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关键词： 苎麻根   胃癌   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:采用网络药理学和分子对接的方法分析苎麻根治疗胃癌作用机制。方法:通过TCMSP以及中国知网、万方等数据库的文献资料,检索苎麻根的活性成分和成分靶点,采用GeneCards、DisGeNET等数据库收集疾病靶点,绘制苎麻根活性成分-胃癌主要靶点的关系图和胃癌靶点的互作关系图,利用ClusterProfiler包进行GO和KEGG通路分析,分子对接验证预测结果并进行渲染。结果:通过筛选及查找文献获得11个苎麻根有效活性成分,包括β-谷甾醇、大黄素、棕榈酸、常春藤皂苷元、熊果酸等;77个潜在靶点,涉及ALB、SRC、MDM2、MAPK8、PIK3R1、MAPK14等;苎麻根活性成分通过1203个生物学过程和142条KEGG通路治疗胃癌。分子对接结合能位于-4.6 kcal/mol与-12.4 kcal/mol之间,对接结果良好。结论:苎麻根治疗胃癌可能是通过协调多成分、多靶点、多通路的综合效果。

关键词： 附子   药理学   毒理学   综述,学术性  

摘要： 附子为毛茛科乌头(aconitum carmichaeli debx.)属植物的子根,其性辛、甘,大热,有毒,归心、肾、脾经,有回阳救逆、补火助阳、散寒止痛之功效,是回阳救逆第一要药,对多种疑难重症疾病具有显著的疗效。目前认为,附子的主要活性成分是水溶性成份,包括生物碱类(去甲乌药碱、去甲猪毛菜碱、乌头原碱等)、多糖、香豆素苷及尿嘧啶等[1]。药理学研究表明,附子中的有效成分具有保护心脏、抗炎镇痛、抗肿瘤和调节调节免疫功能等作用。附子含多种生物碱,如腺苷、腺嘌呤、士的宁等,这些生物碱具有较强的毒性。因此,附子在临床上需谨慎使用[2-3]。本文对近十年附子的药理学、毒理学相关研究进行分析和归纳总结,以期全面了解附子的研究动态,促进其临床研发及应用。

关键词： 痔疮   中药专利复方   数据挖掘   配伍规律   网络药理学   作用机制  

摘要： 目的:挖掘痔疮治疗外用中药复方专利的配伍规律,并探讨其核心药对乳香-没药作用机制。方法:检索国家知识产权局专利公布公告网站建库至2022年10月10日治疗痔疮的外用中药复方专利数据,用Excel 2019进行数据汇总、筛选和清洗,再通过SPSS Modeler 18和SPSS Statistics 26软件进行频数统计、关联规则、系统聚类和因子分析,分别通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、Drugbank、TTD和Disgenet数据库获得药物和疾病靶点,找出交集靶点后再通过DAVID数据库进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,构建药物-靶点-疾病关联图,探索潜在作用机制。结果:纳入中药复方专利163项,包括药物397味,高频药物有冰片、黄柏、五倍子等,以苦寒、归肝经最多;最常用的药对有乳香-没药等6对;关联规则产生核心药物28种,聚类分析将药物归为4大类。核心药对乳香-没药与痔疮的共同靶点共13个,GO分析发现29个生物过程、9个细胞组分和12个分子功能;KEGG通路分析获得主要通路15条。结论:临床外用复方治疗痔疮可选择活血化瘀、清热燥湿解毒、凉血止血、收敛止血,药性偏寒、味辛苦,归肝、脾经的中药。核心药物乳香-没药作用于痔疮可能与抗氧化反应及凋亡过程等生物过程,线粒体外膜、细胞核膜、T小管等细胞组分,血红素结合、序列特异DNA结合等分子功能相关,通过氨酸类代谢、含血清素神经突触、心肌细胞肾上腺素能信号等通路,作用于黄体酮受体基因孕酮受体(Progesterone Receptor,PGR)、前列腺素氧化环化酶(Prostaglandin-Endoperoxide Synthase,PTGS)2及糖皮质激素受体基因核受体亚家族3C组成员1(Nuclear Receptor Subfamily 3,Group C,Member 1,NR3C1)等靶点发挥治疗痔疮的作用。

关键词： GLP-1受体激动剂   阿尔茨海默症   药理学  

摘要： GLP-1受体激动剂在临床上主要用于2型糖尿病的降糖治疗,并具有潜在的减重作用,而目前也开始尝试应用于治疗高血压、非酒精性肝病、抑郁症及神经退行性疾病等病症。尤其在阿尔茨海默症的治疗方面,大量的动物模型及一些临床研究已经展现了GLP-1受体激动剂潜在的疗效,它有很大可能成为治疗阿尔茨海默症药物谱的新秀。目前关于GLP-1受体激动剂治疗阿尔茨海默症的机制的研究,主要基于深入剖析阿尔茨海默症的致病机理,以及探索其与糖尿病的共病机制等方面展开。本文主要综述了GLP-1受体激动剂在治疗阿尔茨海默症的机制方面的最新进展,并介绍了目前在动物研究及临床研究中的最新成果,以期为后续GLP-1受体激动剂治疗阿尔茨海默症的基础研究和临床应用提供参考。

关键词： 黄蜀葵   非药用部位   多糖   慢传输型便秘   网络药理学  

摘要： 目的首先分析黄蜀葵根多糖的单糖组成,并进行治疗慢传输型便秘的作用评价,最后通过网络药理学、分子对接技术探讨黄蜀葵根多糖中改善慢传输型便秘的药效物质和分子机制。方法水提醇沉法制备黄蜀葵根多糖,通过离子色谱法测定黄蜀葵根多糖的单糖组成;采用盐酸洛哌丁胺(10 mg·kg^(-1))诱导的慢传输型便秘模型,以粪便含水率和小肠推进率两个指标评价其治疗便秘的治疗作用;通过苏木素-伊红(HE)染色法和免疫组化法检测结肠组织病理变化以及闭锁小带蛋白-1(ZO-l)蛋白和紧密连接蛋白claudin-1表达;利用RT-qPCR法检测各组结肠组织AQP3、AQP4、TNF-α、IL-1β和IL-6 mRNA表达水平,最后通过网络药理学和分子对接探究黄蜀葵根多糖治疗STC的潜在核心靶点及相关信号通路,探索其分子机制。结果黄蜀葵根多糖能增加小鼠粪便含水率及小肠推进率(P<0.01),抑制AQP3、AQP4、TNF-α、IL-1β和IL-6mRNA的表达(P<0.01,P<0.001)。同时,黄蜀葵根多糖高剂量组可保护结肠屏障的完整性并显著上调便秘小鼠结肠组织ZO-1和claudin-1蛋白表达。此外,网络药理学结果显示,鼠李糖、岩藻糖和葡萄糖醛酸主要作用于STAT3、JUN、CASP3、HSP90AA1、VEGFA和IL-1β等关键靶点,通过调节TRP通道的炎症介质调节、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性和糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路改善便秘。Western blot结果显示黄蜀葵根多糖干预可显著降低便秘小鼠结肠组织的CASP3、VEGFA和IL-1β3蛋白表达量。结论黄蜀葵根多糖可通过多成分、多靶点、多途径治疗慢传输型便秘,为后续的临床应用和药物开发提供科学依据(国家专利已授权ZL202310894613.3),有望促进黄蜀葵非药用部位的资源高效利用。

关键词： 刺五加   肉苁蓉   帕金森病   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接技术探讨刺五加-肉苁蓉治疗帕金森病的作用机制。方法:通过BATMAN-TCM数据库筛选刺五加-肉苁蓉的化学成分及其相关靶点,并从GeneCards、OMIM、TTD中搜集帕金森病的相关靶点,提炼出药物与疾病两者的交集靶点。运用Cytoscape 3.10.1软件和STRING绘制“药物-成分-靶点-疾病”可视化网络图,并筛选出核心成分和关键靶点。借助DAVID对靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,使用TCMSP、RCSB PDB、Autodock vina、PyMOL 2.1.0软件进行化合物与关键靶点分子配体与靶基因蛋白受体对接及可视化处理。结果:共筛选出33种药物有效活性成分,876个药物靶点,9377个疾病相关基因。获得药物、疾病交集基因598个,其中关键靶点为鸟嘌呤核苷酸结合蛋白α亚基基因(GNAS)、肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、原癌基因(JUN)、谷氨酸-草酰乙酸转氨酶2(GOT2)。GO功能富集分析共获得1723条条目,主要包括电压门控钠通道活性、突触后膜电位的调节等生物过程;KEGG通路主要涉及代谢通路、神经退行性变的途径-多种疾病等158条相关通路。分子对接结果表明,药物有效成分槲皮素与关键靶点GNAS有较强结合能力。结论:刺五加-肉苁蓉可多成分、多途径、多靶点治疗帕金森病,为进一步研究该药对治疗帕金森病的作用机制提供了参考。

关键词： 网络药理学   软坚清脉颗粒   动脉硬化闭塞症   ApoE^(-/-)小鼠   胆固醇代谢   脂质代谢   机制  

摘要： 目的:运用网络药理学探索软坚清脉颗粒(RJQM)治疗动脉硬化闭塞症(ASO)的潜在治疗靶点及机制,并利用载脂蛋白E基因缺陷(ApoE^(-/-))小鼠验证。方法:利用数据库分析RJQM作用于ASO的交集靶点,进行GO、KEGG信号通路分析。30只ApoE^(-/-)小鼠高脂饮食,随机分为模型组,RJQM低、中、高剂量组及阳性药组,每组6只。以同周龄C57BL/6J小鼠作为空白对照组。连续灌胃18周。测定血清中总胆固醇(TC)、甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)和高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)水平,HE染色检测肝脏、主动脉弓形态学变化,油红O染色观察主动脉弓根部的病变程度,并结合qRT-PCR检测肝脏中ABCA1、ABCG5、ABCG8mRNA表达情况。结果:KEGG通路富集分析发现RJQM可能通过调节脂质代谢信号通路发挥治疗作用。与模型组比较,RJQM高剂量组TG水平显著降低(P<0.05);RJQM各剂量组肝脏细胞肿胀与脂肪空泡样得到改善,主动脉弓中粥样斑块面积显著减小(P<0.01),油红着色脂滴面积显著减小(P<0.05);RJQM高剂量组肝脏中ABCA1、ABCG5 mRNA表达显著上调(P<0.01);RJQM各剂量组ABCG8 mRNA表达显著下调(P<0.01)。结论:RJQM能够调控脂质和动脉硬化信号通路,通过影响脂质代谢途径发挥干预ASO的作用。

关键词： 痛风性肾病   铁死亡   四妙散   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接探讨四妙散调控铁死亡治疗痛风性肾病(Gouty Nephropathy,GN)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)获取四妙散活性成分并预测相关作用靶点,构建有效成分-靶点数据库。在人类基因数据库(GeneCards)和疾病基因数据库(DisGeNET)获取GN相关靶点。利用微生信网站获取四妙散和GN的交集靶点。利用Cytoscape 3.10.0软件绘制药物-成分-疾病-靶点网络图。通过STRING数据库分析蛋白质-蛋白质相互作用关系并绘制网络图。利用DAVID数据库对交集靶点进行基因本体论(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。在FerrDB数据库获取铁死亡相关靶点,综合分析四妙散、GN和铁死亡之间的关系,并将度值居前5位的活性成分和核心靶点进行分子对接验证。结果:共得到四妙散72种活性成分、对应靶点757个,GN靶点181个,铁死亡靶点511个,取三者的交集,共获得14个靶点。由蛋白质-蛋白质相互作用网络分析发现,丝裂原活化蛋白激酶(Mitogen-Activated Protein Kinase,MAPK)1、信号转导和转录激活因子(Signal Transducer and Activator of Transcription,STAT)3、V-rel网状内皮细胞病毒癌基因同源物A(Recombinant V-Rel Reticuloendotheliosis Viral Oncogene Homolog A,RELA)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(Peroxisome Proliferator Activated Receptor γ,PPARγ)、Toll样受体(Toll-like Receptor,TLR)4及非受体酪氨酸激酶(Non-Receptor Tyrosine Kinase,SRC)为调控铁死亡的核心靶点。KEGG富集分析显示,四妙散调控铁死亡治疗GN主要通过介导肿瘤坏死因子(Tumor Necrosis Factor,TNF)、核因子-κB(Nuclear Factor kappa B,NF-κB)及MAPK信号通路实现。分子对接结果表明,四妙散主要活性成分与核心靶点有较好的结合能力。结论:四妙散治疗GN主要通过多成分、多靶点、多通路,推测调控铁死亡通路可能为重要的作用机制。

关键词： 苍耳子   网络药理学   分子对接   肝毒性   炮制减毒   实验验证  

摘要： 目的基于网络药理学和分子对接技术并结合体内外实验研究炮制对苍耳子肝毒性的影响。方法通过中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology,TCMSP)、毒性与基因比较数据库(The Comparative Toxicogenomics Database,CTD)筛选苍耳子的毒性成分,利用Swiss Target Prediction数据库获取毒性成分作用靶点;检索Genecards数据库和DisGeNET数据库中肝相关疾病靶点,通过绘制韦恩图获取苍耳子毒性成分靶点和肝疾病相关靶点的交集;通过Cytoscape软件构建“药物-毒性成分-靶点”网络,利用STRING数据库对苍耳子肝毒性作用靶点进行蛋白质相互作用(protein-proteininteraction,PPI)分析并筛选关键靶点;利用Metascape数据库对上述关键靶点进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopediaof Genesand Genomes,KEGG)通路富集分析。使用Auto Docktools和PyMOL软件对苍耳子的肝毒性成分和核心靶点进行分子对接验证。体外实验采用MTS法比较苍耳子不同炮制品对正常肝细胞株(L-02)毒性,并测定培养液中乳酸脱氢酶(lactatedehydrogenase,LDH)释放,利用流式细胞仪检测细胞的凋亡情况。体内实验检测灌服苍耳子不同炮制品小鼠血清中谷丙转氨酶(Alanineaminotransferase,ALT)和谷草转氨酶(Aspartateaminotransferase,AST)活性。结果网络药理学分析苍耳子肝毒性成分主要包括羧基苍术苷(carboxyatractyloside)、谷甾醇(sitosterol)、豆甾醇(stigmasterol)等,其核心靶点主要为PPARG、PPARA、NR1H3等。GO功能富集到脂质定位和储存的正、负调节和脂质代谢过程调节等生物过程;转录调节复合物、神经细胞体和受体复合物等细胞组分,转录因子结合、核受体结合和蛋白质结构域特异性结合等分子功能。KEGG通路富集到非酒精性脂肪肝、脂质和动脉粥样硬化、酒精肝、胰岛素抵抗和PPAR等信号通路。分子对接结果显示,肝毒性化合物与核心靶点能较好地结合。体外实验结果显示,苍耳子生品明显促进L-02细胞LDH释放,显示具有明显的细胞毒性,并能诱导细胞凋亡(P<0.05),炮制品能减少LDH释放,降低细胞毒性,诱导细胞凋亡作用减弱,其中酒炙品效果更明显。体内实验结果显示,苍耳子生品显著升高正常小鼠血清中AST和ALT的活性(P<0.05),炮制品无显著影响(P>0.05)。结论炒制和酒炙炮制方法可能通过减弱PPARA、PPARG和NR1H3等肝毒性靶点效应改善脂质代谢信号通路异常,从而降低苍耳子肝毒性,且酒炙法减毒效果更好。

关键词： 网络药理学   细菌性肠胃炎   分子对接   大黄   决明子  

摘要： 背景:已有基于大黄、决明子、枳实、三七治疗细菌性肠炎的临床给药策略,但其靶向机制不明确,作用具体位点不清晰。目的:阐明大黄、决明子、枳实、三七联合用药的作用机理和靶向机制。方法:采用TCMSP等药理学数据库获得潜在靶点,构建PPI和“中药–活性成分–靶点”网络图,筛选核心成分靶点并进行分子对接。结果:四种药物的活性成分包括大黄素、泽兰黄醇、豆甾醇等。该药物治疗交集靶点49个,KEGG筛选出富集得到的14条相关信号通路,分子对接结果表明,关键活性成分与核心靶点都有较好的亲和力。结论:大黄、决明子、枳实、三七中的大黄素、裘皮素、木犀草素、β-谷甾醇等主要通过AKT1、SRC等通路调控疾病进展。Background: Clinical drug delivery strategies based on Rhubarb, Cassia, Citrus aurantium and Panax ginseng for the treatment of bacterial enteritis have been developed, but the targeting mechanism is unclear and the specific site of action is not clear. Objective: To elucidate the mechanism of action and targeting mechanism of the combination of Rhubarb, Cassia, Citrus aurantium and Panax ginseng. Methods: TCMSP and other pharmacological databases were used to obtain potential targets, construct PPI and “TCM-active ingredient-target” network diagrams, and screen the core component targets and perform molecular docking. Results: The active ingredients of the four drugs included rhodopsin, zeylanol and stigmasterol. The drug therapy intersected 49 targets, and KEGG screened 14 relevant signaling pathways obtained from the enrichment, and the molecular docking results showed that the key active ingredients had good affinity with the core targets. Conclusion: Rhubarb, Cassia, Citrus aurantium and Panax ginseng in rhubarb, cucurbitacin, lignocerosin, and β-sitosterol mainly regulate the disease progression through the pathways of AKT1, SRC, and so on.