课程文献中心 更多>>

关键词： 麦门冬汤   p53信号通路   肺纤维化  

摘要： 目的探讨麦门冬汤对肺纤维化小鼠模型的干预作用及其药理机制。方法将C57BL/6小鼠随机分成对照组、模型组、干预组,每组6只,模型组小鼠经气管滴注博来霉素建立肺纤维化小鼠模型,干预组造模24 h后麦门冬汤灌胃给药20 d,观察小鼠一般情况,HE染色观察肺组织的病理变化,免疫组化和Western blot分析α-平滑肌肌动蛋白(alpha smooth muscle actin,α-SMA)和钙黏蛋白(epithelial cadherin,E-cadherin)的表达情况。网络药理分析麦门冬汤干预肺纤维化的潜在机制。其后通过转化生长因子(transforming growth factor,TGF)-β1诱导小鼠胚胎成纤维细胞NIH3T3构建肺纤维化细胞模型,麦门冬汤含药血清和(或)p53抑制剂(pifithrin-α,PFT-α)干预后,荧光定量PCR和Western blot检测p53、α-SMA、E-cadherin和I型胶原蛋白(collagen type I,Collagen I)的表达情况。结果与对照组比较,肺纤维化小鼠模型肺组织均出现大面积实变区和大量炎性细胞浸润,α-SMA表达增加,E-cadherin降低(P<0.01),麦门冬汤干预后上述症状得到显著改善。网络药理学分析发现麦门冬汤的差异药靶基因主要富集在p53信号通路。细胞实验则显示麦门冬汤组含药血清干预可使肺纤维化细胞模型中α-SMA下调,E-cadherin和p53表达上调(P<0.01)。PFT-α干预实验中,PFT-α干预后对照组和麦门冬汤组中p53和E-cadherin表达降低,α-SMA和Collagen I表达升高(P<0.01)。结论麦门冬汤可通过调节p53信号通路改善肺纤维化进展。

关键词： 乳腺肿瘤   山柰酚   网络药理学   计算生物学  

摘要： 背景与目的:山柰酚是一种天然黄酮类化合物,可以调节各种与癌症相关的过程和活动,如细胞周期、氧化应激、细胞凋亡、增殖、转移和血管生成,且其抗乳腺癌的潜力已得到了一些研究的验证,但其作用机制尚不清楚。因此,本研究探讨山柰酚治疗乳腺癌的潜在作用靶点和通路,并建立预后模型。方法:基于网络药理学和生物信息学方法,利用HERB、GeneCards、STRING、Pubchem、RSCD PDB、TCGA等数据库获取山柰酚治疗乳腺癌的交集靶点进行蛋白互作、GO分析及KEGG通路富集分析,并进行分子对接进行验证。用LASSO-Cox回归分析获取预后相关基因并建立风险评分模型,分别对单基因进行预后分析,并分析风险评分和免疫浸润的相关性。结果:网络药理学分析获得55个交集靶点,蛋白互作分析结果获得5个潜在关键基因(Akt1、Bcl2、CASP3、ESR1、AR)。GO分析结果发现山柰酚治疗乳腺癌涉及1604个生物学过程条目、20个细胞组成条目,121个分子功能条目。KEGG通路富集主要包括化学致癌-活性氧信号通路、糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、IL-17信号通路等。分子对接结果表明,山柰酚与关键靶点具有强大的亲和力,与ESR1结合效果最好(-9.1 kcal/mol)。通过LASSO-Cox回归分析获得了10个预后基因(Bcl2、CYP1B1、DPP4、GSTM1、GSTM2、MMP1、NCOA2、NOS2、NR1I3、PTGS2),并以此建立风险评分模型。该模型预测乳腺癌患者预后的AUC>0.5。单基因预后分析提示,Bcl2(HR=0.61,95%CI=0.43~0.86,P=0.005)、CYP1B1(HR=0.68,95%CI=0.49~0.94,P=0.022)、GSTM1(HR=0.68,95%CI=0.47~0.98,P=0.037)、GSTM2(HR=0.64,95%CI=0.46~0.90,P=0.010)、PTGS2(HR=0.62,95%CI=0.44~0.86,P=0.005)高表达组的总生存(OS)期均高于各自的低表达组;MMP1(HR=1.72,95%CI=1.22~2.41,P=0.002)、NCOA2(HR=1.71,95%CI=1.12~2.60,P=0.013)、NOS2(HR=1.67,95%CI=1.20~2.32,P=0.002)、NR1I3(HR=1.69,95%CI=1.21~2.37,P=0.002)高表达组的OS均低于各自的低表达组。预后模型评分与T细胞、CD8+T细胞、髓样树突细胞、NK细胞、B细胞的浸润呈负相关,与单核/巨噬细胞的浸润呈正相关(均P<0.05)。结论:山柰酚可通过多靶点、多通路发挥治疗乳腺癌作用。基于其作用相关靶点筛选出来的预后基因及建立的预后模型可为乳腺癌的临床治疗提供指导;预后模型与免疫的相关性可为下一步实验研究提供了方向。

关键词： 中医药   网络药理学   文献计量学   可视化分析   CiteSpace  

摘要： 目的归纳网络药理学应用于中医药领域的相关文献,探索网络药理学研究现状及发展趋势。方法利用中国知网、维普(VIP)、万方、PubMed及Web of Science数据库,检索网络药理学的相关文献,运用NoteExpress、CiteSpace 5.8.R1对研究机构、研究作者及关键词等内容进行可视化分析。结果纳入文献11263篇,其中英文文献6158篇、中文文献5105篇。载文量最多的中、英文期刊分别为《中草药》(273篇)、《EVIDENCE BASED COMPLEMENTARY AND ALTERNATIVE MEDICINE》(633篇);中、英文发文机构中北京中医药大学发文量最多(583篇),且各机构之间合作较多;文献作者合作网络分析显示,网络药理学研究领域发文量最多的作者是王永华(57篇);关键词分析显示网络药理学研究方向集中于宏观药效学转向微观分子机制,主要应用于新药研发、疾病机制预测及突发公共卫生事件治疗。结论近十年来网络药理学的研究整体上呈上升趋势,利用网络药理学研究传统医药仍是当前关注的热点,完善数据来源及结合多种验证手段对网络药理学的发展具有推动作用。

关键词： 临床药理学   剧情互动小视频   混合式教学  

摘要： 以教师讲授为主的传统教学方式进行的信息灌输容易引起认知疲劳,如何提高学习者的兴趣,是教改的一项重要任务。剧情互动短视频作为一种高效网络传播载体,具有多分支剧情、用户参与抉择、趣味性强的特点,深受青年人喜欢。为了激发学习的兴趣和乐趣,我们基于交互型叙事的理论,探索将剧情互动小视频应用于“临床药理学导论”的课程中,创作了《二甲双胍成药记》多情节、多任务、多结局的小作品,以其为例开展了相关混合式教学的实践。结果表明,该方法具有角色扮演以及沉浸式体验的优势,有利于提高学习者知识内化效率和教学满意度,为创新性教学方法的应用提供参考。

关键词： 芡实   糖尿病   代谢组学   网路药理学   分子对接  

摘要： 通过代谢组学、网络药理学及分子对接技术分析不同芡实品种中的活性成分及其对糖尿病的作用。使用四极杆飞行时间液质联用系统(LC-QTOF-MS)、Metaboanalyst(https://***/)和TBtools软件对芡实成分进行检测和分析;通过PubChem筛选出芡实中具有生物活性的成分;使用Swiss预测芡实成分靶点,通过多种数据库检索疾病靶点取并集;绘制蛋白质互作(PPI)网络查找主要成分及核心靶点;对交集靶点进行GO富集分析和KEGG富集分析;最后通过分子对接技术进行验证。结果表明,苏芡和刺芡中有153种在含量方面具有显著差异的成分;从苏芡中筛选出12种具有缓解糖尿病及其并发症效果的成分以及578个潜在靶点,从刺芡中筛选出3种具有缓解糖尿病及其并发症效果的成分及226个潜在靶点;GO富集和KEGG富集分析结果显示,苏芡中的靶点主要富集在糖尿病性心肌病、胰岛素抵抗、糖尿病并发症中的高级糖基化终末产物-受体信号通路,刺芡中的靶点主要富集在癌症的发病途径、脂肪细胞脂解的调控、磷酸腺苷活化蛋白激酶信号通路;分子对接分析结果显示,筛选出的成分均结合在靶点蛋白质的凹陷处,结合自由能均为负值,分子对接构象稳定。说明,苏芡在缓解糖尿病及其并发症等方面较刺芡具有更好的效果。

关键词： 柴胡疏肝散   肠黏膜损伤   网络药理学   药物靶点   分子对接  

摘要： 目的利用网络药理学探讨柴胡疏肝散改善肠黏膜损伤的作用机制,并通过分子对接技术加以验证。方法利用TCMSP数据库筛选出柴胡疏肝散各中药的活性成分及作用靶点信息,利用GeneCards和OMIM等数据库收集肠黏膜损伤疾病的靶点;将柴胡疏肝散的活性成分靶点与肠黏膜损伤疾病靶点的交集作为关键靶点;利用STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI);用Cytoscape 3.9.1软件构建柴胡疏肝散-活性成分-潜在靶点网络;运用David网站进行GO分析和KEGG富集分析。应用Pymol、AutoDock Tools等软件对核心成分与关键靶点进行分子对接的验证,并利用Pymol进行可视化分析。结果获得柴胡疏肝散的活性成分靶点432个,肠黏膜损伤疾病靶点1307个,取交集得到柴胡疏肝散与肠黏膜损伤的关键靶点142个;用PPI网络对关键靶点进行分析,得到核心靶点蛋白激酶B(Akt1)、白细胞介素6(IL-6)、肿瘤坏死因子(TNF)、IL-1β;富集分析结果显示,柴胡疏肝散可能通过调节高级糖基化终末产物-受体(AGE-RAGE)、IL-17和TNF等信号通路来改善肠黏膜损伤。分子对接结果显示,核心化合物β-谷甾醇与Akt1、IL-6、TNF等有良好的结合活性。结论柴胡疏肝散可通过多靶点、多通路发挥改善肠黏膜损伤的作用,为治疗肠黏膜损伤的新药研究提供了新的思路。

关键词： 少弱精子症   中药   网络药理学  

摘要： 目的运用网络药理学和分子对接技术对菟丝子和覆盆子联合中药(CSRFCH)进行研究,探究CSRFCH治疗少弱精子症(OA)可能的作用机制。方法利用TCMSP、TCMID、BATMAN-TCM、Swiss Target Predition和GeneCards数据库及相关文献资料检索CSRFCH的有效成分靶点及OA相关靶点,利用STRING数据库绘制蛋白质相互作用网络,获取核心靶点。利用DAVID数据库进行富集分析。最后对有效成分及核心靶点进行分子对接。结果CSRFCH的山柰酚、槲皮素、β-谷甾醇、异鼠李素和欧前胡素等成分可能通过关键靶点SRC、MAPK3、PIK3R1、PIK3CA和AKT1作用于癌症通路、PI3K-Akt信号通路等。分子对接结果显示核心成分与核心靶点均有较好的结合能力。结论通过网络药理学方法预测了CSRFCH治疗OA可能通过SRC、MAPK3、PIK3R1、PIK3CA和AKT1相关靶点调控癌症通路、PI3K-Akt信号通路等通路。

关键词： 镇痛   中药   药理学   活性成分   作用靶点  

摘要： 在日常生活与临床中疼痛常有发生,及时对疼痛进行治疗可以有效提高疾病的治愈率。现阶段使用的镇痛药物主要作用于中枢神经系统,但这类镇痛药物会产生一定的依赖性。中药镇痛是一种传统的治疗方法,目前常用的镇痛中药活性成分可分为生物碱类、黄酮类、香豆素类和活性多糖类等四类。它们通过MAPK/p38信号通路、NF-κB经典通路、电压门控Na+离子通道、TRP通道及其他通路发挥镇痛作用,不仅可以抑制炎症介质的产生和释放,减轻疼痛感,也可以调节离子通道的活性和抑制痛觉传导来产生镇痛效果。而中药复方在镇痛方面一直有着良好的治疗效果。因此,本文针对临床中常见的热点问题总结了目前最新中药镇痛机制及药理学研究进展,并对中药复方的临床应用和前景进行综述与展望,为中医药镇痛在临床上的应用提供参考,也为新药的研发和中医药特色诊疗方法的应用提供新思路。

关键词： 白术   防风   多囊卵巢综合征   网络药理学   分子对接  

摘要： 通过分子对接联合网络药理学的相关性分析及总结,对“白术-胆南星”的药物配对治疗多囊卵巢综合征(PCOS)过程中所展现的不同靶点作用所在及其相关的连接信号通路和其药物中作用活性成分进行探究。方法 从数据库TCMSP、HERB、BATMAN-TCM中进行数据收集,同时预测“白术-胆南星”药对的作用靶点、活性成分,借助数据库Gene Cards、CTD等筛选PCOS的相关作用靶点,绘制韦恩图,从而确定药对与PCOS交集部分的共同靶点。在软件Cytoscape3.7.2中构建“靶点-成分”网络,使用STRING数据库分析PPI蛋白互作网络,确定核心靶蛋白,并对共同交集靶点进行GO及KEGG 通路富集分析,最后使用AutoDock-Tools-1.5.6软件进行分子对接试验。结果 白术-胆南星药对主要的有效成分包括黄樟素、榄香素、BETA-律草烯 、 (+)-α-长叶蒎烯等11个;其主要作用于ESR1、SRC、HSP90AA、MAPK1、STAT3等关键靶蛋白。GO 与KEGG 通路富集分析表明,药对主要通过调节PI3K-Akt信号通路、Th17细胞分化通路等在胰岛素抵抗、脂质与动脉粥样硬化、以及MAPK信号通路等,对多囊卵巢综合征起到治疗效果。结论 白术-胆南星药对治疗多囊卵巢综合征涉及多个信号通路及生物学过程,达到调控炎症反应、改善糖脂代谢及调节激素水平的作用,从而干预多囊卵巢综合征,对后续药物的研究和应用提供了依据。

关键词： 六君子汤   结直肠腺瘤   网络药理学   GEO数据库   分子对接  

摘要： 本文采用生物信息学以及网络药理学分析六君子汤在治疗结直肠腺瘤(colorectal adenomas,CRA)中的分子机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)收集六君子汤的有效成分及其相关靶点,利用GEO数据库和OMIM、GeneCards等疾病数据库筛选CRA相关靶点,将六君子汤与CRA的交集靶点信息上传至STRING并通过Cytoscape3.7.2可视化PPI网络。使用Metascape数据库进行KEGG与GO通路富集分析并预测六君子汤治疗CRA的相关通路,绘制“中药-成分-疾病靶点-通路”网络。利用Autodock进行分子对接,通过TIMER 2.0对核心靶点进行结肠腺癌免疫细胞浸润分析与差异性表达分析。结果显示,六君子汤中的主要成分槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇以及刺芒柄花素等可通过多靶点、多通路改善CRA症状,关键靶点为ESR1、TP53、GSK3B以及PTGS2等,相关的信号通路为癌症相关通路、Wnt信号通路以及Hippo信号通路等。六君子汤可通过多靶点、多通路改善CRA症状,其关键成分槲皮素、山奈酚、β-谷甾醇以及刺芒柄花素等可能通过ESR1、AKT1、TP53、GSK3B以及PTGS2等靶点作用于Wnt信号通路、Hippo信号通路等通路发挥治疗CRA的作用。