对慢性牙周炎的调节作用。

关键词： 糖尿病足   当归补血汤   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:运用网络药理学与分子对接探究当归补血汤治疗糖尿病足的作用机制。方法:运用TCMSP、PubChem、SwissTargetPrediction收集药物活性成分及对应靶点,采用GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库筛选疾病靶点;运用韦恩图获取成分与疾病的交集靶点,导入STRING数据库、Cytoscape软件绘制蛋白网络图和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图;对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用分子对接验证药物成分和核心靶点结合能力。结果:获得28个活性成分和500个对应靶点,主要成分包括阿魏酸、β-谷甾醇、豆甾醇和藁本内酯等;核心靶点涵盖丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、肿瘤坏死因子、表皮生长因子受体、雌激素受体1、信号传导及转录激活蛋白3等;主要作用于糖基化终末产物-糖基化终末产物受体信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路和磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B信号通路。分子对接结果显示成分与靶点之间可自由结合。结论:当归补血汤可通过其多种活性成分作用于众多靶点,联合调控多条信号通路,协同发挥对糖尿病足的治疗作用。