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关键词： 复发性阿弗他溃疡   白及   网络药理学   信号通路  

摘要： 利用中药网络药理学方法预测白及治疗复发性阿弗他溃疡的主要活性成分及相关的作用靶点。方法 通过检索中医药系统药理学数据库和分析平台数据库,筛选并获取白及有效活性化学成分;同时基于SwissTarget Prediction 数据库进行对白及有效成分进行靶点预测;结合GeneCard 数据库筛选复发性阿弗他溃疡(RAU)的疾病作用靶点;采用Cytoscape软件构建白及-有效成分靶点与RAU作用靶点相互作用网络;采用String 数据库绘制交集靶点蛋白-靶点蛋白的相互作用网络;并对靶点蛋白进行GO和KEGG富集分析,构建核心有效成分-核心靶点-代谢通路网络图。结果 从白及中筛选出6个有效成分,涉及治疗RAU的靶点共14个;GO分析结果表明其涉及多个分子功能及细胞组成;KEGG富集分析结果表明白及可能通过JAK-STAT、IL-17信号通路等治疗RAU。结论 白及通过多成分、多靶点、多通路治疗RAU,为阐明研究白及成分治疗RAU的药理机制提供理论依据。

关键词： 酒精性脂肪肝   茵陈蒿汤   网络药理学   靶点   信号通路   分子对接  

摘要： 目的:基于网络药理学及分子对接技术,探索茵陈蒿汤治疗酒精性脂肪性肝病(AFL)的可能分子作用机制。方法:通过TCMSP数据库获得茵陈蒿汤的主要活性成分,利用Uniprot数据库获取物基因靶点;通过Genecards、DisGeNET、PharmGKB平台检索和筛选AFL相关疾病基因靶点,使用R语言筛选出共同靶点并可视化绘图;与中药成分靶点取交集,获得茵陈蒿汤治疗酒精性脂肪肝的潜在作用靶点;应用Cytoscape 3.9.1软件构建药物-活性成分-靶点网络图,再通过STRING数据库进行蛋白质相互作用(PPI)网络分析;通过DAVID平台对关键靶点进行GO功能注释和KEGG富集分析;对上述获取的药物活性成分与核心靶点进行分子对接。结果:筛选出茵陈蒿汤活性成分42个,潜在作用靶点126个;获取酒精性脂肪肝病相关靶点基因6564个,药物-疾病共同靶点99个,包括槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、异鼠李素等核心成分;度值较高的靶点蛋白包括TP53、IL-6、MYC、ESR1、CASP3、HIF1A、PPARG、EGFR、CCND1、FOS等;GO富集功能分析显示涉及生物过程1317条,分子功能131条,细胞组分17条,关键靶标主要在膜筏、膜微域、肌质网、肌浆等位置,涉及炎症反应、氧化应激反应、RNA聚合酶Ⅱ特异性DNA结合型转录因子结合、转录核心调节因子结合等多种生物过程。KEGG结果显示共有112条信号通路,包括脂质和动脉粥样硬化、MAPK信号通路、化学致癌-活性氧、细胞凋亡、TNF信号通路、催乳素信号通路等信号通路。分子对接结果显示5个有效活性成分(槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、异鼠李素、豆甾醇)与前6个相关核心蛋白TP53、IL-6、MYC、ESR1、CASP3、PPARG结合稳定。结论:茵陈蒿汤中槲皮素、β-谷甾醇、异鼠李素等核心成分,可能作用于TP53、IL-6、MYC、ESR1、PPARG等关键靶点,通过参与MAPK、TNF、催乳素等多种信号通路发挥治疗作用。

关键词： 葛根芩连汤   银屑病   UHPLC-QE-MS   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的基于网络药理学及分子对接技术探究葛根芩连汤治疗银屑病的作用机制。方法通过UHPLC-QE-MS技术对葛根芩连汤中药溶液样本进行活性成分分析,将得到的活性成分在TCMSP中进行匹配;在GEO数据库中筛选出GSE166388芯片数据,对其进行差异分析后获得银屑病差异表达基因(DEGs),再通过GeneCards、Drugbank、TTD、OMIM数据库检索得到银屑病相关致病基因,与DEGs取交集;在STRING平台进行蛋白互作分析,Cytoscape构建PPI网络并进行拓扑分析;利用Metascape平台进行GO和KEGG富集分析,用clusterProfiler包绘图;最后通过Autodock对核心成分与核心靶点进行分子对接验证,运用Pymol软件进行可视化。结果得到活性成分19个,对应靶点131个,银屑病DEGs 1043个,银屑病相关致病基因1364个,取交集后获得62个治疗靶标;GO富集分析得到583个条目,KEGG富集分析主要涉及脂质与动脉粥样硬化通路、Th17细胞分化通路等;核心成分与核心靶点分子对接活性较好,其中基质金属蛋白酶-9(MMP9)与所有核心成分的对接能力均最强。结论葛根芩连汤可能从脂质代谢、炎症、细胞和免疫调节等方面发挥治疗银屑病的作用,对于肥胖相关性银屑病的治疗也可能具有重要意义。

关键词： 网络药理学   分子对接技术   雷公藤多甙   类风湿性关节炎  

摘要： 目的基于网络药理学探讨雷公藤多甙治疗类风湿性关节炎(RA)的作用机制。方法利用SwissTargetPrediction、STITCH、Comparative Toxicogenomics等数据库检索筛选雷公藤多甙靶点基因。从GEO数据库中获取RA与药物的差异表达基因(DEG)。使用STRING数据库构建雷公藤多甙与DEG交集靶点的PPI网络,采用Cytoscape(v3.7.2)软件对PPI网络进行可视化分析。交集靶基因采用GO功能富集和KEGG通路分析。结果共鉴定出雷公藤多甙靶点基因260个,获取DEG 3687个。雷公藤多甙与DEG相交集的靶基因共99个,雷公藤多甙的靶蛋白中识别出5个关键靶点。GO富集分析结果显示,生物过程主要富集于药物应答、平滑肌细胞增殖正向调控和炎症反应;细胞成分主要富集于胞外空间、胞质和胞外区域;分子功能主要富集于相同的蛋白结合、细胞因子活性和转录因子结合。KEGG通路主要富集于脂质和动脉粥样硬化、癌症通路、癌症中的蛋白聚集糖等等。结论雷公藤多甙可能通过5个关键靶点,调节多条信号通路,发挥抑制炎症、调节免疫反应、保护关节组织等作用,为其治疗RA提供了新的理论支持。

关键词： 17-羟-岩大戟内酯B   狼毒大戟   肝癌   网络药理学   PI3K-Akt通路   线粒体凋亡  

摘要： 目的基于网络药理学探究17-羟-岩大戟内酯B(HJB)对人肝癌HepG2细胞凋亡的作用机制,并进行实验验证。方法采用网络药理学对HJB作用靶点进行筛选,构建靶点网络及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,对HJB抗肝癌潜在的作用靶点及相关通路进行预测。并用0(空白对照)、2.5、5、10、20、40、80μmol/L的HJB作用于HepG2细胞24、48、72 h,采用细胞计数试剂盒-8(CCK-8)法检测各组细胞的增殖活性。以0(空白对照)、5、10、20μmol/L的HJB作用于HepG2细胞48 h后,膜联蛋白V(Annexin V)-异硫氰酸荧光素(FITC)/碘化丙啶(PI)双染法检测各组细胞的凋亡,JC-1染色法观察细胞的线粒体膜电位变化,DCFH-DA染色法观察细胞的活性氧水平。Western blotting法检测各组细胞线粒体凋亡及磷脂酰肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路相关蛋白表达变化。结果通过网络药理学预测,得出HJB与肝癌有291个共同靶点;京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析结果显示HJB治疗肝癌结果主要在癌症通路、癌症中的蛋白多糖、血脂与动脉粥样硬化和PI3K-Akt信号通路等信号通路;HJB时间和剂量相关性地显著抑制HepG2细胞增殖。与空白对照组相比,5、10、20μmol/L HJB组细胞的活性氧水平、凋亡率、B淋巴细胞瘤-2(Bcl-2)相关X蛋白(Bax)、细胞色素C(Cyt C)、裂解胱天蛋白酶-9(cleaved Caspase-9)、裂解胱天蛋白酶-3(cleaved Caspase-3)蛋白水平呈浓度相关性升高(P<0.05),线粒体膜电位、Bcl-2、磷酸化PI3K(p-PI3K)、磷酸化Akt(p-Akt)蛋白表达显著降低(P<0.05)。结论HJB可抑制肝癌HepG2细胞增殖,促进HepG2细胞凋亡,其机制可能与PI3K-Akt通路介导线粒体凋亡途径有关。

关键词： 老香黄   IBD   食药两用   PI3K-AKT   金圣草素   7-羟基香豆素  

摘要： 目的:运用网络药理学和分子对接的方法探究老香黄防治炎症性肠病(IBD)的作用机制。方法:通过文献检索收集并在TCMSP数据库、Swiss Target Prediction数据库筛选老香黄的活性成分,预测潜在靶点;通过GeneCard数据库及韦恩图获取IBD与活性成分重合靶点,并运用String数据库及Cytoscape软件构建PPI网络,筛选核心成分以及靶点;利用David数据库进行KEGG分析;最后利用Autodock vina软件将核心靶点以及活性成分进行分子对接。结果:第八年的老香黄活性成分共20种,其中5种核心成分为金圣草素、山萘酚、7-羟基香豆素、5,7-二甲氧基香豆素、诺米林;10个核心靶点为EGFR、SRC、AKT1等,主要参与PI3K-AKT、MAPK、EGFR等信号通路。分子对接结果验证关键活性成分与核心靶点可自发结合。结论:老香黄可能通过多成分、多靶点和多通路,调控免疫炎症、细胞增殖、分化及凋亡,从而减少炎症反应、修复肠屏障,治疗IBD。这为老香黄在肠道性疾病中的进一步发展和应用提供了理论基础。

关键词： 网络药理学   慢性疲劳综合征   虚劳   大补元煎   分子对接  

摘要： 目的采用网络药理学和分子对接技术分析大补元煎治疗慢性疲劳综合征(CFS)作用机制,为经典古方名方新用提供依据。方法利用TCMSP检索大补元煎的化学成分及其相关作用靶点,并通过UniProt数据库对蛋白靶点进行规范。通过GeneCards、OMIM、PharmGKB、DrugBank数据库获取CFS相关靶点,将大补元煎作用靶点与CFS疾病靶点取交集,同时导入STRING数据库进行分析,并利用Cytoscape3.10.1软件构建蛋白相互作用(PPI)网络,利用Metascape数据库进行GO功能及KEGG通路富集分析,运用微生信平台将分析结果可视化。将核心靶点与相关活性成分进行分子对接,并使用PyMOL2.5.4软件绘制分子对接模式图。结果共检索出大补元煎活性成分204个、潜在作用靶点312个,主要活性成分包括槲皮素、山柰酚、β-谷甾醇、豆甾醇,与CFS相关靶点161个,以AKT1、TNF、IL6、IL1β、ALB等为核心靶点。GO功能富集结果主要涉及细胞对氮化合物、脂多糖、异生刺激的反应等;KEGG通路富集分析主要涉及AGE-RAGE、化学致癌-受体活化、内分泌抵抗、HIF-1等信号通路。分子对接结果显示,核心靶点与核心活性成分对接活性较强。结论大补元煎可通过AKT1、TNF、IL6等核心靶点及激活HIF-1信号通路、钙信号通路、AGE-RAGE信号通路等发挥治疗CFS的作用。

关键词： 冠心病稳定型心绞痛   芎归饮   网络药理学   分子对接  

摘要： 目的:应用网络药理学方法研究并分析芎归饮治疗冠心病稳定型心绞痛的生物过程及分子基础。方法:应用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)数据库检索当归、川芎两种药物的有效组分和对应靶标,利用Cytoscape 3.8.2软件建立芎归饮“中药组成-有效成分-靶基因”关系图并进行分析,得到核心蛋白及靶点。利用数据库查找出冠心病稳定型心绞痛的疾病基因靶标,并借助韦恩图工具统计出药物干预疾病的靶点数量。使用STRING数据库获得蛋白质相互作用(PPI)关系网络图并选择出核心蛋白,将靶标信息上传DAVID数据库完成生物功能分析和途径富集分析,以系统分析其治疗作用发挥路径。结果:整理得到芎归饮活性组分6个,对应基因靶标62个;疾病靶基因1123个,药物与疾病共有靶基因37个;主要通过雌二醇调节、药物调节、蛋白质同源二聚化活性、细胞凋亡、心肌细胞肾上腺素能信号转导等起到对稳定型心绞痛的治疗作用。分子对接结果显示,芎归饮的有效成分与核心蛋白之间存在良好的结合活性。结论:基于网络药理学验证了芎归饮中药物的多个组分可经过雌二醇调节等生物途径作用于SLC6A2、PLAU等靶基因对冠心病稳定型心绞痛起到治疗效果。

关键词： 苦杏仁苷   胃癌   网络药理学   分子对接   体外实验  

摘要： 目的 基于网络药理学的方法,结合分子对接和体外实验,揭示苦杏仁苷治疗胃癌的生物活性、关键靶点和潜在的药理作用机制。方法 基于公共数据库筛选出苦杏仁苷以及胃癌的靶点基因,进行靶点标准化;运用 Cytoscape 软件构建胃癌-苦杏仁苷-靶点网络;将获得的关键靶标上传到 STRING 数据库,用于蛋白质相互作用网络分析;通过拓扑分析确定苦杏仁苷治疗胃癌的核心靶标,并进行功能注释分析和路径富集分析;结合分子对接技术验证苦杏仁苷与核心靶标之间结合活性的强弱;最后通过体外实验进行验证。结果 CCK-8 结果显示,与对照组比较,苦杏仁苷4、8 mg·mL^(-1)干预 48 h后,HGC-27 细胞增殖作用受到显著抑制;流式细胞术结果表明,苦杏仁苷能够浓度依赖性地促进胃癌细胞的凋亡;与对照组比较,苦杏仁苷4、8 mg·mL^(-1)干预 48 h后,Bax蛋白表达水平明显增加,Bcl2蛋白表达水平明显下降。共筛选出苦杏仁苷治疗胃癌的交集靶点 34 个,核心靶点分别是 SSTR1、SSTR2、SSTR3、SSTR4、SSTR5,分子对接结果显示苦杏仁苷与这5个核心靶点有极好的结合能力;与对照组比较,苦杏仁苷4、8 mg·mL^(-1)干预48 h后,SSTR3 蛋白表达水平明显增加。结论 苦杏仁苷可以通过发挥类似生长抑素的作用于生长抑素受体 SSTR3,增加胃癌细胞凋亡,并影响其生长增殖的生物学过程来发挥对胃癌的治疗作用。

关键词： 中药药理学   教学设计   化痰止咳平喘药   苦杏仁  

摘要： 中药药理学因知识更新迅速、内容繁杂抽象、学时分配少等原因一直是一门讲授难度较大的课程。为了提升授课效果,以化痰止咳平喘药苦杏仁的教学设计为例,通过课前问题导入、视听导入、引入科研论文分析、引导归纳思维导图和构建中药药理作用及机制的文献再评价体系等方法,探索提高中药药理学课程教学的新模式,激发学生学习兴趣,提高自学能力,培养中医临床思维,希望为中药药理学教学改革提供参考。