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关键词： 苎麻根   胃癌   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:采用网络药理学和分子对接的方法分析苎麻根治疗胃癌作用机制。方法:通过TCMSP以及中国知网、万方等数据库的文献资料,检索苎麻根的活性成分和成分靶点,采用GeneCards、DisGeNET等数据库收集疾病靶点,绘制苎麻根活性成分-胃癌主要靶点的关系图和胃癌靶点的互作关系图,利用ClusterProfiler包进行GO和KEGG通路分析,分子对接验证预测结果并进行渲染。结果:通过筛选及查找文献获得11个苎麻根有效活性成分,包括β-谷甾醇、大黄素、棕榈酸、常春藤皂苷元、熊果酸等;77个潜在靶点,涉及ALB、SRC、MDM2、MAPK8、PIK3R1、MAPK14等;苎麻根活性成分通过1203个生物学过程和142条KEGG通路治疗胃癌。分子对接结合能位于-4.6 kcal/mol与-12.4 kcal/mol之间,对接结果良好。结论:苎麻根治疗胃癌可能是通过协调多成分、多靶点、多通路的综合效果。

关键词： 网络药理学   白头翁汤   结直肠癌   作用机制   实验验证  

摘要： 目的运用网络药理学结合实验验证探讨白头翁汤治疗结直肠癌的作用机制。方法在中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)数据库中寻找与白头翁、黄连、黄柏、秦皮相关的活性分子及靶点。在人类基因数据库(GeneCards)、靶点数据库(therapeutic target database,TTD)、孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)搜索结直肠癌相关靶点。将白头翁汤有效成分的靶点与结直肠癌靶点取交集获得共同靶点,利用Cytoscape 3.7.2软件构建“药物-成分-靶点-疾病”网络。采用蛋白质互作数据库(search tool for recurring instances of neighbouring genes,STRING)平台进行蛋白质相互作用(protein-protein interaction networks,PPI)网络的构建与分析。同时分别利用DAVID数据库(database for annotation,visualization and integrated discovery)和Bioconductor中的R包clusterProfiler进行基因本体论(gene ontology,GO)富集和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and gnomes,KEGG)通路富集分析。采用噻唑蓝溴化四唑(methylthiazolyldiphenyl-tetrazolium bromide,MTT)实验检测白头翁汤处理过的人结肠癌细胞SW480增殖情况,同时在细胞水平利用蛋白质印迹法(Western-blotting)和定量聚合酶链反应(quantitative polymerase chain reaction,q-PCR)对网络药理学预测出的核心靶点及通路进行初步验证。结果从白头翁汤中筛选得到53个活性成分,作用于结直肠癌的交集靶点157个。网络药理学分析显示白头翁汤中的槲皮素、β-谷甾醇等活性成分通过作用于关键靶点原癌基因JUN(Jun proto-oncogene,JUN)、蛋白激酶B1(protein kinase B1,Akt1)、丝裂原活化蛋白激酶1(mitogen-activated protein kinase 1,MAPK1)等以及调控白介素17(interleukin 17,IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)信号通路、缺氧诱导因子-1(hypoxia-inducible factor 1,HIF-1)信号通路等信号通路治疗结直肠癌。细胞实验证实白头翁汤能够有效抑制SW480细胞增殖、下调靶点蛋白p-Akt和p-p38 MAPK的表达、抑制IL-17、TNF-α、HIF-1α的mRNA水平。结论白头翁汤能够通过调控AKT1、MAPK1等靶点以及调控IL-17、TNF、HIF-1等信号通路,从而治疗结直肠癌。

关键词： 蠲痹止痛汤   网络药理学   膝关节骨性关节炎   分子对接   靶点  

摘要： 目的应用网络药理学及分子对接技术研究蠲痹止痛汤治疗膝关节骨性关节炎(knee osteoarthritis,KOA)的作用机制。方法通过TCMSP、Swisstarget、TTD、GeneCards及DisGeNET等数据库检索筛选蠲痹止痛汤中的有效成分、潜在靶点及KOA的疾病靶点,药物靶标与疾病靶点取交集,相关数据库作PPI网络分析得到8个关键基因,行基因本体(GO)和基因组百科全书(KEGG)分析,得到干预作用于KOA的可能作用通路,行关键基因及对应化合物分子对接,选择结合力最强的前三组行可视化展示。结果获得蠲痹止痛汤有效化合物151个及对应靶点490个,OA靶标1230个,映射交集靶点140个,其中关键靶点PTPN11、NFKB1、RELA、AKT1、PIK3R1、TNF、MAPK1、NFKBIA共8个。靶点可能作用于膜筏、质膜的外侧面、囊腔等细胞结构,涵盖磷酸酶绑定、四吡咯绑定、丝氨酸型肽链内切酶活性、丝氨酸水解酶活性、跨膜受体蛋白激酶活性等功能,涉及对炎症反应调节、细胞对化学压力的反应、蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶活性正调控、老化等生物过程,富集的信号通路包含细胞凋亡、NF-κB信号通路、MAPK信号通路、PI3K-AKT信号通路、类风湿性关节炎等通路。结论蠲痹止痛汤通过PTPN11、NFKB1、RELA、AKT1、PIK3R1、TNF、MAPK1、NFKBIA靶点,作用于PI3K/AKT、细胞凋亡、NF-κB信号通路、MAPK信号通路,抑制炎症、改善软骨凋亡,干预治疗KOA。

关键词： 《药理学》   课程思政   思政元素   专业必修课程  

摘要： 药理学是药学的专业基础课,是研究药物与机体之间相互作用规律的一门学科。课程思政是近年来高校教育改革的新方向,在此背景下,作为国家一流专业的药学中的药理学课程也需要因时而进、因势而新。综合该门课的课程特点,可以挖掘的思政元素有很多,在传授知识的同时引导学生树立正确的世界观、人生观和价值观,真正实现价值引领与知识传授的有机融合;探讨思政育人的必要性,探究思政元素融入课堂教学的实现路径和改革效果,以期实现专业教学和思政教育的相辅相成。*通讯作者。Pharmacology is a basic course of pharmacy, which studies the interaction between drugs and the body. Course ideological and political education is a new direction of higher education reform in recent years. In this context, pharmacology courses in pharmacy, as a national first-class major, also need to be updated with the times and trends. Based on the characteristics of this course, there are many ideological and political elements that can be explored. While imparting knowledge, it guides students to establish correct worldviews, outlooks on life, and values, truly achieving the organic integration of value guidance and knowledge imparting;exploring the necessity of ideological and political education, and the implementation path and reform effect of integrating ideological and political elements into classroom teaching, in order to achieve a seamless integration of professional teaching and ideological and political education.

关键词： 萸精降糖方   2型糖尿病   网络药理学   分子对接  

摘要： [目的]利用网络药理学和分子对接技术预测萸精降糖方治疗2型糖尿病(T2DM)的作用机制。[方法]利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和中药分子机制生物信息分析工具(BATMAN-TCM)数据库筛选萸精降糖方的有效成分和潜在靶点。利用人类基因数据库(GeneCards)、疾病相关的基因与突变位点数据库(DisGeNET)和人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取2型糖尿病靶点,获得药物-疾病的共同靶点。利用STRING数据库和Cytoscape3.7.2构建靶点蛋白互作(PPI)网络。进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并利用Cytoscape3.7.2构建“药物-有效成分-靶点-通路”的网络图。使用Auto Dock Vina 1.1.2对PPI网络图中的核心靶点和萸精降糖方的有效成分进行分子对接。[结果]萸精降糖方治疗T2DM有88个有效成分和377个潜在靶点,311个为交集靶点。从PPI网络图中可以观察到TP53、AKT1等可能成为治疗T2DM的核心靶点。对关键靶点进行GO和KEGG富集分析发现,GO富集的生物学过程包括伤口愈合、对异生物刺激反应等;细胞组成包括膜筏、膜微区等;分子功能包括DNA结合转录因子结合、RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合转录因子结合等。KEGG通路富集包括脂质与动脉粥样硬化通路、AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路等。分子对接结果显示,槲皮素、山柰酚与核心靶点TP53、AKT1具有良好的结合活性。[结论]研究初步探讨了萸精降糖方中有效成分在治疗T2DM方面的潜在作用机制,通过多成分、多靶点、多途径的协同作用,达到治疗T2DM的目的。

关键词： 藜麦籽粒   三萜皂苷   2型糖尿病   网络药理学   分子对接  

摘要： 籽粒作为藜麦可食用部分,被证明富含黄酮、多酚、皂苷等生物活性成分。藜麦籽粒皂苷类化合物在治疗2型糖尿病方面具有潜在的作用,但其治疗作用机制尚不清楚且相关研究较少。文章通过网络药理学对藜麦籽粒中的三萜皂苷治疗2型糖尿病的作用机制进行探讨,结果发现这些三萜皂苷类化合物可能通过HIF-1、PI3K/AKT等信号通路发挥治疗作用;并通过分子对接对预测到的靶点进行验证,结果显示化合物22与MTOR、STAT3、MAPK1以及TLR4等靶点的对接亲和力较高。

关键词： 线上线下   翻转课堂   药理学   教学改革  

摘要： “药理学”是研究药物与机体(包括病原体)相互作用及作用规律的一门学科,是药学与临床医学桥梁课程,为临床合理用药奠定了理论基础。同时,药理学也在新药研发过程中处于前端环节,随医药行业的快速发展,新冠疫情爆发以来国家对原研药发展的重视与新时代人才培养所需,我校药理学教学团队对药理学课程进行优化改革。笔者运用信息化教学辅助工具,以线上线下混合式教学模式进行“药理学”课堂教学,通过翻转课堂、案例分析等多种教学模式提高学生学习的积极性、创新性以及课堂教学效果。同时,完善学生的知识结构和能力结构,培养药学领域复合应用型和科技创新型的一流医药学人才,提高药理学课堂教育的多样性,为药理学教育教学改革提供了方向并积累了教学经验。

关键词： 升陷汤   糖尿病酮症酸中毒   网络药理学   靶基因预测   通路富集分析  

摘要： 基于网络药理学探讨升陷汤治疗糖尿病酮症酸中毒(DKA)的分子靶标。方法 在TCMSP数据库中检索升陷汤各味药物活性成分及靶蛋白。使用Genecards、CTD、OMIM和Drugbank等系统导出介导疾病的蛋白,通过String数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络研究,通过Cytoscape3.9.0软件实现可视化分析。利用David数据库对交集的154个共同靶点开展KEGG富集分析,并使用微生信在线绘图网站绘制气泡图。结果 在升陷汤76个有效活性成分中,筛选出154个与DKA有关的有效活性靶点。PPI网络分析升陷汤治疗DKA可能是通过TP53、HSP90AA1、MAPK1、RELA、AKT1、TNF、MAPK14、IL6等关键靶点发挥作用。KEGG富集分析显示,升陷汤主要通过调控脂质与动脉粥样硬化(Lipid and atherosclerosis)和AGE-RAGE信号通路(AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complications)等信号通路发挥作用。结论 升陷汤可通过干预AKT1、TP53、HSP90AA1、RELA等关键靶蛋白达到治疗DKA疾病的目的。

关键词： 冬菀止咳颗粒   咳嗽变异性哮喘   网络药理学   分子对接   作用机制   中药复方  

摘要： 目的利用网络药理学和分子对接技术挖掘冬菀止咳颗粒治疗咳嗽变异性哮喘(CVA)的作用机制。方法通过TCMSP平台筛选出冬菀止咳颗粒的活性成分及潜在靶点;在Genecard、disgenet及OMIM数据库检索CVA的有关靶点;运用在线韦恩图网站绘制平台得到共有靶点,再将信息导入Cytoscope 3.9.0软件和STRING在线分析平台,开展网络拓扑分析,构建“中药-化合物-靶点-疾病”网络图及蛋白互作网络图;综合上述两个网络图筛选出冬菀止咳颗粒治疗CVA的核心靶点,将这些核心靶点代入DAVID数据库进行GO和KEGG通路富集分析,采用AutoD ockT ools 1.5.7软件对核心靶点和冬菀止咳颗粒活性成分进行分子对接。结果在数据库中设置阈值进行筛选,得到药物活性成分78个,药物靶点283个,疾病靶点1354个,以及共同靶点144个。GO功能富集分析得到828条生物过程、95条细胞学功能、144条分子功能,KEGG富集到基因通路30条,分子对接发现β-谷甾、槲皮素、醇木犀草素、山柰酚、丁香酚与AKT1、TNF基因具有较好的结合潜力。结论本研究在一定程度上表明冬菀止咳颗粒的活性成分与CVA发病的关键蛋白之间存在一定关联,通过多成分、多靶点以及多通路协同整合调控以达成治疗功效,为冬菀止咳颗粒治疗CVA的作用机制带来了新的思考方向与靶点线索。

关键词： 贝母瓜蒌散   网络药理学   咳嗽  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接探索贝母瓜蒌散治疗咳嗽的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取贝母瓜蒌散的有效活性成分及其作用的靶点信息,并利用GenGards与DisGeNET数据库获取治疗咳嗽的靶点信息。将贝母瓜蒌散中的有效活性成分及其作用的靶点信息与治疗咳嗽的靶点信息录入至Venny平台取得交集靶点信息,利用Cytoscape软件构建“药物—成分—靶点”网络图。将交集靶点信息录入到DAVID数据库进行GO功能富集分析与KEGG通路富集分析。应用AutoDock软件对筛选的核心成分与核心靶点进行分子对接,并利用pymol软件进行可视化处理。结果:筛选出贝母瓜蒌散中有效活性成分33个,107个交集靶点。GO功能富集分析显示生物过程得到580条;细胞组分得到77条;分子功能得到97条;KEGG通路富集分析共得到信号通路168条。分子对接结果显示核心成分与核心靶点对接时具有良好的结合能力。结论:贝母瓜蒌散在治疗咳嗽中具有多成分、多靶点的特点与优势,为进一步中医治疗咳嗽的临床用药及机制研究提供了理论基础。