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关键词： 当归四逆汤   稳定型心绞痛   网络药理学   分子对接   张仲景   《伤寒论》  

摘要： 目的:基于网络药理学与分子对接研究当归四逆汤治疗稳定型心绞痛(stable angina pectoris,SAP)的作用机制。方法:使用SyMmap数据库和中药系统药理学数据库与分析平台检索当归四逆汤组方中药甘草、大枣、当归、桂枝、细辛、通草和白芍的化学成分及相关靶点;在GeneCards数据库获取SAP相关疾病靶点;取SAP疾病相关靶点和当归四逆汤组方中药活性成分相关靶点的交集,即为当归四逆汤治疗SAP的潜在靶点,并绘制韦恩图。利用STRING 11.5数据库对潜在靶点进行蛋白质相互作用(protein protein interaction,PPI)网络分析并筛选核心靶点。采用Cytoscape 3.10.1构建“中药-活性成分-潜在靶点”网络,并筛选关键成分。采用Matascape对潜在靶点进行基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析。利用PyMOL4.6.0对关键靶点和成分进行分子对接。结果:从当归四逆汤组方中药共筛选得到155种化学成分及1728个相关靶点;在GeneCards数据库获得SAP相关靶点1089个;取交集得到当归四逆汤治疗SAP的潜在靶点121个。PPI网络分析发现信号传导及转录激活蛋白3(signal transducer and activator of transcription 3,STAT3)、B细胞淋巴因子2(B cell lymphoma 2,BCL2)、蛋白激酶B1(protein kinase B1,PKB1,又称AKT1)等为核心靶点;“中药-活性成分-潜在靶点”网络分析筛选出槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇等为关键成分。GO分析得到4688个生物过程,404个细胞组分和715个分子功能;KEGG分析得到磷脂酰肌醇3-激酶(phosphoinositide 3-kinase,PI3K)-AKT、缺氧诱导因子1(hypoxia-inducible factor 1,HIF1)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)等200条信号通路。分子对接显示活性成分与靶点对接良好。结论:当归四逆汤中的多个化学成分通过调控多个相关靶点参与多条信号通路发挥治疗SAP的作用。

关键词： 原发性痛经   中药   代谢组学   网络药理学   药效物质基础  

摘要： 原发性痛经是一种普遍影响育龄女性的妇科疾病,具有较高的患病率。尽管非甾体抗炎药和激素是常用的一线用药,但不良反应大。中药以其良好的疗效和低不良反应,在临床上获得广泛应用。然而,中药复杂的“多成分-多靶点-多途径”作用特点导致其作用机制尚不明确。代谢组学提供了一种全局分析生物体内源性代谢物变化的方法,而网络药理学通过系统生物学和网络分析手段,揭露了药物的多靶点作用机制。作为新兴研究领域,代谢组学和网络药理学符合中医药的“整体观”和“系统论”,成为探究中药作用机制的有力工具,在揭示中药治疗原发性痛经作用机制方面发挥了重要作用。通过对代谢组学和网络药理学在阐明中药治疗原发性痛经作用机制进行综述,为中药的临床治疗提供更系统的科学依据。

关键词： 肾间质纤维化   冬肾丸   作用机制   网络药理学   分子对接技术  

摘要： 目的:基于网络药理学方法和分子对接技术探讨冬肾丸治疗肾间质纤维化的作用机制。方法:通过TCMSP、HERB获取冬肾丸的药物活性成分,利用SwissTargetPrediction预测活性成分的作用靶点,检索GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库获取疾病相关靶点,利用Venny 2.0得到药物与疾病交集靶点,采用STRING数据库构建交集靶点蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape 3.10.0筛选核心靶点,借助DAVID数据库对核心靶点进行基因本体(GO)功能、京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:获得冬肾丸药物活性成分250种,作用靶点676个,肾间质纤维化相关靶点2069个,交集靶点240个,核心靶点43个。主要活性成有黄芩苷、4',5-二羟基黄酮、木犀草定、槲皮素、白玉兰素B、海风藤酮等,核心靶点包括蛋白激酶B1(AKT1)、表皮生长因子受体(EGFR)、转录激活蛋白3(STAT3)、肿瘤坏死因子(TNF)、胱天蛋白酶3(CASP3)、氨基末端激酶(JUN)、B细胞淋巴瘤2(BCL2)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK3)等。GO功能主要涉及细胞凋亡、炎症、氧化磷酸化等,KEGG通路主要涉及核因子κB(NF-κB)、钙通道、环磷酸鸟苷-蛋白激酶G(cGMP-PKG)等。结论:冬肾丸可能通过AKT1、EGFR、STAT3等靶点来调控NF-κB等信号通路而发挥抗炎、抗氧化、调节细胞凋亡、抑制EMT、脂质代谢等药理作用,从而改善肾纤维化。

关键词： 糖尿病足   当归补血汤   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:运用网络药理学与分子对接探究当归补血汤治疗糖尿病足的作用机制。方法:运用TCMSP、PubChem、SwissTargetPrediction收集药物活性成分及对应靶点,采用GeneCards、OMIM、DisGeNET数据库筛选疾病靶点;运用韦恩图获取成分与疾病的交集靶点,导入STRING数据库、Cytoscape软件绘制蛋白网络图和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图;对交集靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用分子对接验证药物成分和核心靶点结合能力。结果:获得28个活性成分和500个对应靶点,主要成分包括阿魏酸、β-谷甾醇、豆甾醇和藁本内酯等;核心靶点涵盖丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、肿瘤坏死因子、表皮生长因子受体、雌激素受体1、信号传导及转录激活蛋白3等;主要作用于糖基化终末产物-糖基化终末产物受体信号通路、丝裂原活化蛋白激酶信号通路和磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B信号通路。分子对接结果显示成分与靶点之间可自由结合。结论:当归补血汤可通过其多种活性成分作用于众多靶点,联合调控多条信号通路,协同发挥对糖尿病足的治疗作用。

关键词： 苍耳丸   鼻窦炎   网络药理学   分子对接   分子机制  

摘要： 目的:基于网络药理学和分子对接分析苍耳丸治疗鼻窦炎的分子机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)以及Cytoscape3.9.1筛选并判断出苍耳丸主要活性成分。通过GeneCards、OMIM等数据库获取鼻窦炎的主要靶点,运用STRING平台构建药物-疾病靶点的蛋白质相互作用(PPI)网络模型,筛选出核心靶点。采用Metascape数据平台对交集靶点进行基因本体论(GO)功能富集分析和京都基因与基因百科全书(KEGG)通路富集分析。最后使用Autodock软件对主要活性成分及核心靶点进行分子对接验证。结果:苍耳丸调治鼻窦炎的主要活性成分是槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇等,核心靶点有细胞肿瘤抗原p53(TP53)、蛋白激酶B1(AKT1)、转录因子p65(RELA)等,在分子对接验证中,主要活性成分与核心靶点对接结果的能量均低于-5 kcal/mol,说明结合活性较好。结论:苍耳丸主要活性成分通过调节磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)-AKT、Janus激酶-信号转导和转录激活因子(JAK-STAT)等信号通路,降低炎症因子的分泌,从而发挥治疗鼻窦炎的作用。

关键词： 支架理论   药理学   钙通道阻滞药   教学  

摘要： 目的:探讨支架理论在药理学“钙通道阻滞药”章节教学中的应用。方法:选取中山大学2021级临床医学五年制本科班8个班共186人为研究对象,对其进行基于支架理论的“钙通道阻滞药”教学,并通过问卷调查对授课满意度、教学方法、授课的逻辑性、课堂学习氛围、学习兴趣、理解程度和学习质量等方面进行教学质量和学习效果评价。结果:对授课资源的满意度及对课程的总体满意度均为100%;教学方法满意度为95.70%;授课逻辑性满意度为100%;课堂学习氛围满意度为99.46%;学习兴趣满意度为94.62%;对学习内容理解程度的满意度为98.92%;学习质量满意度为99.46%。结论:支架理论在“钙通道阻滞药”教学中行之有效,值得进一步推广使用。

关键词： 莪术醇   肝星状细胞   衰老   肝纤维化   网络药理学   自噬  

摘要： 目的基于网络药理学和实验验证探究莪术醇对肝星状细胞衰老的分子机制。方法采用Pharm Mapper数据库获取莪术醇作用靶点;在GeneCard、OMIM、PharmGKB数据库收集细胞衰老相关靶点。通过对莪术醇作用靶点和细胞衰老相关靶点进行交互处理得到关键靶点。基于String数据库构建关键靶点互作网络并通过Cytoscape软件进行可视化。对关键靶点进行途径和功能的富集分析,同时将关键靶点与莪术醇进行分子对接分析。借助分子生物学试验检测莪术醇对肝星状细胞衰老的作用及机制。结果共获取莪术醇作用靶点152个,细胞衰老相关靶点2937个,莪术醇调控细胞衰老关键靶点71个。富集分析发现关键靶点主要参与代谢过程、转录因子活性、抗氧化活性等,主要富集在IL-17、VEGF、Ras、自噬、MAPK等信号通路。分子对接结果表明莪术醇与关键靶点具有较好的结合能力。CCK8试验发现莪术醇显著抑制了细胞增殖(P<0.01);分子生物学试验发现莪术醇阻滞细胞周期在G0/G1期(P<0.05);提高细胞衰老与自噬相关蛋白的表达(P<0.05);抑制MAP8和MAPK14 mRNA以及细胞外基质表达(P<0.01);透射电镜检测发现莪术醇显著增加自噬小体数量(P<0.01);β-半乳糖苷酶染色检测发现莪术醇诱导细胞衰老的作用被3-MA挽救。结论莪术醇通过靶向MAPK8和MAPK14调控细胞自噬,诱导肝星状细胞衰老可能是莪术醇防治肝纤维化的关键机制之一。

关键词： 壮骨镇痛胶囊   骨转移癌痛   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 利用网络药理学和实验验证揭示壮骨镇痛胶囊治疗骨转移癌痛的活性成分及作用机制。首先,运用中药系统药理学数据库平台(TCMSP)和中药分子机制的生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)获取壮骨镇痛胶囊的化学成分及靶点,GeneCards数据库获得骨转移癌痛的疾病靶点,然后通过Venn、Cytoscape、String及DAVID数据库分析壮骨镇痛胶囊治疗骨转移癌痛的潜在活性成分、核心靶点及作用通路之间的关系,使用Auto Dock进行分子对接分析,最后通过建立骨转移癌痛大鼠模型进行实验验证。网络药理学结果显示壮骨镇痛胶囊治疗骨转移癌痛的活性成分可能为槲皮素、木犀草素、异补骨脂素,关键靶点可能为蛋白激酶B(protein kinase B,AKT1)、肿瘤蛋白53(tumor protein 53,TP53)、表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)等,主要富集于丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、磷脂酰肌醇激酶(phosphatidylinositol 3 kinase,PI3K)-AKT、核因子κB受体(nuclear factor kappa B,NF-κB)等通路。实验结果表明壮骨镇痛胶囊及其活性成分能有效改善骨转移癌痛大鼠的疼痛行为学和骨质破坏,降低PI3K、p-AKT1/AKT1、p-P38/P38、磷酸化-胞外信号调节激酶1/2(phosphorylation-extracellular signal regulated kinase,p-ERK1/2)/ERK1/2、p-c-Jun氨基末端激酶(c-Jun N-terminal kinase,JNK)/JNK、p-P65/P65及p-人核因子κB抑制蛋白α(inhibitor of nuclear factor-κBα,p-IKBα)/IKBα的蛋白表达水平(P<0.05)。因此,壮骨镇痛胶囊及其活性成分槲皮素、木犀草素和异补骨脂素能有效改善骨转移癌痛,其作用机制可能与抑制MAPK、PI3K-AKT及NF-κB通路有关。

关键词： 克罗恩病   黄厚止泻滴丸   网络药理学   作用机制   分子对接  

摘要： [目的]基于网络药理学和分子模拟对接技术探究黄厚止泻滴丸治疗克罗恩病(Crohn's disease,CD)的活性成分和作用机制。[方法]在中国药典收载的中药材质量控制指标成分的基础上,通过中药系统药理学数据库TCMSP,根据口服利用度(OB)≥30%、类药性(DL)≥0.18的筛选原则获取黄厚止泻滴丸的潜在活性成分,借助pubchem等数据库和String平台预测黄厚止泻滴丸活性化合物的所有潜在治疗靶点,利用人类基因数据库GeneCards确定黄厚止泻滴丸治疗CD的潜在靶点,经Cytoscape软件将结果可视化,通过网络拓扑算法获得核心化合物和核心靶点;通过String平台构建PPI网络获得黄厚止泻滴丸治疗CD的重要靶点,通过DAVID平台对重要靶点进行基因本体(GO)富集及代谢途径(KEGG)富集分析;根据网络药理学结果,使用Autodock Vina软件进行分子对接,评估核心靶点与核心化合物之间的亲和力。[结果]34个化合物被确定为黄厚止泻滴丸的主要活性成分,其中槲皮素、木香烃内酯、穆坪马兜铃酰胺、黄柏酮、6-姜酚等可能是黄厚止泻滴丸治疗CD的核心化合物;筛选出黄厚止泻滴丸治疗CD的重要靶点27个,核心靶点6个,雌激素受体(ESR1)和表皮生长因子受体(EGFR)可能是主要的核心靶点;GO和KEGG分析表明黄厚止泻滴丸核心靶点的生物功能主要集中在调控NO的合成、炎症反应、免疫反应以及细胞凋亡,而FoxO信号通路、HIF-1信号通路可能为黄厚止泻滴丸治疗CD的关键信号通路。同时,分子对接结果表明ESR1与EGFR均能与核心成分进行良好对接。[结论]初步揭示了黄厚止泻滴丸治疗CD的潜在活性成分和作用机制,为进一步阐明黄厚止泻滴丸治疗CD的物质基础,服务于临床应用提供了参考。

关键词： 糖尿病肾病   气阴两虚夹瘀型   网络药理学   分子对接   作用机制  

摘要： 目的:运用网络药理学与分子对接研究糖尿病肾病气阴两虚夹瘀型高频用药作用机制。方法:采用TCMSP、BATMAN-TCM筛选高频药物成分和靶点,从GeneCards、OMIM获取糖尿病肾病靶点,取交集靶点并导入STRING和Cytoscape生成核心靶点图,运用Metascape进行GO和KEGG分析。运用AutoDock Tools对成分和靶点进行分子对接。结果:高频药物治疗糖尿病肾病的核心成分包括山柰酚、薯蓣皂苷元、木犀草素、槲皮素、丹参酮ⅡA等,核心靶点有AKT1、TNF、INS、IL-6、VEGFA等,信号通路主要有HIF-1信号通路、Fox O信号通路、脂质和动脉粥样硬化等。结论:本研究运用网络药理学方法及分子对接研究糖尿病肾病气阴两虚夹瘀型高频用药,作用机制主要与参与炎症反应、改善糖脂代谢等有关,为中医药治疗糖尿病肾病提供理论依据,为深入发掘作用机制提供方向。